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MMD1042.3 > Cours 3: Traffic Membranaire Intracellulaire > Flashcards

Cours 3: Traffic Membranaire Intracellulaire Flashcards

1
Q

RAPPEL les membranes cellulaires agissent comme

A

des barrières sélectives qui séparent les molécules et les empêchent de se mélanger

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2
Q

RAPPEL les membranes cellulaires maintiennent ??? et empêchent ???

A

hétérogénéité
homogénéité

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3
Q

RAPPEL les endomembranes sont des membranes ???

A

intracellulaires

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4
Q

les endomembranes séparent…

A

différents compartiments (organites) qui jouent différents roles

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Q

donne des exemples d’organites cellulaires qui possèdent une endomembrane

A

endosome, peroxysome, lysosome, appareil de Golgi, réticulum endoplasmique

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6
Q

quelles sont les 2 voies de traffic membranaire intracellulaire

A

voie endosomale/voie de dégradation
voie de sécrétion/voie de biosynthèse

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7
Q

la cellule doit constamment équilibrer…

A

l’import et l’export de matériel

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8
Q

il y a un flux constant de membranes entre…

A

compartiments intracellulaires et la MP

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9
Q

la MP est à la fois le compartiment ? pour ?? et le compartiment ? pour ??

A

compartiment donneur pour endocytose
compartiment cible pour sécrétion (via exocytose)

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10
Q

le traffic membranaire est extrêmement…

A

dynamique

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11
Q

le transport se fait via…

A

les microtubules

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12
Q

tout se produit dans un cytoplasme extremement…

A

dense

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13
Q

le transport intracellulaire est également appelé transport ?? pour quelle raison

A

transport vésiculaire
pcq il se fait via la formation et la fusion de vésicules

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14
Q

les vésicules servent comme intermédiaires pour…

A

le transport de molécules de chargement (cargo) entre différents compartiements

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15
Q

pour contrôler la spécificité du transport, les cellules utilisent…

A

beaucoup d’étiquettes

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16
Q

les molécules de chargement (cargo) peuvent se retrouver dans…

A

lumière ou la membrane des vésicules

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17
Q

comment appelle-t-on le processus de sécrétion et comment se produit-il

A

exocytose
fusion avec la MP

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18
Q

comment appelle-t-on le processus d’internalisation et comment se produit-il

A

endocytose
formation de vésicules à partir de la MP

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19
Q

RAPPEL les feuillets de la MP sont…

A

asymétriques

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20
Q

RAPPEL le feuillet externe de la MP contient…

A

PC (phosphatidylcholine)
SM (sphingomyéline)
GSL (glycosphingolipides)

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21
Q

RAPPEL le feuillet interne de la MP contient…

A

PI (phosphatidylinositol)
PE (phosphatidyléthanolamine)
PS (phosphatidylsérine)

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22
Q

L’asymétrie des feuillets de la MP apparait aussi à quel endroit

A

dans les feuillets des endomembranes

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23
Q

le feuillet qui est face à la lumière du vésicule devient…

A

le feuillet externe de la MP

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24
Q

le feuillet externe du vésicule devient…

A

le feuillet interne de la MP

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25
Q

la phagocytose fonctionne pour quel type de particules

A

particules plus larges comme bactéries et corps apoptotiques

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26
Q

la phagocytose résulte en un…

A

lysosome

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27
Q

la phagocytose utilise des pseudopodes qui sont dépendants de…

A

l’actine

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28
Q

quel est le lien entre la phagocytose et les molécules de PS sur feuillet interne

A

pendant apoptose, la PS devient exposée au feuillet externe de la MP
le signal PS est reconnu par macrophages, cela induit la phagocytose des corps apoptotiques

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29
Q

processus d’internalisation similaire à la phagocytose mais qui internalise pas des particules solides

A

macropinocytose

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30
Q

la macropinocytose résulte en un…

A

endosome précoce

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31
Q

la macropinocytose fonctionne pour…

A

un liquide non-spécifique

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32
Q

la macropinocytose est l’ingestion de…

A

gouttelettes de fluide avec nutriments (comme acides aminés)

