EXAMEN 3: Biochimie de l'héridité Flashcards
Les nucléotides sont des précurseurs de quoi?
d’ADN et D’ARN
Qu’est-ce que l’ATP?
unité d’énergie biologique universelle
Que permet le GTP?
le déplacement de MACROMOLÉCULES
ex: activation protéines de couplage : protéine G
Donne-moi un exemple de régulateur métabolique.
AMPc
Vrai ou faux?
Les nucléotides à Adénine sont des constituant de coenzyme tels que: NAD, FAD, CoA.
VRAI
Qu’est-ce que les acides nucléiques?
Les acides nucléiques sont des groupes prosthétiques des nucléoprotéines (protéines conjuguées).
Quels sont les 2 types d’acides nucléiques?
ADN et ARN
Comment reconnaître une purine d’une pyrimidine?
Purine: 2 cycles → A, G
Pyrimidine: 1 cycle → C, T, U
Qu’est-ce qui confère à l’ADN une structure hélicoïdale?
Ponts (ou liaisons) hydrogène
Quelle structure prend l’ADN ?
Hélicoïdale
Comment reconnaître le sucre présent dans l’ADN (Désoxyribose) de celui présent dans l’ARN (Ribose)?
Regarder le 2e carbone à partir du ‘‘o’’ en haut!
Désoxyribose: juste un H (pas de OH, car désoxygéné!)
Ribose: un OH
Les acides nucléiques sont des polymères de …….
Nucléotides (nucléotides= nucléosides + PO4)
Qu’est-ce qu’un nucléoside?
sucre + base
Quels sont les types de bases?
puriques→ A,G,
Pyrimidique→T,C,U
Quels sont les types de sucres?
D-ribose
D-désoxyribose
Quels sont les méthylxanthines alimentaires?
Caféine
Théophylline
Théobromine
Comment forme-t-on un polymère de nucléotides?
liaisons phosphodiester entre:
OH du carbone C-5 du pentose nucléotide
OH du carbone C-3 du pentose nucléotide suivant
Combien de chromosomes comporte chaque cellule humaine?
46 chromosomes (44 autosomes + 2 gonosomes)
Combien autosomes dans cellule humaine?
44 autosomes
Chaque chromosome renferme combien de molécules d’ADN?
2 chromatides contenant
UNE seule molécule d’ADN chaque
Qu’est-ce qu’un gêne?
une séquence d’ADN qui spécifie la synthèse d’une chaîne de polypeptides iy d’un acide ribonucléique (ARN) fonctionnel
Où existe l’ADN?
Dans les noyaux cellulaires, les mitochondries et les chloroplasmes
Qu’est-ce que l’Euchromatine?
ACTIVE: impliquée dans synthèse protéique
Qu’est-ce que l’hétérochromatine?
INACTIVE: non-impliquée dans synthèse protéique
Quels sont les 2 types d’hétérochromatine?
1) Hétérochromatine constitutive: TJRS condensée =(inactive, non-transcrite)
2) Hétérochromatine facultative: parfois condensée, parfois activement transcrite
Qu’est-ce que le corps de Barr?
l’un des chromosomes X chez la fille qui n’est presque jamais transcrit: Hétérochromatine
l’autre est de l’hétérochromatine facultative ***EXAM
Quels sont les 4 types de désoxynucléotides présents dans l’ADN?
Désoxyadénylate
Désoxyguanylate
Désoxycytidylate
Désoxythymidylate
De quoi est formée la structure primaire de l’ADN?
de N-hétérosides
1) Partie glucidique: désoxy-2-D-ribose
2) Aglycone: bases puriques (A, G) et pyrimidiques (C, T)
Le codon AUG code pour quoi?
AUG → Méthionine
Qu’est-ce qui assure les liaisons entre les cycles?
Acides phosphorique (lien phosphodiester)
Quelle est la structure secondaire de l’ADN?
Double hélice alpha (hélice bicaternaire)
Quels sont les 3 formes d’ADN?
B, A et Z
Explique-moi la forme B de l’ADN.
2 brins s’enroulent en hélice alpha : sens horaire, antiparallèle
Bases projetées vers le centre
Liens H entre les bases
Explique-moi forme A de l’ADN.
Obtenue par déshydratation de la forme B (donc + compact)
Forme angle 13 à 19 degrés
sens horaire
Quelle forme est obtenue par déshydratation de la forme B de l’ADN?
