Cours 2 Flashcards
l’empaquetage de l’ADN en chromosome participe a 4 fonctions importante, lesquelles?
Compaction de l’ADN
Protection contre les altérations
transmis de façon efficace aux 2 cells filles quand la cellule se divise
Confère une organisation générale particulière a chaque molécule d’ADN
Vrai ou Faux
certaines parties de l’ADN sont compactées et d’autres non, selon les types de gènes
Vrai
les gènes qui doivent être exprimés dans la cellule ne sont pas compactes alors que les autres oui
Vrai ou Faux
la majorité des protéines sont petites et acides
Faux
elles sont petites et basique
Quelle est la fonction des histones dans l’ADN?
Compaction
Il y plusieurs mécanismes permettant la compaction de l’ADN, quelle est la première compaction de l’ADN?
Formation de nucléosome (association d’histone le long de l’ADN)
Que permet la compaction de l’ADN?
Limiter son accessibilité aux protéines
Comment certaines régions spécifiques de l’ADN peuvent-elles interagir avec les protéines?
Par un remaniment local de certains nucléosomes fait par des enzymes
Vrai ou Faux
chez les eucaryotes, l’ADN est toujours circulaire
Faux
elle est toujours linéaire
Vrai ou Faux
il peut y avoir à la fois de l’ADN circulaire et de l’ADN linéaire chez les procaryotes
Vrai
Nommez un exemple d’organisme ayant un macronoyau. Combien de chromosome a-t-il?
Tetrahymena thermophila
225 chromosomes
Combien de copie complète de chromosome ont les cellules procaryotes? Où retrouve retrouve-t-on ces chromosomes?
1 seule
Empaqueté dans le nucléoïde
Les principales protéines qui créent les nucléoides appartiennent a quelle famille?
Les NAP
On peut retrouver dans les cellules procaryotes des plasmides. Qu’est-ce qu’un plasmide?
Petits ADN circulaire généralement pas essentiel à la bactérie qui sont porteurs de gènes et qui peuvent conférer des résistances aux antibiotiques
La majorité des cellules eucaryotes sont dites__________
diploïdes
2 copies d’un chromosome donné sont dites ____________. Ils dérivent de chacun des 2 parents.
homologues
Qu’est-ce qu’un mégacaryocyte?
À quoi ça sert?
Cellules polyspécialisées (env. 28 copies de chaque chromosome) de la moelle hépatoïétique
Production de plaquette sanguine dépourvue de chromosome (important pour la réponse immunitaire)
Vrai ou Faux
le nombre de paire de base correspond à la complexité d’un organisme
Faux
ne correspond pas
À quoi servent la majorité des séquences non codantes dans chez E.coli?
Régulation de la transcription génique
Qu’est-ce qu’un Opéron?
site d’initiation de la transcription utilisé pour controler l’expression de plusieurs gênes
Quelle est la relation entre la densité génique et la complexité d’un organisme?
Relation inverse
Plus la complexité d’un organisme est grande, plus la densité génique est faible
À quoi sert l’ARN polymérase?
Transcrire l’ADN en ARN
Nommez 2 facteurs expliquant la faible densité génique des eucaryotes?
Augmentation de la taille des gènes
Augmentation de la taille des séquences intergéniques
Chez les eucaryotes, comment appelle-t-on les portions qui séparent les séquences codantes de l’ADN? Comment sont-ils éliminés de l’ARN après la transcription?
Introns
Éliminés par épissage
(enlève les introns et fusionne les exons)
Quelle est le pourcentage de la région d’un gène qui est codant?
seulement 5%
À quoi servent les séquences intergéniques? À quel pourcentage du génome humain correspondent-ils?
Diminution de la densité génique
60% de tout le génôme humain
Quelles sont les 2 types de séquences intergéniques? laquelle est régulatrice?
Séquences répétées
Séquences uniques (régulatrice)
____% de tous le génôme humain mène a la production de protéine
1,5%
Que fait la transcriptase inverse?
