Cours 9 Flashcards

1
Q

quelle est la théorie fondamentale de la biologie moléculaire?

A

L’adn est transcrit en ARNm dans le noyau. l’ARNm quitte le noyau et sera transcrit en protéines par les ribosomes. On passe donc d’information codées sous forme d’Acide nucléique a de l’information codé sous forme d’Acide aminé

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2
Q

quels sont les deux tests de criblage génétique?

A

le test Classique et le test inversé

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3
Q

la méthode de criblage classique permet-elle de tester des hypothèses?

A

Non, elle permet de générer des hypothèses et d’identifier les gènes importants pour un
phénotype biologique

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4
Q

Quel est le rôle de la méthode de criblage inversé?

A

Sélectionner un gène et on détermine les

phénotypes qui surviennent en son absence + évaluer des hypothèses

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5
Q

complétez:

le criblage inversé s’effectue sur —1-alors que le criblage classique s’effectue sur-2—

A

1) 1 gene a la fois

2) des miliers de genes a la fois

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6
Q

dans quel type de criblage le phénotype est connu et la séquence est inconnu?

A

criblage classique

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7
Q

dans le criblage inverse on a un phénotype —1- et une séquence -2—

A

1)inconnu

2_connue

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8
Q

comment distingué un phénotype normal d’un phénotype anormal chez des organismes modele dans une études?

A

en mesurant le phénotype grâce au criblage classique

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9
Q

quels sont les types de mutagenèses ?

A

chimique, par irradiation(uv a haute intensité) et par insertion (transposon)

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10
Q

Quels effets provoque une mutagenèse par irradiation?

A

provoque des ruptures dans l’ADN double brin et génère des grandes délétions de morceaux du chromosome ou réarrangements chromosomiques.

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11
Q

quels sont les avantages et désavantages d’une mutagenèse par les UV?

A

Avantage: Facile à cartographier par l’examen cytologique des chromosomes 􏰁 Désavantage: Souvent ne sont pas limités à des gènes uniques. Pas approprié pour la mutagenèse d’échelle fine

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12
Q

la mutagénèse chimique provoque quoi?

A

provoque des mutations ponctuelles (un seul nucléotide)

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13
Q

quels types de mutations la mutagenèse chimique provoque?

A

non-sens, faux sens et des les régions non codée

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14
Q

c’est quoi le résultat de muter une séquence non-codée

A

on va influencer les éléments régulateurs et l’epissage

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15
Q

quelles sont les 6 étapes du criblage classique?

A

1) élaboration d’un test afin de mesurer le phénotype
2) mutagenese des larves\oeufs
3) dépistage pour un phénotype anormal
4) test de complementation, 5)localiser le gene, 6) cloner le gene

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16
Q

comment dépister un phénotype anormal?

A

1)je commence par produire des centaines ou milliers de mutants.2) je vais évaluer chacun par un test de phénotype

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17
Q

donnez un test de phénotype que je peux faire chez le ver de terre

A

ex:est ce que le verre de terre fait des mouvements sigmoïde quand il se déplace ou non.

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18
Q

quelles souches dois-je garder dans un criblage classique?

A

pour effectuer le test de dépistage de phénotype anormal je dois garder TOUTES LES SOUCHES QUI DONNENT UN PHÉNOTYPE ANORMAL.

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19
Q

quel est le rôle du test de complementation?

A

il permet de déterminer si les mutations identifiées sont uniques ou non par des croisement

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20
Q

dans quelle étape du criblage classique on effectue une analyse de linkage?

A

à l’étape 5)localiser le gene

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21
Q

si deux phénotypes different se trouvent souvent dans la meme souche, cela veut dire quoi?

A

cela veut dire que les deux gene du phénotype sont en lien (analyse linkage)

22
Q

comment déterminer la localisation du gene dans le génome?

A

en suivant le transposon et en faisant une analyse linkage

23
Q

c est quoi le rôle du criblage inversé ?

A

déterminer le rôle d’un gene connu dans un certains phénotype.

24
Q

comment fait-on un criblage inversé?

A

en perturbant un gene par knockouts ou genome editing pour déterminer son rôle selon le phénotype observé après la perturbation.

25
Q

quels sont les types de criblage?

A

criblage classique, inversé, in silice, moléculaires

26
Q

Je veux comparer un séquences protéiques ou une séquence d’un gene pour savoir si elle est conservé entre toutes les espèces. quelle approche utiliser? quelle outil utiliser?

A

je dois utiliser le criblage in silice donc la methode bio-informatique. Pour ce faire, je vais utiliser le logiciel BLAST.

27
Q

c’est quoi Ensembl?