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33
Q

la macropinocytose est dépendante de

A

l’actine

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34
Q

la macropinocytose est activé par…

A

Ras-GTP

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35
Q

décrit comme la pinocytose est induite

A

une région de membrane activée stimule la polymérisation d’actine autour de cette région par la phospholipide PIP3
c’est donc PIP3 qui induit la pinocytose

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36
Q

quels sont les types d’endocytose observés

A

dépendante à la clathrine
dépendante à la cavéoline
indépendante à la cavéoline et la clathrine

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37
Q

quel est le type d’endocytose la plus importante

A

endocytose dépendante à la clathrine

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38
Q

décrit le processus d’endocytose dépendante à la clathrine

A

récepteurs de chargements (liés au chargement) sont captés par les adaptines qui lient aussi les clathrines à la face cytosolique de la vésicule en bourgeonnement
protéines clathrines s’assemblent autour du col de la vésicule
une fois assemblées, les molécules de dynamine hydrolysent leur GTP lié et avec l’aide de d’autres protéines détachent la vésicule
quand bourgeonnement est fini, le manteau protéique est retiré par hydrolyse d’ATP et la vésicule nue fusionne avec la membrane cible

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39
Q

de manière concise, les étapes de l’edocytose dépendante à la clathrine sont

A

1- recruitement de clathrine et déformation de la membrane
2- scission par la dynamine (hydrolyse de GTP)
3- vésicule mantelée de clathrine
4- perte de manteau (hydrolyse ATP)

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40
Q

forme inactive de clathrine dans le cytosol

A

triskèle

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41
Q

la polymérisation de la clathrine donne…

A

une forme polyédrale à la membrane qui forme la vésicule

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42
Q

la formation d’une vésicule mantelée de clathrine est facilitée par

A

actine

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43
Q

la scission est médiée par ? qui forme…

A

dynamine
des oligomères en hélices autour du cou de la vésicule en formation (action GTPase)

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44
Q

au début de l’endocytose dépendante à la clathrine, il y a formation de … puis de …

A

puits mantelé
vésicule mantelée

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45
Q

la cavéoline est

A

une protéine membranaire

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46
Q

l’endocytose médiée par la cavéoline forme des vésicules plus…

A

petits que la clathrine

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47
Q

la scission lors de l’endocytose avec cavéoline est médiée par

A

dynamine

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48
Q

l’endocytose médiée par la cavéoline forme ultimement des…

A

cavéosomes

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49
Q

endocytose spécifique de taille moyenne

A

dépendante à la clathrine

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50
Q

endocytose non-spécifique de petite taille

A

dépendante à la cavéoline
indépendante à la clathrine et la cavéoline

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51
Q

différents manteaux forment des vésicules à partir de…

A

différentes membranes donneuses

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52
Q

les endosomes sont…

A

des vésicules entourées d’une simple membrane (1 seule bicouche lipidique) qui proviennent de la MP suite à l’endocytose

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53
Q

les endosomes maturent en devenant de plus en plus…

A

acide

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54
Q

les endosomes précoces et tradifs sont morphologiquement similaires mais…

A

différents dans leurs composantes et leur pH

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55
Q

les endosomes tardifs peuvent former

A

des CMV (corps multivésiculaires) ou il y a bourgeonnement à l’intérieur de la cellule

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56
Q

vrai ou faux, tous les CMV sont des endosomes

A

vrai

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57
Q

vrai ou faux, tous les endosomes sont des CMV

A

faux

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58
Q

fonction de l’endosome précoce

A

tri

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59
Q

ph de l’endosome précoce

A

6.5

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60
Q

fonction de l’endosome de recyclage

A

recyclage

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61
Q

ph de l’endosome de recyclage

A

6.5

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62
Q

fonction de l’endosome tardif/CMV

A

dégradation

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63
Q

ph de l’endosome tardif / CMV

A

6.0

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64
Q

fonction du lysosome

A

dégradation

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65
Q

ph du lysosome

A

5

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66
Q

décrit les étapes du transport de cholestérol qui se fait via ???

