Cours 4 - INTRA Flashcards
Metaphore avec le poisson, que represente la specaition aquatique, membrane de transport et la speciation intra-cell
- speciation aquatique –> eau dans lequel baigne le poisson
- membrane: branchies
- speciation intra-cell: int du poisson
Que retrouve t’on le plus dans la speciation aquatique ? Que fait-il?
ion libre
se lie avec un ligand membranaire –> prend en charge l’ion puis le relacher dans la speciation intra-cell
Comment est la conc de ligand a l’int et a l’ex ?
conc ligand intracell + grand que conc ligand extra
Comment traverser la membrane ?
- transport actif (pompes)
- transport facilie (avec prot membranaire)
- transport facilite (canaux ionique)
- diffusion passive (contaminant organique)
- phagocytose
Comment cree t’on des imitateurs d’anion
metaux qui s’associe a des ligand pour avoir un moyen de transport
Donner un exemple d’imitateurs de cations?
cd2+ entre par les canaux ca 2+ –> accidentel
Definir ligand biotique
ligand qui prend l’ion libre pour le transport
-incorpore la speciation du metal, les effets protecteurs de cations competiteurs et de la matiere organique pour predire le degre de liaison du metal a une membrane et la toxicite
Que se passe t’il quand le ligand est bloque?
a cause du Ca2+ (cations) abondant –> compet
Quel autre probleme peut rencontrer l’ion?
avoir un petit reservoir a cause de la presence du carbone organique (complexant)
En general quelles sont les deux problemes?
- petit reservoir –> complexant
- perte de droits d’entree –> competiteur
Comment sapelle l’experience lie a cette theorie?
MLB –> modele ligand biotique
Chez un poisson, le modele du ligand biotique est applicable a quelle voie d’entree?
par l’eau
Avec quoi peut s’associer le metal qui est entre dans la cell?
- metalo-enzyme (ligand utile)
- molecule qui sert de reserve transitoire du metal
- compartiment sensible
Avec quoi se lie un metal essentiel ?
- metalo enzyme
- reserve transitoire
Donner les 3 classes de ligands?
- type Le(ssentiel)
- type Lt (oxique)
- type Li (nerte)
Donner la caracteristiques des Le, donner un ex
effet benefique un fois le metal lie
-mol d’hemacyanine et ses atmes de cu
Donner la caracteristiques des Lt
effet negatif (liaison inapproprie) -bloquer de groupements donctionnels de biomolecules
Donner la caracteristiques des Li
ligand physiologiquement inerte
-reservoirs d;entreposage ou de stockage de metal
Donne la premiere classe de Li et ses caracteristiques et fonctions
metallothioneine -plusieurs metaux attache 2 fonctions: -regulation de la disponibilite des metaux essentiels cu et zn -detoxification des metaux traces non-essentiels (induire lors dune contamination environnementale) -marqueur interressant -thermostable -asso avec metal-groupe thiol
Donner une autre classe de Li et sa fonction
phytochelatine
- presence de phylochelatine synthase qui sont active allosteriqueemnt par les metaux
- groupement thiol (capte metaux de classe B)
- marqueur parce que + on retrouve de phytochelatine + il y’a de metaux et on en a retrouver dans les arbres morts
Qui repond le plus rapidement pour gerer l’entrer soudaine de metaux dans une cellule?
- phylochelatine –> bassin de mol qui peut etre activer des l’entree des metaux
- metallo –> code ginetiquement donc delai
Donner un troisieme type de Li
granules -present dans les cell et nintervient pas -stable type A,B,C,D -barriere a la toxicite -reserve -sequestration -excretion
Que retrouve t’on principalement comme granule chez les vertberes?
granules insolubles de Se et de Hg
se = mettaloide
Comment trouver ou se trouve les metaux, ligand etc dans lorganisme?
modele de partitionnement subcellulaire
-eloigner chaque composante d’une aprtie et calculer le nbr de metaux a l’int
Donner le 1er defi du modele
briser toute les cell pour liberer les fractions, sans briser les fractions
-separer chq fraction intract sans chevauchemeent–> centrifuge et chaleur
comment le cadmium est il detoxicite ?
mettaloide mais imparfaite
Definir facteur de bioconcentration
accumulation NETTE d’une substance par un organisme aquatique resultant d’une prise en charge direct a partir de l’eau et au travers des surfaces biologiques externes
- eau est la source de metal dans un organisme
- obtenu en labo en eliminant la nourriture
Donner la formule pour le calculer
BCF = conc dune substance a l'equilibre dans l'organisme / conc de la substance dans l'eau unites = L/kg
Definir facteur de bioaccumulation
accumulation nette a l’equilibre d’une sbstance par un organisme resultant d’une prise en charge directe a partir de toutes les sources environnementales\
- on comtpe la nourirture lair, leau
- sur le terrain
Donner la formule ?
