COURS 3 : CYTOGÉNÉTIQUE : PATHOLOGIES CHROMOSOMIQUES ET MÉTHODES DE DÉTECTION

Question 1

Le caryotype permet quoi?

Answer 1

Caryotype : classement des chromosomes selon un ordre établi par entente internationale

Permet :
-d’analyser la structure des chromosomes
-de comparer les 2 homologues

Question 2

Définir comment établir le caryotype

Answer 2

La première étape consiste à compter le nombre de chromosomes

Par la suite, l’analyse des chromosomes se base sur :
-la taille des chromosomes
-classés du plus grand au plus petit (1 à 22) : la 23ième paire constitue les gonosomes qui sont classés à part
-la forme des chromosomes
-le marquage particulier à chacun des chromosomes

Question 3

La forme des chromosmes est déterminée par quoi?

Answer 3

Par la position du centromère

Question 4

VRAI OU FAUX : La forme d’une paire de chromosome est constante

Answer 4

VRAI, mais elle varie d’une paire à l’autre

Question 5

Décrire les 3 types de morphologies de chromosomes

Answer 5

-Métacentrique : position du centromère au centre entraîne 2 bras symétriques

-Submétacentrique : position du centromère entraîne 2 bras asymétriques

-Acrocentrique : position du centromère à une extrémité entraîne un très petit bras court

Question 6

Décrire l’anatomie du chromosome

Answer 6

-Télomère
-Bras p (bras petit et toujours placé en haut)
Bras q (bras long et toujours placé en bas)
-Télomère

Question 7

Le marquage chromosome est-il variable?

Answer 7

Le marquage est constant pour une paire donnée et permet de la distinguer d’une autre paire

Le marquage varie d’une paire à l’autre

Question 8

Le marquage des bandes des chromosomes se fait grâce à quoi?

Answer 8

Marquage en bandes GTG ou bandes G
-obtenu après traitement à la trypsine et coloration au Giemsa
-marquage utilisé en routine dans les laboratoires de cytogénétique

Question 9

Nous étudions les cellules dans quelle phase du cycle cellulaire?

Answer 9

métaphase de la mitose

Question 10

Les cellules du cycle cellulaire se divsion de 2 façons, nommez les

Answer 10

Spontanément
-fibroblastes de la peau ou du fascia, amniocytes (on peut mettre ces cellules en culture)
-cellules tumorales (hémopathies ou tumeurs solides)

Par stimulation : lymphocytes T sanguins peuvent se diviser suite à la stimulation par la PHA (phytohématoglutinine)

Question 11

L’obtention des chromosomes sur caryotype nécessite quoi?

Answer 11

-une culture cellulaire

-un arrêt du cycle cellulaire en métaphase en ajoutant un inhibiteur du fuseau mitotique (Colcemid)

-récolte des chromosomes après un traitement hypotonique de la cellule (les cellules sont traitées pour permettre la libération des chromosmes sur une lame de microscope

Question 12

Décrire la formule chromosomique

Answer 12

C’est la composition en chromosomes d’une cellule donnée

Elle est constituée des éléments suivants :
-le nbr total de chromosomes par cellules (46,47, etc)
-les gonosomes (XX ou XY)
-l’indication de l’anomalie chromosomique, s’il y en a une
-s’il n’y a pas d’anomalie : 46, XX ou 46, XY

Question 13

Pour déterminer la constitution chromosomique d’un individu, on doit analyser quoi?

Answer 13

au moins 10 cellules différentes

Question 14

Définir constitution chromosomique homogène

Answer 14

-lorsque toutes les cellules analysées sont normales (46 XX, 46 XY ou anormales)
-toutes les cellules ont donc la même formule chromosomique
-il s’agit de la majorité des cas

Question 15

Définir constitution chromosomique non homogène ou mosaïque

Answer 15

-lorsqu’on retrouve 2 types ou plus de cellules chez le même individu (2 lignées cellulaires différentes dans un tissu)
-on parle de mosaïcisme pour une anomalie chromosomique lorsque les types cellulaires proviennent d’un même zygote
-on parle de lignées cellulaires
-due à des anomalies dans la ségrégation mitotique des chromosomes

Question 16

Lorsqu’on parle d’anomalies des chromosomes, on parle de quel type de chromatine?

Answer 16

modifications de l’EUchromatine des chromosomes

Question 17

Une anomalie chromosomique qui modifie la quantité d’euchromatine aurait un effet sur quoi?

Answer 17

Une anomalie chromosomique qui modifie la qté d’euchromatine dans le génome entraîne un effet sur le phénotype

Question 18

Si l’anomalie ne touche que l’hétérochromatine, qu’est-ce qui se passe?

Answer 18

On parle de variant chromosomique et l’anomalie n’a pas d’effet sur le phénotype

Question 19

Le chromosome 1 se distingue par quoi?