A

c est un logiciel dans lequel tout le génome des organismes modele ont été séquences au complet. il met l’accent sur les analyses génomique, alignement des séquences et homologies entre les genes

28
Q

quelles techniques utiliser dans le le criblage moléculaire?

A

1) high-throughput strategy
2) biopuce a ADNc
3) criblage ARN interférence

29
Q

c’est quoi la high-throughput strategy?

A

permet d’utiliser un logiciel ou un robot pour accélère l’expérience de criblage moléculaire

30
Q

c’est quoi le rôle des biopuces à ADNc?

A

Analyser l’expression des gènes en réponse aux conditions environnementales, ou temporelle.

31
Q

quel est le principe des biopuce a ADNc?

A

des sondes d’ADN sont sur plaque et elles s’hybride à l’ADN

32
Q

c’est quoi la différence entre un criblage a ARN interférence et un knockout?

A

dans le criblage a ARN interférence je DIMINUE l’expression de genes pour regarder l’effet de cette diminution d’expression sur un phénotype particulier. Cependant dans le knockout j’INACTIVE le gene.

33
Q

comment diminue l’expression d’un gene dans la technique de criblage a ARN interférence?

A

le lien d’une sonde ARN à l’ARN dans la cellule va former un ARN double brin qui est reconnu et qui est clivé.

34
Q

comment quantifier l’expression des genes?

A

par qRT-PCR (qPCR) qui permet de faire une analyse quantitative d’ARNm. laquantification se fait par quantification de fluorescence qui est proportionnelle aux produits amplifiés par pcr.

35
Q

comment la fluorescence est mesuré dans un qPCR?

A

Une sonde contient un raporteur fluorescent inactif qui lie une séquence spécifique d’adn. durant le pcr la sonde est clivé et la fluorescence est révélé. a chaque cycle d’amplification on a plus de fluorescence

36
Q

comment fait on du clonage?

A

en créant un vecteur peut contenir une séquence d’ADN d’intérêt isolé

37
Q

quel est le but du clonage?

A

Un processus qui vise à faire plusieurs copies d’ADN d’intérêt

38
Q

c’est quoi le marquer de sélection qu’on utilise dans un vecteur de clonage?

A

gene de resistance pour un antibiotique

39
Q

quelles sont les caractéristiques du vecteur de clonage?

A

1) réplication autonome(origine de réplication)
2) possibilités de combiner le vecteur avec d’autres morceaux d’adn( marqueur de sélection et sites d enzymes de restrictions)

40
Q

quelle est la différence entre un vecteur de clonage et un vecteur d’expression?

A

un vecteur de clonage est répliqué mais PAS EXPRIMÉ. le vecteur de clonage est répliqué aussi ET PEUT ETRE EXPRIMÉ

41
Q

de quoi ai je besoin pour exprimer un vecteur d’expression?

A

j’ai besoin d’un promoteur approprié. et de mettre celui-ci dans des bactéries

42
Q

comment s’assurer que les bactéries ont incorporer le vecteur?

A

seules les bactéries ayant incorporer un vecteur avec un gene de résistance à la penicilline par exemple vont proliférer dans un milieu de culture contenant l’antibiotique(pénicilline par exemple).

43
Q

quel est le sens de déplacement de l’an lors d’une l’ectrophorese?

A

de la cathode (-) vers l’anode (+)

44
Q

completez:

la migration de l’an dans un champ électrique est—-au—–paires de bases

A

1) inversement proportionnel

2) au logarithme du nombre

45
Q

à quoi sert l’électrophones?

A

séparer les nouveaux fragments d’ADN d’intérêt

46
Q

comment estimer la quantité d’ADN sur après une electrophorese?

A

on peut estimer la quantité d’ADN en comparant la bande d’intérêt avec une quantité connue de marqueur


47
Q

comment purifier mon ADN d’intérêt?

A

1)Purification chimique d’ADN à partir de bactéries

􏰀 2)Kits

48
Q

quelles sont les étapes de purification d’an avec des colonnes

A

1) Lyse avec alkali
2) Neutralisation
3) Précipitation de protéines
4) Récupération d’ADN avec silice
5) Élution d’ADN

49
Q

le silice des colonnes de purification est de quelle charge?

A

positive

50
Q

quel est le rôle du séquensage de sanger?

A

son rôle est d’identifier la séquence d’ADN par une méthode qui ressemble au PCR, cependant la chaine se termine par un nucleotide fluorescent(ou radioactif)

51
Q

la fluorescence dans le séqiensage de senger est détecté de quelle manière?

A

par chromatographie. chaque couleur correspond a une base

52
Q

le séquensage de senger représente-il la seule façon de trouver la séquence de monADN d’intérêt?

A

NON, hybridation des acides nucléiques aussi le permet(in situ,northern blot, southern blot)