A

lipoprotéines de basse densité (LDL)
- LDL se lie au récepteur de LDL
- endocytose
- perte du manteau de clathrine
- fusion avec un endosome
- acidification (cause le détachement du LDL de son récepteur)
- tri:
a. vésicules de transport (avec récepteur LDL) se détachent et retour des récepteurs de LDL vers la MP (recyclage)
b. transfert au lysosome qui contient des enzymes hydrolytiques, LDL est dégradé et cholestérol est libéré

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67
Q

les lysosomes sont (acide ou basique ?) et riches en ???

A

acides
hydrolases acides (enzymes hydrolytiques)

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68
Q

les lysosomes sont le site de…

A

dégradation du système endomembranaire

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69
Q

les lysosomes possèdent une V-ATPase pour quelle raison

A

pomper des H+ à l’intérieur du lysosome et ainsi augmenter son acidité

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70
Q

enzymes des lysosomes sont actifs seulement…

A

à bas pH donc ils ne sont pas actifs avant d’arriver dans le lysosome

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71
Q

la membrane des lysosomes contient également des ??? qui ont quelle fonction?

A

transporteur de métabolite
permettent le recyclage des composantes après la dégradation

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72
Q

les exosomes sont des…

A

vésicules extracellulaires qui proviennent du système endosomal

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73
Q

les exosomes sont libérés quand…

A

CMV (aussi appelé MVB) se fusionnent avec la MP

74
Q

quelles sont les 3 sources de matériel des lysosomes

A

phagocytose
endocytose
autophagie

75
Q

décrit l’autophagie

A

mécanisme qui entoure en membrane des régions de cytoplasme, des aggrégats protéiques et certains organites (comme mitochondries et peroxysomes) permettant leur dégradation via fusion avec des lysosomes

76
Q

comment se nomme l’autophagie de mitochondries

A

mitophagie

77
Q

les autophagosomes sont formés de…

A

une double membrane (2 bicouches lipidiques)

78
Q

les autophagosomes sont formés via l’intermédiaire de

A

phagophores

79
Q

comment s’assemblent les phagophores

A

via recrutement de protéines spécifiques et fusion des vésicules en provenance du RE

80
Q

quelle sont les étapes de l’autophagie

A

1- nucléation
2- extension
3- maturation
4- fusion

81
Q

l’autophagie est produite de facon constitutive pour maintenir…

A

homéstasie de la cellule

82
Q

l’autophagie est aussi stimulée en cas de…

A

déprivation de nutriments pour promouvoir la survie

83
Q

vrai ou faux, les peroxysomes sont présents dans presque toutes les cellules eucaryotes

A

faux, dans TOUTES les cellules eucaryote

84
Q

les peroxysomes ressemblent aux lysosomes mais…

A

ils ne font pas partie du système endo-lysosomal

85
Q

le peroxysome est un organite

A

sphérique à simple membrane

86
Q

diamètre d’un péroxysome

A

200-1000 nm

87
Q

les péroxysomes sont important pour…

A

métabolisme (oxydation des acides gras) et détoxification (production/dégradation du H2O2 et métabolisme des espèces réactives d’oxygène aka ROS)

88
Q

les peroxysomes contiennent…

A

plus de 50 enzymes

89
Q

enzyme la plus importante des peroxysomes

A

catalase (ROS)

90
Q

les peroxysomes permettent la synthèse de…

A

acides biliaires (foie) et lipides (en plus de RE)

91
Q

la plupart des peroxysomes se forment par…

A

fission et croissance comme les mitochondries

92
Q

les protéines peroxysomales permettent…

A

la croissance du peroxysome

93
Q

quels sont les mécanismes d’entrée de la voie endosomale

A

phagocytose, endocytose (médiée par clathrine, cavéoline, etc.) et autophagie

94
Q

les protéines endocytées sont soit…

A

recyclées à la MP
dégradées via les lysosomes
(suite à un tri à l’endosome préccoce/endosome de triage)

95
Q

la lumière des endosomes devient de plus en plus

A

acide dans les étapes tardives de la voie (pH lysosome = 5)

