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BIO 1157 > Final - Cours 7 - Les compartiments cellulaires > Flashcards

Final - Cours 7 - Les compartiments cellulaires Flashcards

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1
Q

comment sont délimités les différents compartiments de la cellule eucaryote

A

des membranes

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Q

où débute la synthèse protéique (traduction)

A

cytoplasme

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Q

v ou f, les protéines travaillent toutes dans le cytoplasme puisque c’est là où elles sont produites

A

faux, suite à la traduction, elles doivent trouver leur chemin vers leur lieu de travail

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4
Q

4 façons pour les protéines de trouver leur lieu de travail suite à leur synthèse dans le cytoplasme

A

pore : gros complexe protéique (CPN)
une membrane : RER, peroxysome
deux membranes : mitochondrie et chloroplaste
sortir de la cellule (voie de sécrétion)

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Q

3 choses qu’il faut pour organiser les protéines dans la cellule

A

énergie (transport actif)
étiquette (peptide signal et parfois sucre)
destination (récepteur)

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6
Q

les organites diffèrent en quoi

A

nombre de membranes qui les entourent

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7
Q

le nombre de membranes qui entourent les organites impacte quoi

A

le type de mécanisme de passage des protéines vers ces organites

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8
Q

composition de l’enveloppe nucléaire

A

deux membranes (interne et externe) + espace intermembranaire

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9
Q

l’espace intermembranaire de l’enveloppe nucléaire est en continuité avec quoi

A

lumière RER

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10
Q

que permettent les pores nucléaires

A

continuité entre nucléoplasme (intérieur du noyau) et le cytoplasme

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11
Q

v ou f, toutes les protéines peuvent passer par les pores nucléaires

A

faux, seulement les protéines autorisées (sous certaines conditions)

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12
Q

hypothèse sur la formation du noyau - même hypothèse qui donne naissance au RE

A

invagination de la membrane plasmique

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13
Q

composé de nombreuses protéines appelées nucléoporines qui forment des structures poreuses dans la membrane nucléaire.

A

complexe du pore nucléaire

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14
Q

décris le transport nucléaire à travers les pores nucléaires

A

bidirectionnel

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15
Q

qu’est-ce qui peut faire varier la taille de l’ouverture des pores nucléaires

A

centre protéique

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16
Q

décris les différents modes de transport des protéines en fonction de leur diamètre par les pores nucléaires

A

petites protéines (9nm de diamètre et moins) passent par le pore par diffusion simple

grosses molécules 9-40nm (grosses protéines et sous-unités ribosomales) peuvent passer par le pore, mais nécessitent de l’énergie (transport actif) pour agrandir d’avantage l’ouverture du pore

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17
Q

nécessaire pour entrer dans le noyau par transport actif

A

signal de localisation nucléaire (SLN)

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18
Q

décris le SLN

A

petit peptide caractérisé par une forte charge positive située quelque part dans la protéine (KKKRK : lys,lys,lys,arg,lys)

19
Q

nécessaire pour sortir du noyau

A

Signal d’exportation nucléaire (SEN)

20
Q

décris le SEN

A

hélice alpha amphiphile comportant plusieurs résidus leucine sur sa partie hydrophobe (ex. LXLXXLXL)

21
Q

Récepteurs de signaux nucléaires

A

karyophérines - lient de SLN (karyophérines importines) ou le SEN (karyophérine exportines)

22
Q

rôle des karyophérines

A

récepteurs de signaux nucléaires
se lient au SLN ou au SEN
transportent les protéines à travers le pore nucléaire

23
Q

deux sites de liaisons de la karyophérine

A

un pour le signal (SEN ou SLN)

un pour la Ran-GTP (GTPase monomérique de la famille Ras : protéines G impliquées dans la régulation de nombreuses voies de signalisation cellulaires)

24
Q

décris le CPN

A

structure modulaire construite à partir des nucléoporines (Nups)