La forme A
Vrai ou faux?
L’hélice A est + large que l’hélice B
L’Hélice A n’est pas limitée seulement à ADN déshydratée
VRAI
Explique-moi la forme Z de l’ADN.
Sens anti-horaire
double hélice stabilisée par la méthylation des bases
Quelle est la règle de complémentarité ou jumelage ou appariment?
A-T , C-G → ADN
A-U , C-G → ARN
Comment peut-on dissocier la structure en double hélice (séparer les 2 brins)?
1) ↑ température
2) ↓ Concentration en sel
Qu’est-ce que ça fait si on sépare les 2 brins?
AUGMENTATION de la densité optique: hyperchromicité
De quoi dépend la vitesse de renaturation?
de la concentration des brins complémentaires
Donne-moi un synonyme d’hybridation.
Appariement de bases
Qu’est-ce que des conditions très stringentes?
↑ T
Conc. sel basse
Qu’à la séquence PARFAITEMENT complémentaire
Conditions moins stringentes:
↓T, ↑ conc. sel
Mésapariments toléré
Stringence trop basse:
Perte de la spécifité
Où est produit l’ARN ribosomal?
dans le nucléole
il s’attache au RER
Comment apelle-t-on la séquence de 3 a.a sur un ARNt et sur un ARNm?
ARNt = anticodon ARNm = Codon
À quoi sert les snARN?
rôle dans maturation de l’ARN et dans l’architecture cellulaire
hnARN?
Ce sont les ARN immédiatement produits dans le noyau, il doivent passer la maturation avant d’entrer dans cytoplasme sous forme ARNm
Qu’est-ce qui change l’ARN en ADN dans les rétro-virus?
La transcriptase inverse
Permet de s’intégrer dans génome de la cell. hôte: transcription prot. : prolifération!
Vrai ou faux?
L’ARN est composé d’une double hélice comprenant de l’Uracile plutôt que de la Thymine.
FAUX
l’ARN est constitué d’un seul brin
Quel sucre trouve-t-on dans l’ARN?
ribose
L’ARN peut se contorsionner et prendre une conformation de ‘‘boucle en épingle a`cheveux’’.
Vrai
La chromatine s’enroule autour de quoi?
autours d’histones
Comment appelle-t-on des histones se combinant à l’ADN?
Nucléosomes
Qu’est-ce que la réplication semi-conservative?
la réplication de l’ADN donnant 2 duplexe chacun constitué de:
une chaîne parentale
une chaîne nouvellement synthétisée
Quelles sont les étapes de manifestation de la réplication semi-conservative?
Réplication de l’ADN
Réparation de l’ADN
Transcription de l’ADN
Traduction
par quoi est assuré la réplication?
ADN polymérase (5 chez l’eucaryote)
Quelle ADN polymérase sert à répliquer l’ADN mitochondriale?
polymérase γ
Quelle polymérase a comme rôle la réparation des cellules endommagées?
polymérase β
Quels sont les 2 traits fondamentaux de toutes les ADN polymérases?
1) synthétise dans sens 5’ → 3’ (le nouveau brin naissant, pas le brin parentale! On lie sur brin parental de 3’ à 5’!!) en ajoutant dNTP au groupe hydroxyle 3’ d’une chaîne naissante
2) Elles n’ajoutent un nouveau nucléotide que si il y a un amorceur
Qu’est-ce que la chorée de Huntington?
Manque contrôle des mvts volontaires
Chromosome 4
Qu’est-ce que Mucoviscidose?
touche transport de chlore : trop de mucus poumons, pancréas, etc.
chromosome 7
Qu’est-ce que la distrophie musculaire de Duchenne?
atteinte de la prot. distrophine (maintient structure sarcomères) = perte de force musculaire Chromosome X (absence de distrophine)
qu’est-ce que la méthode de Sanger?
méthode enzymatique, celle que je comprenais pi que je comprend plus.
Lorsque l’ARN est en état contorsionné, il se forme des _______ __________ selon la règle G-C, A-U.
des ponts hydrogène
L’ADN est sous quelle forme chez E.Coli?
Bicaténaire circulaire
Quelle molécule effectue un désenroulement progressif de l’ADN?
ADN Hélicase
Quels sont les 4 constituants de la fourche de réplication?