96
Q

dans endosome précoce, le pH légèrement acide permet

A

dissociation ligand/récepteur

97
Q

que se passe-t-il avec le récepteur et avec le ligand une fois dissociés

A

récepteur recyclé par endosome de recyclage
ligand transporté vers endosomes tardifs et lysosomes pour dégradation

98
Q

quel type de protéines transmembranaires permet la fusion des vésicules

A

SNARE

99
Q

quels sont les types de SNARE impliqués dans la fusion

A

v-SNARE sur le vésicule intéragissent avec t-SNARE sur membrane cible (target SNARE)

100
Q

étape de la fusion des vésicules

A

1- arrimage de la vésicule de transport
2- coalescence des membranes
3- fusion membranaire

101
Q

le désassemblage des complexes v-t-SNARE dépend de …

A

hydrolyse de l’ATP

102
Q

vrai ou faux, l’hydrolyse d’ATP est aussi nécessaire pour la fusion

A

faux

103
Q

vrai ou faux, tous les compartiments de la cellule utilisent les memes SNAREs

A

faux, différents SNAREs pour différents compartiments

104
Q

pour se fusionner, la vésicule doit d’abord…

A

s’attacher et s’appareiller avec la membrane cible

105
Q

quelle autre protéine permet la fusion des v.sicules

A

GTPases de la famille Rab

106
Q

décrit l’implication des GTPases de la famille Ras dans la fusion des vésicules

A

Rab-GTP (forme active) permet de reconnaitre les protéines effectrices qui permettront l’appareillage
Rab-GDP est sa forme inactive

107
Q

d’ou vient la spécification des membranes des différents compartiments

A

des différents SNAREs, des différents Rabs, et de la composition de la bicouche lipidique qui est aussi différente

108
Q

que sont les phosphoinositides

A

variants de PI (phosphatidylinositol) phosphorylés

109
Q

anneau inositol peut être phosphorylé/déphosphorylé sur…

A

positions 3,4,5 par des kinases et phosphatases

110
Q

types de phosphoinositides

A

PI3P, PI4P, PI5P, PI(4,5)P2, PI(3,4,5)P3

111
Q

toutes les espèces de phosphoinositides sont régulées par ???

A

kinases et phosphatases spécifiques

112
Q

différents phosphoinositides sont enrichis sur ??? ce qui permet…

A

différentes membranes
facon pour les cellules de distinguer les différents compartiments

113
Q

qu’est-ce que la voie de sécrétion/voie de biosynthèse

A

lieu de passage des protéines nouvellement synthétisées au RER et destinées à la MP, à l’exportation par sécrétion ou encore à d’autres organites (comme lysosomes)

114
Q

qu’est-ce que le RE

A

réseau de citernes ou sacs membranaires qui entoure le noyau

115
Q

la surface du RE peut être soit

A

lisse (REL) ou rugueuse à cause des ribosomes (RER)

116
Q

le RE est la fabrique de…

A

membranes cellulaires

117
Q

le RE est en continuité avec…

A

enveloppe nucléaire

118
Q

décrit le REL

A

pas de ribosomes
réseau de tubules
continuité avec RER

119
Q

roles du REL

A

synthèse lipidique (phospholipides, cholestérol, hormones stéroïdiennes, parties lipidiques des lipoprotéines)
réservoir de Ca2+ (réticulum sarcoplasmique des muscles)

120
Q

décrit le RER

A

avec ribosomes
réseau de citernes
en continuité avec REL

121
Q

roles du RER

A

synthèse protéique
repliement des protéines (par exemple ponts disulfure)
controle de qualité
glycolysation des protéines

122
Q

décrit les ribosomes

A

composés d’ARN ribosomale (ARNr) et de protéines
20-30 nm
2 sous-unités: grande et petite

