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Gènes Et Expression Flashcards

1
Q

4 classes principales des AN

A

ARNr
ARNt
ARNm
ARN non codants

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Q

De quoi résulte un nucléotide

A

Condensation d’un nucléoside avec un grpmt phosphate

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3
Q

Ose + base

A

Nucléoside

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4
Q

Nucléoside + phosphate

A

Nucléotide

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5
Q

Bases pyrimidiques

A

Cytosine
Uracile
Thymine

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6
Q

Bases puriques

A

Adénine guanine

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7
Q

Ou se trouve la 5 méthyl cytosine

A

ADN des plantes et animaux (sauf insectes)

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8
Q

Pourquoi peuvent etre utilisées les bases modifiées

A

Marquage (immunohistochimie)
Agents thérapeutiques

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9
Q

Deux formes tautomères des bases

A

Cétone et énol

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10
Q

Vers quelle forme tautomère est en faveur a ph 7

A

Cétone

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11
Q

Transformations chimiques des bases

A

Désamination
Radiations
Agents chimiques
Correction

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12
Q

Nucléoside de la cytosine

A

Cytidine

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13
Q

Suffixe pour les nucléosides

A

Osine pour les purines
Idine pour les pyrimidines

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14
Q

Qu’est ce qui confère le caractère instable aux ARn

A

Grpmnt OH du 2’ ribose

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15
Q

Orientation d’écriture des chaines

A

5 -> 3

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16
Q

Règle de chargaff

A

A =T
G = C
Concentrations

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17
Q

Nb de liaisons hydrogènes, appariement des bases

A

T-A : 2
G-C: 3

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18
Q

Conformation ADN la plus stable

A

B
Enroulement droit
3,4nm / tour
10 Pb / tour

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19
Q

Ou se trouvent les bA

A

Interieur
Hydrophobe

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20
Q

Deux autres conformations de l’hélice

A

A (droite, + compacte)
Z ( gauche, + étirée) en «zigzag»

