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mmd1045 INTRA > Cytogénétique > Flashcards

Cytogénétique Flashcards

1
Q

Caryotype = ?

A

Classement des chromosomes selon un ordre établi par entente internationnale.

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2
Q

caryotype permet de …?

A

Permet
* D’analyser la structure des chromosomes
* De comparer les 2 homologues

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3
Q

comment établir le caryotype?

A
  • La première étape consiste à compter le nombre de chromosomes
  • Par la suite, l’analyse des chromosomes se base sur
    –> La taille des chromosomes
    —> Classés du plus grand au plus petit (1 à 22); la 23è paire constitue les gonosomes qui sont classés à part
    –> La forme des chromosomes
    –> Le marquage particulier à chacun des chromosomes
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4
Q

La morphologie des chromosomes
comment forme est déterminée
+ 3 types de formes du chromosome :

A

La forme des chromosomes est déterminée par la position du centromère
Cette forme est constante pour une paire de chromosome donnée mais elle varie d’une paire à l’autre

  1. Métacentrique:
    Position du centromère au centre entraîne 2 bras symétriques
  2. Submétacentrique:
    Position du centromère entraîne 2 bras asymétriques
  3. Acrocentrique:
    Position du centromère à une extrémité entraîne un très petit bras court
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5
Q

majorité des chromosome sont de quelle forme?

A

Submétacentrique

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6
Q

bras p =?

A

bras court — en haut du centromère (entente internationele)

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7
Q

bras q = ?

A

bras long – sous le centromère

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8
Q

Le marquage chromosomique = ?

A

Le marquage est constant pour une paire donnée et permet de la distinguer d’une autre paire

Le marquage varie d’une paire à l’autre

marquage se fait selon la condensation de la chromatine — bandes foncées = portion du chromosome les plus condensées (moins digérés par la trypsine)
et inversement

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9
Q

Pré-requis pour l’obtention des chromosomes :

A

Cellules qui se divisent car étudiés en métaphase de la mitose (ie lors d’une division cellulaire) * Spontanément:
− Fibroblastes de la peau ou du fascia, amniocytes
− Cellules tumorales (hémopathies ou tumeurs solides)
* Par stimulation: lymphocytes T sanguins peuvent se diviser suite à la stimulation par la PHA (phytohématoglutinine)

cellules sanguines = cellules qui ne se divisent plus - donc doit être remises dasn le cycle cellulaire (métaphase)
ajout de PHA qui peut remettre les LT dans le cycle cellualire

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10
Q

Obtention des chromosomes - caryotype:
nécessite quoi

A

Nécessite
- une culture cellulaire
- arrêt du cycle cellulaire en métaphase en ajoutant inhibiteur du fuseau mitotique (Colcemid)
- récolte des chromosomes après un traitement hypotonique de la cellule

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11
Q

Formule chromosomique = ?
Elle est constituée des éléments suivants:

A

C’est la composition en chromosomes d’une cellule donnée.
Elle est constituée des éléments suivants:
* Le nombre total de chromosomes par cellule: 46 ou 47 ou …
* Les gonosomes (XX ou XY)
* L’indication de l’anomalie chromosomique, s’il y en a une
* S’il n’y a pas d’anomalie: 46,XX ou 46,XY
* Exemple d’anomalie: 47,XX,+13 ou trisomie 13

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12
Q

constitution chromosomique = ?
Pour déterminer la constitution chromosomique d’un individu, on doit analyser un minimum de … cellules différentes

A
  • Composition en chromosome de l’ensemble des cellules d’un individu

Pour déterminer la constitution chromosomique d’un individu, on doit analyser un minimum de 10 cellules différentes

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13
Q

en majorité des cas - la consitution chromosomique est … ?

A

identique dans les 10 cellules analysées

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14
Q

Constitution chromosomique non homogène ou mosaïque = ?

