Cours 6 : TCR Flashcards
Qu’est ce que la sélection clonale
Le fait de faire répondre une cellule avec un récepteur spécifique à l’antigène (clone spécifique à l’Ag)
Vrai ou faux : les polynucléaires neutrophiles reconnaissent les DAMP et les PAMP via leur PRR pour la phagocytose
Vrai
À quel lymphocyte T le CMH1 est-il présenté? Et le CMH2?
1 : CD8
2: CD4
Est ce que les lymphocytes T peuvent lier les virus ou les antigènes de virus sous leur forme natives
Non, ils doivent être liés et présentés par un CMH1-2
Vrai ou faux : le TCR reconnait seulement les antigènes viraux liés CMH
Faux, ils peuvent aussi reconnaitre les antigènes du soi
Quels sont les 2 modèles proposés pour la reconnaissance des antigènes par les lymphocytes T
- Deux récepteurs séparés : un qui reconnait le CMH et l’autre qui reconnait l’Ag
- Un seul récepteur : reconnait l’Ag complexé à une molécule du CMH
Quelle expérience permet de démontrer que la reconnaissance des Ag par le TCR n’est fait que par 1 seul récepteur
- fusion de 2 clones T spécifique différentes : 1 clone spécifique à OVA avec CMH2-IAk et 1 clone spécifique KLH avec CMH2-IAf
- La cellule modifié ne reconnait que L’OVA sur une CPA porteuse du CMH2-IAk et KLH sur une CPA porteuse du CMH2-IAf
Quelles sont les difficultés rencontrées par rapport à l’identification du TCR
- Les cellules T devraient posséder un récepteur antigène spécifique et clonotypique
- Récepteur membranaire (pas de forme soluble)
- Interaction plus faible avec l’Ag que les Ac
- Spécifique pour l’Ag et le CMH
Comment faire pour identifier/isoler le TCR
Production d’Ac qui reconnaissent un type spécifique de TCR et utiliser ces Ac pour caractériser biochimiquement le TCR
Comment générer plusieurs cellules T spécifiques pour un Ag donné (avoir une grande population de ce clone)
- Immunisation de souris avec un Ag (ex : OVA) afin de faire proliférer les cellules T réactives spécifiques envers l’Ag OVA
- Récolte des ganglions lymphatiques 7 jours plus tard
- Expansion des cellules T spécifiques à l’Ag OVA in vitro en cultivant les cellules des ganglions lymphatiques avec l’Ag
Quelles sont les étapes de la création d’un hybridome T spécifique à un Ag donné
- Fusion des cellules T spécifique à l’Ag OVA avec une lignée de cellules T cancéreuses
- Clonage par dilution limite afin d’avoir un hybridome T qui possède une séquence unique de TCR reconnaissant l’Ag OVA
Quelles cytokines seront produites lors de la réponse d’un hybridome à son Ag spécifique
IL-2
Comment obtenir des Ac qui vont se fixer aux hybridomes T spécifiques
- On utilise l’hybridome T comme source d’Ag pour obtenir des Ac monoclonaux dirigés contre le TCR
- Quelques jours après l’immunisation, on prélève la rate
- Fusion des lymphocytes B de la rate avec des cellules B cancéreuses
- Clonage par dilution afin d’obtenir des Ac monoclonaux qui reconnaissent l’hybridome T utilisé lors de l’immunisation
Comment identifie-t-on l’ac qui lie un TCR spécifique
Si l’ajout de l’Ac inhibe la reconnaissance antigénique (pas de production d’IL-2), cet Ac est spécifique au TCR
Quelles est la structure du TCR
1 chaine Alpha
1 chaine Bêta
1 passage transmembranaire positif/chaine
1 queue cytoplasmique/chaine
Vrai ou faux : le TCR fait partie de la superfamille des immunoglobulines
Vrai
Combien de domaines possède chaque chaine du TCR et quels sont-ils
2 domaines contenant un pont disulfure
V : domaine variable
C : domaine constant
Comment créer une grande diversité de TCR afin d’assurer une réponse envers tous les Ag possibles
Grâce à la recombinaison de segments de gènes (Alpha : V et J, Bêta :V, J et D)
Qu’est ce que les SSR
Séquences signal de recombinaison qui dictent quels segments peuvent être réarrangés
De quoi sont constitués les séquences SSR
- Heptamère et nonamère dont la séquence nucléotidique est conservée dans tous les SSR
- D’un spacer de 12 ou 23 paires de bases
Vrai ou faux : lors du réarrangement, on associe toujours un SSR ayant un spacer de 12 pb avec SSR ayant aussi un spacer de 12 pb
Faux, on associe un SSR ayant un spacer de 12 pb avec un SSR ayant un spacer de 23 pb
Pourquoi doit ont apparier les SSR 12-23
Pour que les SSR soient du même côté de la double hélice d’ADN afin de les rendre accessibles à une même enzyme
Quel est le rôle de Rag1/2
