DNA struktur mm Flashcards

1
Q

Vad är en nukleosid?

A

består av en kvävebas (en purin eller en pyrimidin) och en sockermolekyl (deoxiribos eller ribos). Om man dessutom lägger till en eller flera fosfatgrupper får man en nukleotid som är en byggsten i DNA och RNA.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

vad är en nukleotid?

A

Nukleotider är fosforylerade nukleosider. En nukleotid består av:
en kvävebas (en purin eller en pyrimidin)
en sockermolekyl (deoxiribos i DNA, ribos i RNA) och
en eller flera fosfatgrupper

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Vilka är puriner?

A

adenin (A) och

guanin (G)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Vilka är pyrimidiner?

A

cytosin (C) och
tymin (T) (endast i DNA) eller
uracil (U) (endast i RNA)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Vad är ribonukleotider?

A

Nukleotider där purin eller pyrimidine basen är bunden med ribos

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

DNA står för

A

deoxiribonukleinsyra

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

RNA står för

A

Ribonukleinsyra

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Hur är kvävebaserna puriner byggda?

A

En sexring och en femring av kolatomer, med 2 kväveatomer(N) i varje ring. (A och G)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Hur är kvävebaserna pyrimidiner byggda?

A

De består av en sexring av kolatomer med två Kväveatomer (N). (T, c och U).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Vad är skillnad mellan tymin och uracil?

A

Tymin har en metylgrupp. Uracil finns i RNA och tymin i DNA. (varför?)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Vad är en deoiribos, jämfört med ribos?

A

är snarlik ribos , men prefixet deoxi- i namnet kommer från att OH-gruppen på kol nummer två är utbytt mot ett väte

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

3 skillnader DNA/RNA?

A

DNA är två fosfatgrupper från DNA:ts ”ryggrad” bundna till tredje respektive femte kolet, och en kvävebas till det första kolet i kedjan. I RNA är ribos det socker som används som byggsten. DNA är dubbelsträngat, RNA enkel. DNA har tymin, RNA istället uracil.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

hur är ribos byggd?

A

5ring med 5 kol, en OH-grupp (hydroxylgrupp) på alla kolatomer utom 5´-kol (där är en syreatom som kopplar över till 1´-kol.)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Hur binder ribos och kvävebasen? = nukleosid

A

Genom 1´ -kol på ribos med en kväve (N) på kvävebasen. Det blir en kondensation=H20 bildas

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Hur binds fosfatgrupp på nukleosid?= nukleotid

A

På ribosens 5´-kol. Då bildas H2O. . Bindningen kallas fosfodiester-bindning.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Vad heter nukleotiden då kvävebasen adenosin är med, och det finns 1, 2 resp 3 fosfatgrupper?

A

adenosinmonofosfat (AMP), adenosindifosfat, adenosintrifosfat (ATP)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

vad gör en gen?

A

kodar för protein

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Var bildas fosfdiesterbindning mellan två nukleotider?

A

5’-fosfat och 3’-OH hos två nukleotiders socker (ribos)

19
Q

Vad kallas bindningen melan kvävebas och sockret (ribos)?

A

Glykosidbindning

20
Q

Hur paras baserna ihop?

A

Med vätebindningar. 3 st mellan G och C, 2 st mellan resten (A,T,G)

21
Q

vad menas antikodon?

A

Antikodon är den del av tRNA som binder till kodonet på mRNA. Antikodonet har en specifik sekvens av tre nukleotider som har en motsvarande frekvens hos mRNA, så att tRNA transporterar aminosyran till ribosomen som syntetiserar proteinerna

22
Q

vad är en kodon?

A

Ett kodon är en följd av tre kvävebaser i nukleotiderna i en RNA-molekyl. Kan vara A, G, C, U)

23
Q

Vilka stopkodoner finns?

A

kombinationerna UAA, UAG och UGA (TAA, TAG och TGA i DNA-kod).

24
Q

vad menas stoppkodon?