A
  • Lorsqu’on retrouve 2 types ou plus de cellules chez le même individu
  • On parle de mosaïcisme pour une anomalie chromosomique lorsque les types cellulaires proviennent d’un même zygote
    On parle de lignées cellulaires
  • Due à des anomalies dans la ségrégation mitotique des chromosomes
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15
Q

Anomalies chromosomiques = ?

A

anomalies/Modifications de l’euchromatine des chromosomes

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16
Q

vrai ou faux. Les anomalies chromosomiques sont habituellement visibles au microscope et donc touchent qu’un gène.

A

faux. Les anomalies chromosomiques sont habituellement visibles au microscope et donc touchent plusieurs gènes (plus de plusieurs dizaines)

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17
Q

Une anomalie chromosomique qui modifie la quantité d’euchromatine dans le génome entraîne …

Si l’anomalie ne touche que l’hétérochromatine on parle de …

A

Une anomalie chromosomique qui modifie la quantité d’euchromatine dans le génome entraîne un effet sur le phénotype

Si l’anomalie ne touche que l’hétérochromatine on parle de variant chromosomique et est sans effet sur le phénotype

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18
Q

Les anomalies chromosomiques
Deux grands types:

A

*Anomalies de nombre *Anomalies de structure

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19
Q

types d’anomalies de nombre :

A

Polyploïdie: addition d’un ou plusieurs complément haploïde (n):
−Triploïdie: 69,XXX (3n)
* Tétraploïdie: 92,XXXX (4n)

Aneuploïdie: touche une seule paire d’homologue dont le nombre est augmenté ou diminué:
* Trisomie: 47,XY,+21 (3 chromosomes 21)
* Monosomie: 45,X (1 seul chromosome X)

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20
Q

les 2 mécanismes de la triploïdie : 6

A

dygénie — complément supplémentaire vient de la maman (ovaire 46 + spermato 23)

diandrie — complément supplémentaire provient du papa (spermato 46 + ovaire) ou 2 spermato à 23 qui féconde en même temps ovaire à 23

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21
Q

cause la plus fréquente de triplïdie = ?
+ conséquences diandrie et dygénie

A
  • Cause la plus fréquente: Diandrie 84%
    *fécondation d’un ovule par 2 spermatozoïdes ou dispermie
    – > Retard de croissance important (RCIU), kystes du placenta (changements molaires), peu viable

Dans les cas maternels (Digynie): placenta hypotrophique, syndactylies 2-3, RCIU

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22
Q

cause de l’aneuploïdie = ?

A

Résulte d’une erreur dans la répartition des chromosomes lors de la division cellulaire (lors de la méiose)
* Pour être homogène doit se faire en méiose
* Non dysjonction en mitose entraîne un mosaïcisme tissulaire

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23
Q

les monosomies de chromosome complet sont-elles viables?

+ facteur de risque pour aneuploïodie – ?

A
  • Sauf pour le chromosome X, les monosomies d’un chromosome complet ne sont pas viables
  • Âge maternel avancé (plus de 35 ans) constitue un facteur de risque
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24
Q

Non-dysjonction en méiose 1 – ?
Non-dysjonction Méiose 2 – ?
la plus fréquente?

A

Non-dysjontion MI:
Deux chromosomes homologues (différents du même parent) demeurent dans le même gamète
- Type le plus fréquent

Non-dysjontion MII:
* Deux chromatides sœurs demeurent dans le même gamète (donc 2 chromosomes identiques sauf pour les recombinaisons subies)

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25
Q

Trisomies et effet de l’âge maternel (en termes de méiose)

A

> 90% des trisomies origine de la méiose maternelle

> Erreur en méiose 1 le plus souvent
* sauf pour trisomie 18 où l’erreur en méiose 2 est plus fréquente
Effet de l’âge maternel est présent pour les erreurs en méiose 1 et en méiose 2

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26
Q

impact de recombinaisons sur la non-dysjonction : ?
près du télomère/ près du centromère = quel risque est le plus élevé
+ quel démographique en termes d’âge est touchée + ça affecte quelle méiose?

