Cours 3 - Diagnostic moléculaire (Partie I) Flashcards
Quelle est la première cause identifiable de mort subite chez le jeune ?
→ Une maladie génétique cardiovasculaire.
Vrai ou Faux : La majorité des morts subites chez les jeunes sont dues à des infections virales.
→ Faux. La première cause identifiable est une maladie génétique cardiovasculaire.
Quels sont les deux types de dépistage familial utilisés pour les maladies génétiques cardiovasculaires ?
→ Le dépistage clinique
→ Le dépistage moléculaire.
Qu’est-ce que la médecine personnalisée ?
→ C’est une médecine visant à améliorer la stratification et la prise en charge des patients en utilisant des informations biologiques et des biomarqueurs.
Quel est l’objectif principal de la médecine personnalisée ?
→ Améliorer la stratification et la prise en charge des patients.
Vrai ou Faux : La médecine personnalisée repose uniquement sur les antécédents familiaux du patient.
→ Faux. Elle repose sur des informations biologiques et des biomarqueurs.
Quels domaines biologiques sont mentionnés comme sources d’informations pour la médecine personnalisée ? (4)
→ Les voies moléculaires des maladies,
→ La génétique,
→ La protéomique
→ La métabolomique.
Définissez la pharmacogénétique.
→ C’est l’étude de la relation entre le profil génétique d’un patient et sa réponse aux médicaments, permettant d’adapter la sélection et la dose des traitements.
Complétez : En pharmacogénétique, le choix des médicaments (__________ et __________) est adapté au profil génétique du patient.
→ sélection, dose.
Vrai ou Faux : La pharmacogénétique adapte le traitement selon la tolérance du patient à la douleur.
→ Faux. Elle adapte selon le profil génétique et la réponse aux médicaments.
Qu’est-ce que l’oncogénétique permet de faire ?
→ Adapter les thérapies en fonction des caractéristiques génétiques de la tumeur et du profil génétique du patient.
Quel est le but de la cardiogénétique ?
→ Guider le traitement à partir des caractéristiques génétiques du patient et dépister les membres de la famille à risque.
Vrai ou Faux : La cardiogénétique ne concerne que le traitement du patient et non sa famille.
→ Faux. Elle permet aussi le dépistage familial.
Par quels types de chromosomes le génome est-il encodé ?
→ Par les chromosomes nucléaires et les chromosomes mitochondriaux.
Complétez : Les chromosomes nucléaires comprennent 22 paires d’__________ et 1 paire de __________.
→ autosomes, gonosomes.
Vrai ou Faux : Les chromosomes sexuels sont appelés autosomes.
→ Faux. Ils sont appelés gonosomes.
Sous quelle forme se présentent les chromosomes mitochondriaux ?
→ Sous forme circulaire.
Combien de gènes sont encodés par les chromosomes mitochondriaux ?
→ 37 gènes.
Comment se transmettent les chromosomes mitochondriaux ?
→ Exclusivement par la mère.
Vrai ou Faux : Les chromosomes mitochondriaux peuvent être transmis par le père.
→ Faux. Ils sont transmis uniquement par la mère.
À quoi sont associés les variants dans les gènes mitochondriaux ?
→ À des maladies à transmission maternelle.
Quels sont les trois processus principaux de l’expression génétique ?
→ Réplication, transcription, traduction.
Quel enzyme est responsable de la réplication de l’ADN ?
→ L’ADN polymérase.
Quel rôle joue l’ARN dans l’expression génétique ?
→ Il sert de matrice pour la traduction en protéine par le ribosome.
Vrai ou Faux : L’ARN est fréquemment utilisé en clinique.
→ Faux. Il est rarement employé en clinique.
Quel est le rôle du ribosome dans l’expression génétique ?
→ Il effectue la traduction de l’ARN en protéine.
Pourquoi les protéines sont-elles importantes dans l’analyse de laboratoire ?
→ Elles sont majoritairement analysées (sérum/plasma) et jouent de multiples rôles dans la cellule (structure, métabolisme, régulation, etc.).
Complétez : Le transfert d’information génétique permet l’expression du __________ dans le __________.
→ génotype, phénotype.
Vrai ou Faux : Les protéines n’ont qu’un rôle structural dans la cellule.
→ Faux. Elles participent aussi au métabolisme, à la régulation et à d’autres fonctions cellulaires.
Quel acide nucléique est transcrit à partir de l’ADN ?
→ L’acide ribonucléique (ARN).
Que devient l’ARN après épissage ?
→ Il devient l’ARN messager (ARNm).
Quel est le rôle de l’épissage ?