25
Q

Décris les différentes structures du CPN

A
26
Q

deux conformations des protéines RAS

A

RAS-GTP et RAS-GDP

27
Q

la structure RAS-GTP interagit avec d’autres protéins (karyophérines dans ce cas) et a une activité de GTPase en présence de quelle protéine

A

GAP (la Ran-GTP est hydrolysée en Ran-GDP par l’action de la Ran GTPase activating protein (RanGAP))

28
Q

lorsque la GEF agit en stimulant l’échange du GDP pour le GTP, quel est l’effet sur la protéine G

A

activation (change GDP pour GTP)

29
Q

Ran est le seul membre de la famille RAS v ou f

A

faux, plusieurs
EF-Tu, EF-G = traduction
Ran = transport dans le noyau
Rab, Arf, Sar = transport vésiculaire

30
Q

comment se lie la Ran-GTP à la karyophérine

A

via le phosphate gamma du GTP (3e phosphate)

31
Q

v ou f, les importines (karyophérines importations) lient Ran-GTP et SLN en même temps

A

faux, les deux liaisons sont mutuellement exclusives, ou l’un ou l’autre

32
Q

la proportion de Ran-GTP et de Ran-GDP dépend de quoi

A

activités de GAP (hydrolyse de GTP) et GEF (facteur d’échange)

33
Q

explique le cycle de transport nucléocytoplasmique régulé par Ran (importine)

A

liaison Ran-GDP/importine
signal NLS
formation du complexe Ran-GDP/importine/protéine
- entrée dans le noyau
dissociation de Ran-GDP du complexe trinaire à cause de GEF
liaison de Ran-GTP à l’importine + protéine
libération de la protéine cargo
- sortie de Ran-GTP + importine vers le cytoplasme
hydrolyse de Ran-GTP en Ran-GDP dans le cytoplasme
dissociation de Ran-GTP + importine
liaison de Ran-GDP à l’importine et NOUVEAU CYCLE

34
Q

Ran-GDP est favorisée où

A

cytoplasme

35
Q

Ran-GTP est favorisée où

A

noyau

36
Q

les exportines lient le signal SEN et quelle Ran en même temps ?

A

Ran-GTP

37
Q

explique le cycle de transport nucléocytoplasmique régulé par Ran (exportine)

A

liaison de Ran-GTP et protéine SEN à la karyophérine dans le noyau
-passage dans le pore et sortie du noyau
hydrolyse de Ran-GTP en GDP par GAP
changement conformationnel de la karyophérine
libération de la protéine

38
Q

v ou f, les karyophérines exportines n’utilisent pas GEF

A

vrai
Contrairement aux importines qui nécessitent un facteur d’échange nucléaire (GEF) pour favoriser le retour de Ran-GDP au noyau, les exportines n’utilisent pas un GEF spécifique pour libérer Ran-GDP/échanger contre Ran-GTP

39
Q

4 modèles qui représentent des voies alternatives de transport

A

modèle de diffusion-rétention
modèle du facteur de transport
modèle de séquence signal
modèle médié par une vésicule

40
Q

voie alternative qui implique l’importine 16 (protéine tronquée de la karyophérine) et qui ne fait pas intervenir Ran

A

modèle de séquence signal

41
Q

explique le modèle médié par la vésicule

A

membrane externe forme une vésicule, prend la protéine à transporter et la transporte dans l’espace intermemb

pas d’utilisation de pore nucléaire pour la diffusion de la protéine dans la membrane

42
Q

voie alternative : le complexe protéine-karyophérine passe par le CPN en utilisant un long lieur non structuré

A

modèle du facteur de transport

43
Q

explique le modèle de diffusion-rétention

A

diffusion libre et bidirectionnelle entre les membranes nucléaires internes et externes à travers les pores périphériques

44
Q

dans le modèle de diffusion-rétention, l’accumulation de la protéine au niveau de la membrane interne est due à quoi

A

l’attachement par la chromatine (ADN + protéines associées dans le noyau) et/ou les lamines (protéines de la membrane interne du noyau )

BIO 1157 (10 decks)

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