F15 - Prokaryot genexpression och proteinsyntes Flashcards
Förutse effekterna av att ta bort följande regioner av DNA:
(a) den gen som kodar lac-repressor
(b) lac-operatören
(c) genen som kodar CAP.
(a) Celler kommer att uttrycka b-galaktosidas, lacpermeas och tiogalaktosidtransacetylas även i frånvaro av laktos.
(b) Celler kommer att uttrycka b-galaktosidas, lacpermeas och tiogalaktosidtransacetylas även i frånvaro av laktos.
(c) Nivåerna av kataboliska enzymer såsom b-galaktosidas kommer att förbli låga även vid låga nivåer av glukos.
Lac operonmutanter som saknar permeasaktivitet finns. Även om genen för b-galaktosidas är intakt induceras inte enzymet när laktos tillsätts till bakterietillväxtmediet. Varför?
Laktos kan inte komma in i cellen, eftersom permeaset saknas.
Vissa föreningar, kallade anti-inducerare, binder till repressorer såsom lac-repressorn och inhiberar inducerarens verkan; det vill säga transkription undertrycks och högre koncentrationer av inducerare krävs för att inducera transkription. Föreslå en verkningsmekanism för anti-inducerare.
Anti-inducerare binder till konformationen av repressorer, såsom lac-repressorn, som kan binda DNA. De upptar en plats som överlappar den för induceraren och konkurrerar därför om att binda sig till repressorn.
Vilka två reaktionssteg krävs för bildandet av ett aminoacyl-tRNA.
Först är bildandet av aminoacyladenylatet, som sedan reagerar med tRNA för att bilda aminoacyl-tRNA. Båda stegen katalyseras av aminoacyl-tRNA-syntetas.
Vad menas med en aktiverad aminosyra i samband med proteinsyntes?
En aktiverad aminosyra är en aminosyra kopplad till ett lämpligt tRNA.
Den energiska ekvivalenten för två ATP-molekyler används för att aktivera en aminosyra, men ändå används endast en molekyl ATP. Förklara.
ATP klyvs till AMP och PPi. Följaktligen krävs en andra ATP för att omvandla AMP till ADP, substratet för oxidativ fosforylering.
Beskriv hur allolaktos och cAMP kombinerar för att reglera lac operon.
Allolaktos binder till repressorproteinet, vilket hindrar repressorn från att binda till operatören och tillåter polymerasåtkomst till genen så att transkription kan ske. Cyklisk AMP binder till CAP. Detta komplex binder till lac-operonen uppströms om promotorn och stimulerar bindningen av polymeras till promotorn.
Vilka är de viktigaste komponenterna som krävs för proteinsyntes (kap 39)?
Ribosomer, tRNA, mRNA och aminoacyl-tRNA-syntetaser.