Brainscape's Knowledge GenomeTM

Browse over 1 million classes created by top students, professors, publishers, and experts.


See full index

Mikrobiologi > F7 mikrobiell genetik > Flashcards

F7 mikrobiell genetik Flashcards

1
Q

genom

A
  • cirkulärt
  • standard: 1 ORI
  • kan replikeras åt båda håll samtidigt
  • 5’ till 3’
  • kromosomer och plasmider
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

plasmider

A
  • ungefär 5000 baspar
  • eget ORI => replikeras självständigt
  • oftast cirkulärt
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

supercoiling

A

DNA snurrar sig, som runt en stång
- görs av DNA gyras

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

replisom

A

proteinkomplex som utför replikation
- DNA polymeras, DNA helikas, DNA gyras osv

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

4 typer av mutationer

A
  1. tysta = gör ingen skillnad, flera kodon kodar samma aminosyra
  2. missense = ändrar kodon till annan aminosyra
  3. nonsense = introducerar ett stop-kodon
  4. frame switch = insertion eller deletioner, ändrar läsram och sekvensen som följer
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

transkription initiering

A
  • sigma-faktorer binder till promotor => RNA polymeras rekryteras
  • s.f. släpper så RNA poly kan börja
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

sigma-faktorer

A
  • reglerar i cellen => om det är varmt kan den starta transkription som löser detta
  • olika s.f. beroende på gen och yttre signaler som promotorn kräver
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

promotorer

A
  • konstitutiv = alltid på
  • reglerad = sätts på/ stängs av vid stimuli
  • starkare promotor => fler proteiner
    consensus.. -10……..-35
  • consensus = ju mer lik promotor desto bättre binder sigma-faktorer
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

terminatorer

A
  • sekvensberoende = sekvens som passar som terminator bildas när RNA:t bildas
  • Rho-beroende = protein binder till växande RNA, när RNA polymeras når det så släpper RNA poly
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

operon

A

= flera gener sitter efter varandra och kan transkriberas samtidigt
promotor… gen1…gen2…gen3…terminator
- t.ex. 3 proteiner krävs för att bryta ner ett socker

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

arginin-repressorn

A
  • ex. på reglering
  • om arginin finns: cell vill ej producera egen arginin (onödigt) => arginin binder repressor som då bromsar promotorn
  • annat ex: Lac-operonet
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

maltos-operon

A
  • ex. på aktivering
  • aktivator kan sitta vid promotor eller längre ifrån
    -> kan aktivera flera promotorer
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

quorum sensing

A

= ett sätt att känna av hur många cellkompisar den har vid sig
- exempelvis toxin kräver att många celler utsöndrar för effekt => vill ej utsöndra tills vet att det finns många i närheten pga att inte slösa resurser
- t.ex. biofilminformation, toxinproduktion

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

translation, tRNA, wobbling

A
  • i bakterier sker translation och transkription samtidigt => RNA bildas, ribosom binder och jobbar direkt
  • finns 28-46 olika tRNA
  • wobbling = två första i kodon måste vara rätt, tredje spelar inte lika stor roll för att spara resurser
  • start-kodon: ATG
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

reglering av translation

A
  • bildas adapterregion (som utbuktning bilden) och RBS hamnar bredvid
  • metabolit kommer in => riboswitch binder till den => RBS hamnar på adapterregionen så ribosomen inte längre kommer åt den => translation stoppad
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

proteinveckning

A
  • spontant eller chaperon
  • kan ske under translation
  • många bakterier: GroEL som chaperon
    -> behöver GroES som “lock”
17
Q

sekretoriska proteiner

A

= hjälpproteiner som hjälper med vesikelbildning
- SecA-system binder till N-terminal => veckning stoppas
- proteinerna veckas först efter de har transporterats genom membranet för det är svårt att ta sig igenom annars

18
Q

arkéer

A
  • cirkulära kromosom, ofta runt histoner
  • flera ORI
  • replikation + transkription liknar eukaryotas
  • sällan exoner + introner
    -> har dock ofta i tRNA och rRNA
  • ribosomer likt eukaryota och prokaryota, translationen likt eukaryota
19
Q

griffiths experiment

A
  1. patogen med rough kolonier in i mus => mus överlever
  2. patogen med smooth kolonier in i mus => mus dör
  3. båda in i mus => mus dör och smooth kolonier har bildats
    -> gener kan överföras
20
Q

genöverföring

A
  • vertikal = vid replikation, celldelning
  • horisontell = mellan celler
21
Q

transformation, rekombinering

A

= fritt DNA kan tas in i cell
- DNA är mat alt. tror att det är eget men skadat => tas in i genomet
- om lyckas ta in => nytt DNA permanent
- om misslyckas => DNA dör
- rekombinering = integrering av DNA i genom

22
Q

transduktion

A

= DNA från virus
- vissa nybildade viruspartiklar får med sig lite av bakteriers DNA när de packar ihop sitt DNA för att sprida till nästa cell

23
Q

konjugation

A

= celler går ihop och överför
- pilus förankrar två celler => drar ihop tills celler bredvid varandra => brygga för cell-cell kontakt har bildats
- kräver konjugationsförmåga
-> kodat på konjugationsplasmid som oftast är det som överförs

24
Q

själviskt DNA

A

DNA som inte gynnar värdcellen men som gynnar plasmiden

25
Q

F (fertility) plasmid

A

= episom, alltså genetiskt element som kan integrerar i värdcellens genom
- F+-cell: innehåller icke-integrerad F-plasmid (acceptorn)
- Hfr-cell: innehåller integrerad F-plasmid (donatorn)

26
Q

transposable elements

A

= “hoppande gener”
- DNA-sekvenser som kan byta plats i genomet
- kan skapa eller reversera mutationer
- leder ofta till duplikat av sekvenser (inverted repeats)
- transposoner + insertionssekvenser (IS elements)
-> ir och dessa bär med sig gen (transposase, trp) för att förflytta sig
- kan hoppa på konjugationsplasmid och då hoppa över till annan cell

27
Q

restriktionsenzymer

A
  • känner igen specifika DNA-sekvenser och klipper sönder dem
  • kan skydda eget genom genom modifieringar
  • finns i bakterier och arkéer
28
Q

CRISPR

A
  • adaptivt IS i bakterier och arkéer mot främmande DNA
  • virus tar in sitt DNA, om cell då överlever => DNA klipps i bitar och farlig del hamnar i CRISPR-sekvensen
  • Cas-9 jämför farlig sekvens med RNA-sekvensen => virussekvens klipps sönder

Mikrobiologi (14 decks)

Brainscape helps you reach your goals faster, through stronger study habits.
© 2024 Bold Learning Solutions. Terms and Conditions