A

L’absence de recombinaisons et les recombinaisons en positions télomériques sont des facteurs de risque pour la non-dysjonction à tout âge
* Erreur de méiose 1
* Le bivalent ségrégerait de façon plus ou moins indépendante

Les recombinaisons péricentromériques: facteur de risque chez la femme plus âgée
* Erreur en M2
* Interfèrerait avec la cohésion normale des chromatides soeurs

risque plus élevé quand cest près du centromère

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27
Q

à part patron des recombinaison - sur quel facteur l’âge maternel a un impact dans la méiose?

A

Vieillissement du fuseau mitotique

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28
Q

syndrome de Turner = ?

A
  • 2% des conceptions
  • 90% résultent en avortements spontanés (phénotypes les plus sévères avec hydrops = œdème généralisé du fœtus/embryon)
  • Majorité: non-disjonction dans les gamètes paternels
  • 1/2000 nouveau-né féminins
  • À la naissance: phénotype variable, intelligence normale
    —> Le plus constant: courte taille proportionnée et dysgénésie gonadique

Intelligence normale
* Difficultés spatio-temporelles, d’attention possibles

Courte taille proportionnée

Insuffisance ovarienne par dysgénésie gonadique:
* Absence ou non complétion de la puberté spontanée
* Aménorrhée primaire
* Infertilité (possible avec nouvelles technologies reproductives)
…

Majorité des cas — dysjonction provient du gamète paternel

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29
Q

Syndrome de Turner étiologie cytogénétique : ?

A

Formule chromosomique 45,X dans
* 55% des cas de façon homogène
* 20% en mosaïque (avec lignée 46,XX ou 46,XY); donc origine post- zygotique/mitotique

Anomalie de structure d’un chromosome X dans 25% des cas homogène ou en mosaïque * Isochromosome Xq, délétion, etc.

30
Q

Triple X ou 47,XXX - description = ?

A

Incidence 1/1000 filles
* Phénotype féminin
* Intelligence normale mais légèrement diminuée p/r à fratrie
—> Difficultés d’apprentissage fréquentes

  • Grande taille
  • Pas de malformation ou de dysmorphies
  • Fertilité normale
31
Q

Syndrome de Klinefelter ou 47, XXY - description = ?

A

Incidence 1/500 garçons
Phénotype masculin
Intelligence normale mais légèrement diminuée p/r à fratrie
– > Difficultés d’apprentissage fréquentes
Grande taille
Hypogonadisme (petits testicules)
* Infertilité (possible avec nouvelles technologies reproductives)
* Risque de gynécomastie
* Caractères sexuels secondaires peu développés

32
Q

47,XYY - descrtiption

A

Incidence 1/900 garçons
Phénotype masculin normal
Intelligence normale mais légèrement diminuée p/r à fratrie
* Difficultés d’apprentissage fréquentes
* Impulsivité possible

33
Q

3 aneuploïdies fréquentes = ?

A

Syndrome de Down ou trisomie 21

Trisomie 13 ou syndrome de Patau

Trisomie 18 ou syndrome d’Edward

34
Q

Syndrome de Down ou trisomie 21 47,XX,+21 ou 47,XY,+21
+ phénotype du syndrome

A
  • Incidence 1/660
  • Première anomalie chromosomique décrite chez l’humain
  • Incidence augmente avec l’âge maternel * 1/1250 à 25 ans
  • 1/840 à 30 ans
  • 1/356 à 35 ans
    Jones et al.
  • 1/94 à 40 ans
  • 1/24 à 45 ans
  • 95% causée par une non disjonction méiotique lors de la méiose maternelle
  • Formes plus rares (translocation 2.5%, mosaicisme 2.5%)

phénotype du syndrome:
* Retard mental léger à modéré
* Bon tempéremment
* Hypotonie

  • Traits physiques caractéristiques:
  • Occiput plat
  • Visage rond
  • Orientation des fentes palpébrales vers le haut * Replis épicanthiques
  • Protrusion de la langue
  • Plis palmaires transverses
  • Clinodactylie 5è doigts
  • Malformations cardiaques 40% (canal atrio-ventriculaire)
  • Malformations gastro-intestinales 12% (atrésie duodénale, de l’œsophage) * Risque de leucémie ~1%
35
Q

