Cours 8 Flashcards
qu’est-ce que la traduction?
processus par lequel l’information génétique contenue dans l’ARNm est interprétée pour produire la séquence linéaire en acides aminés des protéines
Vrai ou Faux
la traduction est un mécanisme très couteux en énergie
vrai
quelles sont les structures faisant partie de la machinerie de traduction? a quoi servent-elles?
ARNt (interface entre les acides aminés et les codons)
ARNm (matrice pour la traduction)
Aminoacyl-ARNt synthétase (lient les acides aminés aux ARNt spécifiques à un codon)
ribosome (reconnaissance de l’ARNm par chaque ARNt t catalyse de la formation de liens peptidiques)
combien faut-il de nucléotide pour former un acide aminé?
3 nucléotides pour 1 A.A.
le cadre de lecture ouvert commence par un codon d’initiation. quel est l’enchainement de nucléotide le caractérisant?
5’ AUG 3’
Où la traduction commence-t-elle?
démarre en 5’ du cardre de lecture ouvert jusqu’à l’extrémité 3’
À quoi sert le codon d’initiation? (2)
spécifie le 1er acide aminé
définit le cadre de lecture
en absence d’un codon d’initiation, combien de cadre de lecture sont-ils possible?
3 cadres de lecture possible
il existe 3 codons possible pour définir le codon stop, lesquels?
UGA
UAG
UAA
chez les eucaryotes, il y a un seul cadre de lecture par ARNm. Quel adjectif caractérise ce phénomène?
ARN monocistronique
1 ARN code pour 1 protéine
À quoi sert la coiffe 5’ sur l’ARNm? où cette coiffe se situe-t-elle?
la coiffe 5’ sert a recruter le ribosome, elle est située en amont du codon d’initiation.
que se produit-il après la liaison du ribosome à la coiffe?
le ribosome scan l’ARN 5’ vers 3’ jusqu’à AUG
qu’est-ce que la séquence de Kozak? à quoi sert-elle?
Séquence où l’on retrouve un G ou u A en amont du codon d’initiation et un G en aval de ce même codon.
sert a augmenter l’efficacité de traduction
À quoi sert la queue Poly-A et où se situe-t-elle?
la queue poly-A favorise un recyclage des ribosomes.
elle se situe en aval du codon stop
comment est la structure de l’ARNt?
structure tige-boucle, mais la forme réelle a été démontré en L
quelles sont les régions de l’ARNt et quelle est la caractéristique de chacune? (5)
bras accepteur: liaison à l’acide aminé sur CAA (simple brin)
boucle pseuro-U: contient la pseudouridine
boucle D: contient la dihydrouridine
boucle de l’anticodon: reconnait le codon
boucle variable: taille variable
quelle est la fonction de l’aminoacyl-ARNt synthétase
chargement des acides aminés à l’ARNt (ajout d’un A.A. sur le bras accepteur de l’ARNt)
qu’est-ce qu’on appelle le second code génétique?
ce sont des régions supplémentaires qui emmènent la spécificité de la l’ARNt synthétase
en plus de l’extrémité 3’ de l’ARNt contenant la base discriminante et le second code génétique, quelle autre structure permet d’augmenter la fidélité? comment fonctionne-t-elle?
la poche d’édition
c’est une poche située à côté de la cavité catalytique qui gère le chargement précis de l’ARNt
(permettant la liaison à la cavité catalytique de l’isoleucine mais pas de la valine par exemple)
Pourquoi la liaison avec l’ARNt synthétase a-t-elle besoin d’être autant spécifique?
car le ribosome ne détecte pas les ARNt incorrectement chargés. son seul critère est l’interaction codon-anticodon. Il faut donc que l’appariement soit parfait pour éviter les mutations.
qu’est-ce qui joue le rôle majeur dans la sélection du bon acide aminé par l’ARNt?
Les ARNt synthétases
en ce qui concerne le ribosome…
par quoi est-il constitué?
quelle est sa fonction?
constitué de 4 molécules d’ARN et de + de 80 protéines
synthèse de l’ADN et synthèse des protéines chez les eucaryotes
comment est-il possible de séparer les composantes du ribosome?
par ultracentrifugation sur un gradient de sucrose
les sous-unités du ribosome migrent jusqu’à atteindre a densité de sucrose qui correspond à la leur.
le cycle du ribosome est caractérisé par 6 étapes, lesquelles?
- Formation du complexe de pré-initiation.
