Génétique des populations II Flashcards
Qu’est-ce que l’assortiment positif?
L’assortiment correspond à l’union des individus dans la population.
Positif : Les individus se reproduisent préférentiellement en fonction de leur similitude phénotypique
Pouvez-vous donner un exemple d’assortiment positif?
Chez les humains : Se reproduisent selon leur culture, leur éducation, leur salaire, leur taille corporelle, etc.
Chez les plantes : en fonction du moment de la floraison
Quelle est la conséquence de l’assortiment positif sur les fréquences génotypiques d’une population?
- Augmentation de la fréquence des homozygotes au détriment des hétérozygotes
- Change les fréquences génotypiques mais non pas les fréquences allèliques (allèles seulement redistribuer chez plus d’homozygotes)
Est-ce qu’une population qui subit l’assortiment positif est à l’équilibre de Hardy-Weinberg?
Non, puisque les fréquences alléliques ne changent pas et sont redistribuer plus chez les homozygotes et moins chez les hétérozygotes, cause un déséquilibre (fréquence génotypique ne correspondent pas aux fréquences alléliques)
Qu’est-ce que l’assortiment négatif?
Les individus dissemblables s’accouplent préférentiellement
Pourquoi la reproduction sexuée est-elle considérée un assortiment négatif?
Parce que favorise reproduction entre individu dissemblable. En effet, empêche la reproduction avec le même sexe
Pourquoi plusieurs angiospermes (plantes à fleurs ) ont-elles évolué des mécanismes divers pour forcer l’assortiment négatif?
Parce beaucoup de plantes possèdent les deux sexes et produisent des gamètes mâles et femelles. Auto-fécondation possible = diminue le mélange génétique et le partage des gènes qui permet de trouver des combinaisons génétiques avantageuses et d’éliminer les combinaisons désavantageuse.
Quelle est la conséquence de l’assortiment négatif sur les fréquences génotypiques d’une population?
- Augmentation des hétérozygotes au détriment des homozygotes
- Maintien de la variabilité génétique dans la population
Quel est l’effet de l’isolement par la distance sur les fréquences génotypiques d’une population étalée sur un grand territoire?
Population d’espèce donné incapable de se reproduire à cause de la distance. Mène à la formation de gradients de fréquences alléliques :
- Mène à un déficit en hétérozygotes par rapport à la loi de l’équilibre (fréquence génotypiques attendues avec les fréquences alléliques)
Qu’est-ce que l’endogamie?
Population consanguine : Population dans laquelle les unions entre individus apparentés se produisent plus fréquemment qu’elles n’auraient eu lieu par l’union au hasard
Quel est le risque individuel de l’endogamie chez les humains?
La consanguinité augmente le risque que la progéniture soit homozygote pour un allèle nocif (létal ou déterminant une maladie héréditaire)
Qu’est-ce que le coefficient de consanguinité?
Coefficient de consanguinité (Fi) : Probabilité que deux allèles se retrouvent à l’état homozygote chez la progéniture (I) d’un couple consanguin (BC) car ils proviennent d’un ancêtre commun (A) (couple demi-frère et demi-soeur)
Dans la formule Fi = (1/2)n (1+Fa), que signifie la variable « n »?
n = nombre total d’individus dans un chaîne de parenté en excluant l’individu pour lequel on calcul le coefficient de consanguinité
Comment calcule-t-on le coefficient de consanguinité pour un individu particulier?
Fi= Somme(1/2^n)
- Somme des expressions 1/2^n pour toutes les chaînes de parenté
- Représente les chances d’être homozygote pour un allèle hérité par un de ces ancêtres
Dans la formule Fi = (1/2)n (1+Fa), que signifie Fa ?
Formule modifiée dans le cas où l’ancêtre possède lui-même un coefficient de consanguinité Fa
Quel est l’effet de la consanguinité sur les fréquences génotypiques d’une population?
f(A/A) = p^2(1-F) + pF
f(A/a) = 2pq(1-F)
f(a/a) = q^2(1-F)+ qF
Pourquoi la consanguinité cause-t-elle des effets néfastes sur la santé de populations qui se reproduisent habituellement par hétérogamie?
Parce que la consanguinité augmente la fréquence des homozygotes accompagnée d’une réduction de la fréquence des hétérozygotes. Les fréquences alléliques demeurent inchangées.
