Final - cours 9 - Les compartiments cellulaires 3 Flashcards
que comprend le traffic vésiculaire
chargement d’une cargaison (site de bourgeonnement)
formation de vésicules à partir d’une membrane donneuse
fusion de ces vésicules avec une membrane cible
v ou f, le traffic vésiculaire est bidirectionnel
faux, a une direction
v ou f, il existe 2 types de vésicules
faux, trois, recouvertes par 3 protéines différentesn
nom des vésicules formées à partir du RER et qui sont acheminées vers le Golgi
COP-II
v ou f, Sar1 est activée dans le cytoplasme
faux, inactive
par quoi est activée Sar1
par GEF de la membrane, devient Sar-GTP - changement de conformation !
lorsque Sar-GDP devient Sar-GTP, ça permet le recrutement de ?
protéines Sec23/24
les protéines Sec23/24 lient quoi ?
Sar-GTP et un récepteur de cargaison
forment l’intérieur du manteau protéique des vésicules COP-II
protéines qui se lient par dessus Sec 23/24 pour former l’extérieur du manteau protéique de COP-II
Sec 13/31 - elles sont courbées et leur forme détermine le diamètre de la vésicule
une fois que COP-II ont bourgeonné du RER que doivent-elles faire
se fusionner à une membrane cible grâce à deux protéines utiles pour le ciblage
nom des deux protéines nécessaires pour le ciblage des vésicules COP-II
Rabs (GTPase de type Ras), SNAREs (protéines de fusion)
comment est-ce que Rab-GTP s’insère dans la membrane de COP-II
activation par un GEF membranaire situé sur la membrane donneuse de vésicule
où se trouve le récepteur de Rab-GTP
sur la membrane cible (acceptrice de la vésicule)
il y a environ 60 Rabs et leurs récepteurs spécifiques dans une cellule animale
que sont les SNAREs
protéines membranaires qui se trouvent sous forme de paires complémentaires
quelles sont les deux SNARES
v-SNARE (sur la membrane de la vésicule)
t-SNARE (dans la membrane cible)
qualifie la liaison entre les v/t-SNARE
vraiment forte
l’eau entre les deux membrane est expulsée, sans eau, les deux couches externes de chaque membrane fusionnent
que faut-il faire une fois que la vésicule a fusionné avec la membrane cible
dissocier la paire de SNAREs
il faut l’énergie de l’hydrolyse d’ATP pour les dissocier (NSF = ATPase)
les vésicules COP-II fusionnent avec quelle partie du golgi
cis-Golgi
v ou f, toutes les protéines passent du cis-Golgi, au médiane-Golgi puis au trans-Golgi
faux, après la fusion avec le cis-Golgi, cune partie des protéines retourne au RER via les vésicules COP-I
dans la région médiane-Golgi, les protéines subissent quoi
une maturation de leurs sucres
que se passe-t-il aux protéines dans le trans-Golgi
les protéines sont triées et emballées pour leur destination finale
endosome/lysosome (vésicules de clathrine)
membrane plasmique (vésicule COP-I)
v ou f, COP-I et COP-II utilisent les mêmes protéines de recouvrement
faux, protéines de recouvrement différentes p23/p24 : hétérooligomère
p23 : homooligomère
p24 : homooligomère
par quoi commence la formation de COP-I
activation de ARF1 (protéine GTPase de type RAS) à la place de Sar1
vésicules qui bourgeonnent continuellement à partir du Golgi
COP-I : transportent les protéines vers le RE, entre les différentes parties du Golgi lui-même ou vers la membrane plasmique
il y a recyclage grâce à la protéine activatrice ARF1 (ne prend pas de signal spécifique de la cellule)
dans le cis-Golgi, les manteaux COP-I se forment autour des protéines transmembranaires ayant quelle séquence en c-terminale
KKXX
nom des récepteurs qui font partie des protéinestransmembranaires ayant KKXX
KDEL
les COP-II retournent au RE
faux, les COP-I
on dit que le retour de lipides et de protéines KKXX/KDEL du cis-Golgi au RE est
constitutif (continuel)
* a besoin de Rab-snares appropriés
v ou f, le RE trie les protéines
faux, le cis-Golgi s’en occupe
nom du transport cis-Golgi au RE
transport rétrograde
explique les deux modèles qui expliquent le mécanisme de transport des protéines à travers les différentes citernes et vésicules du Golgi
