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MMD1042.3 > Cours 6B: ARNs Non-Codants > Flashcards

Cours 6B: ARNs Non-Codants Flashcards

1
Q

vrai ou faux, ARN non-codant n’est pas fonctionnel puisqu’il n’est pas traduit en protéines

A

faux, meme si il n’est pas traduit, il est fonctionnel

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Q

est-ce que les molécules d’ARN non-codant sont transcrites

A

oui

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3
Q

qu’est-ce qu’un mRNA

A

ARN messager qui code pour une protéine

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4
Q

qu’est-ce qu’un ncRNA

A

ARN non-codant qui ne code pas pour une protéine

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5
Q

RAPPEL
Pourcentage de séquences utiles correspondant aux gènes dans l’ADN
Pourcentage d’exons dans ADN
Pourcentage de séquences intergéniques inutiles dans ADN

A

10-20%
1,5-2%
80-90%

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6
Q

vrai ou faux, il existe plusieurs types d’ARN non-codants différents

A

vrai

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7
Q

quel pourcentage du génome humain peut être transcrit

A

minimum 70%

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8
Q

cmb d’ARN transcrits total
cmb d’ARN traduits en protéines

A

180 000
30 000

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9
Q

environ 150 000 ARN sont…

A

des longs ARN non-codants (lncRNA)

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10
Q

le génome humain peut coder environ ???? miRNA

A

400-600 micro ARNs

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11
Q

à la base, on pensait que les ncRNAs étaient des…

A

bruits de fond transcriptionnel générés par liaison aléatoire de ARN polymérase à des séquences d’ADN ressemblantes à des promoteurs

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12
Q

les miRNA et les siRNA font partie de quel type de ncRNA

A

les iRNA (RNA interference)

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13
Q

différence entre lncRNA et miRNA

A

lncRNA plus de 200 nucléotides
miRNA moins de 200 nucléotides

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14
Q

les lncRNA, miRNA et siRNA régulent l’expression des gènes au niveau…

A

transcriptionnel, post-transcriptionnel et au niveau de l’épissage du pré-ARNm

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15
Q

les lncRNA, miRNA et siRNA participent à…

A

formation d’hétérochromatine, modification des histones, ciblage de méthylation et silençage des gènes

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16
Q

vrai ou faux, les lncRNA, miRNA et siRNA peuvent être impliqués dans différentes pathologies comme le cancer

A

vrai

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17
Q

vrai ou faux, les miRNA et les siRNA peuvent être impliqués dans des phénomènes épigénétiques

A

faux, ce sont les lncRNA et les miRNA qui peuvent être impliqués

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18
Q

iRNA joue un rôle important dans…

A

défense des cellules contre les séquences nucléotidiques parasites (virus et transposons)

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19
Q

iRNA est un processus biologique dans lequel…

A

molécule d’ARN inhibent l’expression ou la traduction des gènes en neutralisant les molécules d’ARNm ciblées

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20
Q

qui suis-je? je peux inhiber de manière sélectiveet robuste l’expression des gènes d’intérêt spécifique lorsqu’introduit dans la cellule

A

siRNA synthétiques

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21
Q

le miRNA est une petite molécule de ncRNA d’environ ? nucléotides de long

A

22

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22
Q

miRNA aussi retrouvé chez…

A

plantes, animaux et certains virus

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23
Q

les miRNA fonctionne dans…

A

régulation post-traductionnel de l’expression génétique

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24
Q

les miRNA sont abondants dans plusieurs types de cellules mammifères, vrai ou faux

A

vrai

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25
Q

les miRNA semblent cibler quel pourcentage des gènes humains

A

environ 60%

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26
Q

la plupart des miRNA sont conservés entres les espèces ce qui permet…

A

de les étudier chez une souris par exemple et d’en comprendre la fonction chez l’humain

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27
Q

fonctionnement des miRNA

A

la plupart inhibent l’expression génétique en ciblant ARNm
fonctionnent via appariement de bases avec séquences complémentaires au sein des molécules d’ARNm ciblées