→ L’épissage consiste à retirer les introns de l’ARN et à assembler les exons pour former l’ARNm.
Sur quoi repose le code génétique ?
→ Sur la correspondance entre les triplets de nucléotides (codons) présents sur l’ARN messager et les acides aminés.
Combien de codons existent dans le code génétique ?
→ 64 codons.
Combien d’acides aminés sont codés par les 64 codons ?
→ 22 acides aminés.
Complétez : Le code génétique est dit __________ car plusieurs codons peuvent coder pour un même acide aminé.
→ dégénéré.
Pourquoi dit-on que le code génétique est universel ?
→ Parce que le même code génétique est utilisé par presque tous les organismes vivants.
Quelle relation le code génétique établit-il au sein d’un organisme ?
→ Il établit la correspondance entre le génotype et le phénotype.
Complétez : Le code génétique lie le __________ (information génétique) au __________ (caractères observables).
→ génotype, phénotype.
Qu’est-ce que le génotype ?
→ C’est l’information codée dans notre génome, correspondant à une composition et une séquence génétique spécifique.
Par quoi est défini un génotype ?
→ Par la séquence des deux allèles d’un gène.
Qu’est-ce que le phénotype ?
→ C’est la manifestation physique ou clinique du génotype.
Vrai ou Faux : Le phénotype ne peut pas être mesuré.
→ Faux. Il peut être représenté par des quantités mesurables comme l’IMC ou le taux de cholestérol.
Donnez un exemple de phénotype discret.
→ La présence ou l’absence d’une maladie.
Donnez deux exemples de phénotypes quantitatifs.
→ Indice de masse corporelle (IMC) et niveaux sanguins de cholestérol.
Qu’est-ce que la corrélation génotype-phénotype ?
→ C’est l’association entre la présence d’un ou plusieurs variants génétiques (génotype) et leurs expressions cliniques ou physiologiques (phénotype).
Vrai ou Faux : Le génotype détermine totalement le phénotype sans influence externe.
→ Faux. Le phénotype est influencé par le génotype mais aussi par des facteurs environnementaux.
Qu’est-ce qu’un individu hétérozygote ?
→ C’est un individu dont les deux allèles d’un gène sont différents.
Qu’est-ce qu’un individu homozygote ?
→ Un individu dont les deux allèles pour un gène sont identiques.
Qu’est-ce qu’un individu hémizygote ?
→ Un individu qui ne possède qu’un seul chromosome (ou segment de chromosome) pour un gène donné, notamment en référence aux gènes portés par le chromosome X chez un individu XY.
À quoi réfère la notion d’hémizygotie chez l’humain ?
→ Aux gènes localisés sur le chromosome X chez un individu XY.
À quoi correspond la génétique mendélienne ?
→ À l’étude de la transmission des caractères héréditaires selon les lois établies par Mendel.
Quel était le but des expériences de Mendel sur les petits pois ?
Établir des lois statistiques sur la transmission des caractères héréditaires. (Hybridation)
Quel est le mode de transmission des maladies mendéliennes ?
→ Monogénique (ou monofactorielle).
Quelle est la différence entre une maladie mendélienne homogène et hétérogène ?
→ Homogène : le gène impliqué est le même chez tous les patients (myopathie de Duchenne.)
→ Hétérogène : le gène affecté peut être différent d’un patient à l’autre. (cardiomyopathie hypertrophique.)
Quels sont les quatre modes de transmission des maladies mendéliennes ?
→ Autosomal dominant,
→ Autosomal récessif,
→ Lié à l’X dominant,
→ Lié à l’X récessif.
Combien d’allèles mutés sont nécessaires pour qu’une maladie autosomique dominante se manifeste ?
→ Un seul allèle muté suffit.
Quel est le statut des individus hétérozygotes dans une maladie autosomique dominante ?
→ Ils sont malades.
Comment sont affectés les individus homozygotes dans ce type de maladie ?
→ Ils sont atteints plus sévèrement.
Quel est le risque de transmission de la maladie à chaque grossesse dans un cas de transmission autosomique dominante ?
→ 50 %.
Vrai ou Faux : Un enfant ne peut hériter de la maladie que si les deux parents sont porteurs.
→ Faux. Un seul parent porteur suffit dans une transmission autosomique dominante.
Nommez trois exemples de maladies à transmission autosomique dominante.
→ Cardiomyopathie hypertrophique,
→ Syndrome de Marfan,
→ Hypercholestérolémie familiale.
Qu’est-ce que la pénétrance en génétique ?
→ C’est le pourcentage d’individus ayant un génotype donné qui présentent le phénotype associé.