modèle de transport de vésicules : citernes restent statiques, les protéines voyagent d’une citerne à une autre via les vésicules
modèle de maturation des citernes : maturation graduelle des citernes et des protéines qu’elles contiennent (antérograde). Le transport rétrograde se fait par vésicules
v ou f, le mélange des deux modèles de transport des protéines (Golgi) est impossible
faux, possible
rôle de la matrice extragolgienne
responsable de l’intégrité structurale du Golgi, aide au transport et positionne le golgi dans la cellule
nom des protéines de la matrice extra golgiennes
golgines - associées aux membranes du Golgi, du côté cytoplasmique
décris les golgines
ces protéines s’allongent et forment un filet qui exclut la majorité des organites, même les ribosomes
super hélice retrouvée chez tous les eucaryotes
différents types d’attaches pour les membranes et le cytosquelette
les golgines s’insèrent dans la membrane du golgi via quoi
C-terminal
extrémité des golgines qui peut se retrouver plus loin dans le cytoplasme (100-600nm)
N-terminal
la structure de la super hélice des golgines est continue v ou f
faux, peut être interrompue à certains endroits pour permettre plus de flexibilité
les différents types de golgines peuvent lier des protéines d’identité…
vésiculaires (Rab, Arf…)
où sont recrutées les golgines
à des citernes spécifiques
comment est-ce que les golgines réussisent à avoir leur vésicules spécifiques
elles les pêchent dans le cytoplasme
pour étudier la spécificité des golgines, quel organite avons-nous utilisé et pourquoi
un type de golgine à la fois est exprimé sur la mitochondrie pour trouver quelle golgine se lie à quelle vésicule. On a choisi la mitochondrie, car habituellement elle ne se lie à aucune vésicule.
l’attachement d’une vésicule ou d’une citerne à la golgine peut mener à deux choses… lesquelles
fusion membranaire (certaines golgines interagissent avec les SNAREs)
stabilisation de la matrice externe du golgi (empilement des citernes)
les protéines arrivent au golgi ayant une glycosylation fournie par le RER : toutes ont la même unité préformée liée aux Asns (Ser-Thr-X-Asn) composée de N-acétylglucosamine et de mannose… Différentes enzymes golgiennes travaillent sur cette unité de quelle façon
séquentielle… afin de former une unité de sucre différente
produit de la 1re enzyme = substrat de la 2e enzyme
on a deux sortes d’oligosaccharides au niveau du golgi… lesquels
complexes
riches en manose (Mannosidase I)
technique utilisée pour localiser l’enzyme mannosidase I (ManI)
tomographie immunoélectronique : anticorps couplés aux particules d’or (observables en MET), puis modélisation de l’appareil de golgi en 3D (tomographie)
maturation des sucres (arrivée au golgi) : le ciblage
moyen de signaler le lieu d’appartenance de la protéine lors du tri dans le trans-Golgi
maturation des sucres (arrivée au golgi) : aide au repliement en milieu aqueux donc la maturation des sucres augmente la…
solubilité
maturation des sucres (arrivée au golgi) : couche protectrice
résistance aux protéases, ce qui est très utile pour les constituants du lysosome
maturation des sucres (arrivée au golgi) : adhérence
intercellulaire et au substrat
maturation des sucres (arrivée au golgi) : signalisation intercellulaire, nomme deux exemples
antigènes et globules blancs
en plus de protéines, le golgi participe dans la production de
glycolipides
v ou f, les groupes sanguins O et B, ne possèdent pas de N-acétylgalactosamine
vrai, ils possèdent fucose, galactose et N-acétylglucosamine
v ou f, le groupe sanguin AB est une combinaison des sucres du groupe A et B
vrai
voyage des protéines à partir du trans golgi, deux possibilités
vers la membrane plasmique : vésicules COP-I (ont des Rabs et SNAREs appropriés). Les protéines cargo sont ciblées par un sucre complexe