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28
Q

les molécules d’ARNm ciblées par miRNA sont silencées par quels processus

A

clivage du brin d’ARNm en 2 morceaux
déstabilisation de l’ARNm par clivage de la queue polyA
diminution de l’efficacité de la traduction d’ARNm en protéines

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29
Q

la biogenèse des miRNA se fait à quel endroit

A

dans le noyau

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30
Q

les gèes de miRNA sont généralement transcrits par…

A

ARN polymérase II

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31
Q

le transcrit de miARN est d’abord…

A

coiffé, polyadénylé et épissé

32
Q

les miRNA font partie d’un transcrit précurseur contenant ???? appelé ???

A

1 ou plus miRNA
pri-miRNA

33
Q

1 pri-miRNA peut contenir ???

A

1-6 précurseurs de miRNA appelés pré-miRNA

34
Q

structure de chaque pré-miRNA

A

structure tige-boucle de 70-80 nucléotides

35
Q

décrit la maturation des miRNA dans le noyau

A
  • chaque structure d’ARN double brin des épingles à cheveux d’un pri-miRNA est reconnue par protéine nucléaire DGCR8 (ou pasha chez invertébrés)
  • DGCR8 et enzyme Drosha forment un complexe microprocesseur
  • activité enzymatique de Drosha découpe les pré-miRNA à partir du pri-miRNA
  • CROPPING: Drosha libère les pré-miRNA (épingles à cheveux) des pri-miRNA à la base des épingles à cheveux
36
Q

uen fois séparé du pri-miRNA par la Drosha, le pré-miRNA résultant a quelle particularité

A

2 nucléotides non-appariés à son extrémité 3’

37
Q

décrit l’export des pré-miRNA

A

exportés vers cytoplasme par Exportin-5 qui reconnait les 2 nucléotides laissées à extrémité 3’ par drosha

38
Q

le transport par Exportin-5 est dépendant de…

A

énergie du GTP lié à la protéine Ran (Ran-GTP)

39
Q

décrit la maturation des pré-miRNA dans cytoplasme

A
  • DICING: épingle à cheveux pré-miRNA est processé par Dicer
  • Dicer = endoribonucléase qui coupe la boucle reliant les bras de l’épingle à cheveux et donnant un duplex miRNA:miRNA* imparfait d’environ 22 nucléotides
40
Q

dans le duplex miRNA:miRNA*, lequel est le brin guide et lequel est le brin passager

A

miRNA: brin guide
miRNA*: brin passager

41
Q

vrai ou faux, l’un ou l’autre des brins du duplex peut potentiellement agir en temps que miRNA fonctionnel

A

vrai

42
Q

qui choisi le brin à utiliser (brin guide miRNA)

A

Argonaute (Ago)

43
Q

le brin guide, Ago et d’autres protéines forment ensemble

A

RISC (complexe de silencing induit par ARN)

44
Q

dans RISC quelles composantes peuvent intéragir

A

miRNA et sa cible d’ARNm

45
Q

vrai ou faux, miRNA mature ne fait pas partie du RISC

A

faux

46
Q

autre nom de RISC

A

complexe miRNA ribonucléoprotéine (miRNP)

47
Q

quel est le role que joue Ago dans RISC

A

Ago lie le miRNA mature qui va alors guider le RISC pour une interaction avec un ARNm cible

48
Q

quels sont les 2 mécanismes d’action principaux de RISC

A

appariement étendu
appariement pas extensif

49
Q

décrit l’appariement extensif

A

SLICING: si appariement entre miRNA et ARNm est étendu (presque parfait), ARNm cible est clivé et dégradé

50
Q

vrai ou faux, certains Ago sont en mesure de cliver directement les ARNm cibles

A

vrai par exemple Ago2 humaine

51
Q

décrit l’appariement non extensif (imparfait, partiel)

A

séquestration dans les P-bodies:
- si appariement pas extensif, Ago ne slice pas, la traduction est inhibée et ARNm est déstabilisé
- ARNm sont séquestrés dans des structures cytosoliques dites P-bodies (processing bodies) ou a lieu leur dégradation

