Cours 7 Flashcards
la probabilité d’apparition d’une mutation dépend de quoi? (3)
fréquence de dommage
vitesse de réparation
potentiel mutagène
quelles sont les conséquences d’un haut taux de mutations dans une cellule somatique?
et dans une cellule germinale?
cellule somatique: destruction d’un individu
cellule germinale: destruction de la lignée d’une espèce
quelles sont les causes principales d’une mutation?
erreurs de réplication
lésions chimiques ou physiques
quelle est la différence entre une transition et une transversion?
transition: changement d’un nucléotide de la même classe (A en G ou T en C)
transversion: changement d’un nucléotide d’une classe différente ( A:C / A:T / G:C / G:T)
Vrai ou Faux
un mésappariement est toujours relié a une mutation
Faux
un mésappariement peut se faire réparer avant un deuxième cycle de réplication. Si le 2e cycle a lieu avant la réparation, il y aura alors mutation
a quoi servent les exonucléases 3’?
corrigent les mésappariements pendant la réplication
augmentent la fidélité de 100x
quels sont les 2 défis de l’exonucléase 3’?
inspecter/réparer les mésappariements avant la 2e réplication
reconnaitre le nucléotide mésapparié et non celui sur l’autre brin
nommez 2 type d’erreur de glissement et dites dans quelles conditions elles se produisent
insertion (région de répétition courte en tandem)
délétion (brin matrice fait une boucle)
comment l’exonucléase 3’ fait pour reconnaitre le nucléotide qui est mésapparié?
E. coli méthyle les 2 brins d’ADN sur les A de la séquence GATC avant réplication. Lors de la réplication, seul le brin parental est méthylé. Le mauvais nt est donc sur le brin non-méthylé.
Donnez l’ordre d’apparition des complexes lors de la réparation d’un mésappariement chez les procaryotes.
- DAM (méthyltransférase) méthyle les brins mères sur le A de chaque séquence GATC
- Réplication de l’ADN
- MutS inspecte le brin a la recherche de mésappariement.
- Recrutement de MutL au complexe MutS-Mésappariement
- Activation de MutH lorsque le complexe est lié au GATC
- MutH (endonucléase) clive en 3’ du mésappariement et en 3’ du GATC
- UvrD (hélicase) enlève le bout contenant un mésappariement
- ADN pol 3 et ligase remplissent la brèche
chez les eucaryotes, quel est l’équivalent de MutS? et MutL?
MutS –> MSH
MutL –> MLH
quelle est la principale différence entre la réparation des mésappariement chez les eucaryotes vs procaryotes?
chez les eucaryotes, le point de départ de la réparation est la cassure sur le fragment d’okazaki avant la ligature. Il n’y a pas d’hémiméthylation.
quels sites sont très sensibles au transitions C –> T par les UV?
les 5’méthylcytosine
Nommez 3 agents intercallants
proflavine
bromure d’éthidium
quel est le mécanisme d’action des agents intercallants?
ils s’intercallent entre les bases d’ADN et provoquent des additions ou des délétions
quels sont les agents exogènes?
UV alkylation rayon gamma et X analogues des bases agents intercalants
quels sont les UV causant des dommages directs?
UVC et UVB
l’ADN absorbe l’ADN a quelle longueur d’onde?
près de 260 nm
quels sont les UV causant des dommages indirects? comment le font-ils?
UVA
excitent d’autres chromophores cellulaires
quelles sont les types d’altérations causés par les Rayon gamma et X ? comment?
cassure bicaténaire
ils attaquent le désoxyribose du squelette de l’ADN
2 conséquences possibles des altérations de l’ADN
empêchent la réplication ou la transcription
provoquent un changement permanent de l’ADN après réplication
qu’est-ce que la photoréactivation?
une enzyme qui utilise l’énergie lumineuse pour s’activer
quelle est la fonction de la photolyase?
où retrouve-t-on cette enzyme?
elle utilise l’énergie lumineuse pour rompre les liens covalents entre pyrimidine adjacentes
retrouvée chez les procaryotes et les eucaryotes inférieurs
quelle mécanisme de réparation est effectué par la photolyase?
réversion directe
quelle est la différence entre la BER et la réversion directe?
BER enlève la base endommagée et la remplace
réversion directe répare le dommage
dans l’excision des nucléotides, quelle est l’ordre d’arrivée des enzymes/molécules? et que font-elles?
- UvrA et UvrB scrutent l’ADN
- UvrA reconnait le dommage
- UvrB ouvre l’hélice et recrute UvrC
- UvrC crée 2 incisions (8 nt de 5’ et 4-5 nt de 3’)
- UvrD (hélicase) enlève le fragment
- . l’ADN pol et la ligase remplissent la brèche
qu’est-ce que le XP?
c’est un cancer cutané multiples dont la sévérité est différente selon le groupe affecté où les gens sont très prohosensibles.
Décès avant 20 ans
Comme le NER est générale, pourquoi a-t-on besoin du BER?
les dommages reconnus par la BER ne seraient pas reconnus par la NER (les distorsions entre autre)
dans l’excision des bases, quelle est l’ordre d’arrivée des enzymes/molécules? que font-elles?
une enzyme a 2 activités (glycosylase et AP endo/exonucléase)
l’activité glycosylase enlève la base et génère un site AP
l’activité exonucléase enlève le site AP
l’ADN pol et la ligase remplissent la brèche
a quel moment se produit la synthèse translésionnelle?
quand un dommage n’est pas réparé et que l’ADN pol est bloqué
quel est l’objectif de la synthèse translésionnelle? comment?
empêcher l’avortement de la réplication d’un chromosome en incorporant un nucléotide non spécifique a la séquence
quel est le mécanisme d’action de la synthèse translésionnelle?
- l’ADN pol rencontre un dommage qui l’empêche d’avancer et se détache
- l’anneau coulissant se fait ubiquitiné
- l’anneau coulissant ubiquitiné recrute l’ADN polymérase translésionnelle
- l’ADN pol translésionnelle ajoute un nucléotide de facon aléatoire
- on traverse le dommage
- l’anneau coulissant est désibiquitiné et l’ADN pol translésionnelle perd son affinité
- arrivé de l’ADN pol et on continue la réplication
que permet la recombinaison?
des échanges génétiques entre les régions homologues
dans quels processus la réplication est-elle impliquée?
méiose (crossing over)
réparation de l’ADN