Elle copie l’ARN en ADN double brin. Lors d’une infection, elle copie l’ARNm cellulaire en ARNc permettant l’intégration de pseudogènes complexes
La majorité des séquences intergéniques sont des séquences répétées. Nommez les 2 principales classes de ce type d’ADN. Comment sont-elles caractérisées? Quelle est la troisième classe secondaire?
ADN microsatellite: séquence de très petite taille (<13pb) répétée en tandem
ADN répété dispersée: plus grand que microsatellites (100-1000 pb et +) en simple copie
ADN minisatellite: taille intermédiaire (10-60pb) répétée en tandem avec taux de mutation élevé
D’où proviennent les ADN microsatellite? et les séquences répétées en tandem?
Microsatellite: proviennent de la difficulté rencontré par la polymérase lors de la duplication de l’ADN
Séquences répétées en Tandem: proviennent des transposons
Qu’est-ce qu’une transposition?
Séquence qui peut sauter d’un emplacement a un autre dans le génome en laissant la copie originaleà son site initial
Qui à découvert les transposons? En quel année cette personne a-t-elle recu le prix nobel de médecine?
Barbara McClinctock
prix nobel: 1983
Quel pourcentage du génome humain correspond aux transposons?
Quels seraient les rôles prédominants des transposons? (2)
45% du génome humain
1- création de nouveaux gènes
2- source d’amortissement des mutations dues à l’environnement
Vrai ou Faux
les différentes caractéristiques des séquences intergéniques ne sont pas exclusives au génôme humain
Vrai
elles se retrouvent dans biens d’autres organismes
Dans l’ADN chromosomique, a quoi sert,
un origine de réplication?
un centromère?
un télomère?
origine de réplication: dirige la réplication de l’ADN chromosomique (la machinerie s’assemble à ce site pour débuter la réplication)
Centromère: orientent la ségrégation des chromosomes entre 2 cellules filles (génèrent 2 chromatides soeurs et guident la formation du kinétochore)
Télomère: protègent et répliquent l’extrémité des chromosomes linéaires
À quelle fréquence retrouve-t-on les sites d’origine de réplication chez les eucaryote? et les procaryotes?
eucaryote: 1 site /30-40 pb (généralement ds section non codante)
Procaryote: 1 seul site unique
Avec quelles structures le kinétochore interragit-il?
ADN du centromère
les microtubules
Chaque kinétochore porte 2 régions? comment se nomment-elles et à quoi servent-elles?
Région interne: étroitement associé à l’ADN
Région externe: interagit avec les microtubules
A quoi sert la variante H3 (CENP-A) du kinétochore?
aide le kinétochore à s’associer à l’ADN
Nommez 2 protéines qui génèrent de la force permettant le déplacement de protéine
Dynéine
Kinésine
À quoi sert MAD 2?
attachement des microtubules et tension entre les kinétochores soeurs
(activent les points de contrôle tubaire, régulant l’anaphase)
Que se passait-il s’il y avait absence de centromère dans un chromosome? et s’il y en avait plusieurs?
les chromosomes répliqués se répartiraient de façon aléatoire
Cassure des chromosomes si les kinétochores attaché aux filaments se dirigent vers des directions opposés
la région centromérique ___________ avec la complexité de l’organisme
augmente
Vrai ou Faux
les protéines du kinétochore sont codées par la région centromérique
Faux
les introns et les exons recrutent des protéines permettant la formation du kinétochore, mais n’interviennent pas directement dans la transcription
Où retrouve-t-on principalement les télomères? quelles sont leurs 2 principales fonctions?
aux extrémités d’un chromosome linéaire
1- protection (évite cassure, recombinaison ou dégradation des extrémités du chromosome)
2- recrutent la télomérase qui permet à la cellule de répliquer les extrémités de ses chromosomes
Chez l’homme, quelle est la séquence répétée représentant les télomères?
5’ TTAGGG 3’
Vrai ou Faux
Dans la division cellulaire mitotique des eucaryotes, il y a maintient du même nombre de chromosome dans les cellules mères que dans les cellules filles
Vrai
Quelles sont les 4 phases du site de division cellulaire et que se passe-t-il dans chacune d’entre elle?
