F3 tillväxt och odling Flashcards
generationstid
tid det tar organismen att fördubbla sig
- beror av näringstillgång, genetiska faktorer, T osv
binary fission
= hur prokaryoter delar sig
cell blir längre => septum bildas => cell klyvs => 2 dotterceller
divisom
=proteinkomplex som finns i dottercellerna
- drar samman membran
- syntetiserar cellvägg
4 faser av tillväxt
- Lagfas = se till att det finns näring
- Exponentiell tillväxt
- Stationär fas = näring börjar ta slut, avfall ansamlas, vissa celler börjar dö och vissa växer vilket ger nettotillväxt 0
- Dödsfas = fler celler dör än växer
kardinaltemperatur
= minimal-, optimal- och maximaltemperatur som organismen kan växa i (ej att de annars dör)
- oftast under 40
vad händer om för varmt? (+ värmeanpassningar)
- enzym trivs bra i varmt men inte för varmt, de denaturerar
=> fler jonbindningar för att stabilisera
=> aminosyrasubstitution kan göra stabilare - membran kompaktare för ej flytande
=> vissa tex arkéer kan ha monolipidlager
vad händer om för kallt? (+ köldanpassningar)
- membran blir fastare som gel vilket gör att transporten blir långsammare
=> för att lösa detta blir hög halt av omättade + korta fettsyror - enzymer löser också
=> fler alfahelix än betahelix
=> fler polära, färre hydrofoba aminosyror
=> färre svaga anpassningar så inte för rigida
hypertonisk lösning
högre koncentration än cellens inre => vatten tränger ut ur cellen så cytoplasman minskar och gradient minskar
hypotonisk lösning
lägre koncentration än cellens inre => vatten tränger in i cellen
isotonisk lösning
cell upptar lika mycket vatten som den avger
exempel på enzym som förstör toxiskt syre
katalas, peroxidas och superoxid-dismutas
obligat
fakultativ
aerotolerant
microaerofiler
behöver ha
tar gärna men behöver ej
tolererar men vill ej ha
behöver men i mindre koncentration än i luft
inokulum
det som tas för att starta odling
ympa
att starta en kultur
renkultur
isolat från en kultur
typstam
den stam som användes för beskrivning av arten första gången
isolat
renkultur från naturlig miljö
Odlingmedier:
1. definiterat
2. minimal
3. komplext
4. selektiv
5. differential
- alla komponenter definierade
- minimal näringstillgång
- rikt, odefinierat (t.ex. glukos 15g)
- gynnar en tillväxt och hämmar en annan
- visar på typ av organism, t.ex. metabolisk aktivitet som på MacConkey-agar
riskklass 1
t.ex. E. coli
Inte farliga alls.
- behöver inte vara isolerat, labbrock räcker
riskklass 2
t.ex. influensavirus och Hepatit A
Kan orsaka sjukdomar men finns behandling/vaccin. Kan vara cancerframkallande men för små mängder.
- avgränsad lokal, sterilisera/autoklavera avfall. Labbrock, handskar, ev. ögonskydd
riskklass 3
t.ex. HIV, Corona, Malaria
Allvarliga sjukdomar som det kan finnas behandling mot men inte alltid.
- luftsluss för undertryck. Låst så bara vissa får komma in, total skyddsutrustning och skobyte in och ut
riskklass 4
t.ex. Ebola
Dödliga sjukdomar, ingen behandling så kan orsaka pandemi.
- slussat och låst. Vatten autoklaverat, ingen kontakt med ämnet, total skyddsutrustning och obligatorisk dusch
CFU
= Colony Forming Unit
en levande mikroorganism kapabel till att föröka sig och bilda koloni
optisk densitet
- ljusspridning = vanligaste sätt att mäta tillväxt
- lösning grumlig pga ljus studsar av många organismer
- encelliga organismer => celltäthet proportionelig mot OD
kemostatodling
= odling i bioreaktor kemostat
- volym hålls konstant
=> näring pumpas in hela tiden och mikroorganismvätska pumpas ut så hänsyn tas till att den förökar sig
biofilm
- cell rör sig med t.ex. flagell tills den hittar yta => ah! biofilm här
- delar näring, när den tar slut sprids alla organismer igen
Fördelar: - motståndskraft mot yttre förändringar
- försämrad penetrering av t.ex. ab
- viktigt för vattenledning, bränsletankar, implantat osv
- psykrofil
- mesofil
- termofil
- hypertermofil
- trivs bra i låga temp
- trivs bra i “normal” temp (för oss)
- trivs bra i höga temp (45-80 grader)
- trivs bra i extremt höga temp (över 80 grader)
- ofta arkéer
- acidofiler
- alkalofiler
- halofiler
- extrem-halofiler
- osmofiler
- xerofiler
- trivs bäst i pH<6
- trivs bäst i pH>9
- lägre vattenaktivitet
- 15-30% NaCl
- hög sockerkoncentration
- torra miljöer