Dugga

Question 1

Vilken typ av virus är Rubella respektive Morbilli?

Answer 1

Båda är RNA-virus.
Rubella: (+)ssRNA, Togavirus. Med hölje.
Morbilli: (-ssRNA)

Question 2

Vad infekterar B19-virus? Vilken typ av virus är detta?

Answer 2

Parvovirus! Litet DNA-virus, ssDNA. Infekterar erytroblaster, d.v.s. hematopoetiska stamceller. Farligt om man har bakomliggande hematologisk sjukdom.

Question 3

Hur kan man påvisa att ett virus är orsak till canceruppkomst?

Answer 3

• Tidsmässigt samband: virusinfektion i rimlig tid innan cancern
• Styrka, specificitet och konsekvens: virusmarkörer, antikroppar och geografisk spridning
• Dosrespons: virusprevention t.ex. vaccination minskar cancerrisk

Question 4

Vilka tre gener hos HIV1 kodar för vad?

Answer 4

Gag: kodar för kapsid, matrixproteiner och nukleokapsid
Pol: kodar för enzymer såsom proteas, integras och reverse transcriptase
Env: kodar för gp120 och gp41

Question 5

Hur smittar olika hepatitinfektioner? Är sjukdomen akut eller kronisk?

Answer 5

Hepatit A: Akut. Fekal-oral smitta.
Hepatit B: Kronisk. Slemhinnekontaktsmitta.
Hepatit C: Kronisk. Slemhinnekontaktsmitta.
Hepatit D: Kan enbart smitta någon som redan bär på HBV. Slemhinnekontaktsmitta.
Hepatit E: Akut. Fekal-oral smitta.

Question 6

Vilka fem virusfamiljer är viktigast då det kommer till zoonotiska virus?

Answer 6

Flavivirus
Togavirus
Bunyavirus
Arenavirus
Filovirus
Lyssavirus

Question 7

Vilka virus kan behandlas med proteashämmare?

Answer 7

HIV1 och HCV.

Question 8

Varför skulle influensavirus teoretiskt kunna behandlas med proteashämmare?

Answer 8

Influensaviruspartikelns Hemaglutinin måste klyvas av Furinproteaser för att kunna entra cellen.

Question 9

Vilka cytoplasmatiska PAMPs finns?

Answer 9

• dsRNA
• 5’trifosfoRNA (omoget RNA)
• cyt-DNA

Question 10

Vilka cytoplasmatiska PRRs finns?

Answer 10

• RNA-helikaser såsom MDA5 (känner igen dsRNA) och RIG1 (känner igen dsRNA, stem loops och omodifierad 5’-nde)
• DNA-receptorer: cGAS
• RNA-polymeras III: binder AT-rika regioner vilket är virusets ORI

Question 11

Vad kan utgöra PAMPS som sitter på ytan av ett virus?

Answer 11

Bakterier, svampar, cellulärt skräp och virala glykoproteiner.

Question 12

Vilka PRRs binder de olika virala PAMPsen dsRNA, ssRNA och DNA i endosomen?

Answer 12

dsRNA - TLR3
ssRNA - TLR7/8
DNA - TLR9

Question 13

Vilka signaler skickar TLR3, TLR7/8 och TLR9?

Answer 13

IRF3, IRF 7 och NFkB.

Question 14

Vilket är det enda dubbelsträngade RNA-viruset?

Answer 14

Rotavirus!

Question 15

Vilka fördelar får viruset av att ha ett hölje?

Answer 15

Vid infektion: viruset kan då ta sig in genom att plasmamembranen fuserar, och undkommer då endosomen och dess antivirala försvar med TLRs t.ex.
Höljet verkar även skyddande vid transport.

Vid nybildning: om viruset har hölje (som den “tar” från värdcellens membran) kan den nybildade partikeln fredligt försvinna från värdcellen utan att lysera den.

Question 16

Varför kan inte ett +RNA-virus bilda de färdiga virusproteinerna direkt?

Answer 16

+RNA-virus är redan färdiga templat som direkt kan translateras av ribosomerna. Detta bildar en lång polypeptidkedja. All genomisk information ligger alltså i en lång sträng.
Om RNAt skulle bilda färdiga virusproteiner direkt skulle den genetiska informationen vara uppdelad i småbitar som kan bli olika proteiner. Nu måste istället den långa kedjan (då den translaterats) klyvas till smådelar.
+RNA-virus får aldrig chansen att likt våra celler bilda små snuttar av mRNA som kodar för olika genetisk information till olika proteiner.

Question 17

Hur infekterar VZV? Inkubationstid?

Answer 17

Via lungepitel, och har sitt målorgan i huden.
Därav en längre inkubationstid: måste färdas från lungepitelet via blodbanan/lymfocyter till huden, där infektionen kan blomma ut. D.v.s. har både primär och sekundär viremi.

Question 18

Vad replikeras fortast: VZV eller norovirus? Varför?

Answer 18

Norovirus replikerar snabbare i.o.m. att det är ett RNA-virus, och VZV är ett DNA-virus.

Question 19

Vilken typ av virus är Respiratoriskt syncytievirus?

Answer 19

(-)ssRNA med helikal kapsid och hölje. Tillhör familjen Paramyxovirus.

Question 20

Hur ser patogenesen ut för Respiratoriskt syncytievirus?

