F16 - Proteiner Flashcards
Många av “looparna” på proteinerna som har beskrivits består av hydrofila aminosyror. Varför?
“Looparna” är alltid på ytan av proteiner, utsatta för miljön. Eftersom många proteiner finns i vattenmiljöer är de exponerade öglorna hydrofila för att interagera med vatten.
Glycin är en mycket konserverad aminosyrarest vid utvecklingen av proteiner. Varför?
Glycin har den minsta sidokedjan av någon aminosyra. Dess storlek är ofta kritisk för att polypeptidkedjor ska kunna göra snäva svängar eller närma sig varandra nära.
Proteiner som sträcker sig över biologiska membran innehåller ofta en helix. Med tanke på att membranens insidor är mycket hydrofoba, förutsäg vilken typ av aminosyror som kommer att vara i en sådan spiral. Varför är en helix särskilt lämplig för existens i den hydrofoba miljön i det inre av ett membran?
Aminosyrorna kommer att vara hydrofoba till sin natur. En a-helix är särskilt lämplig för att korsa ett membran eftersom alla amidväteatomer och karbonylsyreatomer i peptidkedjan deltar i vätebindningar mellan kedjor och stabiliserar sålunda dessa polära atomer i en hydrofob miljö.