- C’est négatif sur les espèces qui se reproduisent habituellement par hétérogamie parce que ces espèces ont évoluées en réduisant la consanguinité (accumulation d’allèles nocifs récessifs)
Comment calcule-t-on (ou estime-t-on) le coefficient de consanguinité d’une population?
Moyenne du coefficients de consanguinité de tous les individus
Qu’est-ce que la sélection?
Consiste en un taux différentiel de survie et de reproduction. Elle «choisit» les mutation déterminant les phénotypes les mieux adaptés
- Aboutit à des changement dans les fréquences génotypiques et alléliques d’une population
Quels sont les deux paramètres individuels qui peuvent être affectés par la sélection?
- La probabilité relative de survie
- Le taux de reproduction d’un génotype (phénotype)
Comment la sélection affecte-t-elle les deux types de fréquences (allélique et génotypique) dans la population?
Certains allèles ne sont pas transmis dans les générations suivantes (mauvais fitness)
Que signifie la valeur adaptative relative (W)?
Probabilité relative de survie et le taux de reproduction d’un génotype (phénotype);
- Valeur relative aux autres génotypes dans la population
Quelle valeur aura la valeur adaptative relative du (ou des) génotype le plus fit?
W = 1
Pourquoi la sélection directionnelle positive qui favorise un allèle récessif atteint-elle la fixation de l’allèle plus rapidement que dans le cas d’un allèle dominant?
Hétérozygote continue à porter les allèles récessifs qui vont avoir tendance à rester à la population = asymptote de la fréquence de l’allèle dominant
Augmente lentement parce que l’avantage est seulement exprimé chez les homozygotes, puis la fréquence d’homozygote est faible au début. L’allèle est fixé plus rapidement, car homozygote ont seulement des allèles récessifs
Qu’est-ce que la sélection directionnelle?
Sélection où un allèle est favorisé plus qu’un autre (dominance de cette allèle et disparition de l’autre)
Pourquoi la sélection directionnelle positive qui favorise un allèle dominant n’atteint-elle la fixation de l’allèle que très lentement dans les générations?
Hétérozygote continue à porter les allèles récessifs qui vont avoir tendance à rester à la population, alors que les homozygotes ne transmettent seulement l’allèle récessif.
Qu’est-ce que la sélection directionnelle positive?
Un allèle apporte un certain bénéfice = tendance à augmenter
Qu’est-ce que la sélection directionnelle négative, ou sélection « purificatrice »?
S’apparente plus aux allèles récessifs létaux qui évidement ne se reproduisent pas, ce qui crée la disparition graduelle d’homozygotes récessifs.
- Perte d’allèle défavorable chez une population
Quel est l’effet de la sélection purificatrice sur la fréquence d’un allèle défavorable?
q = sqrt(taux mutation/coefficient sélection)
- Cet équilibre explique la persistance des maladies génétiques rares dans les populations
Qu’est-ce que la sélection stabilisante?
Sélection qui favorise l’hétérozygote. L’hétérozygote possède une meilleur valeur adaptative que les homozygotes -> stabilisation qui possède les deux types d’allèles
Quel génotype est favorisé par la sélection stabilisante?
L’hétérozygote
La sélection stabilisante dépend-elle de la fréquence des allèles?
La fréquence des allèles est basée sur la valeur adaptatives des homozygotes et non pas des fréquences alléliques initiales
Dans le cas de l’anémie falciforme, pourquoi la fréquence de l’allèle HbS est-elle élevée dans certaines populations en Afrique?
Exemple de sélection en faveur de l’hétérozygote (stabilisatrice chez l’humain). Les hétérozygotes sont résistants au paludisme -> taux de survie plus élevé que les homozygotes (surdominance) = favorise le maintien de l’allèle récessif
Comment peut-on reconnaître un événement de sélection positif récent dans une population en observant les marqueurs génétiques (polymorphismes)?
Suite à la sélection d’un allèle favorable, augmentation soudaine d’un allèle. Cela mène à un déséquilibre de liaison (LD) -> Marqueurs avec un fort LD sont à proximité d’un gène sélectionné récemment
Qu’est-ce qu’un « balayage sélectif »?
Tous les haplotypes de la population sont identiques
Comment peut-on reconnaître un locus sous effet de sélection stabilisante?
Sélection stabilisante (en faveur de l’hétérozygote) peut mener à une diversité génétique exceptionnelle
