Dogma central da biologia molecular Flashcards
Caracterize o processo de replicação.
Envolve a duplicação do DNA.
Está sempre associado à divisão celular.
É semiconservativa: há duas fitas do DNA, e uma delas servirá como fita-molde.
A dupla hélice, durante o processo, será aberta pela enzima helicase.
Caracterize o início da replicação.
O processo começa na forquilha de replicação, que possui direção bidirecional em eucariotos e unidirecional em procariotos.
Essa forquilha abrange as extremidades da alça onde o DNA parental está sendo desnovelado.
O que é ori C?
É o ponto inicial da replicação, possui uma sequência de DNA (com proteínas específicas e sequências ricas em A e T).
O que é replicon?
É a unidade do DNA onde está ocorrendo o evento de replicação.
V ou F: o genoma eucarioto possui apenas uma origem de replicação.
F: por ser muito grande, o DNA possui várias origens.
Em que fase do ciclo celular ocorre a replicação? Esse processo dura quanto tempo?
Na fase S da intérfase e dura 6 a 8 horas.
Qual a velocidade da forquilha de replicação eucariótica?
2 mil pares de bases/minuto.
A replicação ocorre em qual sentido?
5’ - 3’ com a extremidade 3’ OH livre como ponto de alongamento desse DNA.
Se as fitas sempre são sintetizadas no sentido 5’ - 3’, como podem ambas as fitas serem sintetizadas simultaneamente?
Para que duas fitas sejam sintetizadas ao mesmo tempo, uma delas é sintetizada de forma contínua e a outra descontínua:
- a fita molde 3’ - 5’ faz geração de fita complementar 5’ - 3’ (síntese contínua).
- a fita que vai servir de molde mas está no sentido 5’ - 3’ vai sofrer uma torção e expor a extremidade 3’. Tal processo geral os chamados FRAGMENTOS DE OKAZAKI, que serão ligados pela DNA ligase.
O que é replissomo?
É o local onde está ocorrendo a replicação.
Quais as principais enzimas envolvidas no processo de replicação?
DNA polimerase, RPA, helicase, primase, topoisomerase, DNA ligase.
Qual a função da DNA polimerase?
Sintetização, correção e reparo do DNA.
Quais os tipos de DNA polimerase?
DNA polimerases: alfa, gama, delta, épsilon e beta.
Caracteriza a DNA polimerase alfa.
Replicação do DNA na forma descontínua.
Caracteriza a DNA polimerase gama.
Replicação do DNA mitocondrial.
Caracteriza a DNA polimerase delta.
Replicação do DNA nuclear na forma contínua.
Caracteriza a DNA polimerase épsilon e beta.
Reparo do DNA.
Qual a função da RPA?
Se liga ao DNA de fita simples para estabilizá-lo.
Qual a função da primase?
Produz iniciadores (primers) a partir de um molde de DNA.
Qual a função da topoisomerase?
Relaxa o superenovelamento acima da forquilha de replicação; separa o DNA circular no final da replicação.
Qual a função da DNA ligase?
Forma ligações covalentes para ligar as fitas de DNA; liga os fragmentos de Okazaki e os novos segmentos no reparo de excisão.
O que e quando ocorre na duplicação cromossômica?
Ocorre: - duplicação do DNA. - duplicação dos filamentos de cromatina. - síntese de histonas. - duplicação dos centríolos. Ocorre na fase S da intérfase.
O que são primers?
São oligonucleotídeos responsáveis por sinalizar o local de ação da DNA polimerase e oferecer a extremidade 3’ OH livre, estando presentes tanto na fita contínua quanto na descontínua.
No final do processo de replicação são removidos.
São sintetizados pelas primases.
Como se dá o término da replicação?
Envolve a síntese de estruturas especiais nas extremidades de cada cromossomo: telômeros.
Caracterize os telômeros.
São sintetizados pelas telomerases.
São cópias repetidas de uma sequência curta de oligonucleotídeos.
O que é transcrição?
É o processo de síntese da molécula de RNA mensageiro utilizando trechos de uma das fitas do DNA como molde.
V ou F: A transcrição não envolve toda a molécula de DNA.
