Expresión génica Flashcards
que es la expresión génica
diferentes células pueden expresar diversos grupos de genes, aun teniendo el mismo ADN
La regulación génica es
la forma como una célula controla qué genes se expresan
los 6 tipos de control
- transcripcional
- procesamiento del RNA
- transporte y localización del RNA
- postraduccional
- degradación del RNAm
- actividad proteica
la regulación de la expresión génica a nivel transcripcional se divide en
regulación cis
regulación trans
en la regulación cis actúan
potenciadores y silenciadores (secuencias)
en la regulación trans actúan
factores de transcripción (proteínas que leen secuencias)
las proteínas pueden reconocer el DNA con gran afinidad gracias a
los dominios de unión al DNA
proteínas reconocen superficie del __ para identificar la secuencia de nucleótidos
ácido nucleico
dónde se reconoce la secuencia de mejor manera
surco mayor del DNA
ejemplos de proteínas que reconocen a los ácidos nucleicos
- Motivo hélice-giro-hélice (desarrollo embriónico)
- Motivo zipper de Leucina
- Hélice asa hélice (HLH)
- Motivos Dedos en Zn (hormonas esteroideas)
mínimo necesario para unir factor de transcripción y transcribir gen
promotor
sitio donde los factores de transcripción y la RNA polimerasa se ensambla
promotor (caja tata)
donde las proteínas reguladoras se unen para controlar el proceso de ensamblaje en el promotor
secuencias regulatorias
las secuencias regulatorias se dividen en
potenciadores
silenciadores
función de potenciadores
atraer FT
RNA pol II hacia el promotor (aumenta velocidad)
proteína que va a leer secuencia del potenciador
activadores
los activadores
actúan directamente con los FT y pueden regular actividad de RNA POL II
la unión de factores de transcripción específicos a los potenciadores son responsables del control de la expresión génica:
- desarrollo
- diferenciación
- respuesta de las células a las hormonas y factores de crecimiento
lee a silenciador para disminuir velocidad/inhibir transcripción
represores
una función importante de los represores puede ser la de
inhibir expresión de genes específicos de un tejido en tipos celulares inadecuados
los activadores y represores pueden inducir cambios en la estructura de la
cromatina
para qué se inducen cambios en la cromatina?
esconder o modificar gen para que se transcriba más o menos
el enrollamiento del ADN en un núcleo soma es un obstáculo para la transcripción afecta:
- capacidad de los FT para unirse al ADN
- capacidad de la ARN polimerasa para transcribir
en la regulación de la expresión génica por metilación de DNA se agrega un grupo metilo al
carbono 5 de la citosina (las que están después de una guanina)
la metilación confiere
cambio conformación al en la doble cadena de DNA
variación espacial y temporal en la cromatina
entre más metilación haya
menos expresión génica hay
la metilación de un promotor o de secuencias reguladoras interfieren en
el inicio de transcripción
se puede distinguir la hebra original de la hija gracias a
las metilaciones de la original
actúa en secuencias CG que están pareadas con secuencias CG metiladas
metiltransferasas
eucromatina
regiones relativamente dispersas poco condensadas que ocupan la mayor parte del núcleo
la eucromatina tiene altos niveles de
acetilación
la eucromatina tiene cromatina
activa transcripcional
características de la heterocromatina
regiones de cromatina densamente condensadas
inactivas, no se expresan
abundantes en los telómeros y centrómeros
niveles altos de metilación
la heterocromatina se divide en
facultativa y constitutiva
se expresan durante el desarrollo y/o diferenciación y posteriormente se silencian
heterocromatina facultativa
siempre permanecen condensados y se encuentran silenciados, están en telómeros y centrómeros
heterocromatina constitutiva
2 dominios de las histonas
- unirse a otras histonas y unirse al DNA
- amino terminal que se encuentra fuera del DNA y sufre modificaciones
los dominios de las histonas interactúan con
proteínas o complejos proteícos efectores o transductores
la acetilación de histonas
añade cargas negativas a las histonas
2 tipos de lisinas (H3K56)
(acetilación es de histonas)
acetiltransferasas de histonas (HAT)
deacetilasas de histonas (HDAC)
las HAT promueven
transcripción
HDAC (deacetilasas de histonas)
represores transcripcionales
fosforilación de histonas gracias a
serinas, treoninas y tirosinas
fosforilación de histonas
incrementa carga negativa de histona
favorece la transcripción
2 tipos de metilaciones de histonas
metiltransferasas de lisina (HKMT)
metiltransferasas de arginina
metiltransferasade lisina (HKTM) puede
activar o reprimir la transcripción de un gen
metiltransferasas de arginina
activación transcripcional
las histonas se pueden
fosforilación
metilar
acetilar
las deacetilasas de histonas (HDAC)
incrementan carga positiva
suprimen transcripción de p53
clases de HDAC
clase I
clase II
clase III
HDAC1
cáncer de prostata
HDAC 2
carcinoma gástrico
HDAC 8
neuroblastoma y glioma
HDAC 1,2,3 y 8
son clase I
inhibidores de HDAC
vorinostat
romidepsin
belinostat
panobinstat
