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BIO 1157 > Final - cours 9 - Les compartiments cellulaires 3 > Flashcards

Final - cours 9 - Les compartiments cellulaires 3 Flashcards

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1
Q

que comprend le traffic vésiculaire

A

chargement d’une cargaison (site de bourgeonnement)
formation de vésicules à partir d’une membrane donneuse
fusion de ces vésicules avec une membrane cible

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Q

v ou f, le traffic vésiculaire est bidirectionnel

A

faux, a une direction

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3
Q

v ou f, il existe 2 types de vésicules

A

faux, trois, recouvertes par 3 protéines différentesn

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4
Q

nom des vésicules formées à partir du RER et qui sont acheminées vers le Golgi

A

COP-II

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5
Q

v ou f, Sar1 est activée dans le cytoplasme

A

faux, inactive

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6
Q

par quoi est activée Sar1

A

par GEF de la membrane, devient Sar-GTP - changement de conformation !

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7
Q

lorsque Sar-GDP devient Sar-GTP, ça permet le recrutement de ?

A

protéines Sec23/24

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8
Q

les protéines Sec23/24 lient quoi ?

A

Sar-GTP et un récepteur de cargaison
forment l’intérieur du manteau protéique des vésicules COP-II

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9
Q

protéines qui se lient par dessus Sec 23/24 pour former l’extérieur du manteau protéique de COP-II

A

Sec 13/31 - elles sont courbées et leur forme détermine le diamètre de la vésicule

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10
Q

une fois que COP-II ont bourgeonné du RER que doivent-elles faire

A

se fusionner à une membrane cible grâce à deux protéines utiles pour le ciblage

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11
Q

nom des deux protéines nécessaires pour le ciblage des vésicules COP-II

A

Rabs (GTPase de type Ras), SNAREs (protéines de fusion)

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12
Q

comment est-ce que Rab-GTP s’insère dans la membrane de COP-II

A

activation par un GEF membranaire situé sur la membrane donneuse de vésicule

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13
Q

où se trouve le récepteur de Rab-GTP

A

sur la membrane cible (acceptrice de la vésicule)

il y a environ 60 Rabs et leurs récepteurs spécifiques dans une cellule animale

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14
Q

que sont les SNAREs

A

protéines membranaires qui se trouvent sous forme de paires complémentaires

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15
Q

quelles sont les deux SNARES

A

v-SNARE (sur la membrane de la vésicule)
t-SNARE (dans la membrane cible)

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16
Q

qualifie la liaison entre les v/t-SNARE

A

vraiment forte
l’eau entre les deux membrane est expulsée, sans eau, les deux couches externes de chaque membrane fusionnent

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17
Q

que faut-il faire une fois que la vésicule a fusionné avec la membrane cible

A

dissocier la paire de SNAREs

il faut l’énergie de l’hydrolyse d’ATP pour les dissocier (NSF = ATPase)

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18
Q

les vésicules COP-II fusionnent avec quelle partie du golgi

A

cis-Golgi

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19
Q

v ou f, toutes les protéines passent du cis-Golgi, au médiane-Golgi puis au trans-Golgi

A

faux, après la fusion avec le cis-Golgi, cune partie des protéines retourne au RER via les vésicules COP-I

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20
Q

dans la région médiane-Golgi, les protéines subissent quoi

A

une maturation de leurs sucres

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21
Q

que se passe-t-il aux protéines dans le trans-Golgi

A

les protéines sont triées et emballées pour leur destination finale

endosome/lysosome (vésicules de clathrine)
membrane plasmique (vésicule COP-I)

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22
Q

v ou f, COP-I et COP-II utilisent les mêmes protéines de recouvrement

A

faux, protéines de recouvrement différentes p23/p24 : hétérooligomère
p23 : homooligomère
p24 : homooligomère

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23
Q

par quoi commence la formation de COP-I

A

activation de ARF1 (protéine GTPase de type RAS) à la place de Sar1

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24
Q

vésicules qui bourgeonnent continuellement à partir du Golgi

A

COP-I : transportent les protéines vers le RE, entre les différentes parties du Golgi lui-même ou vers la membrane plasmique

il y a recyclage grâce à la protéine activatrice ARF1 (ne prend pas de signal spécifique de la cellule)

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25
Q

dans le cis-Golgi, les manteaux COP-I se forment autour des protéines transmembranaires ayant quelle séquence en c-terminale

