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Génétique-RB > Génétique des populations > Flashcards

Génétique des populations Flashcards

1
Q

Qu’est ce qu’une population?

A

Ensemble d’individus d’une même espèce vivant sur un territoire tel que tous les individus présentent la même probabilité de rencontre de partenaires
reproducteurs

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Q

Quelles types de populations sont possibles?

A
  • 1 espèce avec plusieurs populations

- Des espèces différentes

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3
Q

Quand est ce qu’une espèce se distingue d’une autre?

A

Lorsqu’il n’y a pu de contact avec le pool génétique

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4
Q

Quel est le but principal de la génétique des populations?

A

Décrire la variété génétique au sein de la

population

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Q

Vrai ou Faux: Fréquence allélique est la fréquence de l’allèle dans une population tandis que la fréquence génotypique est la fréquence d’un génotype donné

A

Vrai

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6
Q

Qu’est ce qu’une population en équilibre?

A

Population dans laquelle les fréquences
génotypiques et alléliques
sont constantes de génération en génération

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7
Q

Qu’est ce que l’équilibre de Hardy-Weinberg?

A

p^2+2pq+q^2=1
les fréquences
génotypiques résultent de l’union au hasard

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8
Q

Les fréquences alléliques
étant identiques pour les
gamètes femelles et mâles,l’équilibre de Hardy-Weinberg ne s’applique pas, pourquoi?

A

Mâles sont hémizygotique pour les chromosomes X et Y

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9
Q

Vrai ou Faux: Dans une population en équilibre, les fréquences des homozygotes seulement dépendent des fréquences alléliques

A

Faux, les fréquences des homozygotes et

des hétérozygotes dépendent des fréquences alléliques lorsque l’on a une population à l’équilibre

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10
Q

Comment peut-on calculer les fréquences alléliques et génotypiques sans distinguer l’homozygote dominant de l’hétérozygote?

A

En sachant la fréquence des phénotypes, on peut déduire la fréquence allélique de l’allèle récessif et ensuite faire -q pour avoir la valeur de p. Après, on peut calculer les fréquences génotypiques avec l’équation de Hardy-Weinberg

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11
Q

Quelles sont les caractéristiques des populations à l’équilibre?

A
  • Population très grande ou même infiniment grande
  • Pas de mutation, migration et sélection
  • Population panmictique
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12
Q

Comment peut-on déterminer qu’une population est en déséquilibre?

A

On détecte soit une mutation, une sélection ou une migration

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13
Q

Qu’est ce qu’il se passe lorsque j’ai une population panmictique?

A

Les individus se reproduisent

par l’union au hasard

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14
Q

Qu’est ce qui peut mener à une variation phénotypique?

A
  • Variation morphologiqie
  • Variation quantitative
  • Polymorphisme chromosomique
  • Polymorphisme immunitaire
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15
Q

Qu’est ce qui est impliqué dans une variation moléculaire?

A
  • Polymorphisme de séquences en a.a

- Polymorphismes dans l’ADN comme des microsatellites, des SNPs, haplotypes mitochondriaux et haplotypes chromosomiques

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16
Q

Quelles sont les sources de variation dans une population?

A
  • Reproduction sexuée
  • Recombinaison
  • Migration
  • Mutation
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17
Q

Qu’est ce que le taux de mutation?

A

Probabilité qu’un allèle
change vers un autre
allèle en une génération

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18
Q

Vrai ou Faux: Le taux de mutation est beaucoup plus élevé pour les microsatellites que pour les mutations
ponctuelles (SNP)

A

Vrai

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19
Q

Comment on estime le déséquilibre de liaison?

A

D = Pobservé - Pattendu

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20
Q

Comment on estime le déséquilibre de liaison pour un haplotype donné?

A 
D = Pab - PaPb
Pab= fréquence observée
PaPb= fréquence prédite par le calcul de probabilité
21
Q

Vrai ou Faux: Au fil des générations, le déséquilibre de liaison va augmenter en
fonction de la fréquence de recombinaison « r ».

A

Faux, il va diminuer!

22
Q

Qu’est ce que ça veut dire lorsque l’on a une valeur de r qui est de 0.5?

A

Le fréquence du nouvel allèle décroit de moitié à chaque génération

23
Q

Vrai ou Faux: + r est petit,, + D décroît lentement.

A

Vrai

24
Q

Vrai ou Faux: Les allèles localisés sur le même
chromosome vont atteindre l’équilibre de
liaison plus lentement; en fonction de la
fréquence de crossing-over

A

Vrai

25
Q

Vrai ou Faux: + les allèles sont proches, + ils sont en équilibre pendant longtemps.