52
Q

décrit les P-bodies

A

structures dynamiques contenant enzyme Dcp1 (decaping enzyme) ainsi que des enzymes de dégradation des ARNm

53
Q

quels sont les 2 autres mécanismes d’action plus secondaires de RISC

A
  • miRNA partiellement complémentaire peuvent inhiber l’initiation de la traduction de ARNm cible en se liant au début du ARNm
  • miRNA partiellement complémentaire peuvent également accélérer la déadénylation entrainant ainsi la dégradation précoce des ARNm
54
Q

les miRNA provoquent parfois aussi ???? des sites promoteurs qui affecte l’expression des gènes cibles

A

modification d’histones et méthylation de l’ADN

55
Q

les miRNA ont certaines interactions avec quel supresseur de tumeur
quelles sont ces interactions

A

p53
certains miRNA sont régulés par p53 alors que d’autres régulent p53

56
Q

différents miRNA peuvent affecter différentes étapes du…

A

cancer du sein

57
Q

vrai ou faux, la majorité des miRNA sont extracellulaires

A

faux, intracellulaires

58
Q

vrai ou faux, certains miRNA ont été découverts dans environnement extracellulaire (comme différents fluides biologiques et milieux de culture cellulaire)

A

vrai

59
Q

nom donné généralement aux miRNA trouvés en milieux extracellulaires

A

miRNA circulant ou extracellulaire

60
Q

2 types de miRNA qui peuvent affecter les diverses étapes du cancer du sein

A

oncogenic miRNA
tumor suppressor miRNA

61
Q

vrai ou faux, des miRNA diagnostiques, prédictifs et prognostiques peuvent être impliqués dans le cancer du sein

A

vrai

62
Q

qu’est-ce qu’un lncRNA

A

transcrit de plus de 200 nucléotides qui ne code pas pour une protéine

63
Q

vrai ou faux, les lncRNA sont exprimés plus fortement que les gènes codants pour des protéines

A

faux, plus faiblement

64
Q

vrai ou faux, les lncRNA sont généralement plus enrichis dans le cytoplasme

A

faux, plus enrichis dans les noyaux

65
Q

vrai ou faux, les lncRNA montrent une plus faible conservation de séquence

A

vrai (même si certains sont fortement conservés)

66
Q

les lncRNA sont ??? comme les ARNm codants mais ils ne sont pas ???

A

transcrits et matures
traduits

67
Q

les gènes des lncRNA sont définis par…

A

position relative aux gènes codants situés à proximité

68
Q

quels sont les types de lncRNA

A

lncRNA intergéniques
lncRNA antisens
lncRNA introniques
lncRNA divergents

69
Q

décrit les lncRNA intergéniques

A

lincRNA localisés dans une région entre gènes

70
Q

décrit les lncRNA antisens

A

transcrits dans direction opposée d’un gène codant et leur séquence chevauche en partie ou totalement gène codant associé

71
Q

décrit les lncRNA introniques

A

contenus dans un intron d’un gène codant

72
Q

décrit les lncRNA divergents

A

transcrits de façon divergente au promoteur d’un gène codant

73
Q

les lncRNA peuvent contrôler l’expression de quels gènes et de quelle façon

A

voisins (en cis, action locale)
indépendamment de localisation de gènes cibles (en trans, action distale)

74
Q

le contrôle des lncRNA sur l’expression des gènes cibles peut être soit…

A

positif (activation) ou négatif (répression)

75
Q

à travers quels mécanismes les lncRNA peuvent-ils agir pour réguler l’expression génique

A
  • diriger des modificateurs de chromatine vers gènes cibles spécifiques
  • déplacer des régulateurs de l’expression (activateurs ou répresseurs) des séquences régulatrices de l’expression
  • entrer en compétition avec miRNA et protéger les ARNm de la dégradation par miRNA (fonction éponge)
  • moduler des évènements d’épissage et interférer avec la traduction
  • promouvoir association des facteurs des séquences amplificatrices et promotrices pour initier la transcription

MMD1042.3 (11 decks)

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