A

KKXX

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26
Q

nom des récepteurs qui font partie des protéinestransmembranaires ayant KKXX

A

KDEL

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27
Q

les COP-II retournent au RE

A

faux, les COP-I

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28
Q

on dit que le retour de lipides et de protéines KKXX/KDEL du cis-Golgi au RE est

A

constitutif (continuel)
* a besoin de Rab-snares appropriés

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29
Q

v ou f, le RE trie les protéines

A

faux, le cis-Golgi s’en occupe

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30
Q

nom du transport cis-Golgi au RE

A

transport rétrograde

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31
Q

explique les deux modèles qui expliquent le mécanisme de transport des protéines à travers les différentes citernes et vésicules du Golgi

A

modèle de transport de vésicules : citernes restent statiques, les protéines voyagent d’une citerne à une autre via les vésicules

modèle de maturation des citernes : maturation graduelle des citernes et des protéines qu’elles contiennent (antérograde). Le transport rétrograde se fait par vésicules

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32
Q

v ou f, le mélange des deux modèles de transport des protéines (Golgi) est impossible

A

faux, possible

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33
Q

rôle de la matrice extragolgienne

A

responsable de l’intégrité structurale du Golgi, aide au transport et positionne le golgi dans la cellule

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34
Q

nom des protéines de la matrice extra golgiennes

A

golgines - associées aux membranes du Golgi, du côté cytoplasmique

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35
Q

décris les golgines

A

ces protéines s’allongent et forment un filet qui exclut la majorité des organites, même les ribosomes

super hélice retrouvée chez tous les eucaryotes

différents types d’attaches pour les membranes et le cytosquelette

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36
Q

les golgines s’insèrent dans la membrane du golgi via quoi

A

C-terminal

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37
Q

extrémité des golgines qui peut se retrouver plus loin dans le cytoplasme (100-600nm)

A

N-terminal

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38
Q

la structure de la super hélice des golgines est continue v ou f

A

faux, peut être interrompue à certains endroits pour permettre plus de flexibilité

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39
Q

les différents types de golgines peuvent lier des protéines d’identité…

A

vésiculaires (Rab, Arf…)

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40
Q

où sont recrutées les golgines

A

à des citernes spécifiques

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41
Q

comment est-ce que les golgines réussisent à avoir leur vésicules spécifiques

A

elles les pêchent dans le cytoplasme

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42
Q

pour étudier la spécificité des golgines, quel organite avons-nous utilisé et pourquoi

A

un type de golgine à la fois est exprimé sur la mitochondrie pour trouver quelle golgine se lie à quelle vésicule. On a choisi la mitochondrie, car habituellement elle ne se lie à aucune vésicule.

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43
Q

l’attachement d’une vésicule ou d’une citerne à la golgine peut mener à deux choses… lesquelles

A

fusion membranaire (certaines golgines interagissent avec les SNAREs)
stabilisation de la matrice externe du golgi (empilement des citernes)

44
Q

les protéines arrivent au golgi ayant une glycosylation fournie par le RER : toutes ont la même unité préformée liée aux Asns (Ser-Thr-X-Asn) composée de N-acétylglucosamine et de mannose… Différentes enzymes golgiennes travaillent sur cette unité de quelle façon

A

séquentielle… afin de former une unité de sucre différente

produit de la 1re enzyme = substrat de la 2e enzyme

45
Q

on a deux sortes d’oligosaccharides au niveau du golgi… lesquels

A

complexes
riches en manose (Mannosidase I)

46
Q

technique utilisée pour localiser l’enzyme mannosidase I (ManI)

A

tomographie immunoélectronique : anticorps couplés aux particules d’or (observables en MET), puis modélisation de l’appareil de golgi en 3D (tomographie)

47
Q

maturation des sucres (arrivée au golgi) : le ciblage

A

moyen de signaler le lieu d’appartenance de la protéine lors du tri dans le trans-Golgi

48
Q

maturation des sucres (arrivée au golgi) : aide au repliement en milieu aqueux donc la maturation des sucres augmente la…

A

solubilité

49
Q

maturation des sucres (arrivée au golgi) : couche protectrice

A

résistance aux protéases, ce qui est très utile pour les constituants du lysosome

50
Q

maturation des sucres (arrivée au golgi) : adhérence

A

intercellulaire et au substrat

51
Q

maturation des sucres (arrivée au golgi) : signalisation intercellulaire, nomme deux exemples

A

antigènes et globules blancs

52
Q

en plus de protéines, le golgi participe dans la production de

A

glycolipides

53
Q

v ou f, les groupes sanguins O et B, ne possèdent pas de N-acétylgalactosamine

A

vrai, ils possèdent fucose, galactose et N-acétylglucosamine

54
Q

v ou f, le groupe sanguin AB est une combinaison des sucres du groupe A et B

A

vrai

55
Q

voyage des protéines à partir du trans golgi, deux possibilités

A

vers la membrane plasmique : vésicules COP-I (ont des Rabs et SNAREs appropriés). Les protéines cargo sont ciblées par un sucre complexe

vers les endosomes-lysosomes : vésicules de clathrine (ont des Rabs et SNAREs appropriés) les protéines cargo sont ciblées par un sucre riche en mannose phosphaté