G1: préparation (la cell s’assure qu’elle a tout le matériel requis pour la duplication de son génome)
S: duplication des chromosomes (fin = 92chrom/cell)
G2: préparation pour la sécrégation
M: mitose (ségrégation des chromosomes)
qu’est-ce qu’une chromatide?
Chaque chromosome dupliqué est une chromatide
les chromatides d’une même paire = chromatide soeur
Comment sont associés les chromatides soeurs entre eux?
par l’action de l’anneau de cohésine
Qu’est-ce que le fuseau mitotique?
Chaque paire de chromatides soeurs liée à une structure (microtubule) est un fuseau mitotique
les microtubules sont attachés à 2 centres organisateurse microtubules appelés: __________
centrosomes
Quels sont les 3 événements majeurs lors de la mitose?
Assemblage du Kinétochore à chaque centromère
Cohésion entre les chromatides
Protéolyse de la cohésine
Que se passerait-ils si les chromatides soeurs n’étaient pas reliées par une force de cohésion?
seraient déplacées vers les pôles opposées
Sous quelle forme sont les chromosomes lors de la ségrégation? et durant les interphases (G1, S et G2)?
très compacte
quelle est la famille de protéine qui permet la cohésion et la condensation des chromatides soeurs? quelle structure permettent-ils de former?
les protéines SMC
formentla cohésine avec des protéines non-SMC
de quoi est formé la cohésine?
SMC 1 et SMC 3 (forment l’anneau) –> prot SMC
Scc1 et Scc3 (stabilisent l’anneau) –> prot non SMC
comment y a-t-il perte du complexe cohésine?
clivage protéolytique des sous-unités non SMC provoque l’ouverture de l’anneau
La condensation des chromosomesà la ségrégation nécessite un autre complexe comprenant des protéines SMC, lequel?
quelles protéines forment la condensine?
La condensine
SMC 2 et SMC 4
Ycs4, Brn 1, Ycg1
Quelles sont les 4 étapes de la mitose?
que se passe-t-il dans chacune de ces étapes?
Prophase (duplication, condensation, dégradation)
Métaphase (fuseau mitotique prend forme, kinétochore des chromatides soeurs se fixent aux microtubules)
Anaphase (séparation)
Télophase et Cytokinèse (formation enveloppe cellulaire et division du cytoplasme)
Qu’est-ce qui indique que la fixation des chromatides aux micro-tubules est correct
les 2 kinétochores paire de chromatide sont reliés via les microtubules aux centres organisateurs (centrosomes)
Que permet l’attachement bivalent des chromatides soeurs?
Et l’attachement monovalent?
tention qui tire les chromatides soeurs dans des directions opposées pour permettre la ségrégation
fixation d’une seule chromatide ou lafixation des 2 sur un même microtubule. Aucune tension sur les chromatides non viable
Par quoi débute la ségrégation des chromosomes?
protéolyse de la cohésine
à la perte de cohésion des cellules soeurs, dans quel phase du cycle cellulaire se retrouve-t-on?
Anaphase
Les étapes G1 et G2 donnent le temps à la cellule d’assurer 2 contrôles , lesquels?
Préparation à l’étape suivante
Vérification que la phase précédente à été correctement accomplie
Quelle est la condition préalable à l’atteinte de la phase S (G1) ?
les cellules doivent atteindre une certaine taille et un certain niveau de synthèse protéique
différence entre mitose et méiose
dans la méiose, les cellules filles contiennent 2 fois moins de chromosome (haploide) que la cellule mère
de quel type sont les 2 étapes de méiose successives?
Méiose 1 : réductionnelle
Méiose 2: équationnelle
Vrai ou Faux
dans la méiose 1 l’attachement est monovalent
Vrai
Si l’attachement dans la méiose 1 est monovalent, de quoi résulte la résistance?
Quand disparaitra cette cohésion?
connexions physiques induite par recombinaison avec les paires homologues.