Trisomie 13 ou syndrome de Patau 47,XX,+13 ou 47,XY,+13

A
  • Incidence 1/5000
  • Retard mental sévère
  • Fente labio-palatine
  • Polydactylie
    => Malformation cérébrale sévère (holoprosencéphalie)
  • Malformations cardiaques, rénales et autres

Anomalies létale le plus souvent:
* Survie médiane 7 jours
* 91% décèdent dans la 1ère année
* Survie à long terme 5-10%

36
Q

Trisomie 18 ou syndrome d’Edward 47,XX,+18 ou 47,XY,+18

A
  • Incidence 1/6000-1/8000
  • Retard mental sévère
  • Retard de croissance
  • Mains fermées
    – > 2ème sur 3ème doigt et 5ème sur 4ème doigt
  • Pieds en piolets
  • Malformations cardiaques, digestives, rénales fréquentes

Anomalie létale le plus souvent:
* Survie médiane 14.5 jours
* 5-10% survivent au-delà de la première année

37
Q

Anomalies de structures
Définition:

A
  • modifications dans la forme des chromosomes
  • Presque toujours dues à des cassures

Un chromosome peut être le site d’une ou de plusieurs cassures transversales. Plus d’un chromosome peuvent subir des cassures en même temps.

Un chromosome peut être le site d’une ou de plusieurs cassures transversales. Plus d’un chromosome peuvent subir des cassures en même temps.

38
Q

Suite à une ou des cassures:
au niveau du fragment

A
  • le fragment peut se perdre,
  • se recoller exactement comme il était avant la cassure (on ne le verra pas),
  • se recoller différemment (au même endroit ou ailleurs)
39
Q

Une seule cassure: La délétion terminale
+ syndrome engendré

A

Délétion: perte de matériel sur un chromosome.
Le fragment qui ne contient pas de centromère et qui ne se recolle pas sera perdu lors des divisions
cellulaires (fragment acentrique).
Les cellules filles conservent le chromosome cassé, c’est-à-dire le segment chromosomique qui contient le centromère.
Ceci donnera une délétion terminale (del).

Syndrome du Cri-du-Chat
Délétion terminale du bras court du chromosome 5
Retard de croissance
Cri caractéristique à la naissance Retard mental

40
Q

Délétion interstitielle = ?

A

Deux cassures à l’intérieur d’un même bras chromosomique
Perte du matériel entre les 2 points de cassure (fragment acentrique) Fusion aux 2 points de cassure

41
Q

l’inversion paracentrique = ?

A
  • Deux cassures dans un même chromosome
    Si les cassures affectent le même bras chromosomique (le bras court p ou le bras long q) et s’il n’y a pas perte du segment,
    Le segment chromosomique peut se recoller à l’envers ce qui entraînera une inversion paracentrique (inv).

Si les cassures affectent chacun des bras chromosomiques (le bras court p et le bras long q) et est donc de part et d’autre du centromère
Le segment chromosomique peut se recoller à l’envers ce qui entraînera une inversion péricentrique (inv).
Ce type d’inversion change la position du centromère

42
Q

la translocation = ?
+ types de translocations: ?

A

Lorsqu’il y a deux cassures qui se produisent sur deux chromosomes différents (une cassure sur chaque chromosome),
Qu’il y a échange de matériel chromosomique + recollage des segments

On distingue deux sortes de translocation:
* la translocation réciproque − Exemple: t (9;22)
* la translocation robertsonienne
* Exemple.: rob(13;15) ou der(13;15)
Elles peuvent être équilibrées ou déséquilibrées.