vers les endosomes-lysosomes : vésicules de clathrine (ont des Rabs et SNAREs appropriés) les protéines cargo sont ciblées par un sucre riche en mannose phosphaté
les protéines cargo vers la membrane plasmique sont ciblées par un sucre riche en mannose phosphaté. v ou f
faux, sucre complexe
il est possible de concentrer les protéines cargo des vésicules ayant quitté le trans-Golgi en une seule vésicule, comment est-ce que cela s’appelle
retrait de membranes (à partir de la vésicule nouvellement formée)
lorsque le retrait de membranes est effectuées, que se passe-t-il avec elles et de quoi sont-elles faites
les membranes récupérées, faites de clathrine retournent au Golgi - recyclage
deux voies qui existent pour les vésicules sécrétoires à partir du golgi
voies constitutives et voies contrôlées
comment fonctionnent la voie contrôlée pour les vésicules sécrétoires
les protéines sont emmagasinées dans des vésicules qui attendent un signal avant de fusionner à la membrane plasmique
v ou f, les voies constitutives des vésicules sécrétoires nécessitent un signal
faux, seulement les voies contrôlées
l’insuline est un exemple de vésicule sécrétoire de la voie constitutive ou contrôlée
contrôlée (permet à GLUT4 d’aller fusionner avec la membrane, de laisser entrer le glucose)
v ou f, les mastocytes réagissent par voie contrôlée
vrai, en cas d’allergie relâchent de l’histamine
chez les vertébrés, le Golgi est adjacent à quoi
MTOC - il s’attache aux microtubules et au MTOC directement
à quoi s’attache le golgi pour se déplacer
dynéine
protéine importante qui participe au positionnement du golgi
golgines
chez les plantes et les mycètes, le golgi se positionne et se déplace grâce à l’interaction de
sa matrice (extra-golgienne) avec l’actine F et la myosine
nom du modèle qui explique le positionnement et le déplacement du golgi chez les plantes et les mycètes
modèle du Dock, Pluck and Go (accroche, cueille et part)
le golgi et la mitose
durant la mitose, la phosphorylation des protéines de la matriceExG ( et donc les golgines) bloque la voie de sécrétion et défait les citernes en petites vésicules
golgi = distribué par petits paquets de façon égale entre les cellules filles
distribution se fait à l’aide du fuseau mitotique et les dynéines
golgi et l’apoptose
voie de sécrétion = bloquée. Le golgi est fragmenté de façon similaire à la mitose, mais c’est irréversible.
pourquoi est-ce que la fragmentation de l’apoptose est irréversible
les enzymes protéolytiques, les caspases, détachent et dégradent les protéines de la MEG
site intracellulaire de digestion
lysosome (compartiment acide)
précurseurs des lysosomes
endosomes
comment former des lysosomes
vésicules de clathrine partent du Golgi (contiennent des hydrolases acides) ou de la membrane plasmique
les vésicules sont acheminés vers des compartiments intermédiaires appelés endosomes
l’endosome est de plus en plus acide (activité de la pompe ATPase de type V) : accumule les hydrolases acides - fusion avec les vésicules contenant les enzymes
se transforme en lysosome
les protéines destinées au lysosome/endosome sont étiquetées dans le Golgi avec
un mannose-6-phosphate (M6P)
il faut atteindre quel pH pour parler de lysosome
5
le noyau est plus acide ou basique
basique (les histones ont plusieurs aa basiques. pH du noyau est plus grand que celui du cytoplasme de 0,2-0,5)
les protéines destinées aux lysosomes/endosomes sont étiquetées dans le Golgi avec un mannose-6-phosphate. Ce dernier est synthétisé par deux réactions en série, lesquelles
phosphotransférase lie la région signal de la future protéine lysosomale et transfère un (N-acétylglycosamine phosphaté : GlcNac-P) sur un mannose
une hydrolase enleve le GlcNac et ne garde que le phosphate
comment se forment les vésicules de clathrine
elles se forment autour de leur cargaison grâce aux adaptines. Elles lient le récepteur membranaire du M6P d’un côté, puis la clathrine de l’autre