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21
Q

Par quoi est assuré la stabilité de l’ADN

A

liaisons H
Intéractions hydrophobes/ élecrostatiques

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22
Q

Charges négatives de l’ADN

A

Égal au nb de charges négatives des nucléotides

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23
Q

Est ce que l’ADN est soluble

A

OUI

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24
Q

Comment on purifie l’ADN

A

Saturation saline, déshydratation alcoolique => précipitation

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25
Que fait la température sur l’ADn
Dénaturation Rupture des liaisons H
26
Que donne un refroidissement lent et un rapide
Réappariement des brins pour le lent et le rapide non
27
Qu’entraine la séparation des brins
Augmentation de l’absorption (effet hypechrome)
28
Calcul du Tm
Tm= (A+T)x2 + (G+C)x4
29
Forme des ADN viraux
Double brins et circulaires
30
Organisation de l’ADN des bactéries
1 chromosome double brin circulaire Plasmides
31
Organisation de l’ADN des eucaryotes
Plusieurs chromosomes Extrémitées protégées Histones Grande compaction
32
Sous quelle forme sont les ARN viraux
Linéaires et simple brin
33
Deux types de réplication de l’ARN viral
Raplication ARN Ou ADN (transcriptase inverse, intégration dans le génome de l’hote
34
Autres ARN fonctionnels (non codants)
SmRNA (maturation, épissage) snoRNA (maturation des ARNr)
35
Structure secondaires ARN
Boucles Tige
36
Durée moyenne du cycle C
30H
37
Durée de la phase S
8H
38
Composition du cycle C
Phase M Phase G1 Phase S Phase G2
39
Mode de réplication de l’ADN
Semi conservatif
40
Que sont les topoisomérses
Enzymes permettant le relachement de sur enroulement
41
Comment s’allonge le brin néo syhtétisé
De 5 vers 3
42
Les types d’ADN polymérases
I II III chez les bactéries a B y delta eta
43
Roles des ADN polymérases bactériens
I: réplication réparation II: réparation III: réplication
44
Roles des ADN polymérases humains
Alpha: réplication B: réparation Gamma: mitochondrie, réplication réparation Delta: réplication brin tardif, réparation Eta: réplication brin précoce, réparation
45
Conditions d’activation des ADN polymérases
Présence des 4 DNTP Présence d’ADN (ADN dépendant) Sel magnésium Amorce ADN ARN,
46
Quelle autre activité aditionnelle des ADN polymérases
Activité exonucléase 3’ 5’
47
A quoi sert l’activité exonucléase 3->5
Correction d’erreurs
48
Taux d’erreur de la polymérisation
1 pour 10^5 nucléotide
49
Taux d’erreur final
1 pour 10^9
50
Quelle esr la caractéristique des virus a ARN rétrovirus
ADN polymérase a activité transcriptase inverse ARN dépendante
51
Quels sont les protéines impliquées dans le réplication
Topoisomérase Clamp SSB DNA hélicase DNA primase
52
Quel est le role de l’ADN hélicase
Activité enzymatique de séparation et de déroulement (dénaturation locale) ATP dépendante
53
Structure de l’ADn hélicase
Anneau héxamérique
54
Roles de l’ADN primase
Synthèse d’amorces pour les ADN polymérases Associée a l’ADN polymérase a
55
Est ce que l’hélicase et la primase sont accroché
Oui
56
Sur quel brin progresse le complexe hélicase-primase
Brin tardif
57
Role de clamp
Associé a l’ADN polymérase, la maintient sur l’ADN
58
Mise en place de clamp
Deux moitiés + protéine d’assemblage Attachement de ADN polymérase et détachement de la protéine d’aasemblage
59
Qu’est ce que SSB
Single strand DNA binding proteins
60
Role de SSB
Se lie a l’ADN dénaturé Stabilise la conformation de simpkle brin déroulé Maintient allongé
61
Quel est le role de l’ADN ligase
Lier les brins d’ADN séparés ATP Agit sur brèche simple brin ou pour lier des ADN double brins
62
Quel enzyme synthétise les télomères
La télomérase
63
Molécules qui cible la réplication
Psoralène Intercalants Bléomycine Novobiocine Sarcomycine Analogues de nucléotides
64
Mécanismes de sauvegarde de l’ADN
Sysèmes de detoxification (CP450) Mécanismes de prévention (anti-oxydants, super oxyde, peroxydase….)
65
Def de xénobiotique
Substance présente dans un organisme mais qui lui est normalement étrangère
66
Différentes origines des lésions de l’ADN
Physiques Chimiques Métaboliques IntraC
67
Effet direct d’agent mutagène chimique (exemple)
Acide nitreux : C-> U A-> hypoxanthine 5méthyl cytosine -> thymine
68
Agents chimiques modifiants l’ADN
Réactifs alkylants Intercalants (bromure d’éthidium) Molécule produisant des pontages intra/ inter brins
69
Exemples de causes pathologiques
Désaminationz oxydatives Erreurs de réplication Fluctuation thermiques Dépurination Erreur de méthylation Stress oxydatif
70
Types de mécanismes de réparation
Immédiate Secondaire
71
Qu’est ce que la correction immédiate
Resynthèse du brin d’ADN
72
Réparations secondaires
Excisions de bases De nucléotides Correction des mésappariement Réparation des cassures
73
Quels sont les mécanismes de réparation immédiate
Exonucléase 3-5 Photolyase (NER chez l’humain) Réversion directe par des alkyltransferases Réversion de coupure simple brin par une adn ligase
74
Mécanismes de réparation secondaires
BER NER RH NHEJ MR
75
BER
Base excision repair Reconnaisance et excision de la base anormale par une ADN glycolase spécifique ADN polymérase B et ligase ajoute le nucléotide
76
NER
Nucléotide excision repair Courpure du brin anormal Séparation des brins (hélicase) Resynthèse: polymérase delta ou eta, ligase
77
Deux modes d’actions pour BER et NER
Mode géneral (indépendant de la présence de gènes Couplé a la transcription (gènes activements transcrits, + efficace)
78
MR
Mismatch repair Reconnait et répare les mésappariements Reconnait l’ADN néosynthétisé
79
HR
Recombinaisons homologues Avec l’ADN du chromosome homologue
80
NHEJ
Non homologue end joining Par liaison de 2 brins Perte de nucléotides Risque de mutations
81
É grands types de recombinaisons
Générale Spécifique de site
82
Recombinaison générale
Recombinaison méiotique (C germinales) Recombinaisons mitotiques (C somatiques) Entre séquences homologues de deuc chromatides
83
Recombinaisons méiotique
Crossing over

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