43
Q

Translocations réciproques équilibrées
se font entre quels chromosomes
impact sur nombre de chromosomes
impact sur matériel chromosomique
impact sur phénotype
risque sur la ségrégation des chromosomes:

A
  • Les translocations réciproques se font entre des chromosomes non-homologues et le long des bras chromosomiques;
  • Ne fait pas varier le nombre de chromosomes (46);
  • Ne s’accompagne d’aucune perte de matériel chromosomique
    et par conséquent
  • N’entraîne pas d’effet sur le phénotype (l’individu porteur est
  • phénotypiquement normal);
  • Présente un risque de ségrégation non-équilibrée lors des divisions de la méiose et par conséquent un risque accru
  • de phénotype anormal chez les descendants * de fausse couche
  • d’infertilité
44
Q

Chez le porteur d’une translocation réciproque équilibrée (pour les deux chromosomes impliqués dans la translocation), ses gamètes peuvent contenir soit:
+ impact du troisième évènements

A
  • deux chromosomes normaux;
  • deux chromosomes transloqués mais équilibrés (comme le parent porteur);
  • un chromosome transloqué et un normal. = > Cette troisième combinaison, appelée ségrégation nonéquilibrée, produira des zygotes anormaux avec une monosomie et une trisomie partielles combinées, et donc porteurs d’une translocation non-équilibrée.
    L’enfant, si viable, sera de phénotype anormal.
45
Q

Translocations Robertsonnienne = ?

A

Survient après cassures et recollement au niveau des centromères des chromosomes acrocentriques (13, 14, 15, 21, 22);

46
Q

Translocation Robertsonnienne et trisomie 21

A
  • LatranslocationRobertsonniennenonéquilibrée est en cause dans 2.5% des cas de trisomie 21
47
Q

utilité de savoir le caryotype de l’enfant dans la trisomie (translocation vs libre)

A
  • Aneuploidieoutrisomielibre:~1%
  • Translocation Roberstonnienne non-équilibrée:
    — selon le statut de porteur des parents: de novo
    <1%
    — Un parent porteur a un risque de récurrence
    de trisomie 21
  • 15% pour une femme * 1% pour un homme

Lecaryotypedesparentsneserapasnécessaire
si aneuploidie mais primordial si translocation

48
Q

La cytogénétique moléculaire = ?
+ techniques associées:

A

Permet d’étudier le génome humain d’une façon plus fine que le caryotype standard

2 techniques seront abordées:
* Hydridation in situ en fluorescence (FISH)
* Hybridation génomique comparative sur micropuce

49
Q

Hybridation in situ en fluorescence (FISH)
Définition:

se fait sur quoi

A
  • Appariement d’une séquence d’ADN connue d’acides nucléiques (la sonde), et marquée avec une molécule fluorescente, à une ou des séquences complémentaires qu’on veut étudier

Se fait sur chromosomes en métaphase, des noyaux interphasiques de cellules fixées, de frottis, empreinte ou sur une section de tissu

50
Q

Hybridation (fish) - processus utilisés:

A

Dénaturation et renaturation
* L’hybridation s’effectue grâce à une alternance des processus de dénaturation et de renaturation de l’ADN
− Dénaturation: processus dans lequel les liaisons hydrogènes sont rompues entre les bases des deux brins complémentaires de l’ADN. Rend l’ADN simple brin
− Renaturation: processus dans lequel des segments d’ADN simple- brin complémentaires vont s’apparier. Il y aura formation de liaisons hydrogène entre les bases complémentaires

Un fragment d’ADN simple-brin à séquence connue (nommé la sonde) sous des conditions spécifiques d’hybridation, se lie à l’ADN simple-brin complémentaire que l’on veut étudier

51
Q

intérêt de techniques FISH

A
  • Permet la détection d’anomalies chromosomiques inframicroscopiques (non visibles au caryotype)
52
Q

Types de sonde

A

Peinture chromosomique
Sondes à séquence répétitive:
* Sondes centromériques
* Sondes télomèriques

Sondes à séquence unique: séquence d’une région spécifique du génome. ADN non répétitif

53
Q

syndromes classiques de microdélétions chromosomiques diagnosticables par technique FISH:

