Doenças genômicas Flashcards
Qual a janela de tamanho das doenças genômicas em pares de bases?
Maiores que 10 Kb e menores que 5 Mb
Quais alterações podem causar doenças genômicas?
- Deleção
- Duplicação
- Inversão
Como diagnosticar doenças genômicas?
Via fenótipo
Exames: array, MLPA e FISH
Como funciona o MLPA?
É dado pela amplificação de sondas em diferentes pontos do cromossomo
Software dá a porcentagem de hibridização em cada parte do cromossomo
A cópia que for deletada aparece menos por ter menos hibridização, por exemplo
O que é a síndrome DiGeorge?
Dada por uma deleção no cromossomo 22, braço longo, porção 11.2
del(22)(q11.2)
Qual é a clínica da síndrome DiGeorge?
- Tetralogia de Fallot
- Alterações imunológicas
- Aplasia de timo e paratireoide
- Fácies sindrômicas
Qual é o problema do FISH para diagnósticos?
Ele requer uma suspeita clínica
Como o array e o MLPA seriam utilizados no caso da síndrome DiGeorge?
Array: mostra o mecanismo de deleção
MLPA: indica o local e o tamanho da deleção
Qual o problema do array para identificação de certas alterações cromossômicas?
Ele é incapaz de detectar alterações no braço curto do cromossomo
O que são Low Copy Repeats (LCR)?
São blocos semelhantes no genoma que se repetem (em torno de 5% a 10% do genoma é constituído por blocos semelhantes)
Qual é o probrema dos Low Copy Repeats (LCR)?
Eles podem se juntar durante o crossing-over, causando um emparelhamento errado do material genético
Isso aumenta a chance de ter uma falha na divisão do material genético
O que acontece se uma pessoa tiver muitos Low Copy Repeats (LCR)?
Há mais chance de ocorrer algum problema durante a divisão do material genético
O que pode acontecer com a criança com síndrome de Miller Dieker e lisencefalia?
Dependendo do tamanho da deleção, ela pode ter a lisencefalia isolada ou a lisencefalia total
Qual é a limitação do array quanto à detecção de translocações?
Ele não é capaz de detectar translocação equilibrada porque a técnica envolve ler todas as sondas de uma vez após fragmentação do DNA
Basicamente, ele vai dizer que o cromossomo 22, por exemplo, está normal, sendo que parte dele está em outro cromossomo (isso ele não irá perceber por não saber dizer de onde veio aquela parte do cromossomo)
Como transpassar o problema da array quanto à translocação?
O uso do cariótipo pode ajudar a detectar uma translocação equilibrada (dá para perceber que parte de um cromossomo está em outro)
Quais outros pontos do material genético dificultam a visualização pelo array?
Os CNVs e SNPs
O que são SNPs?
É o polimorfismo de uma única base
É quando muda o G, A, C, T ou o U em um único ponto
Qual é a importância dos SNPs?
Eles não possuem relevância clínica, porém garantem a variabilidade entre os indivíduos
O que são CNVs?
Segmentos de DNA, maior que 10 Kb, com um número variável de cópias comparado com um “genoma referencial”
O que causa a neurofibromatose tipo 1?
Mutações no gene NF1, localizado no cromossomo 17, braço longo, parte 11.2
O que causa a síndrome de Hunter?
Deficiência da enzima iduronato-sulfatase
É uma herança recessiva ligada ao X (Xq28)
O que causa a distrofia muscular Duchenne/Becker?
Associada com fraqueza muscular
É ligada ao X (uma deleção)
O que piora a situação do paciente quanto a uma deleção?
Quando essa muda a leitura do códon
Qual é a vatangem de se utilizar o FISH e o array?
O FISH encontra o duplicado que o array não soube indicar onde estava
Depois, deve-se fazer o cariótipo da mãe e do pai para ver de onde veio o duplicado
