dna nanotechnology Flashcards
perchè le molecole di dna vengono utilizzate come building block ?
come viene sintetizzato il dna in lab ?
descrivi il duplex dal punto di vista entropico entalpico
come si misura la stabilità degli acidi nucleici?
come può essere predetta la tm ?
cosa è l’effetto ipocromo? disegna un grafico in cui mostri la curva di dna denaturato e nativo. asse y assorbanza e asse x lunghezza d’onda. fai un secondo grafico in cui metti in relazione assorbanza a 260 nm e temperatura.
dna triplex. come sono fatti ? disegnane uno TAT e CGC.
fai differenza tra dna triplex unimolecolare e monomolecolare
perchè CGC nel dna triplex è ph sensibile ? fai un grafico in cui rappresenti sulle y la frazione di triplex unfolfolded e sull’asse delle x il ph. fai questo grafico per un dna unimolecolare cgc e uno tat
metiltransferasi. cosa sono ? cosa fanno ? come si può monitorare la presenza di metiltransferasi in un campione in cui è presente un triplex con una guanina o più metilate ?
DNA i-motif
DNA g-quadruplex
dna hairpin o molecular beacon. spiega come è fatta questa struttura e poi spiega perchè con un duplez aperto si ha una tm minore rispetto a uno stem loop (come si chiama questo fenomeno? )
xeno-nucleic acid XNA. cosa sono in generale?
descrivi LNA se puoi disegnali. cosa succede alla molecola se al posto di mettere delle basi normali si mette LNA? a che enzimi è resistente il duplex di LNA ?
PNA. Cosa sono? come si accoppiano due strand di pna ? come avviene la sintesi? cosa comporta l’inserimento di pna nella molecola e perchè ? cosa succede ad un duplex di pna se lo mettiamo in acqua pura? a che enzimi sono resistenti?
fai un confronto tra LNA e PNA sulla solubilità in acqua
aptameri. cosa sono ? quali sono i loro ligandi? processo di selezione
sensore molecolare per la cocaina
secondo te perchè un’azienda potrebbe investire nell’uso di aptameri e sostituirli agli anticorpi?
sensore elettrochimico per la trombina
cosa è holliday junction ? applicazioni biotech, parla dei motivi strutturali principali.
dna origami come sono fatti? come si formano in laboratorio? spiega anche la tecnica di sungle stranded tile e spiega i vantaggi
applicazioni biotech degli origami a dna (ne abbiamo fatte 3 )
Toehold-mediated Strand Displacement. cosa è e come avviene. spiega la reazione dal punto di vista cinetico e termodinamico e quali sono i fattori che la influenzano. rappresenta la reazione graficamente mettendo sulle y la velocità e sulle x la lunghezza del toehold