Anaphase 1, mais elle est maintenu au centromere
Quelles sont les 2 états de la chromatine observées au microscope?
forme moins compacte (collier de perle (nucléosome); diamètre de 10 nm)
forme compacte: (replié sous forme de grande boucle; diamètre de 30 nm)
qu’est-ce qu’un nucléosome? quel est le facteur de compaction d’un nucléosome?
octamère de 8 histones + l’ADN qui l’entoure
6X
comment appelle-t-on l’ADN entre les nucléosomes? et celle fortement lié au nucléosome?
ADN internucléosomique
ADN du coeur
Rôle de la Mnase ?
Clive l’ADN libre de protéine mais pas celle associé aux protéines
le nucléosome minimal contient _____ pb
147 pb
Dans toutes les cellules, il existe des segments d’ADN qui sont non compactés en nucléosome. Pourquoi?
Réplication
Expression des gènes
Recombinaison
Quelles sont les histones de l’octamère?
H2A H2B H3 H4
il y a 2 copies de chaque histone dans le coeur protéique autour duquel s’enroule l’ADN
Quel est le rôle de H1? sa particularité?
Se lie à l’ADN internucléosomique
2x moins abondantes que les autres
Vrai ou Faux
Les histones ont une forte proportion d’acide aminé chargé positivement
Vrai
permet la liaison a l’ADN chargé négativement
20% des résidus des histones sont ces 2 acides aminés
lysine et arginine
Quelle est la région conservée de toute les histones? de quoi est-il composé?
domaine globulaire
3 régions en hélice alpha séparé par 2 petites boucles
Vrai ou Faux
H2B et H2A peuvent former des hétérodimères qui formeront des tétramères mais pas H3 et H4
Faux
cest le contraire
Quelles sont les 3 étapes de l’assemblage d’un nucléosome?
- Assemblage ordonné entre l’ADN
- Tétramère H3-H4 lie l’ADN
- 2 dimères H2A-H2B s’associent au complexe ADN H3-H4
Comment l’extension N-terminale de la queue d’histone peut-elle être mise en évidence?
digestion à la trypsine
les queues d’histones sont les cibles pour altérer la fonction des nucléosomes. Quelle réactions chimiques peuvent-elles subir?
Méthylation
Acéthylation
Phosphorylation
quelle est l’ordre d’enchainement des histones et le nombre de paire de base associé?
H3 H2A/H2B H3/H4 H2A/H2B H3
13 30 60 30 13
Nommez une cause de coupure et de tention considérable de l’ADN. Conséquence?
l’association du tétramère H3-H4 avec la partie centrale et les extrémités de l’ADN
Facilite l’accèsaux dimères H2A-H2B
Où émergent les 4 queues H2B et H3 dans l’ADN?
entre les 2 sillons
les points de sorties se forment entre 2 petits sillons adjacents
Où émergent les queues H2A et H4 dans l’ADN?
au-dessous ou au-dessusdes 2 hélices d’ADN, mais pas en travers
il existe 2 conformation chromatienne observable, lesquelles? qu’est-ce qui les distingue?
euchromatine: niveau d’expression génique élevé
hétérochromatine: zone de faible expression des gènes, importante pour la suppression d’expression génique
la différence réside dans l’assemblage ou non des nucléosomes en structure complexe
Que se passe-t-il une fois que le nucléosome est formé? pourquoi?
Fixation de H1
interragit avec l’ADN internucléosomique et protège de 20 pb additionnelles en augmentant la qté d’ADN associé au nucléosome.
Donne un angle mieux défini pour l’entrée et la sortie de l’ADN du nucléosome
Quels sont les 2 modèles de représentation de la fibre de 30 nm. Quelles sont leurs caractéristiques?
solénoïde: forme superhélice à 6 nucléosomes/tour.
Ne passe jamais à travers l’axe de la fibre
zigzag: Passe à travers l’axe centrale de la fibre
Que se passe t-il en absence de queue N-terminale chez les histones? à quoi sert-elle?
pas de formation de fibre de 30 nm
stabiliser la fibre par interaction avec les nucléosomes adjacents
Que permet H2A.X
recrute des enzymes de réparation de l’ADN lorsque cassure