123
Q

les ribosomes sont essentiels pour

A

traduction des ARNm en protéines

124
Q

la synthèse protéique est la traduction de…

A

ARNm en protéines

125
Q

pendant la synthèse protéique, le ribosome se déplace…

A

5’ vers 3’ en lisant chaque codon de 3 nucléotides

126
Q

ARNt spécifique pour chaque codon transfère…

A

chaque acide aminé à la chaine polypeptidique jusqu’à un codon stop

127
Q

qu’est-ce qu’un polysome

A

multiples ribosomes en train de traduire le meme ARNm simultanément

128
Q

si ribosomes sont dans le cytoplasme, comment peut-on produire les protéines destinées à la sécrétion hors de la cellule ou à insertion dans la MP

A

protéines destinées à être sécrétées ou transmembranaires ont un séquence signal “signal peptide” N-terminal qui dirige le ribosome au réticulum endoplasmique
c’est une étiquette

129
Q

donne des exemples d’étiquettes pouvant être utiliser pour différentes fonctions dans organisme

A

signaler import vers RE, rétention dans la lumière du RE, import dans les mitochondries, import dans le noyau, import dans les peroxysomes, etc

130
Q

les ribosomes libres synthétisent

A

des protéines cytosoliques (ou nucléaire, ou mitochondriales, etc.)

131
Q

les ribosomes du RER synthétisent

A

des protéines destinées à être sécrétées ou transmembranaires ou qui fonctionnent dans le système endomembranaire

132
Q

décrit la translocation co-traductionnelle au RER

A

séquence signal amène les ribosomes qui chevauchent ARNm en voie de traduction à la surface extérieure du RE (une particule de reconnaissance de signal SRP se lie à son récepteur SRP dans la membrane du RE)
la protéine qui se forme d’allonge dans citerne du RE à travers un complexe protéique = le translocon (ou canal de translocation)
la séquence signal est ensuite clivée par peptidase

133
Q

que ce passe-t-il avec les protéines transmembranaires pendant la translocation co-réplicationnelle

A

elles sont insérées dans la bicouche lipidique via le translocon

134
Q

RAPPEL le glycocalyx est formé par ??? et est important pour ???

A

certaines protéines transmembranaire et lipides glycolysés à la surface externe de la cellule
important pour protection chimique et reconnaissance cellulaire

135
Q

la glycolysation des protéines commence dans…

A

lumière du RE (précurseur du glycocalyx)

136
Q

quelles sont les 2 classes de glycoprotéines

A

N-glycolysation
O-glycolysation

137
Q

différence entre N et O-glycolysation

A

N: oses (glucose) liés à un nitrogène de l’asparagine (Asp) dans réticulum endoplasmique
O: oses (galactose) liés à un oxygène de la Sérine/Thr dans appareil de golgi

138
Q

la N-glycosylation commence dans lumière du RE avec…

A

ajout de glycane préformé

139
Q

N des asparagines deviennent glycolysées avec…

A

chaine initiale de 14 sucres (glycane) dans lumière du RE

140
Q

précurseur du glycane

A

2 GlcNAc (N-acétylglucosamine), 9 mannose, 3 glucose

141
Q

décrit le contrôle de qualité dans la lumière du RE

A

chaperon calnexin retient les glycoprotéines incorrectement repliées
seules les protéines correctement repliées sont permises de quitter vers AG

142
Q

si il y a trop de protéines mal repliées…

A

la cellule augmente la transcription des gènes des chaperons (comme calnexine) pour augmenter quantité de RE

143
Q

propriété de la cellule par rapport à son RE

A

autocontrôle de la taille du RE

144
Q

qu’est-ce que XBP1

A

facteur de transcription qui augmente la capacité de synthèse de la cellule

145
Q

qu’est-ce que IRE1

A

endoribonucléase transmembranaire qui controle le splicing spécifique de ARN de XBP1

146
Q

que ce passe-t-il avec les protéines anormalement repliées

A

elles sont rétro-transloquées et éliminées via dégradation associée au RE (ERAD)

147
Q

que ce sont les protéasomes

A

1 des 2 dispositifs de la cellule pour éliminer les protéines vieilles, endommagées ou inutiles

148
Q

les protéasomes s’occupent spécifiquement des…

A

protéines solubles dans cytosol et nucléoplasme (facteurs de transcription, etc.)