A

S. Velo-cardio-facial/Di George: del(22)(q11.2q11.2)
S. de Williams: del(7)(q11.23q11.23)
S. Prader-Willi: del(15)(q11q13)
S. d’Angelman: del(15)(q11q13)

54
Q

Syndrome DiGeorge/vélocardiofacial
description + signes majeurs (en gras)

A

Délétion interstitielle de la région 22q11.2
Incidence ~1/4000
Phénotype très variable (expressivité) même dans une même famille

55
Q

Microdélétions récurrentes: mécanisme

A

Séquences répétées similaires à l’extérieur de la région fréquemment délétée (DNA Low Copy repeats)
Recombinaison homologue non allélique durant la méiose
* Délétion de la région entre les répétitions
* Duplication de la région entre les répétitions

Explique
* la fréquence de ces remaniements
* le haut taux de survenue de novo * Les points de cassure identiques

56
Q

qui suis-je?
Ce mécanisme explique tous les autres syndromes de microdélétion/microduplication récurrents.

A
57
Q

Syndrome de Williams - description :

A

*Retard mental
*Retard de croissance
*Lèvres proéminentes
*Iris “en étoile”
*Sténose aortique supravalvulaire, sténose pulmonaire
*Hypoplasie de l’émail

*Incidence env. 1/7500
*Habituellement de novo
*50% de risque de transmission pour les atteints

58
Q

Syndrome de Prader Willi - description:
+ comment se fait le diagnostic

A

Région soumise à l’empreinte parentale: 15q11q13
70%: délétion allèle paternel
25%: disomie maternelle
2%: empreinte anormale
Gène SNRPN exprimé sur la copie paternelle
Le diagnostic cytogénétique (par FISH) permet de poser un diagnostic seulement s’il s’agit d’une délétion
Incidence: 1/10 000-30 000

59
Q

Syndrome d’Angelmann

A

Région 15q11-13

Gène UBE3A exprimé à partir de l’allèle maternel
* 70%: délétion allèle maternel (détectable par FISH)
* 2-5%: disomie paternelle
* 5%: aN empreinte
* 20% mutation intragénique

Retard mental important, ataxie, rires inappropriés
Incidence: 1/12 000-1/24 000

60
Q

Syndrome microduplication VS. microdélétion de la même région:

A

En comparaison avec les délétions de ces mêmes régions:
− Phénotypes peu distinctifs, moins typés
− Phénotypes moins sévères
− Plus difficiles à suspecter cliniquement a priori

61
Q

FISH interphasique - avantage + nécessaire dans quels cas

A

L’hybridation in situ en interphase, ie sur noyaux sans culture cellulaire s’avère indispensable pour la détection d’anomalies de nombre ou d’anomalie de structure dans les cas où:
* L’index mitotique est peu élevé (ex cellules néoplasiques)
* Un résultat rapide est nécessaire (ex diagnostic prénatal)
* Pour un diagnostic d’une mosaïque/clone faible pour une aneuploïdie ou pour une anomalie clonale précise

62
Q

FISH interphasique
type de sonde
commentaire sur cylce cellulaire + nbre de cellules

A

Tout type de sonde peut être utilisé (sauf les peintures et les sondes télomériques)
Pas besoin de mitoses donc pas nécessaire d’avoir des cellules en division (pas de culture); l’échantillon peut être traité immédiatement
Un grand nombre de cellules peuvent donc être analysées rapidement

63
Q

Hybridation génomique comparative - description

A

Comparaison de l’ADN d’un patient avec un ADN contrôle

S’effectue grâce à l’hybridation de ces ADN marqués en fluorescence (patient + contrôle) sur un support d’ADN
* Préparation chromosomique contrôle (lame cytogénétique)
* Fragments de l’ADN génomique que l’on veut étudier (micropuce)
* Sur les mêmes principes d’hybridation (dénaturation et renaturation) de la FISH
Intensité de la fluorescence hybridée sur un segment donné contrôle vs patient évaluée par un ordinateur

64
Q

Hybridation génomique comparative sur micropuce - permet de …

A

Permet de comparer l’ADN d’un patient à un ADN de référence et de déceler des:
* Surplus de séquences par rapport à cet ADN de référence: duplication de la séquence pour le patient
* Pertes de séquences par rapport

65
Q

vrai ou faux.
analyses faites par FISH vont chercher des anomalies plus fines qu’avec la micropuce.