comment se nomme une unité de clathrine et de quoi est-elle composée
triskèle, composé de 3 grosses protéines (chaines lourdes) et 3 petites (chaines légères)
à quoi ressemble la vésicule finale de clathrine
panier d’osier (à cause du chevauchemet des triskèles)
le lysosome est formé à partir de quelle partie du golgi
trans
nécessaire pour détacher la vésicule de la membrane donneuse (formation du lysosome), protéine se tord grâce à l’énergie libérée par l’hydrolyse du GTP
dynamine (GTPase)
les vésicules (formation du lysosome à partir du trans-golgi) perdent quoi… cela permet quoi
elles perdent leur manteau de clathrine (pour fusionner avec d’autres membranes) - permet de recycler la clathrine et d’exposer les Rabs et SNAREs
v ou f, le manteau des COP est plus épais que celui de clathrine
faux, celui de clathrine est plus épais
transport des hydrolases acides et du récepteur de M6P
transport des hydrolases acides = unidirectionnel
récepteur de M6P ne fonctionne pas au pH acide, récepteur = recyclé vers le Golgi - une phosphatase acide enlève le P de M6P dans le lysosome permet détachement cargaison-récepteur puisque la cargaison perd le signa reconnu par le récepteur)
station qui reçoit les vésicules de clathrine du Golgi et de la membrane plasmique
endosome
que font les endosomes
le tri des molécules qu’ils reçoivent à partir des molécules de clathrine
recyclent les récpeteurs (les retournent soit vers le Golgi ou la membrane plasmique) avant que la digestion ne commence
deux mécanismes d’endocytose des vésicules en provenance de la membrane plasmique (endosome)
pinocytose : ingestion de molécules solubles dans la MEC, utilise les puits recouverts comme intermédiaires dans la formation des vésicules de clathrine
endocytose par récepteurs : profite de la pinocytose grâce à l’utilisation des adaptines
l’endocytose se déroule à la membrane plasmique ou dans l’endosome
membrane plasmique
explique comment on fait entrer le LDL dans une cellule ayant besoin de cholestérol (endocytose par récepteur)
LDL se lie aux récepteurs LDL (membrane plasmique)
on a la clathrine du côté cytoplasmique
formation d’un puit
vésicule de clathrine
on se débarasse de la clathrine
plusieurs vésicules avec des récepteurs LDL fusionnent ensemble
on a un endosome précoce - détachement de la cargaison grâce au pH - TRI
retour/recyclage des récepteurs vers la membrane plasmique par des endosomes de recyclage
partie protéique du LDL = dégradée par lysosomes et partie cholestérol = libérée par le lysosome
les adaptines sont des liens entre
récepteurs et clathrine
type d’endocytose qui nécessite la formation de pseudopodes
phagocytose
formation des pseudopodes
cellule se contracte (actine et myosine) d’un côté, cytoplasme = projeté de l’autre côté, les filaments d’actine forment un filet rigide, donne une direction au mouvement du cytoplasme projeté
différence entre phagocytose et endocytose
phagocytose : taille de ce que la cellule va faire rentrer = supérieur de 0,5 microns (phagosome)
v ou f, toutes les cellules peuvent faire de la phagocytose
faux
permet de dégrader quelque chose dans la cellule - formation d’un autophagosome
autophagie
v ou f, il y a des lysosomes chez les plantes
faux
v ou f, il n’y a pas de phagocytose chez les plantes
vrai
qu’est-ce qui prend la place des lysosomes chez les plantes
vacuole
v ou f, il n’y a pas d’endocytose chez les plantes
faux
v ou f, il y a un endosome précoce chez plantes pour le tri
vrai
v ou f, il y a un endosome de recyclage chez les plantes
vrai
v ou f, les vacuoles peuvent stocker des protéines chez les légumineuses et même détoxifier
vrai
v ou f, le cytoplasme grandit en même temps que la vacuole
faux, seulement la vacuole
si la protéine n’a pas besoin de passer par le RE, on appelle ça quelle incorporation
incorporation post traductionnelle
si la protéine passe par le RE, c’est quel type d’incorporation
co-traductionnelle