149
Q

taille des protéasomes

A

20S, similaire à petite sous-unité ribosomale

150
Q

les protéasomes sont situées…

A

dans cytosol

151
Q

une série de protéases dégrade les protéines comme

A

un broyeur d’évier

152
Q

le RE lisse et rugueux sont en continuité avec…

A

eux-mêmes et l’enveloppe nucléaire

153
Q

RE est la porte d’entrée vers

A

voie de sécrétion

154
Q

REL est le site de synthèse des…

A

lipides

155
Q

RER est le site de synthèse des…

A

protéines sécrétoires et membranaires via translocation co-traductionnelle

156
Q

RER important pour

A

structure secondaire des protéines

157
Q

RER est le lieu du début de…

A

glycolysation des protéines

158
Q

RER possède des mécanismes de…

A

controle de qualité (grace aux chaperons)

159
Q

la cellule auto-controle la taille de son RE via

A

UPR

160
Q

qu’est-ce que l’appareil de golgi

A

série de citernes/sacs aplatis (citernes cis, médianes et trans)

161
Q

de quelle coté du AG est l’entrée

A

coté RER, citernes cis

162
Q

de quelle coté est la sortie du AG

A

coté MP, citernes trans

163
Q

il y a un ??? à travers l’AG

A

flux net de transport

164
Q

que retrouve-t-on entre le RE et AG

A

compartiment intermédiaire RE-Golgien (ERGIC): cluster tubulo-vésiculaire

165
Q

transport antérograde

A

RE vers AG

166
Q

transport rétrograde

A

AG vers RE

167
Q

le transport rétrograde se fait via

A

COPI

168
Q

le transport antérograde se fait via

A

COPII

169
Q

la rétention au RE se fait via le transport ?

A

rétrograde

170
Q

roles de AG

A

finition/maturation des protéines produites dans RER par glycosylation (ajout d’oses pour activation et stabilisation des protéines)
étiquetage des protéines pour marquer la destination finale (par exemple par des oses)
triage, concentration et emballage des protéines dans vésicules ou granules de sécrétion

171
Q

les vésicules/granules de sécrétion produites par le AG sont acheminés à destination de quelle facon

A

par transport le long des microtubules grace à des moteurs (kinésine, dyénine)

172
Q

la N-glycosylation des protéines commence dans ??? et continue dans ???

A

RE
AG (finition et maturation des glycoprotéines)

173
Q

suite à la N-glycosylation, un tri se fait à la sortie de ?, quelles sont les options

A

réseau trans-golgien
lysosomes, MP et vésicules de sécrétion

174
Q

les glycoprotéines du RER sont enrichis en

A

mannose (simple)

175
Q

les glycoprotéines de l’AG sont formées

A

d’oligosaccharides plus complexes

176
Q

décrit la sécrétion constitutive

A

fait par toutes les cellules
protéines solubles sécrétées en permanence
aussi pour homéostasie (maintien) de la MP (ex: Na+/K+ ATPase)

177
Q

décrit la sécrétion régulée

A

seulement les cellules sécrétoires suite à un signal extracellulaire (par exemple les cellules beta du pancréas qui sécrètent insuline en réponse au glucose)
dans ces cellules le réseau transgolgien (TGN) fait tri pour séparer composantes des différents types de vésicules sécrétoires

178
Q

le bouton synaptique est un exemple de sécrétion ?

A

régulée

179
Q

quelles sont les étapes du bouton synaptique

A

1- livraison du contenu des vésicules synaptiques à la MP
2- endocytose de composantes des vésicules synaptiques pour former de nouvelles vésicules synaptiques
3- bourgeonnement de nouvelles vésicules synaptiques depuis les endosomes
4- chargement de neurotransmetteurs dans les vésicules synaptiques
5- sécrétion de neurotransmetteur par exocytose en réponse à un potentiel d’action

180
Q

la neurotransmission par exocytose régulée est contre-balancée par

A

endocytose

181
Q

décrit le transport endosomal dans les cellules polarisées

A

contiennent 2 MP (apicale et baso-latérale)
transcytose: endocytose MP apicale + transport + fusion avec MP baso-latérale

MMD1042.3 (11 decks)

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