A

Faux, + les allèles sont proches + ils sont en déséquilibre + longtemps dans la population

26
Q

Comment calcule-t-on la variation causée par la migration ou le flux génique?

A

q1 = qo (1-m) +qmm
où:
qo: fréquence allélique dans la population d’accueil
qm: fréquence allélique dans la population donneuse
m: proportion d’immigrants dans la
population d’accueil = taux de migration

27
Q

Qu’est ce qui arrive lorsque l’on a un taux de migration constant?

A

Toutes les populations vont tendre à une même fréquence allélique, malgré les différences initiales. Il y a une uniformisation de la fréquence allélique et génotypique dans la population

28
Q

Quels sont les facteurs qui influence le déséquilibre dans les populations?

A
  • Assortiment positif
  • Assortiment négatif
  • Isolement par la distance
  • Consanguinité
  • Sélection
29
Q

Qu’est ce que l’assortiment positif?

A

Les individus se reproduisent préférentiellement en fonction de leur similitude
phénotypique

30
Q

Qu’est ce que l’assortiment négatif?

A

Les individus dissemblables

s’accouplent préférentiellement

31
Q

Qu’est ce que l’assortiment positif et négatif favorisent?

A

+: favorise les homozygotes

-: favorise les hétérozygotes

32
Q

Donner un exemple d’assortiment positif/homogamie?

A

Hippocampes!!!!!

33
Q

Quelle est la conséquence de l’assortiment positif?

A 
- Augmentation de la fréquence des
homozygotes au détriment des
hétérozygotes
- Change les fréquences génotypiques mais
non pas les fréquences alléliques
34
Q

Donner un exemple d’assortiment négatif.

A

Reproduction sexuée

35
Q

Quelles sont les conséquences génétiques de l’assortiment négatif?

A

augmentation des
hétérozygotes au détriment des homozygotes
(fréquence des hétérozygotes >2pq).
Maintien de la variabilité génétique dans la
population.

36
Q

L’isolement par la distance mène à quoi?

A
  • Formation de gradients de fréquences alléliques

- Déficit en hétérozygote par rapport à la loi de l’équilibre de Hardy-Weinberg

37
Q

Qu’est ce qu’une population consanguine?

A

Population dans laquelle

les unions entre individus apparentés se produisent plus fréquemment qu’elles n’auraient eu lieu par l’union au hasard

38
Q

Quels sont les conséquences de la consanguinité au niveau individuel?

A

La consanguinité augmente le risque que la progéniture soit homozygote pour
un allèle nocif

39
Q

Qu’est ce que le coefficient de consanguinité?

A

Probabilité que deux
allèles se retrouvent à l’état homozygote chez la progéniture (I) d’un couple consanguin (BC)
car ils proviennent d’un ancêtre commun (A)

40
Q

Comment calcule-t-on le coefficient de consanguinité?

A 
Fi = Σ 1/2n
n= nombre total d’individus
dans une chaîne de parenté
en excluant l’individu pour
lequel on calcule
le coefficient de consanguinité
41
Q

Comment calcule-t-on le coefficient de consanguinité lorsque l’ancêtre a aussi un coefficient de consanguinité?

A 
Fi = Σ (1/2n )(1+ Fa)
Fa= fréquence de consanguinité de l'ancêtre
42
Q

Quelle est la conséquence principale de l’endogamie?

A

Augmentation de la fréquence d’homozygotes accompagnée d’une

réduction de la fréquence des hétérozygotes.

43
Q

Quel est l’effet de la consanguinité sur les populations?

A

Augmentation de la stérilité ,mortalité infantile et diminution de la portée moyenne

44
Q

Qu’est ce que la sélection?

A

Taux différentiel de survie et de reproduction.

45
Q

Qu’est ce que la valeur adaptative ou fitness (W)?

A

Probabilité relative de survie et taux de reproduction d’un génotype

46
Q

Quel est le résultat de la sélection?

A

Changements dans les fréquences génotypiques et alléliques d’une population

47
Q

Quels sont les différents type de sélection possibles?

A
  • Sélection directionnelle positive
  • Sélection directionnelle négative
  • Sélection stabilisatrice
48
Q

Peut-on détecter la présence de sélection par séquençage?

A

Oui

49
Q

Quelle est l’utilité de l’équilibre entre une mutation et la sélection?

A

Persistance des maladies génétiques rares dans les populations

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