Cytoskelet Flashcards

1
Q

Cytoskelet - typy + Buňky střevního epitelu, Fibroblast

A
  • Fce: tvar a pevnost buněk, opora pro organely, pohyby buněk, polarizace, buněčné dělení, transport organel
  • Typy:
    1.Mikrofilamenta:
  • d=7 nm
  • nejtenčí, dynamické, polarizované, ohebné
  • vlákna z aktinového monomeru
  • motorové proteiny = MYOSINY
  • buněčný pohyb a tvar
    2.Intermediální filamenta:
  • d=10 nm
  • POUZE u živočichů
  • ,,lano’’
  • odolné, pevné
  • mnoho druhů, tkáňově specifické
  • vlákna z fibrilárních proteinů
  • tvar a pevnost buňky
  • nepolarizované
  • nemají motory
    3.Mikrotubuly:
  • d=25 nm
  • dlouhé duté válce
  • dynamické, neohebné, polarizované
  • vlákna z tubulinového dimeru (alfa, beta)
  • transport váčků, organel a chromosomů, pohyb buňky
  • motorové proteiny = DYNEINY a KINOSINY

-BUŇKY STŘEVNÍHO EPITELU:
- polarizace je zajištěná cytoskeletem (apikální a basolaterální strana)
- Mikroklky = svazky mikrofilament
-FIBROBLAST:
- živočišná buňka
- umí se pohybovat = hustá síť mikrofilament pod membránou + mikrotubuly

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Mikrofilamenta - velikost, charakteristika, stavba, typy

A
  • d=7 nm
  • velmi dynamické, umí polymerovat/depolymerovat, pružné a ohebné
  • buněčný pohyb a udržování tvaru
  • vlákna jsou polární -> + a - konec
  • Stavba: aktin, pro polymeraci potřeba ATP
  • motorové proteiny: myosiny
  • tvorba svazků (bundlers) nebo sítí (crosslinkers) spolu s aktin-vazebnými proteiny
  • Výběžky, mikroklky, kortikální síť, kruhy, filopodia, stresová vlákna, kontraktilní prstenec
  • BUNDLERS: fascin, fimbrin, alfa-aktinin
  • CROSSLINKERS: spectrin, filamin, dystrophin
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Mikrofilamenta - Interakce mikrofilament s membránou

A
  • kortikální síť
  • SPEKTRIN:
  • = aktinový crosslinker
  • v membráně erytrocytů
  • interakce s transmembránovými proteiny (přes adapterové proteiny) a aktinem
  • Adapterové proteiny - Band 4.1, ankyrin
  • u všech Metazoa (mnohobuněční)
  • mikrofilamenta stabilizovaná TROPOMYOSINEM a TROPOMODULINEM
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Mikrofilamenta - Aktin - charakteristiky, typy

A
  • u všech Eukaryota, nekonzervovanější protein (spolu s hitony)
  • 2 formy: Globulární/Filamentární
    A) GLOBULÁRNÍ AKTIN:
  • G-aktin
  • rozpustná forma, nepolymerizovaná
  • 4 domény, uprostřed se váže ATP/ADP
  • vazba Mg2+ (všechny nukleotid vazebné proteiny mají Mg2+ jako kofaktor)
  • ve struktuře je patrná rýha -> možný vstup/výměna ATP
  • Polymerace: konec s rýhou nasedne na konec bez rýhy -> 2 různé konce
    B) FILAMENTÁRNÍ AKTIN:
  • F-aktin
  • polarizace do filament s navázaným ADP
  • ATP je jen na koncích
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Mikrofilamenta - Mechanismus polymerace aktinu + aktinové inhibitory

A
  • start: přidání iontů K+, Na+ nebo Mg2+
  • 3 fáze:
    a) NUKLEACE:
  • = pomalý proces, tvoří se nukleační jádra
    b) ELONGACE:
  • rychlý růst na obou koncích
  • koncentrace G-aktinu je ještě vysoká
  • dosažení rovnovážného stavu F a G aktinu = Kritická koncentrace G-aktinu
    c) STABILNÍ FÁZE:
  • Neustálá depolymerace/polymerace na obou koncích
  • poměr F a G aktinu je stabilní

Aktinové inhibitory:
- LATRUNCULIN váže volnou G formu aktinu a brání v polymeraci - PHALOIDIN (mochomůrkový jed), váže F aktin a zabraňuje depolymeraci

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Mikrofilamenta - Kritická koncentrace aktinu

A
  • = koncentrace aktinu, kdy za daných podmínek (teplota, pH…) dochází k polymeraci G aktinu na F aktin
  • po přidání dalšího G aktinu se navýší koncentrace F aktinu, ale G aktin je ve stejném množství
  • Preferenčně polymerizuje G aktin s ATP
  • koncentrace G aktinu = (0,12-0,6) růst vlákna na + konci a rozpad na - konci => Treadmilling, mechanismus běžeckého pásu
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Mikrofilamenta - Regulátory polymerace aktinu

