DNA struktur mm Flashcards
Vad är en nukleosid?
består av en kvävebas (en purin eller en pyrimidin) och en sockermolekyl (deoxiribos eller ribos). Om man dessutom lägger till en eller flera fosfatgrupper får man en nukleotid som är en byggsten i DNA och RNA.
vad är en nukleotid?
Nukleotider är fosforylerade nukleosider. En nukleotid består av:
en kvävebas (en purin eller en pyrimidin)
en sockermolekyl (deoxiribos i DNA, ribos i RNA) och
en eller flera fosfatgrupper
Vilka är puriner?
adenin (A) och
guanin (G)
Vilka är pyrimidiner?
cytosin (C) och
tymin (T) (endast i DNA) eller
uracil (U) (endast i RNA)
Vad är ribonukleotider?
Nukleotider där purin eller pyrimidine basen är bunden med ribos
DNA står för
deoxiribonukleinsyra
RNA står för
Ribonukleinsyra
Hur är kvävebaserna puriner byggda?
En sexring och en femring av kolatomer, med 2 kväveatomer(N) i varje ring. (A och G)
Hur är kvävebaserna pyrimidiner byggda?
De består av en sexring av kolatomer med två Kväveatomer (N). (T, c och U).
Vad är skillnad mellan tymin och uracil?
Tymin har en metylgrupp. Uracil finns i RNA och tymin i DNA. (varför?)
Vad är en deoiribos, jämfört med ribos?
är snarlik ribos , men prefixet deoxi- i namnet kommer från att OH-gruppen på kol nummer två är utbytt mot ett väte
3 skillnader DNA/RNA?
DNA är två fosfatgrupper från DNA:ts ”ryggrad” bundna till tredje respektive femte kolet, och en kvävebas till det första kolet i kedjan. I RNA är ribos det socker som används som byggsten. DNA är dubbelsträngat, RNA enkel. DNA har tymin, RNA istället uracil.
hur är ribos byggd?
5ring med 5 kol, en OH-grupp (hydroxylgrupp) på alla kolatomer utom 5´-kol (där är en syreatom som kopplar över till 1´-kol.)
Hur binder ribos och kvävebasen? = nukleosid
Genom 1´ -kol på ribos med en kväve (N) på kvävebasen. Det blir en kondensation=H20 bildas
Hur binds fosfatgrupp på nukleosid?= nukleotid
På ribosens 5´-kol. Då bildas H2O. . Bindningen kallas fosfodiester-bindning.
Vad heter nukleotiden då kvävebasen adenosin är med, och det finns 1, 2 resp 3 fosfatgrupper?
adenosinmonofosfat (AMP), adenosindifosfat, adenosintrifosfat (ATP)
vad gör en gen?
kodar för protein
Var bildas fosfdiesterbindning mellan två nukleotider?
5’-fosfat och 3’-OH hos två nukleotiders socker (ribos)
Vad kallas bindningen melan kvävebas och sockret (ribos)?
Glykosidbindning
Hur paras baserna ihop?
Med vätebindningar. 3 st mellan G och C, 2 st mellan resten (A,T,G)
vad menas antikodon?
Antikodon är den del av tRNA som binder till kodonet på mRNA. Antikodonet har en specifik sekvens av tre nukleotider som har en motsvarande frekvens hos mRNA, så att tRNA transporterar aminosyran till ribosomen som syntetiserar proteinerna
vad är en kodon?
Ett kodon är en följd av tre kvävebaser i nukleotiderna i en RNA-molekyl. Kan vara A, G, C, U)
Vilka stopkodoner finns?
kombinationerna UAA, UAG och UGA (TAA, TAG och TGA i DNA-kod).
vad menas stoppkodon?
Ett stoppkodon är ett kodon, det vill säga tre på varandra följande nukleotider i en mRNA-molekyl, som talar om för ribosomen att translationen skall avbrytasDe flesta kodon i mRNA motsvarar tillägget av en aminosyra till en växande polypeptidkedja i ribosomerna. Stoppkodon kodar dock inte för någon aminosyra, utan bara för terminering av translationen.
Vad menas nonsensemutation?
förändringar i DNA:t som introducerar ett stoppkodon tidigare i DNA-sekvensen än där det funnits från början
startkodon?
Ett kodon som signalerar initiering av proteintranslation (genetisk translation) genom att stimulera bindning av initierings-tRNA (transfer-RNA, met hos prokaryoter).
Vilken är startkodon hos prokaryoter/eukaryoter?
Hos prokaryoter kan AUG- och GUG-kodon fungera som startkodon, medan AUG är den enda initiatorn hos eukaryoter
Vad är kromatin och vilka sorter finns?
DNA lindat runt histon (+andra proteiner ingår). De finns i två former:• Eukromatin: öppen struktur, gener kan transkriberas.
• I heterokromatinet är det genetiska materialet tättpackat eller kondenserat. Kondenseringsgraden är så hög att cellen inte kan använda generna för transskription.
vad är en nukleosom?
En nukleosom består av ett histonkomplex, som innehåller två molekyler av vardera histon H2A, H2B, H3 och H4.
Vad är och gör kinetokoren?
det är en proteinstruktur vid kromosomens centromerområde. Vid celldelningen fäster mikrotubuli vid kinetokoren och drar de fördubblade dotterkromatiderna åtskiljs. Detta leder till att kromosomerna fördelas lika på de båda dottercellerna
Vad gör en colchininbehandling?
Colchicin förstör nämligen kärnspolens mikrotubuli, vilket leder till att de delande cellerna stannar upp i metafasstadiet. Colchicin gör också att kromosomerna kondenseras extra starkt. I en Colchicin-metafas liknar kromosomerna därför ofta bokstaven X.
Vad menas med konstitutivt respektive fakultativt heterokromatin?
Heterokromatin kan vara konstitutivt (ständigt sluten) eller fakultativt (kan övergå till eukromatin).
Supercoiling?
Tillåter DNA blir kompakt medan selektivt utryck av gener tillåts.??
Pseudogener?
Produceras av retrovirus som gör en DNA kopia av en messenger RNA.
Kan pseudogener bli uttryckta?
Nej, eftersom de fattas promotor och introner. Pseudogener replikeras med genomet men blir inaktiva.
Vad är repetitivt DNA?
Repeterade sekvener, från 2 till flera tusen,som är arrangerade i tandem. Genomet består av ca 30 % repetitivt DNA. En annan term är satellit DNA.
Vad är transposoner?
DNA sekvenser som kan hoppa till olika ställen i genomet.
Tre strukturer av dubbelhelixen?
B-formen (vanligast), A- och Z-formen
.
B-form av dubbelhelix?
B-formen, den vanligaste i kromosomalt DNA, högervriden.
A-formen av dubbelhelix?
A-formen, genom att dehydrera måttligt B, högervriden, konformationen i DNA-RNA hybrider är lik
Z-formen av dubbelhelix
Z-formen (zickzack) kan finnas i regioner där puriner och pyrimidiner alterneras. Övergången B och Z form i DNA tros spela rol i genuttryck-reglering
Två st signalerar initierar DNA-syntes
Celldelning och DNA-repair
Vad menas att cirkulärt DNA är supercoilat?
Dubbelhelixen korsar( tvistar) över sig själv en eller fler gånger
Supercoilng:
kompakterar DNA.
Positivt supercoiling = overwinding. Negativ = underwinding.