Que signifie une pénétrance incomplète ?
→ Un individu possède le génotype associé à la maladie, mais ne développe pas la maladie.
Vrai ou Faux : Une pénétrance de 100 % signifie que tous les individus porteurs du génotype développent la maladie.
→ Vrai.
Qu’est-ce que l’expressivité ?
→ C’est le niveau d’expression d’un génotype donné au niveau phénotypique.
Complétez : L’expressivité mesure le __________ d’expression d’un génotype donné.
→ niveau.
Qu’est-ce qu’une mutation de novo ?
→ C’est une mutation qui apparaît spontanément chez un individu, sans être héritée des parents.
Vrai ou Faux : Dans la variabilité de l’expressivité, tous les individus présentent un phénotype identique.
→ Faux. Ils présentent le phénotype à des degrés divers.
Quelle est la différence visuelle entre la pénétrance variable et l’expressivité variable?
→ La pénétrance variable alterne entre présence ou absence totale du phénotype,
→ Alors que l’expressivité variable montre des variations d’intensité du phénotype chez tous les individus.
Combien d’allèles mutés sont nécessaires pour qu’une maladie autosomique récessive se manifeste ?
→ Deux allèles mutés.
Quel est le statut des individus hétérozygotes (Aa) dans une transmission autosomique récessive ?
→ Ils sont porteurs, mais généralement non malades.
Que signifie être homozygote (AA) pour un gène muté récessif ?
→ Cela signifie que l’individu est malade.
Quelles sont les probabilités pour chaque grossesse lorsque les deux parents sont porteurs (Aa) ?
→ 25 % d’enfant homozygote malade,
→ 50 % porteur,
→ 25 % sain.
Donnez deux exemples de maladies autosomiques récessives.
→ Fibrose kystique,
→ Hémochromatose.
Qu’est-ce que l’effet fondateur ?
→ C’est la perte de variation génétique qui survient lorsqu’un petit groupe d’individus fonde une nouvelle population dans une zone géographique différente.
Quel phénomène génétique est observé lors de l’effet fondateur ?
→ Une perte de variation génétique.
Quel est le mode de transmission de l’hérédité mitochondriale ?
→ Transmission maternelle, non-mendélienne.
Complétez : Lors de la fécondation, le cytoplasme de l’oocyte est exclusivement d’origine __________.
→ maternelle.
Pourquoi l’hérédité mitochondriale est-elle dite non-mendélienne ?
→ Parce qu’elle ne suit pas les lois classiques de Mendel, les mitochondries sont transmises uniquement par la mère.
Tous les enfants d’une femme atteinte d’une maladie mitochondriale seront-ils malades ?
→ Oui.
Tous les enfants d’un homme atteint d’une maladie mitochondriale seront-ils malades ?
→ Non, ils seront sains.
Quel est le type d’hérédité de l’hérédité multifactorielle ?
→ Non-mendélienne.
Complétez : L’hérédité multifactorielle dépend à la fois de l’__________ et de l’__________.
→ hérédité, environnement.
Pourquoi dit-on que certains caractères (comme la taille) ont une hérédité multifactorielle ?
→ Parce qu’ils dépendent de plusieurs gènes (multigénique) et de facteurs environnementaux.
Comment est distribuée l’expression des caractères multifactoriels dans la population ?
→ Selon une distribution normale.
Que peuvent affecter les variants rares dans l’ADN ? (2)
Ils peuvent affecter une énorme (ex. : trisomies) ou une infime (un seul nucléotide) partie de l’ADN.
Quels types de maladies peuvent être causées par des variants rares ?
Ils peuvent être à l’origine de maladies génétiques (variants germinaux) et de cancers (variants somatiques).
Quel impact fonctionnel peuvent avoir les variants rares sur une protéine ?
Ils peuvent augmenter (gain de fonction) ou diminuer (perte de fonction) la fonction de la protéine encodée.
Qu’est-ce qu’un variant structural ? (3)
- Anomalies chromosomiques de nombre
- Anomalies de structure (translocations, insertions, inversions, délétions, duplications)
- Variations du nombre de copies (CNVs)
Que sont les InDels ?
Ce sont de petites insertions ou délétions de nucléotides dans l’ADN.
Que sont les SNPs ? (5)
Ce sont des polymorphismes d’un seul nucléotide.
- Variants synonymes
- Variants faux-sens
- Variants non-sens
- Variants affectant les sites d’épissage
- Variants non-codants
Qu’est-ce qu’une anomalie chromosomique de nombre ?
C’est une anomalie affectant le nombre total de chromosomes présents chez un individu.
Que signifie “monosomie” ?