A
  • PROFILIN - polymerace, váže G aktiny v ATP či ADP formě, jako nucleotic exchange factor
  • THYMOSIN BETA 4 - váže aktivovaný G aktin ATP, zabraňuje jeho depolymeraci
  • COFILIN - rozdělování vláken aktinu na - konci, depolymerace
  • TROPOMYOSINY - coiled coil helikální strukturou -> stabilizace mirkofilament
  • CAPPING (ČEPIČKOVÉ) PROTEINY - vazba + konce, brání růst vlákna
  • TROPOMODULIN - opak capping proteinu, váže - konec mikrofilamenta a brání rozpadu
  • STŘÍHACÍ (SEVERING) PROTEINY - umí rozstřihnout mikrofilamenta
  • NUKLEAČNÍ PROTEINY - tvorba de novo nukleačního jádra, stimulace polymerace mikrofilament
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Mikrofilamenta - Polymerace aktinu jako síla pro buněčný pohyb -

A
  • spolupráce aktin vazebných proteinů
  • Lamelopodia pohyblivé savčí buňky
  • aktivace WASp proteinů -> aktivátory Arp2/3 komplexu -> větvení mikrofilament -> tvorba nových nukleačních center
  • Profilin - polymerace, aktivní dimer a aktinem
  • Cofilin - depolymerace dál od membrány
  • Celý proces je poháněn za spotřeby ATP
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Mikrofilamenta - Myosin

A
  • všechny Eukaryoty
  • jsou to ATPázy
  • pohyb po mikrofilamentech k + konci
  • hlavička, motorová doména s ATPázovou aktivitou, ATP vazebné místo
  • hlavička váže aktin a regulační pojednotky
  • Rakce na Ca2+
  • 3 Typy:
    1) TYP I:
  • monomer s kalmodulinem
  • vazba na membránu, tvorba endocytózy a váčkový transport
    2) TYP II:
  • ve svalových vláknech
    3) TYP V:
  • transportní váčky organely -> 1 konformace
  • Natažená konformace - s ATP, není vazba k aktinu
  • Konformace v záběru - s ADP/bez navázaného nukleotidu
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Mikrofilamenta - Příklady mimosvalové funkce myosinů

A
  • Myosin II se účastní změn buněčného tvaru, adheze a cytokineze
    -> používaný při buněčném zaškrcování - tvorba kontraktilního prstence
  • Myosin V - vnitrobuněčný transport organel a váčků
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Mikrofilamenta - Regulace buněčného pohybu

A
  • role malých G proteinů - rodiny Rac, Rho, Cdc42
    -> příbuzní rodiny Ras
  • příjem signálů z vnějšku a regulace polymerace aktinu (formin, Arp2/3), cofilinu…
  • aktivní s GTP
  • Druzí poslové - PIP2 (regulace aktin vazebných vláken), Ca2+ (regulace aktin vazebných vláken + myosinu)
  • Leading edge buňky: Aktivace Cdc42 a Rac -> polymerace aktinu
  • Opačná strana: Aktivace Rho -> aktivace myosinu a forminu, stah stresových vláken
  • Výsledek: polymerace a posun buňky k vedoucímu okraji
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Mikrofilamenta - Aktin vazebné proteiny

A
  • inhibitory/aktivátoři polymerace
  • Bundlers (svazky)
  • Crosslinkers (sítě)
  • Motorové proteiny (myosin)
  • Stabilizátory (tropomyosin)
  • Stříhací (severing) proteiny
  • Kotvící proteiny pro mikrofilamenta
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Mikrotubuly - charakteristika, stavba, funkce

A
  • dlouhé duté válce
  • d=25 nm
  • polarizace, + a - konec, dynamika rozpadu
  • motorové proteiny: Kineziny, dyneiny
  • transport váčků a organel, úlohy při buněčném dělení (dráhy pro rozdělení chromosomů), buněčný pohyb bičíky
  • růst tubulinu na + konci
    STAVBA:
  • alfa-/beta-tubulin
  • alfa-tubulin-GTP, beta-tubulin-GDP
  • dlouhé řetězce tubulinu = PROTOFILAMENTA -> 13 protofilament k sobě -> válec -> MIKROTUBULOVÝ SINGLET
  • mohou se tvořit DUPLETY 13+10 protofilament (bičík, flagella) nebo TRIPLETY 13+10+10 (centrioly, bazální tělíska)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Mikrotubuly - Mikrotubuly organizující tělíska (MTOC)

