Cours 4B: Traduction Flashcards
comment est lu/décodé la séquence d’ARNm
en groupe de 3 bases appelées triplets ou codons
les triplets/codons codent pour des…
acides aminés
vrai ou faux, tous les acides aminés ont plusieurs codons
faux, Méthionine Met et Tryptophane Trp en ont qu’un seul
signal d’initiation de la traduction
AUG (méthionine)
codons qui codent pour un signal STOP
UAA, UAG, UGA
vrai ou faux, tous les organismes utilisent le meme code génétique
vrai
décrit la structure d’un ARNm eucaryote
coiffe 5’
région 5’ non-traduite (5’ UTR)
AUG
région codante (ORF: open reading frame)
STOP (UAA, UAG ou UGA)
région 3’ non-traduite (3’ UTR)
queue poly-A 3’
à quoi sert la coiffe 5’
reconnaissance par ribosome
efficacité de la traduction
stabilité de ARNm
à quoi sert la région 5’ UTR
efficacité de la traduction
à quoi sert la région 3’ UTR
efficacité de la traduction
stabilité ARNm
à quoi sert la queue poly-A
efficacité de la traduction
stabilité ARNm
comment on identifie le début d’un ORF
c’est le premier AUG (méthionine) qui détermine l’initiation de l’ORF
à la place de AUG, que retrouve-t-on dans l’ADN
ATG
il existe combien de cadres de lecture possible pour un ARNm donné
3
décrit une mutation silencieuse
mutation n’affecte pas la traduction puisque plusieurs codons pour le meme acide aminé
ex.: GGC gly devient GGA mais c’est toujours gly
décrit une mutation faux-sens/missence
la mutation change l’acide aminé lors de la traduction
ex.: CGT arg devient CAU his
décrit une mutation non-sens
la mutation crée un codon STOP à un endroit ou il ne devrait pas y en avoir un
ex.: TAT tyr devient UAA STOP
décrit une mutation de continuation
la mutation retire un codon STOP et la synthèse du polypeptide continue
ex.: TAA STOP devient UUA leu
décrit les mutations d’insertion
+1 frameshift
ajout d’un nucléotide dans la chaine qui décale les triplets
ex.: ATG GGC ATT devient ATA GGG CAT T…
décrit les mutations de délétion
-1 frameshift
retrait d’un nucléotide dans la chaine qui décale les triplets
ex.: ATG GGC ATT devient AGG GCA TT…
quelles sont les possibilités d’effet des mutations
ponctuelles
insertions
délétions
sil il y a une insertion et une délétion…
on retrouve le cadre de lecture de départ
??? permettent la lecture du code génétique
les ARNt (ARN de transfert)
concrètement, que font les ARNt
ils assortissent les acides aminés aux codons
cmb de nucléotides dans un ARNt
70-80
les ARNt ont une structure en…
feuille de trèfle
les ARNt sont des ??? qui relient les acides aminés aux codons
adaptateurs moléculaires
peut il y avoir de l’ambiguité dans les ARNt
non
peut il y avoir de la dégénérescence ou de la redondance dans les ARNt
oui
combien de codons total
64
combien de codons codent pour les acides aminés
61 codons pour 20 acides aminés
combien de codons STOP
3
quel est le codon d’initiation
AUG
vrai ou faux, certains acides aminés ont plusieurs ARNt
vrai
quelle structure de l’ARNt s’apparie par complémentarité avec le codon
anti-codon
àquoi servent les extrémités 5’ et 3’ de l’ARNt
reconnaissance et positionnement
qui s’occupe de reconnaitre et coupler un acide aminé à son ARNt spécifique
Aminoacyl-ARNt-synthétase
Aminoacyl-ARNt-synthétase est l’enzyme que l’on considère comme le premier ??? et qui assure le processus de ???
adaptateur du code génétique
chargement
comment appelle-t-on un ARNt avec son acide aminé
ARNt chargé
la liaison entre un ARNt et son acide aminé est…
riche en énergie et donc très instable
quel est le 2e adaptateur du code génétique
molécule d’ARNt
ou se passe la lecture du code génétique
dans le ribosome
le message de l’ARNm est décodé sur…
les ribosomes
quelles sont les composantes du ribosome
gros complexe de 4 ARN et plus de 80 nucléotides
une grande sous-unité et une petite sous-unité
les ARN comptent pour quel pourcentage de la masse du ribosome
plus de 50%
quels sont les sites de liaison présents sur le ribosome
1 site de liaison à ARNm
3 sites de liaison à ARNt:
- site A pour site Aminoacyl ARNt (site accepteur)
- site P pour site Peptidyl-ARNt
- site E pour exit (site de sortie)
quelles sont les 3 phases majeures de la traduction
initiation, élongation et terminaison
plusieurs antibiotiques inhibent…
la traduction des protéines dans les bactéries
l’élongation se fait en combien de sous-étapes
4
décrit l’étape 1 de l’élongation
- ARNt chargé d’un acide aminé se lie au site A libre du ribosome selon codon sur ARNm
- codon détermine l’acide aminé ajouté à la chaine polypeptidique en croissance
- site A et site P assez proches pour que 2 ARNt s’apparient à 2 codons spécifiques
- cet arrangement ajusté permet d’empecher les erreurs de lecture pendant la synthèse
décrit l’étape 2 de l’élongation
- bout carboxylique de la chaine polypeptidique est découplé de ARNt situé au site P et est lié par liaison peptidique au groupe aminé libre lié à ARNt au site A
- rxn favorable énergétiquement et réalisée spontanément grace à la grande énergie du lien aminoacyl avec son ARNt
décrit l’étape 3 de l’élongation
- déplacement de la grande sous-unité par rapport à la petite sous-unité du ribosome déplace les 2 ARNt dans A et P vers (respectivement) les sites P et E de la grande sous-unité
décrit l’étape 4 de l’élongation
- la petite sous-unité se déplace d’exactement 3 nucléotides sur la molécule d’ARNm ce qui repositionne exactement face à face les 2 sous-unités dans leur position originale
- site A est donc libre pour accueillir l’ARNt chargé suivant
que ce passe-t-il une fois que les 4 étapes de l’élongation ont été réalisées
on recommence à l’étape 1 jusqu’à arriver d’un codon STOP
comment se produit la terminaison de la traduction
quand le ribosome arrive à un codon STOP, il n’y a pas d’acide aminé correspondant
un facteur reconnait alors cette situation
liaison d’un facteur de libération (release factor) au site A porteur d’un codon STOP = fin de la traduction
polypeptide achevé se détache et le ribosome dissocie ses 2 sous-unités
les protéines sont en réalité traduites par des…
polyribosomes
décrit un polysome/polyribosome
série de ribosomes qui peuvent traduire simultanément une meme molécule d’ARNm
que permet un polysome
une plus grande efficacité de la traduction