1) ADN hélicase (désenroulement)
2) Primase (démarrage synthèse d’ARN amorce)
3) ADN polymérase (synthèse du brin soeur)
4) SSB (empêche ADN monocaténaires de se recoller)
Aussi: Ligase (soudage des segments Okazaki)
Quelles est la différence entre un brin précoce et un brin retardé?
Brin précoce = continue
Brin retardé = fragments d’Okasaki
La synthèse se fait dans quelle sens?
5’ → 3’
Quelles sont les propriétés communes des ADN polymérases?
1) Allongement des chaînes :vitesse
2) Caractère processif : nbr de nucléotides ajoutés à chaque fois
3) Lecture des épreuves: identification des erreurs et la correction (EDITING)
Comment appelle-t-on l’identification des erreurs et la correction par ADN polymérase?
EDITING
Quel type de polymérase a la plus grande processivité?
Polymérase III : 0,5 Megabase
Quel est impliqué dans la lecture et la correction des épreuves?
Polymérase II
Quel Polymérase complète la synthèse des chaînes entre les fragments d’Okazaki sur le brin tardif?
Polymérase I
Vrai ou faux?
Le brin précoce se fait de 5’ à 3’.
Le brin tardif se fait de 3’ à 5’.
FAUX!!!!
Le brin précoce ET le brin tardif se font de 5’ à 3’.
Le brin tardif se fera par contre à REBOURS.
ADN polymérase III est une exonucléase
Elle peut donc faire de l’editing (relecture avec correction)
Combien de chromosomes chez E.Coli?
un seul
Comment appelle-t-on chaque origine de réplication lors de la formation de bulles de réplication chez les eucaryotes?
Réplicon
Chez les eucaryote, la réplication débute par quoi?
ADN polymérase α
Quelle caratéritique spéciale a l’enzyme ADN polymérase α?
Elle a une activité primase pour synthétiser amorce ARN
La polymérase δ a une activité exonucléase, explique-moi ce que ça veut dire.
Qu’elle peut réaliser de l’editing (relecture + correction)
Qu’est-ce que la commutation de polymérase?
Quan Polyméraseδ remplace Polyméraseα
Parce quoi est réalisée l’élimination des amorces d’ARN lors de la réplication de l’ADN eucaryote?
ARNase H1
Parce qui est fait la réunion des fragments d’ADN?
ADN ligase
Qu’est-ce que les télomères?
seg. finaux des chromosomes
Par quoi sont répliqués les télomères& de les réparer?
télomérase
Quels sont les virus capable d’infecter les cell. des vertébrés et les transformer en cell. cancéreuses?
1) Virus tumoraux à ADN
2) Virus tumoraux à ARN (rétrovirus)
les cell cancéreuses ont la télomérase donc pourraient durer éternellement
.
Qu’arrive-t-il lorsque les télomères disparaissent (à cause de trop nombreuses divisions cellulaire)?
la cellule ne peut plus se diviser, donc vieillit et peut-être mourir!
En fait, chaque division cellulaire fait partir un bout de télomère
Par quoi débute la réparation?
une paire d’endonucléase qui inscisent
étape de la réparation par excision de nucléotides.
1) paire endonucléase incisent le squelette = ne tient plus qu’avec des ponts H
2) Clivage pont H par ADN hélicase
3) Remplissage lacune par ADN polymérase
4) soudage du brin par ADN ligase
Explique effet flottement.
le 3e nucléotide du codon pas le même, mais l’anti-codon se lie quand même
Différence entre non-sens et faux sens
faux sens: code pour un autre acide aminé
non-sens: terminaison prématurée
Quelle est la particularité de l’Hb Milwaukee?
à la position 67 de chaîne β: Glu au lieu de Val
Quelle est la particularité de l’Hb Bristol?
à la position 67 de chaîne β: Asp
est-ce que le changement de Lys par Asn altère la fonction normale?
NON
nomme-moi 3 exemple de faux-sens acceptable.
Hb Hikari
Hb S
Hb M
Qu’a de spécial Hb Hikari?
Asn position 61 au lieu de Lys
Qu’a de spécial Hb S?
Glu remplacé par Val position 6 → anémie falciforme
Qu’a de spécial Hb M?
Met Fe2+ en Fe3+ → Methémoglobine = incapable de transporter O!!!!