V: são genes (ou trechos) que serão transcritos na forma de mRNA.
Quais são os componentes necessários para o processo de transcrição?
Uma fita de DNA molde (3’ - 5’).
Fatores de transcrição.
RNA polimerase.
Sítio promotor.
O que são fatores de transcrição?
São proteínas que se ligam a fita molde do DNA de células eucarióticas para permitir que haja uma ligação entre a RNA polimerase e o DNA.
Estão presentes somente nos eucariotos.
Caracterize a RNA polimerase.
É responsável por reconhecer o sítio promotor.
Adiciona novos nucleotídeos.
Cliva as pontes de hidrogênio.
Realiza a síntese (5’ - 3’).
O que é sítio promotor?
É uma região do DNA que inicia a transcrição de um determinado gene.
Quais as atividades da RNA polimerase?
Reconhecem e ligam-se em sequências específicas do DNA.
Desnaturam a fita de DNA.
Mantêm as fitas de DNA separadas na região de síntese.
Estabilizam o híbrido DNA:RNA na síntese.
Renaturam o DNA imediatamente após a síntese.
Terminam a síntese sozinha, ou com ajuda de proteínas.
Quais as principais características da transcrição?
É mais seletiva que a replicação -> age apenas em parte de genes que estão sendo necessitados.
Não requer iniciador (primer).
Utiliza apenas uma fita de DNA como molde (3’ - 5’).
Sequências reguladoras marcam o início e o final dos segmentos de DNA que serão transcritos e designam qual fita do duplex de DNA será usado como molde.
Quais as etapas da transcrição?
Início: ligação do complexo de iniciação em eucariotos.
Alongamento: adição de ribonucleotídeos pela RNA polimerase.
Término: reconhecimento da sequência de término.
Onde ocorre a transcrição?
No núcleo da célula.
Caracterize o pré-mRNA.
É o mRNA ainda com íntrons e éxons, ou seja, é a forma imatura do mRNA.
V ou F: A direção da transcrição varia de gene para gene.
Verdadeiro: a escolha da fita molde vai depender da localização e da orientação do sítio promotor.
Como se dá o início da transcrição?
Começa com a ligação dos fatores de transcrição (TFs) às sequências do DNA na região do sítio promotor.
TFs + snRNAp (I, II ou III) = PIC (complexo mínimo capaz de iniciar a transcrição).
Qual a sequência promotora mais encontrada na maioria dos genes?
TATA box, que consiste em uma região conservada rica em adeninas e timinas que está, aproximadamente, 25 pb a montante do sítio de início.
Como se dá o término da transcrição?
O complexo RNA polimerase deve:
- reconhecer o terminador.
- cessa a incorporação de ribonucleotídeos.
- dissociar o complexo de transcrição liberando os fatores de transcrição, RNA polimerase e o DNA renaturado em sua conformação original.
- liberar o RNA sintetizado.
Quais as 3 etapas do processamento ou “splicing”?
- Adição de guanina metilada na ponta 5’
- Adição de cauda poli A na ponta 3’
- Retirada de íntrons e união de éxons.
Porque ocorre o splicing?
Ocorre para:
- Proteger contra a ação de ribonucleases.
- Aumentar a estabilidade.
- Tornar o RNA funcional.
Como essas enzimas que fazem a remoção de íntrons e união dos éxons sabem onde estão localizados os os mesmos?
Existem sequências especiais de nucleotídeos em um transcrito que sinalizam o início e o término de um íntron.
O que são essas sequências especiais?
São pequenas ribonucleoproteínas nucleares (snRNPs) que dirigem a clivagem do RNA nos limites éxon-íntron e catalisam a ligação covalente das sequências dos éxons.
Quais são os 5 tipos de snRNPs?
U1, U2, U4, U5 e U6.
O que é splicing alternativo?
É a combinação de éxons, formando vários tipos de mRNA alternativos ao mesmo tempo, obtendo diferentes proteínas.
Quantos % dos genes humanos sofrem splicing alternativo?
95%, permitindo que eucariotos elevem astronomicamente o potencial de codificação de seus genomas.