A

Ett stoppkodon är ett kodon, det vill säga tre på varandra följande nukleotider i en mRNA-molekyl, som talar om för ribosomen att translationen skall avbrytasDe flesta kodon i mRNA motsvarar tillägget av en aminosyra till en växande polypeptidkedja i ribosomerna. Stoppkodon kodar dock inte för någon aminosyra, utan bara för terminering av translationen.

25
Q

Vad menas nonsensemutation?

A

förändringar i DNA:t som introducerar ett stoppkodon tidigare i DNA-sekvensen än där det funnits från början

26
Q

startkodon?

A

Ett kodon som signalerar initiering av proteintranslation (genetisk translation) genom att stimulera bindning av initierings-tRNA (transfer-RNA, met hos prokaryoter).

27
Q

Vilken är startkodon hos prokaryoter/eukaryoter?

A

Hos prokaryoter kan AUG- och GUG-kodon fungera som startkodon, medan AUG är den enda initiatorn hos eukaryoter

28
Q

Vad är kromatin och vilka sorter finns?

A

DNA lindat runt histon (+andra proteiner ingår). De finns i två former:• Eukromatin: öppen struktur, gener kan transkriberas.
• I heterokromatinet är det genetiska materialet tättpackat eller kondenserat. Kondenseringsgraden är så hög att cellen inte kan använda generna för transskription.

29
Q

vad är en nukleosom?

A

En nukleosom består av ett histonkomplex, som innehåller två molekyler av vardera histon H2A, H2B, H3 och H4.

30
Q

Vad är och gör kinetokoren?

A

det är en proteinstruktur vid kromosomens centromerområde. Vid celldelningen fäster mikrotubuli vid kinetokoren och drar de fördubblade dotterkromatiderna åtskiljs. Detta leder till att kromosomerna fördelas lika på de båda dottercellerna

31
Q

Vad gör en colchininbehandling?

A

Colchicin förstör nämligen kärnspolens mikrotubuli, vilket leder till att de delande cellerna stannar upp i metafasstadiet. Colchicin gör också att kromosomerna kondenseras extra starkt. I en Colchicin-metafas liknar kromosomerna därför ofta bokstaven X.

32
Q

Vad menas med konstitutivt respektive fakultativt heterokromatin?

A

Heterokromatin kan vara konstitutivt (ständigt sluten) eller fakultativt (kan övergå till eukromatin).

33
Q

Supercoiling?

A

Tillåter DNA blir kompakt medan selektivt utryck av gener tillåts.??

34
Q

Pseudogener?

A

Produceras av retrovirus som gör en DNA kopia av en messenger RNA.

35
Q

Kan pseudogener bli uttryckta?

A

Nej, eftersom de fattas promotor och introner. Pseudogener replikeras med genomet men blir inaktiva.

36
Q

Vad är repetitivt DNA?

A

Repeterade sekvener, från 2 till flera tusen,som är arrangerade i tandem. Genomet består av ca 30 % repetitivt DNA. En annan term är satellit DNA.

37
Q

Vad är transposoner?

A

DNA sekvenser som kan hoppa till olika ställen i genomet.

38
Q

Tre strukturer av dubbelhelixen?

A

B-formen (vanligast), A- och Z-formen

.

39
Q

B-form av dubbelhelix?

A

B-formen, den vanligaste i kromosomalt DNA, högervriden.

40
Q

A-formen av dubbelhelix?

A

A-formen, genom att dehydrera måttligt B, högervriden, konformationen i DNA-RNA hybrider är lik

41
Q

Z-formen av dubbelhelix

A

Z-formen (zickzack) kan finnas i regioner där puriner och pyrimidiner alterneras. Övergången B och Z form i DNA tros spela rol i genuttryck-reglering

42
Q

Två st signalerar initierar DNA-syntes

A

Celldelning och DNA-repair

43
Q

Vad menas att cirkulärt DNA är supercoilat?

A

Dubbelhelixen korsar( tvistar) över sig själv en eller fler gånger

44
Q

Supercoilng:

A

kompakterar DNA.

Positivt supercoiling = overwinding. Negativ = underwinding.