Aminosyror/Proteiner Flashcards
Hur är den generella aminosyra-strukturen?
De har minst en aminogrupp (NH2). De har minst en karboxylgrupp (COOH). • De har en centrala kolatom som kallas alfakol (α-kol, Cα). Både aminogruppen och karboxylgruppen binder till α-kolet. • Det som skiljer olika aminosyror åt är sidokedjan (R).
Vad menas opolär?
En opolär molekyl saknar ett permanent elektriskt dipolmoment. Det beror på att laddningsfördelningen är symmetrisk över hela molekylen
Menas polär?
En polär molekyl är en molekyl som är övervägande positiv i minst en ände och negativ i andra.
Om en aminosyra är alifatisk är sidogruppen?
Enbart av kol/väte
Vad är hydrolys?
en molekyl klyvs i två delar efter att en vattenmolekyl har adderats. Hydrolysen kan katalyseras i närvaro av en syra (sur hydrolys) eller en bas (basisk hydrolys).
2 Aminosyror kan hydrolyseras, vilka?
Prolin och Lysin
Vad menas med alifatisk aminosyra?
De saknar en bensenring.
De alifatiska sidokedjorna är ganska hydrofoba. De är opolära, har oladdad R-grupp
Vad kännetecknar Prolin?
Prolin är den enda av aminosyrorna där sidokedjan binder både till α-C och aminogruppen. • Strukturen för prolin är mer ”rigid” än för de övriga.
Prolin är inte aromatisk = dvs har en bensenring.
Om en aminosyra är polär men oladdad, hur ser r-gruppen ut?
R-gruppen är då kol/syre/kväve
Hur är en aminosyra positiv?
De har en extra aminogrupp, kan då ta emot en proton = positivt laddad.
Vilka 3 st är positivt laddade?
Lysine (K)
Arginine (R)
Histidine (H)
(Histoner har dessa,=positiva)
Hur är en aminosyra negativt laddade?
De har en extra karboxylgrupp, kan då donera en proton = negativt laddad
Vilka 2 är negativt laddade r-grupper?
Aspartate (D)
Glutamate (E)
De alifatiska är…
opolära. oladdad R-grupp
Finns 7 st alifatiska (opolära):
Glycin(Gly) Alanine (Ala) Proline (P) Valine (V) Leucine(L) Isoleucine(I) Methionine (M)
Vad menas med aromatisk aminosyra?
deras sidokedja innehåller en aromatisk bensenring
Vilka 3 har aromatisk R-grupp?
Phenylalanine (Phe)
Tyrosin (Tyr)
Tryptophan (Trp)
För alla aminosyror, utom en, binder α-kolet 4
olika atomgrupper och därför kan aminosyrorna
förekomma som två olika spegelbildsisomerer. Vilken kan ej?
Glycin (Gly)
Aminosyror, som innehåller en hydroxylgrupp (-OH), är?
är polära och därmed ganska vattenlösliga. Med hjälp av aminosyrornas hydroxylgrupper kan proteinerna binda sockergruppen. Bindningen kallas O-glykosidbindning. Tyrosin skulle kunna hänföras till denna grupp.
Det finns 2 aminosyror som innehåller Svavel, vilka?
cystein och metionin
Vad är en disulfidbrygga?
Om två cysteiner finns i närheten av varandra kan de oxideras och
bilda en cystin.
• Om det sker i en proteinmolekyl, bildas en disulfidbrygga. (mellan två svavelatomer (kovalent) som bildas), då frigörs 2H + 2e-.
Vilken aminosyra kan bilda disulfidbrygga i ett protein?
Cystein.
En kan karboxyleseras:
Glutamat (E), är negativt laddad, (neg. laddad är ju även Aspartate- D)
Vad är en amidgrupp?
En amid är en kemisk förening som kan tänkas som en förening mellan ett karboxylsyrederivat och en amin
Det finns två aminosyror som har en amidgrupp:
asparagin (N) och glutamin (Q)
Varför kallas aminosyror med opolära sidokedjor för hydrofoba?
Opolära sidokedjor består främst av kolkedjor som inte vill interagera med vatten, utan istället undviker det. I vissa fall kan sidokedjan innehålla grupper som i vanliga fall är polära, men utklassas av övriga sidokedjans storlek. Tex trots att metionin (M) innehåller en svavelgrupp som man vanligtvis tänker är polär så är resten av sidokedjan opolär.
Vilka 7 st är opolära? (samma som alifatiska)
Glycin(Gly) Alanine (Ala) Proline (P) Valine (V) Leucine(L) Isoleucine(I) Methionine (M)
Vad menas opolär?
En opolär molekyl saknar ett permanent elektriskt dipolmoment. Det beror på att laddningsfördelningen är symmetrisk över hela molekylen
Menas polär?
En polär molekyl är en molekyl som är övervägande positiv i minst en ände och negativ i andra.
Vad menas med polära neutrala (oladdade) sidokedjor?
Polära neutrala sidokedjor innehåller atomgrupper som är väldigt elektronegativa, såsom hydroxi-grupper (-OH) eller tiolgrupper (-SH). Detta resulterar det i att sidokedjan blir polär, men neutral (oladdad) l, och de interagerar gärna med vatten. (5st)
Det finns 5 st som har polära neutrala (oladdade) R-grupp:
Serine- S Threosine- T Cysteine- C Asparagine- N Glutamine- Q
3 stpositivt laddade (vid normalt pH)(kallas då polära basiska) Rgrupper:
Lysine- K
Arginine- R
Histidine- H
Finns 2 st negativt laddade (vid normal pH) (kallas då polära sura) R grupper:
Aspartate- D
Glutamat (E)
Finns 7 st opolära (alifatiska)
(neutrala/ oladdade) R grupp
Glycin(Gly) Alanine (Ala) Proline (P) Valine (V) Leucine(L) Isoleucine(I) Methionine (M)
Vad menas med basiska sidokedjor?
Polära basiska sidokedjor innehåller någon form av basisk grupp, som exempelvis en aminogrupp. Vid neutralt pH är sidokedjan positivt laddad då den har tagit upp en proton.
