Aminosyror/Proteiner

Question 1

Hur är den generella aminosyra-strukturen?

Answer 1

De har minst en aminogrupp
 (NH2).
De har minst en karboxylgrupp (COOH).
• De har en centrala kolatom som kallas alfakol
(α-kol, Cα). Både aminogruppen och
karboxylgruppen binder till α-kolet.
• Det som skiljer olika aminosyror åt är
sidokedjan (R).

Question 2

Vad menas opolär?

Answer 2

En opolär molekyl saknar ett permanent elektriskt dipolmoment. Det beror på att laddningsfördelningen är symmetrisk över hela molekylen

Question 3

Menas polär?

Answer 3

En polär molekyl är en molekyl som är övervägande positiv i minst en ände och negativ i andra.

Question 4

Om en aminosyra är alifatisk är sidogruppen?

Answer 4

Enbart av kol/väte

Question 5

Vad är hydrolys?

Answer 5

en molekyl klyvs i två delar efter att en vattenmolekyl har adderats. Hydrolysen kan katalyseras i närvaro av en syra (sur hydrolys) eller en bas (basisk hydrolys).

Question 6

2 Aminosyror kan hydrolyseras, vilka?

Answer 6

Prolin och Lysin

Question 7

Vad menas med alifatisk aminosyra?

Answer 7

De saknar en bensenring.

De alifatiska sidokedjorna är ganska hydrofoba. De är opolära, har oladdad R-grupp

Question 8

Vad kännetecknar Prolin?

Answer 8

Prolin är den enda av aminosyrorna där sidokedjan binder både till α-C och aminogruppen. • Strukturen för prolin är mer ”rigid” än för de övriga.
Prolin är inte aromatisk = dvs har en bensenring.

Question 9

Om en aminosyra är polär men oladdad, hur ser r-gruppen ut?

Answer 9

R-gruppen är då kol/syre/kväve

Question 10

Hur är en aminosyra positiv?

Answer 10

De har en extra aminogrupp, kan då ta emot en proton = positivt laddad.

Question 11

Vilka 3 st är positivt laddade?

Answer 11

Lysine (K)
Arginine (R)
Histidine (H)
(Histoner har dessa,=positiva)

Question 12

Hur är en aminosyra negativt laddade?

Answer 12

De har en extra karboxylgrupp, kan då donera en proton = negativt laddad

Question 13

Vilka 2 är negativt laddade r-grupper?

Answer 13

Aspartate (D)

Glutamate (E)

Question 14

De alifatiska är…

Answer 14

opolära. oladdad R-grupp

Question 15

Finns 7 st alifatiska (opolära):

Answer 15

Glycin(Gly)
Alanine (Ala)
Proline (P)
Valine (V)
Leucine(L)
Isoleucine(I)
Methionine (M)

Question 16

Vad menas med aromatisk aminosyra?

Answer 16

deras sidokedja innehåller en aromatisk bensenring

Question 17

Vilka 3 har aromatisk R-grupp?

Answer 17

Phenylalanine (Phe)
Tyrosin (Tyr)
Tryptophan (Trp)

Question 18

För alla aminosyror, utom en, binder α-kolet 4
olika atomgrupper och därför kan aminosyrorna
förekomma som två olika spegelbildsisomerer. Vilken kan ej?

Answer 18

Glycin (Gly)

Question 19

Aminosyror, som innehåller en hydroxylgrupp (-OH), är?

Answer 19

är polära och därmed ganska vattenlösliga. Med hjälp av aminosyrornas hydroxylgrupper kan proteinerna binda sockergruppen. Bindningen kallas O-glykosidbindning. Tyrosin skulle kunna hänföras till denna grupp.

Question 20

Det finns 2 aminosyror som innehåller Svavel, vilka?

Answer 20

cystein och metionin

Question 21

Vad är en disulfidbrygga?

Answer 21

Om två cysteiner finns i närheten av varandra kan de oxideras och
bilda en cystin.
• Om det sker i en proteinmolekyl, bildas en disulfidbrygga. (mellan två svavelatomer (kovalent) som bildas), då frigörs 2H + 2e-.

Question 22

Vilken aminosyra kan bilda disulfidbrygga i ett protein?

Answer 22

Cystein.

Question 23

En kan karboxyleseras:

Answer 23

Glutamat (E), är negativt laddad, (neg. laddad är ju även Aspartate- D)

Question 24

Vad är en amidgrupp?

Answer 24

En amid är en kemisk förening som kan tänkas som en förening mellan ett karboxylsyrederivat och en amin

Question 25

Det finns två aminosyror som har en amidgrupp:

Answer 25

asparagin (N) och glutamin (Q)

Question 26

Varför kallas aminosyror med opolära sidokedjor för hydrofoba?

Answer 26

Opolära sidokedjor består främst av kolkedjor som inte vill interagera med vatten, utan istället undviker det. I vissa fall kan sidokedjan innehålla grupper som i vanliga fall är polära, men utklassas av övriga sidokedjans storlek. Tex trots att metionin (M) innehåller en svavelgrupp som man vanligtvis tänker är polär så är resten av sidokedjan opolär.

Question 27

Vilka 7 st är opolära? (samma som alifatiska)

Answer 27

Glycin(Gly)
Alanine (Ala)
Proline (P)
Valine (V)
Leucine(L)
Isoleucine(I)
Methionine (M)

Question 28

Vad menas opolär?

Answer 28

En opolär molekyl saknar ett permanent elektriskt dipolmoment. Det beror på att laddningsfördelningen är symmetrisk över hela molekylen

Question 29

Menas polär?

Answer 29

En polär molekyl är en molekyl som är övervägande positiv i minst en ände och negativ i andra.

Question 30

Vad menas med polära neutrala (oladdade) sidokedjor?

Answer 30

Polära neutrala sidokedjor innehåller atomgrupper som är väldigt elektronegativa, såsom hydroxi-grupper (-OH) eller tiolgrupper (-SH). Detta resulterar det i att sidokedjan blir polär, men neutral (oladdad) l, och de interagerar gärna med vatten. (5st)

Question 31

Det finns 5 st som har polära neutrala (oladdade) R-grupp:

Answer 31

Serine- S
Threosine- T
Cysteine- C
Asparagine- N
Glutamine- Q

Question 32

3 stpositivt laddade (vid normalt pH)(kallas då polära basiska) Rgrupper:

Answer 32

Lysine- K
Arginine- R
Histidine- H

Question 33

Finns 2 st negativt laddade (vid normal pH) (kallas då polära sura) R grupper:

Answer 33

Aspartate- D

Glutamat (E)

Question 34

Finns 7 st opolära (alifatiska)

(neutrala/ oladdade) R grupp

Answer 34

Glycin(Gly)
Alanine (Ala)
Proline (P)
Valine (V)
Leucine(L)
Isoleucine(I)
Methionine (M)

Question 35

Vad menas med basiska sidokedjor?

Answer 35

Polära basiska sidokedjor innehåller någon form av basisk grupp, som exempelvis en aminogrupp. Vid neutralt pH är sidokedjan positivt laddad då den har tagit upp en proton.