Answer 19

Variant hétérochromatique (Zone d’hétérochromatine toujours présente en-dessous du centromère au niveau du bras long. La taille de l’hétérochromatine va varier d’un individu à l’autre sans que cela n’est d’impact sur le phénotype)

Question 20

Quels sont les 2 grands types d’anomalies chromosomiques?

Answer 20

-anomalies de nbr
-anomalies de structure

Question 21

Quels sont les 2 types d’anomalies de nombre + description

Answer 21

Polyploïdie : addition d’un ou plusieurs complément haploïde (n) :
-triploïdie : 69, XXX (3n)
-tétraploïdie

Aneuploïdie : touche une seule paire d’homologue dont le nombre est augmenté ou diminué
-trisomie 47, XY +21
-monosomie : 45 X (1 seul X)

Question 22

Décrire les 2 mécanismes de triploïdie

Answer 22

Digénique : le complément chromosomique supplémentaire provient de la mère (fécondation de spermatozoïde ayant 23 chromosomes avec un ovule ayant 46 chromosomes)

Diandrique :
-complément chromosomique supplémentaire provient du père (fécondation de spermatozoïde ayant 46 chromosomes avec un ovule ayant 23 chromosomes)
-2 spermatozoïdes à 23 chromosomes avec 1 ovule à 23 chromosomes

= 69 chromosomes pour chacune de ces triploïdie

Question 23

Quel est le mécanisme de triploïdie le plus fréquent?

Answer 23

le mécanisme diandrie dans 84% des cas par fécondation d’un ovule par 2 spermatozoïdes ou dispermie

Question 24

Nommez les caractéristiques de phénotypes importantes pour la diandrie et la digynie

Answer 24

Diandrie
-retard de croissance intra-utérin important, kystes du placenta (changements molaires), peu viable

Digynie
-placenta hypotonique, syndactylies 2-3 (doigts collés ensemble), RCIU

Question 25

Décrire l’aneuploïdie

Answer 25

Anomalie du nombre d’une seule paire de chromosome (augmenté ou diminué)

Résulte d’une erreur dans la répartition des chromosomes lors de la division cellulaire
-pour être homogène doit se faire en méiose
-non dysjonction en mitose entraîne un mosaïcisme tissulaire

Question 26

Nommez un facteur de risque de l’aneuploïdie

Answer 26

âge maternel avancé (plus de 35 ans) constitue un facteur de risque

Question 27

L’aneuploïdie résulte de quoi?

Answer 27

Non-dysjonction en méiose 1
-division réductionnelle (séparation des homologues)
-2 chromosomes homologues (différents d’un même parent) demeurent dans la gamète
-type le plus fréquent

Non-dysjonction en méiose 2
-division équationnelle (sert à séparer les chromatides soeurs)
-non-dysjonction MII : 2 chromatides soeurs demeurent dans le même gamète (donc 2 chromosomes identiques sauf pour les recombinaisons subies)

Question 28

Est-ce que les monosomies sont viables?

Answer 28

Non, sauf pour le chromosome X, les monosomies d’un chromosome complet ne sont pas viables

Question 29

Quel est l’effet de l’âge maternel sur les trisomies?

Answer 29

> 90% des trisomies origine de la méiose maternelle

Erreur en méiose 1 le plus souvent
-sauf pour trisomie 18 où l’erreur en méiose 2 est plus fréquente

Effet de l’âge maternel est présent pour les erreurs en méiose 1 et 2

Question 30

Quels sont les types de recombinaisons méiotiques et trisomies

Answer 30

L’absence de recombinaisons et les recombinaisons en positions télomériques sont des facteurs de risque pour la non-dysjonction à tout âge
-erreur de méiose 1
-le bivalent ségrégerait de façon plus ou moins indépendante

Les recombinaisons péricentromériques : facteur de risque chez la femme plus âgée
-erreur en M2
-interfèrerait avec la cohésion normale des chromatides soeurs

Question 31

Qu’est-ce que le syndrome de Turner?

Answer 31

Monosomie du chromosome X
-2% des conceptions
-90% résultent en avortements spontanés (phénotypes les plus sévères avec hydrops = oedème généralisés du foetus/embryon)
-majorité : non-disjonction dans les gamètes paternels
-1/2000 nouveau-né féminins

Question 32

Décrire le syndrome de Turner à la naissance

Answer 32

Phénotype variable, intelligence normale

Le plus constant : courte taille proportionnée et dysgénésie gonadique

Question 33

Nommez les caractéristiques du syndrome de Turner

Answer 33

Phénotype féminin avec corpuscule de Barr absent

Intelligence normale
-difficultés spatio-temporelles, d’attention possibles

Courte taille proportionnée

Insuffisance ovarienne par dysgénésie gonadique
-absence ou non complétion de la puberté spontan.e
-aménorrhée primaire
-infertilité (possible avec nouvelles technologies reproductives)