Spécifiques aux lymphocytes et assure la recombinaison des séquences V, J et D : cassure du double brin d’ADN
Quel est le rôle de TdT
Spécifique aux lymphocytes : ajoute des nucléotides à la jonction des gènes V, D et J du TCR
Quel est le rôle d’Artémis
Ouverture des extrémités codantes et des boucles en épingle lors de la recombinaison V, D et J du TCR
Rôle Ligase IV
Joint les 2 bouts d’ADN (soudure) lors de la recombinaison V, D et J du TCR
Quelle sont les grandes étapes du mécanisme de recombinaison du TCR
- Formation d’une synapse
- Clivage
- Trans-estérification
- Ouverture de l’épingle à cheveu par Artémis
- Aujout des P nucléotides
- Action des exonucléases
- Ajout de N-nucléotides par Tdt
- Ligation
Que se passe-t-il lors de la formation d’une synapse dans la recombinaison du TCR
1.Rag1/2 se lient au RSS = initiation
2. Rag1/2 catalysent la formation de la synapse entre le segment de gène V et J = rapprochement des 2 segments
3. Protéines HMG aide le repliement de l’ADN afin de rapprocher les segments de gènes
Que se passe-t-il lors du clivage dans la recombinaison du TCR
Rag1/2 introduisent une cassure simple dans 1 des brins d’ADN en 5’ de l’heptamère du SSR des segments V et J
Que se passe-t-il lors de la trans-estérification dans la recombinaison du TCR
- Groupement 3’OH généré par le clivage de Rag1/2 attaque le groupement phosphate de l’autre brin d’ADN
- Création une extrémité en épingle au niveau de l’extrémité codante et une extrémité franche au niveau du bout signal
Que se passe-t-il avec l’extrémité franche de la jonction signal (recombinaison TCR)
Liguée pour former un cercle de recombinaison qui sera éventuellement perdu
Que se passe-t-il lors de l’ouverture de l’épingle à cheveu par Artémis dans la recombinaison du TCR
L’ouverture peut avoir lieu à divers endroit dans l’épingle à cheveu : selon l’endroit de l’ouverture, cela créera différentes extrémités
Que se passe-t-il lors de l’ajout des P-nucléotides dans la recombinaison du TCR
Les extrémités cohésives sont remplies par une polymérase en utilisant l’information du brin complémentaire
Que se passe-t-il lors de l’action des exonucléases dans la recombinaison du TCR
À l’occasion, avant que les extrémités soient remplies par la polymérase, il arrive que des exonucléases enlèvent des nucléotides
Que se passe-t-il lors de l’ajout de N-nucléotides par Tdt dans la recombinaison du TCR
Ajout de nucléotide de façon aléatoire et indépendante de la matrice d’ADN par l’enzyme Tdt
Que se passe-t-il lors de la ligation dans la recombinaison du TCR
Ligation des extrémités pour former la jonction codante
Vrai ou faux : pour faire la ligation des extrémités pour former la jonction codante, on utilise les enzymes classiques de la réparation des cassures d’ADN double brin
Vrai
Qu’est ce qui permet la génération de la diversité jonctionnelle des TCR lors de la recombinaison V, J et D
- P-nucléotides et N-nucléotides
- Activité exonucléases
Combien de séquence nucléotiques possibles de TCR
10^15
Qu’est ce que l’exclusion allélique (concernant le TCR)
Lorsqu’un réarrangement est productif pour la chaine alpha ou bêta, ceci mène à l’arrêt du réarrangement du locus respectif
Assure que chaque cellule T exprime 1 seul TCR
Vrai ou faux : le TCR se lie parallèle au complexe peptide-CMH
Faux, il se lie en diagonale
Avec quoi interagissent CDR1/2 vs CDR3
CDR1/2 : les hélices alpha du CMH
CDR3 : peptide
Est ce que le CD3 participe à la reconnaissance d’Ag
Non, il permet la transmission des signaux d’activation lors de la reconnaissance antigénique
Est ce que CD3 est requis pour l’expression du complexe à la surface cellulaire et la transmission des signaux
OUI
Structure CDR3
Complexe de 6 polypeptides invariables formés de 3 dimères :
1. Gamma-epsilon
2. Delta-epsilon
3. Zeta-zeta
Vrai ou faux : CD3 ge et de sont des membres de la superfamille des immunoglobulines
Vrai, ils ont un domaine extracellulaire (domaine immunoglobuline) et une région cytoplasmique
Structure de CD3 zeta
Très courte région extracellulaire et longue queue cytoplasmique contenant des motifs ITAM
Utilité des motifs ITAM sur les queues cytoplasmiques des CDR3 zeta
Sites de recrutement à des protéines adaptatrices suite à leur phosphorylation induite par l’activation
Vrai ou faux : pour assembler le complexe du TCR, l’interaction des charges est d’une importance majeure