BAF = conc dan l’organisme/ conc dans le milieu
que veut dire accumulation nette a lequilibre ?
somme de ce qui rentre - ce qui sort
resultat de la prise en charge, de la distribultion, de la transformtion et de l’excretion
-a lequilibre : atteindre le plateau, mm quantite prise en charge que quantite rejete
pourquoi la voie d’entree est importante?
differentes voie d’entree = toxicite differente
2echelle de transfert trophique?
- entre 2 niveaux
- le long d’un reseau entier
ENTRE 2 NIV:
Definir bioamplification
terme decrivant l’augmentation des cen de contaminantdans les organismes au fur et a mesure que l’on progresse le long de la chaine trophique
-peut etre une hausse, baisse ou stable
-
Donner la formule du facteur de bioamplification?
BMF = conc d’une substance dans l’organisme
conc de la substance dans la diete
pas de unite
-en general moins pour les metaux (baisse entre 2 niv (proie en a moins) –> biominification
-surtout les contaminants organiques
comment mettre en valeur le transfert trophique entre deux niveaux?
- modele du partionnement subcellulaire
- modele biodynamique ou biocinetique
Que reccupere t’on a lissue d’un modele de partinnement subcellilaire
DETOXICATION: -granules -proteine thermostables SENSIBLE: -prot thermosensibles -mitochondries -microsomes/lysosomes
Qu’est ce qui est assimile ?
cytosol
pq est il utile d’utiliser ce modele?
TAM= trophically available metals
- metaux disponible pour transfert trophique
varie: - avec type nourriure
- identite consom
- metal
Definir efficacite d’assimilation
portion d’un contaminant assimilee par l’organisme a partir de sa nourriture
Donner la formule
AE: Aassimile/Anourriture = 9Anourriture - A eces) / Anourriture
Que peut-on conclure sur la fraction qui est assimile?
fraction qui est transferee au niveau trhophique suivant est celle qui est dans le cytosol, et non pas celle associe aux membranes
Que se trouve dans le cytosol?
prot thermosensible et thermostable
Comment peut t’on aller gratter des metaux dans des fractions - disponible?
avec de organismes avec un bon pouvoir digestif
MODELE BIODYNAMIQUE OU BIOCINETIQUE:
FORMULE: ce qui rentre par l’eau + par la nourrtiture - ce qui sort (temps de croissance important)
Quelle est le probleme avec le taux de croissance?
si un organisme grandit trop vite, il va grandir + plus vite quil accumule
Definir potentiel de transpher trophique?
estime du transfert trophique d’un M pour un organisme, si l’eau n’est pas un vecteur important
Donner la formule
TTP = AE(ce qui rentre PAR LA NOURRITURE) x IR (TAUX DE D’INGESTION)/ (Ke(TAUX D’EXCRETION) + g)
si TTP >1 –> bioamplification probable
si TTP<1 —> BIOAMPLIFICATION IMPROBABLE
LE LONG DE AL CHAINE ALIMENTAIRE:
quel outil est utilise?
isotope stables
Comment se passe les isotopes Carbone a travers la chaine?
changement d’isotope se produisant tout en bas de la chaine qui est garde
par ex: pelagic (algues) ou benthic (belaphine)–> 2 traces differentes
Donner un autre isotope
azote
–> enrichissement progressif du istope 15 par rapprt a istope 14 le long du reseaux
Alors, comment on reconnait de quel reseau alimentire provient un animale? Sa position trophique?
Istope du carbone –> pelargique ou benthique
cb de 15N
Qu’utilise t’on pour representer ce quil se passe dans un reseau alimentaire? Definition?
taux de bioamplification
estime de l’accroissement moyen de la conc de Metaux par unite de isotope 14N
donner les 3 facons par lesquelles un predatuer au sommet peut avoir une conc de metal differentes entre different sites
- ligne reste la mm mais monte ou descend –> changement e ligne de base pour le metal
- la pente change –> changement du fonctionnement du reseaux alimentaire
- mm pente mais + longue –> ajout de qql un dans la chaine trophique
Definir fraction bioaccessibilite
fracation d;une substance chimique qui se retrouve dans la phase dissoute dans le tractus digestif d’un organisme
-in vitro
diff biodisponibilite et bioaccessibiite
biodisponibilite –> faire une prise de sang et voir cb de metaux apres manger il y’a
bioaccesibilite –> phase dissoute apres la digestion
CALCUL TAUX BIOAMPLIFICATION
log10 Cm = A x 15N + B
A = pente de l’equation (TMF)
B ; ordonne a l’origine