Answer 20

Först uppkommer förkylning, ÖLI och eventuellt bronkeolit. Sedan kan syncytier/”giant cells” (cell med flera celler i sig) bildas, som ger immunmedierad cellskada. Denna skada kan leda till nekros och skapar klumpar av mucus och fibrin.
Risken för infekterade barn blir då kvävning, i.o.m. dess smala luftstrupar.

Question 21

Vad gör virala oncogenerna E5 E6 E7?

Answer 21

E5: stimulerar MAPK-aktivitet och EGF-aktivitet
E6: hämmar och degraderar p53 och pRB
E7: skapar genomisk instabilitet. Hämmar p107 och P130 som kontrollerar cellcykeln. Hämmar även Rb:s bindning till E2F (är en transkriptionsfaktor för cyklon D1 och E, DNA-syntesgener och ARF).

Question 22

Vilken PAMP hör ihop med vilken PRR?

Answer 22

5'trifosfoRNA + RIG1
cytDNA + cGAS
dsRNA + RIG1 och MDA5
ssRNA + TLR7/8
DNA + TLR9

Question 23

Vad innebär antiviralt tillstånd?

Answer 23

Cellen har fått signal, vilket skapar dsRNA i kärnan. Detta kommer dels aktivera/dimerisera PKR som kommer fosforylera eIF2alfa, vilket gör att translation avstannar. Det kommer även göra så OAS bildar oligoA vilket aktiverar RNaseL som kan degraderar RNA (både viralt och för värd).

Question 24

Hur går det till då ett HIV-virus binder och kommer in i en makrofag?

Answer 24

HIV1 har på sin yta höljeprotein gp120. Detta binder till CD4-R på värdcell. Detta ger en konformationsändring som gör att gp120 kan binda co-receptorn CCR5. Detta i sin tur ger en konformationsändring som blottar gp41. Gp41 greppar nu tag i cellmembranet och möjliggör fusion.

Question 25

På vilket sätt verkar NNRTI?

Answer 25

Icke-nukleosid reverse transcriptase-hämmare. Hämmar reverse transcriptase genom att binda dess aktiva ytan. Nu kan inte viruset bilda DNA från RNA.

Question 26

På vilket sätt verkar NRTI?

Answer 26

Nucleoside reverse transcriptase inhibitor. Blockerar reverse transcriptase genom att tävla med de naturliga nukleotiderna som inkorporeras till HIV-DNA. Avslutar DNA-syntes av HIV-RT.

Question 27

Varför måste virus med (-)ssRNA ha med sitt eget RNA-polymeras?

Answer 27

För cellens RNA-polymeras enbart kan binda +ssRNA.

Question 28

Varför har DNA-viruset HBV ett reverse transcriptase?

Answer 28

P.g.a. realisationen går via RNA-kopia som via reverse transcriptaset bildar ena strängen på det blivande DNAt.

Question 29

Hur kan Epstein-Barrvirus undkomma immunförsvar?

Answer 29

EBNA (Epstein Barr nuclear antigen) är ett virus-DNA-bindande protein som håller tillbaka MHC klass I.

Question 30

Vilka virusfamiljer tillhör hepatitvirusen?

Answer 30

HAV: Picorna
HBV: Hepadna
HCV: Flavivirus
HDV: Deltavirus
HEV: Hepe

Question 31

Vad sker i HIV1-infektionens tre olika kliniska faser?

Answer 31

Akut fas: CD4-makrofager infekteras med HIV1. HIV1-replikering sker. Antal CD4-lymfocyter sjunker. Sprids i lymfoid vävnad.

Asymptomatisk fas: värdimmunsystemet får kontroll över viruset. HIV1-replikationen blir låg. Antal CD4-lymfocyter ökar igen. Virus replikeras och muteras för att söka “gaps” i immunförsvaret. Latens etableras, och viruset vilar i makrofager.

Symptomatisk fas: extensiv HIV-replikation. Antal CD4-lymfocyter minskar drastiskt. CD4-T-cellys kan resultera i AIDS.

Question 32

Vad kan påverka vävnadstropism? (Från värdorganismens håll)

Answer 32

• Cellulära receptorer
• Temperatur
• pH
• Permessiva celler (replikation av virus måste tillåtas. Cell måste vara transkriptionellt aktiv)
• Enzymer (vissa virus kräver proteaser för att kunna komma in i celler…)

Question 33

Vad avgör skifte från mRNA-syntes till RNA-replikation för RNA-virus?

Answer 33

Vid avsaknad av fritt kapsidprotein bildas mRNA (behöver bilda kapsid!).
Vid närvaro av kapsidprotein bildas fullängds-RNA som sedan kan replikeras till genomiskt RNA (om negativt) (har kapsid - behöver något att stoppa i dem!).

Question 34

Vad gör NS1 för influensaviruset?

Answer 34

Hämmar IFN Q/B och därmed immunorespons.

Question 35

Vad gör NS2 för influensaviruset?

Answer 35

Gör att virusets genom kan entra kärnan.

Question 36

På vilket sätt kan rotavirus ge allvarlig dehydrering?

Answer 36

Detta virus löser upp tight junctions mellan enterocyter så vatten kan läcka ut.

Question 37

Vilka två steg i retrovirusets replikation skiljer sig mot andra virustypers replikation men är nödvändigt för retrovirusets?

Answer 37

• Omvänd transkription av (+)ssRNA till dsDNA m.h.a. reverse transcriptase
• Irreversibel integrering av provirus dsDNA i värdcellens genom.

Question 38

Vilka antigen från vilka stammar innehåller influensavaccin?

Answer 38

H1N1, H2N2, H3N2