56
Q

les protéines cargo vers la membrane plasmique sont ciblées par un sucre riche en mannose phosphaté. v ou f

A

faux, sucre complexe

57
Q

il est possible de concentrer les protéines cargo des vésicules ayant quitté le trans-Golgi en une seule vésicule, comment est-ce que cela s’appelle

A

retrait de membranes (à partir de la vésicule nouvellement formée)

58
Q

lorsque le retrait de membranes est effectuées, que se passe-t-il avec elles et de quoi sont-elles faites

A

les membranes récupérées, faites de clathrine retournent au Golgi - recyclage

59
Q

deux voies qui existent pour les vésicules sécrétoires à partir du golgi

A

voies constitutives et voies contrôlées

60
Q

comment fonctionnent la voie contrôlée pour les vésicules sécrétoires

A

les protéines sont emmagasinées dans des vésicules qui attendent un signal avant de fusionner à la membrane plasmique

61
Q

v ou f, les voies constitutives des vésicules sécrétoires nécessitent un signal

A

faux, seulement les voies contrôlées

62
Q

l’insuline est un exemple de vésicule sécrétoire de la voie constitutive ou contrôlée

A

contrôlée (permet à GLUT4 d’aller fusionner avec la membrane, de laisser entrer le glucose)

63
Q

v ou f, les mastocytes réagissent par voie contrôlée

A

vrai, en cas d’allergie relâchent de l’histamine

64
Q

chez les vertébrés, le Golgi est adjacent à quoi

A

MTOC - il s’attache aux microtubules et au MTOC directement

65
Q

à quoi s’attache le golgi pour se déplacer

A

dynéine

66
Q

protéine importante qui participe au positionnement du golgi

A

golgines

67
Q

chez les plantes et les mycètes, le golgi se positionne et se déplace grâce à l’interaction de

A

sa matrice (extra-golgienne) avec l’actine F et la myosine

68
Q

nom du modèle qui explique le positionnement et le déplacement du golgi chez les plantes et les mycètes

A

modèle du Dock, Pluck and Go (accroche, cueille et part)

69
Q

le golgi et la mitose

A

durant la mitose, la phosphorylation des protéines de la matriceExG ( et donc les golgines) bloque la voie de sécrétion et défait les citernes en petites vésicules

golgi = distribué par petits paquets de façon égale entre les cellules filles

distribution se fait à l’aide du fuseau mitotique et les dynéines

70
Q

golgi et l’apoptose

A

voie de sécrétion = bloquée. Le golgi est fragmenté de façon similaire à la mitose, mais c’est irréversible.

71
Q

pourquoi est-ce que la fragmentation de l’apoptose est irréversible

A

les enzymes protéolytiques, les caspases, détachent et dégradent les protéines de la MEG

72
Q

site intracellulaire de digestion

A

lysosome (compartiment acide)

73
Q

précurseurs des lysosomes

A

endosomes

74
Q

comment former des lysosomes

A

vésicules de clathrine partent du Golgi (contiennent des hydrolases acides) ou de la membrane plasmique

les vésicules sont acheminés vers des compartiments intermédiaires appelés endosomes

l’endosome est de plus en plus acide (activité de la pompe ATPase de type V) : accumule les hydrolases acides - fusion avec les vésicules contenant les enzymes

se transforme en lysosome

75
Q

les protéines destinées au lysosome/endosome sont étiquetées dans le Golgi avec

A

un mannose-6-phosphate (M6P)

76
Q

il faut atteindre quel pH pour parler de lysosome

A

5

77
Q

le noyau est plus acide ou basique

A

basique (les histones ont plusieurs aa basiques. pH du noyau est plus grand que celui du cytoplasme de 0,2-0,5)

78
Q

les protéines destinées aux lysosomes/endosomes sont étiquetées dans le Golgi avec un mannose-6-phosphate. Ce dernier est synthétisé par deux réactions en série, lesquelles

A

phosphotransférase lie la région signal de la future protéine lysosomale et transfère un (N-acétylglycosamine phosphaté : GlcNac-P) sur un mannose

une hydrolase enleve le GlcNac et ne garde que le phosphate

79
Q

comment se forment les vésicules de clathrine

A

elles se forment autour de leur cargaison grâce aux adaptines. Elles lient le récepteur membranaire du M6P d’un côté, puis la clathrine de l’autre