A

Faux. les micropuces produisent des analyses plus fines

66
Q

Types de micropuce

A

BACs
* Sondes de la taille d’une sonde de FISH
* Résolution de l’analyse moins grande

Oligonucléotides
* Meilleure résolution vs BACs
* Sondes oligonucléotides: fragments d’ADN de env 60pb * Oligonucléotides avec ou sans marqueurs SNPs
− SNP: single nucleotide polymorphism
* Polymorphisme le plus commun du génome humain
* Segment d’ADN où les 2 chromosome ne diffèrent que par 1 nucléotide ou paire de base
* Permet de détecter allèles différents (hétérozygotes vs homozygotes) * Résultat techniquement plus fiable et technique plus rapide

67
Q

Analyse de micropuce permet de faire quel type de détection + description?

A

Détection des variants du nombre de copie (CNV)
CNV: copy number variation Taille: ≥ 1Kb ad quelques Mb
Déséquilibré: délétion (perte de matériel génétique), duplication, triplication (surplus de matériel)…
Sont des variations fréquentes dans le génome normal * Seraient présents dans 5-13% du génome
* 11 700 cnvs décrits sur 1000 gènes * La majorité sont rares
La plupart non pathogénique, à distinguer de ceux qui entraînent un phénotype (pathogéniques)
* Rôle dans la diversité biologique?, maladies complexes?, certains syndromes
But de l’analyse de micropuce: détection de CNV pathogénique expliquant le phénotype du patient

68
Q

Hybridation génomique sur micropuce
Avantages:

A
  • Permet de raffiner l’analyse chromosomique à une résolution de quelques dizaines de kb et donc de poser un diagnostic chez un plus grand nombre de sujets (env. 25%)
  • Meilleure sensibilité pour la détection de duplication que la FISH
  • Allie la précision de la FISH et l’approche d’évaluation globale du génome du caryotype
    − Ne nécessite pas de savoir où cibler dans le génome au préalable
  • Ne nécessite pas de cellules en division (extraction d’ADN)
69
Q

Hybridation génomique sur micropuce
Désavantages/limites:

A
  • Ne permet pas de détecter les remaniements équilibrés (translocations, inversions etc)
  • Ne permet pas de “voir” l’organisation cytogénétique du remaniement détecté
  • Limite quant à la détection des mosaïques ( anomalie ~20% et plus détectable)
  • Polymorphismes sans conséquence du génome fréquents et parfois n’ont jamais été vus encore dans le laboratoire
    − La plupart sont rares (retrouvés chez <2% de la population) − Impact sur le phénotype clinique pas toujours clair
  • Risque de trouver aN pathogénique non reliée (ex gènes cancer, gènes à révélation tardive, porteurs…)
70
Q

Recommandations analyse de micropuce

A

Utilisation en première ligne de la CGH sur micropuce pour les patients avec * Retard mental, retard de développement
* Autisme
* Malformations (incluant fœtus)
Confirmation des remaniements par caryotype, FISH ou méthodes moléculaires Conseil génétique pré-test et post-test nécessaire
Non indiqué pour:
* Rechercher des remaniements équilibrés (ex translocation) car non détectables par cette méthode
* Si phénotype clair d’anomalie chromosomique précise (ex trisomie 21: caryotype; S de Williams: FISH sonde spécifique)

71
Q

Caryotype indications:

A

Caryotype indications
Recherche de remaniements chromosomiques équilibrés: couples avec avortements spontanés répétés infertilité
histoire familiale d’un tel remaniement
Recherche de mosaïcisme
Phénotype clinique clair d’une anomalie chromosomique détectable par caryotype
ex trisomie 21

mmd1045 INTRA (6 decks)

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