- la petite sous-unité ribosomique s’associe avec l’ARNm et l’ARNt initiateur
- la petite sous-unité ribosomique scan l’ARNm jusqu’à atteindre le codon d’initiation
- la petite sous-unité ribosomique recrute la grande sous-unité ribosomique
- un 2e ARNt se lie au complexe avec l’Aminoacyl-ARNt
- transfert du polypetide en cours de synthèse de la position A à la position P
- Dissociation des sous-unités ribosomique après la sortie du polypeptide à la position E
Vrai ou Faux
plusieurs ribosomes peuvent être engagés dans la traduction en même temps
Vrai
la traduction est constante
on parle de polyribosome ou de polysome
À quelle fréquence retrouve-t-on un ribosome sur l’ARNm?
a tous les 80 nts environ
quelles sont les 2 sous-unités ribosomiques chez les eucaryotes?
petite sous-unité (30S) –> centre de décodage
grande sous-unité (50S) –> centre peptidyl transférase
par où l’ARNm passe-t-elle après avoir été scanné par le ribosome?
par un tunnel situé dans la petite sous-unité du ribosome
qu’est-ce qui empêche l’accès de l’ARNt aux codons de l’ARNm des autres sites?
un angle forcé par la structure du ribosome entre les sites P et A
quelle contrainte exige le tunnel de sortie du polypeptide?
la taille du tunnel permet seulement la formation d’hélice alpha. La structure 3D (feuillet B) est donc acquise a la sortie du ribosome
Où se situe le centre peptidyl-transférase?
dans la grande sous-unité du ribosome
Où se trouve le centre de décodage?
dans la petite sous-unité du ribosome
quelle est la différence entre la structure de RF1 et d’un ARNt?
RF1: anticodon peptidique et GGQ aux extrémités de RF1
ARNt: il y a un anticodon et un CCA aux extrémité de l’ARNt
combien existe-t-il de combinaison de codon possible?
( 3 Acides aminés, 4 lettres possibles)
4 x 4 x 4 = 64 codons
que veut-on dire par: le code génétique est dégénéré?
plusieurs acides aminés sont codés par plus d’un codon
Vrai ou Faux
lorsqueles 2 premières lettres d’un codon sont identiques, la 3e peut souvent être nimporte laquelle et l’acide aminé codé sera le même
Vrai pour ceux qui ont 4 codons
en partie vrai pour ceux qui en ont 6
comment peut-on reconnaitre un acide aminé hydrophobe? quels sont les exceptions?
lorsqu’on retrouve une pyrimidine ( C ou U) en 2e position.
exception:sérine et thréonine
comment peut-on reconnaitre un acide aminé polaire?
lorsqu’une purine est en 2e position ( A ou G)
quelle est la différence entre l’appariement canonique et l’appariement non canonique (bancal)?
canonique: watson-crick (A:U / C:G) en position 35 et 36 de l’ARNt
non-canonique: interaction distinct de watson-crick en position 34
Dans l’appariement bancal, avec quoi un G peut-il se lier?
U ou C
Dans l’appariement bancal, avec quoi un C peut-il se lier?
C
Dans l’appariement bancal, avec quoi un A peut-il se lier?
U
dans l’appariement bancal, avec quoi un U peut-il se lier?
A ou G
dans l’appariement bancal, avec quoi un I peut-il se lier?
A ou U ou C
comment peut-on produire l’inosine?
en désaminant une adénine avec une désaminase (ADAR)
grâce a l’appariement bancal, combien de codon peuvent lier un seul ARNt?
1 seul ARNt peut lier 3 codons différents
qu’est-ce qui explique que la base 34 tolère mieux l’appariement bancal que les autres?
empilement des bases entre la base 34 et la base 37, ce qui fait que la base 36 est emprisonnée. la base 34 se ramasse a flotter car aucune base en dessous pour la stabiliser ce qui favorise la rotation
quelles sont les 3 règles qui gouvernent le code génétique?
- les codons sont lu de l’extrémité 5’ vers l’extrémité 3’
- les codons ne se chevauchent pas et le message ne contient aucun espace.
- le message est traduit dans un cadre de lecture fixe imposé par le codon d’initiation
quelles sont les 3 types de mutations ponctuelles qui altèrent le code génétique?
- mutation faux sens (changement d’un acide aminé pour un autre)
- mutation non sens (création d’un codon de terminaison)
- mutation par décalage du code de lecture (délétion ou insertion de base)
qu’est-ce qu’une mutation silencieuse?
une mutation où un nucléotide est remplacé par un autre, mais que l’Acide aminé codé demeure le même