A
  • místo, kde mikrotubuly začínají růst, zachycené - konci
  • ŽIVOČICHOVÉ = Centrosom, bazální tělísko (bičík)
  • ROSTLINY = MTOC je difuzní
    CENTROSOM:
  • ze 2 centriol - struktura 13+10+10 tripletů, obsahují amorfní proteinovou hmotu -> zde GAMMA TUBULINOVÉ PRSTENCE = nukleační centrum, start polymerace
  • růst mikrotubulů probíhá na + konci
  • Volné MT vniklé rozpadem nebo odštěpením se pohybují mechanismem běžeckého pásu (treadmilling)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Mikrotubuly - Dynamická nestabilita

A
  • dynamické zkracování a prodlužování
  • KATASTROFA a ZÁCHRANA (rescue) = body zlomu
  • Polymeruje jen GTP tubulin -> za řadí se na místo -> hydrolýza GTP->GDP -> konec přestane být chráněn GTP čepičkou -> Katastrofa -> protofilamenta se rozpadají jako banán
  • po určité době dojde k zastavení a obnovení růstu = záchrana
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Mikrotubuly - S mikrotubuly asociované proteiny

A

1.Proteiny stabilizující mikrotubuly:
- chrání + konce před rozpadem
- vážou se z boku MT
- TAU proteiny v neuronech: chrání + konce a vymezují rozestupy mezi MT
- +TIP: vážou se do švů a zabraňují tak rozpadu MT, např. protein EB1
2.Proteiny destabilizující mikrotubuly:
- rozvolňují - konec MT na protofilamenta
- KINESIN 13: motorový protein MT, 13 pohromadě ale destabilizuje, jeho ATPázová doména odštěpuje GTP čepičku
- KATANIN: umí přeseknou mikrotubul

16
Q

Mikrotubuly - Motorové proteiny

A
  • pohyb po MT na spotřeby ATP
  • až 3 um/s
    1.KINESINY:
  • pohyb k + konci (k okraji buňky)
  • Kinesin 14: pohyb k - konci
  • fungují v dimeru
  • Kinesin 1: nejběžnější
  • Kinesin 5: heterodimer, oběma konci interaguje s MT -> klouzavý pohyb 2 MT od sebe
  • Kinesin 13: rozpan MT
  • Mitotické kinesiny: transport chromosomů k + i k - konci
    2.DYNEINY:
  • transport organel k - konci (do středu)
  • váže na sebe náklad pomocí DYNAKTINU (proteinový komplex)
17
Q

Mikrotubuly - Mikrotubuly během mitózy, rozestup chromosomů v anafázi

A
  • Mitóza - kompletní přebudování MT
  • Duplikace centrosomu -> opačné póly buňky se rozestoupí -> kinetochorové a polární MT se účastní dělení chromosomů, astrální MT uchycení k opačným pólům buňky
  • Astrální MT: směřují k okrajům buňky a vážou centrosom k membráně
  • Kinetochorové MT: vážou kinetochor, přibližují chromosomy k centrosomům
  • Polární MT: směřují mezi dvěma centrosomy
    ROZESTUP CHROMOSOMŮ V ANAFÁZI:
  • depolymerace kinetochorových MT
  • KINESINY 13 - na kinetochoru, depolaymerace + konců připojených na kinetochor
  • KINESIN 5 - polární MT, klouzání dvou MT od sebe
  • KINESIN 4 - táhne ramena chromosomů k opačnému pólu
18
Q

Mikrotubuly - Postttranslační modifikace tubulinu

A
  • acetylace
  • fosforylace
  • proteolytické štěpení
  • polyaminace glutaminu (přidání kladného náboje)
  • polyglycylace
  • polyglutamylace glutamátů
  • reversibilní detyrosinace C konce alfa-tubulinu
  • kombinace modifikací => TUBULINOVÝ KÓD
19
Q

Intermediální filamenta - charakteristika, rodiny

A
  • pouze u živočišných buněk (zbytek mají buněčnou stěnu)
  • mechanická pevnost, tvar a opora buněk
  • na rozdíl od MT a MF neváží nukleotidy, nejsou polarizované, nejsou dynamické, nemají motory
  • tvořené z FILAMENTÁRNÍCH monomerů
  • monomer -> dimery -> tetramery -> mikrofilamenta
  • základní stavební jednotka = Coiled-coil dimer proteinu
  • Mikrofilamenta = 5 skupin, jen jedna (laminy) u nižších živočichů
  • KERATINY (acidické, bazické) = v epiteliálních buňkách, mechanická pevnost a pružnost
  • z odumřelých speciálních typů epiteliálních buněk jsou kožní deriváty, mnoho keratinu, stabilizace S-S vazbami
  • SKUPINA III = ve svalech, např. DESMIN, VIMENTIN
  • NEUROFILAMENTA = pevnost axonů
  • LAMINY = jediné, co je u nižších živočichů, organizace jádra