Fe2+ : fixe oxygène (lie)
Fe3+ : NON.
Nommez-moi des codons de non-sens.
Ce sont des codons d’arrêt:
UAA
UAG
UGA
Comment se nomme le promoteur riche en AT chez les procaryotes?
Boîte de Pribnow
Comment nomme-t-on la région riche en AT chez les eucaryotes?
Boîte de Golgberg-Hogness ou Boîte TATA
Que permettent les sites riches en TATA?
peuvent s’ouvrir pour favoriser la liaison de l’ARN polymérase à un brin d’ADN
En quoi consiste l’initiation?
formation de la 1e liaison phosphodiester
5’ → 3’
lue de 3’→5’
mais synthétisé de 5’→3’
En quoi consiste l’élongation?
L’ajout de nucléotides par l’ARN polymérase
en appariant les base complémentaires à l’aide de ponts H
En quoi consiste la terminaison?
losrque la polymérisation s’arrête en un point spécifique de l’ADN
Procaryote: région riche en GC suivi d’une suite de A
Eucaryote: plus diff. à déterminer.
AMP, ADP et ATP sont interconvertibles sous l’action de qui?
Adénylate kinase
Vrai ou faux?
Chez les procaryotes, les transcrits primaires des gênes codants pour ARNm peuvent servir de matrice de traduction avant même la fin de leur transcription.
(ne nécessite pas de maturation)
Vrai!
Les eucaryotes, eux, nécessite une grande maturation
Est-ce que les transcrits primaires chez les eucaryotes nécessites une maturation?
OUI!
Les exons sont les portions ______ et les introns les portions ______ .
Exons = Codantes! Introns = non-codantes
En quoi consiste l’épissage?
On enlève les introns, on raboute les exons!
qu’est-ce que le splicéosome?
- transcrit primaire
- 5 petits ARN nucléaires ou ARNsn
- plus de 50 protéines
*l’ensemble forme un complexe nucléoprotéique de petite taille (snRNP) ou snurp
Donne-moi un exemple d’épissage défectueux.
β-thalassémie :
empêchement envelage introns = ↓ ou absence synthèse chaîne β
Quelles sont les caractéristiques du code génétique?
1) Dégénéré : plusieurs codon code même a.a
2) Non équivoque: un codon code pour un seul a.a
3) Non chevauchant:chevauche pas quand lecture
4) Sans ponctuation: lecture du début à la fin, sans virgule
5) Universel:
6) Codon non-sens: 3 codons ne codent pas a.a. →
UAA, UGA, UAG
7) AUG: code la méthionine, codon d’initiation
Quel est le premier acide aminé des protéines?
Méthionine
Après l’activation de la méthionine, un groupe formyle est ajouté chez les __________.
Procaryotes
*Pas de formylation chez les eucaryote, mais ARNt pour reconnaissance de la méthionine
Qu’a-t-on besoin pour réaliser une liaison peptidique?
l’enzyme peptidyltransférase
Qu’a-t-on besoin pour réaliser la translocation (passer du site A au site P)?
Enzyme: translocase
Par quoi se termine la traduction?
reconnaissance des codons UAA, UAG, UGA
Qu’est-ce qu’un opéron?
Lors de la transcription
ensemble gênes structuraux et ceux qui les contrôlent
(promoteur: endroit où ça commence et opérateur: dit vas-y ou non)
Un brin d’adn, OH libre extrémité 3’ et Oh libre extrémité 5’
.
Quelles sont les 3 étapes de la transcription?
Démarrage
Élongation
Terminaison
Transcription
Le brin d’ADN transcrit s’appelle :
brin matrice ou brin anti-sens
Lue de 3’ à 5’
Synthétisé de 5’ à 3’
.
Quel type d’ARN dirige l’alignement des sites d’épissage?
ARNsn
Qu’est-ce qui catalyse l’épissage?
RNPsn
Quelle est la plus petite unité d’expression génétique ?
Cistron
Quels sont les étapes de la transcription?
Reconnaissance
Initiation
Élongation
terminaison
Quel est le rôle de ARN polymérase I
Transcrit gène des ARN ribosomiques
ARN polymérase II
Transcrit gènes codant pour protéine: catalyse synthèse des ARNm
ARN polymérase III
Transcrit gènes des ARNt et divers gènes codant de petits ARN