80
Q

comment se nomme une unité de clathrine et de quoi est-elle composée

A

triskèle, composé de 3 grosses protéines (chaines lourdes) et 3 petites (chaines légères)

81
Q

à quoi ressemble la vésicule finale de clathrine

A

panier d’osier (à cause du chevauchemet des triskèles)

82
Q

le lysosome est formé à partir de quelle partie du golgi

A

trans

83
Q

nécessaire pour détacher la vésicule de la membrane donneuse (formation du lysosome), protéine se tord grâce à l’énergie libérée par l’hydrolyse du GTP

A

dynamine (GTPase)

84
Q

les vésicules (formation du lysosome à partir du trans-golgi) perdent quoi… cela permet quoi

A

elles perdent leur manteau de clathrine (pour fusionner avec d’autres membranes) - permet de recycler la clathrine et d’exposer les Rabs et SNAREs

85
Q

v ou f, le manteau des COP est plus épais que celui de clathrine

A

faux, celui de clathrine est plus épais

86
Q

transport des hydrolases acides et du récepteur de M6P

A

transport des hydrolases acides = unidirectionnel

récepteur de M6P ne fonctionne pas au pH acide, récepteur = recyclé vers le Golgi - une phosphatase acide enlève le P de M6P dans le lysosome permet détachement cargaison-récepteur puisque la cargaison perd le signa reconnu par le récepteur)

87
Q

station qui reçoit les vésicules de clathrine du Golgi et de la membrane plasmique

A

endosome

88
Q

que font les endosomes

A

le tri des molécules qu’ils reçoivent à partir des molécules de clathrine

recyclent les récpeteurs (les retournent soit vers le Golgi ou la membrane plasmique) avant que la digestion ne commence

89
Q

deux mécanismes d’endocytose des vésicules en provenance de la membrane plasmique (endosome)

A

pinocytose : ingestion de molécules solubles dans la MEC, utilise les puits recouverts comme intermédiaires dans la formation des vésicules de clathrine

endocytose par récepteurs : profite de la pinocytose grâce à l’utilisation des adaptines

90
Q

l’endocytose se déroule à la membrane plasmique ou dans l’endosome

A

membrane plasmique

91
Q

explique comment on fait entrer le LDL dans une cellule ayant besoin de cholestérol (endocytose par récepteur)

A

LDL se lie aux récepteurs LDL (membrane plasmique)

on a la clathrine du côté cytoplasmique

formation d’un puit

vésicule de clathrine

on se débarasse de la clathrine

plusieurs vésicules avec des récepteurs LDL fusionnent ensemble

on a un endosome précoce - détachement de la cargaison grâce au pH - TRI

retour/recyclage des récepteurs vers la membrane plasmique par des endosomes de recyclage

partie protéique du LDL = dégradée par lysosomes et partie cholestérol = libérée par le lysosome

92
Q

les adaptines sont des liens entre

A

récepteurs et clathrine

93
Q

type d’endocytose qui nécessite la formation de pseudopodes

A

phagocytose

94
Q

formation des pseudopodes

A

cellule se contracte (actine et myosine) d’un côté, cytoplasme = projeté de l’autre côté, les filaments d’actine forment un filet rigide, donne une direction au mouvement du cytoplasme projeté

95
Q

différence entre phagocytose et endocytose

A

phagocytose : taille de ce que la cellule va faire rentrer = supérieur de 0,5 microns (phagosome)

96
Q

v ou f, toutes les cellules peuvent faire de la phagocytose

A

faux

97
Q

permet de dégrader quelque chose dans la cellule - formation d’un autophagosome

A

autophagie

98
Q

v ou f, il y a des lysosomes chez les plantes

A

faux

99
Q

v ou f, il n’y a pas de phagocytose chez les plantes

A

vrai

100
Q

qu’est-ce qui prend la place des lysosomes chez les plantes

A

vacuole

101
Q

v ou f, il n’y a pas d’endocytose chez les plantes

A

faux

102
Q

v ou f, il y a un endosome précoce chez plantes pour le tri

A

vrai

103
Q

v ou f, il y a un endosome de recyclage chez les plantes

A

vrai

104
Q

v ou f, les vacuoles peuvent stocker des protéines chez les légumineuses et même détoxifier

A

vrai

105
Q

v ou f, le cytoplasme grandit en même temps que la vacuole

A

faux, seulement la vacuole

106
Q

si la protéine n’a pas besoin de passer par le RE, on appelle ça quelle incorporation

A

incorporation post traductionnelle

107
Q

si la protéine passe par le RE, c’est quel type d’incorporation

A

co-traductionnelle

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