Vrai, les régions transmembranaires des molécules CD3 sont chargées négativement = stabilisation de la chaine positive du TCR
Vrai ou faux : l’affinité du RTC pour le complexe Ag-CMH est plutôt faible
Vrai (lien avec la sélection thymique)
Quelles sont les molécules accessoires utilisées pour augmenter les interactions entre la cellule T et les CPA
- Adhésine
- Co-récepteurs
Est ce que les co-récepteurs de la cellule T participe à la signalisation intra-cellulaire
Oui, dans la liaison de la tyrosine kinase Lck
Quel est le rôle des molécules accessoires des cellules T
Renforcement du contact TCR-CMH (augmentation de l’affinité) et aide à la signalisation
Qu’est ce que l’éducation thymique
Maturation de cellules T restreintes au CMH qui sont utiles et non-autoréactives
Qu’est ce que la sélection positive (éducation thymique)
Survie des cellules T dont les TCR reconnaissent les molécules du CMH du soi
Qu’est ce que la sélection négative (éducation thymique)
Élimination des cellules T qui réagissent trop fortement avec le CMH du soi
Quel est le site du développement des lymphocytes T
Le thymus
Que se passe-t-il chez l’humain et la souris s’ils n’ont pas de thymus
Humain = syndrome de DiGeorge
Souris = mutation nude
Pas de cellules T
Vrai ou faux : le thymus doit être constamment colonisé par des précurseurs hématopoïétiques provenant de la moelle osseuse
Vrai
Comment se nomment les cellules T en cours de différenciation dans le thymus
Thymocytes
Vrai ou faux : les cellules épithéliales du cortex et de la médulla du thymus expriment les molécules CMH1 et CMH2
Vrai
Où se retrouvent les cellules dendritiques et les macrophages dans le thymus
Dendritiques : jonction cortico-médullaire et médulla
Macrophage : répartis dans tout le thymus
À quelle endroit dans le thymus se fait l’entrée des cellules précurseurs hématopoïétiques
À la jonction cortico-médullaire
Qu’est ce qui provoque l’engagement des cellules précurseurs hématopoïétiques vers la différenciation en lymphocyte T
Leur liaison au récepteur Notch (par les ligands Notch exprimées par les cellules épithéliales)
Grâce à quelle molécule de surface peut-on suivre le développement des thymocytes
CD4
CD8
CD3
Quelles sont les 4 sous populations de thymocytes et quelle est leur expression de CD4, CD8 et CD3
- Double négatif : CD4-, CD8-, CD3-
- Double positif : CD4+, CD8+, CD3 (faible ou fort)
- CD4 simple positif : CD4+, CD8-, CD3+
- CD8 simple positif : CD4-, CD8+, CD3+
Par quelle molécules de surface peut-on identifier les 4 sous populations de thymocytes double négatif
CD44 (molécule d’adhésion)
CD25 (chaine alpha du récepteur IL-2)
Que se passe-t-il au stade DN1 et comment est l’expression de CD44 et CD25
DN1 prolifèrent afin d’augmenter le nombre de précurseurs des cellules T
CD44+
CD25-
Que se passe-t-il au stade DN2 et comment est l’expression de CD44 et CD25
- DN2 prolifèrent afin d’augmenter le nombre de précurseurs des cellules T
- début du réarrangement de la chaine bêta du TCR et des locus gamma/delta
CD44+
CD25+
Que se passe-t-il au stade DN3 et comment est l’expression de CD44 et CD25
Arrêt de la prolifération afin d’effectuer le réarrangement complet de la chaine bêta du TCR = expression du pré-TCR
CD44 low
CD25+
Que permet l’expression du pré-TCR sur les DN3 (bêta-sélection)
- Survie du thymocyte DN3
- Prolifération massive de DN3
- différenciation en cellule DP
- Exclusion allélique de la chaîne bêta du TCR
Vrai ou faux : la prolifération massive des DN3 suite à la bêta sélection permet de créer un clone avec le même réarrangement bêta et d’y associer différentes chaines alpha
Vrai
À quels stades sont transcrites les protéines Rag1/2
DN2, DN3, DN4, DP
Qu’est ce qui indique au thymocyte qu’il y a eu un réarrangement productif de la chaine bêta
L’expression du Pré-TCR à la surface cellulaire (bêta-sélection)
Par quoi est provoquée l’exclusion allélique lorsqu’il y a réarrangement productif de la chaine bêta
La dégradation de RAG2 pendant la phase de prolifération
Pourquoi la phase de prolifération après le réarrangement productif de la chaine bêta est-elle importante
Pour créer des clones de thymocytes avec la chaine bêta réarrangée, ce qui permet à plusieurs thymocytes de tenter de faire une chaine alpha
Vrai ou faux : l’expression de la chaine pré-Talpha est perdue lors de la différenciation en thymocytes DP
Vrai