C’est l’absence d’un chromosome dans une paire (aneuploïdie par défaut).
Quelle est la monosomie viable la plus connue ?
Le syndrome de Turner (45, X).
Que signifie “trisomie” ?
C’est la présence d’un chromosome en trop dans une paire (aneuploïdie par excès).
Quelles sont les trisomies les plus connues ?
- Trisomie 13 : Syndrome de Pateau
- Trisomie 18 : Syndrome d’Edwards
- Trisomie 21 : Syndrome de Down
Qu’est-ce qu’une délétion ?
C’est la perte ou suppression d’une portion d’un chromosome.
Que se passe-t-il dans une duplication ?
Une portion du chromosome est dupliquée, créant du matériel génétique supplémentaire.
Qu’est-ce qu’une inversion ?
Une portion du chromosome est brisée, retournée tête-bêche puis réattachée, ce qui inverse la séquence génétique.
Que désigne une insertion ?
Une portion d’un chromosome est insérée dans un autre chromosome.
Qu’est-ce qu’une translocation ?
C’est un échange de matériel génétique entre deux chromosomes non homologues, après cassure.
Que se passe-t-il si une insertion ou délétion est un multiple de 3 nucléotides ?
Il n’y a pas de changement du cadre de lecture (lecture des codons reste intacte).
Et si l’insertion ou la délétion est inférieure ou supérieure à 3 nucléotides (non multiple de 3) ?
Il y a un changement du cadre de lecture (frameshift), ce qui peut fortement altérer la protéine produite.
Qu’est-ce qu’une mutation faux-sens (missense) ?
→ C’est une mutation qui entraîne le remplacement d’un acide aminé par un autre.
Qu’est-ce qu’une mutation non-sens (nonsense) ?
→ C’est une mutation qui introduit un codon stop prématuré, stoppant la traduction.
Qu’est-ce qu’une mutation synonyme ?
→ C’est un changement de nucléotide qui ne modifie pas l’acide aminé codé.
Qu’est-ce qu’un variant au niveau d’un site d’épissage ?
→ C’est une mutation qui affecte les régions spécifiques (sites donneurs 5’ ou accepteurs 3’) impliquées dans l’épissage de l’ARN.
Que sont les mutations non-codantes ?
→ Ce sont des mutations situées dans les introns ou les régions intergéniques, en dehors des exons.
Quels sont les deux grands types d’effets fonctionnels des variants génétiques ?
→ Perte de fonction (LoF)
→ Gain de fonction (GoF).
Quels sont les principaux types de variantes?
1) Faux-sens (missense)
2) Perte de fonction (LoF)
3) Gain de fonction (GoF)
Qu’est-ce qu’un mécanisme épigénétique ?
→ C’est un facteur qui affecte le fonctionnement des gènes sans modifier le génotype.
Complétez : Chaque maladie est associée à des variants dans certains gènes __________.
→ spécifiques.
Qu’est-ce qu’un cas-index ?
→ C’est une personne chez qui un diagnostic clinique ou suspecté déclenche une recherche génétique pour une cause génétique.
Que se passe-t-il si le résultat génétique du cas-index est positif pour un variant pathogénique ?
→ Un dépistage en cascade peut être réalisé dans la famille pour identifier les porteurs et les membres à risque.
Que signifie “prise en charge clinique différentiée” ?
→ Adapter les soins (médication, chirurgie, suivi…) selon les résultats génétiques.
Qu’est-ce qu’un cas-index (ou proband) ?
→ C’est le premier membre de la famille chez qui une maladie génétique est identifiée, menant à une investigation génétique.
Vrai ou Faux : Le diagnostic d’un cas-index permet de poser un diagnostic sur l’ensemble de la population.
→ Faux. Il concerne les membres de la famille à risque.
Quel est l’impact du diagnostic d’un cas-index sur les membres de la famille ?
→ Il soulève un indice de suspicion et permet de diagnostiquer certains membres porteurs du même variant.
À quoi sert la génétique médicale ?
1) Pour le patient atteint
2) Pour les grossesses futures
3) Pour les familles
4) Pour la société
Quel est le premier rôle de la génétique médicale pour un patient atteint ?
Elle permet de poser un diagnostic clinique précis.
Quel est l’apport de la génétique médicale en planification de grossesse ?
Elle permet la détermination du risque de récurrence d’une maladie génétique.
En quoi la génétique médicale est utile pour les proches d’un patient ?
Elle permet le dépistage en cascade des personnes à risque dans la famille.
Quelle est l’utilité de la génétique médicale pour la santé publique ?
Elle permet le développement de la médecine préventive.