Autres signes possibles
-oreilles basses implantées
-cou palmé (pterygium colli), résultat d’un hygroma kystique en grossesse
-thorax large et mammelons écartés
-anomalie cardiaque (coartaction de l’aorte ou autre)
-anomalies rénales (reines fusionnées, ectopiques, etc)
-cubitus valgus (déviation de l’axe des avant bras)
-oedème du dorsum des mains et des pieds néonatal
-hydrops foetalis

Question 34

Décrire l’étiologie cytogénétique du syndrome de Turner

Answer 34

Formule chromosomique 45, X trans
-55% des cas de façon homogène
-20% en mosaïque (avec lignée 46, XX ou 46, XY) : donc origine post-zygotique/mitotique

Anomalie de structure d’un chromosome X dans 25% des cas homogène ou en mosaïque
-isochromsome Xq, délétion, etc

Question 35

Qu’arrive-t-il en cas de triple X ou 47, XXX

Answer 35

-Incidence 1/1000 filles
-Phénotype féminin
-Intelligence normale, mais légèrement diminuée par rapport à la fratrie
-Difficultés d’apprentissage fréquentes
-Grande taille
-Pas de malformation ou de dysmorphies
-Fertilité normale

Question 36

Décrire le syndrome de Klinefelter

Answer 36

47 XXY

Incidence 1/500 garçons

Phénotype masculin

Intelligence normale, mais légèrement diminuée p/r à la fratrie (diff d’apprentissage fréquentes)

Grande taille

Hypogonadisme (petits testicules)
-infertilité (possible avec nouvelles technologies reproductives)
-risque de gynécomastie
-caractères sexuels secondaires peu développés

Question 37

Décrire 47, XYY

Answer 37

Incidence 1/900 garçons

Phénotype masculin normal

Intelligence normale, mais légèrement diminuée p/r à la fratrie
-difficultés d’apprentissage fréquentes
-impulsivité possible

Question 38

Quel est l’incidence de la trisomie 21?

Answer 38

1/660

Incidence augmente avec l’âge maternel
-1/1250 à 25 ans
-1/840 à 30 ans
-1/356 à 35 ans
-1/94 à 40 ans
-1/24 à 45 ans

Question 39

Down syndrome est généralement causé par quoi?

Answer 39

95% causée par une non disjonction méiotique lors de la méiose maternelle
-formes plus rares (translocation 2.5%, mosaicisme 2.5%)

Question 40

Quelles sont les caractéristiques du syndrome de down

Answer 40

Retard mental léger à modéré

Bon tempérament

Hypotonie

Traits physiques caractéristiques
-occiput plat
-visage rond
-orientation des fentes palpébrales vers le haut
-replis épicanthiques
-protrusion de la langue
-plis palmaires transverses
-clinodactylie 5ième doigt

Malformations cardiaques 40% (canal atrio-ventriculaire)

Malformations gastro-intestinales 12% (atrésie duodénale, de l’oesophage)

Risque de leucémie environ 1%

Question 41

Description de la trisomie 13

Answer 41

Syndrome de Patau

Incidence 1/5000
Retard mental sévère
Fente labio-palatine
Polydactylie (un doigt supplémentaire)
Malformation cérébrale sévère (holoprosencéphalie)
Malformations cardiaques, rénales et autres
Anomalies létales le plus souvent
-survie médiane de 7 jrs
-91% décèdent dans la 1 année
-survie à long terme 5-10%

Question 42

Description de la trisomie 18

Answer 42

Syndrome d’Edward

Incidence 1/6000-1/8000
Retard mental sévère
Retard de croissance
Mains fermées
2 et 3ième doigt et 5 et 4ièm doigt
Pieds en piolets
Malformations cardiaques, digestives, rénales fréquentes
Anomalie létale le plus souvent
-survie médiane 14.5 jrs
-5-10% survivent au-delà de la première année

Question 43

Qu’est-ce que les anomalies de structures?

Answer 43

Modifications dans la forme des chromosomes
Presque toujours dues à des cassures
Un chromosome peut être le site d’une ou de plusieurs cassures transversales
Plus d’un chromosome peut subir des cassures en même temps
Les points de cassure ont tendance à se recoller entre eux
Un fragment chromosomique qui ne s’est pas recollé persiste dans les cellules filles au cours des divisions cellulaires seulement s’il contient un centromère

Question 44

Qu’arrive-t-il suite à une cassure d’un chromosome?

Answer 44

-le fragment peut se perdre
-se recoller exactement comme il était avant la cassure
-se recoller différemment (au même endroit ou ailleurs)

Question 45

Décrire la délétion terminale

Answer 45

Une seule cassure
Délétion : perte de matériel sur un chromosome

Le fragment qui ne contient pas de centromère et qui ne se recolle pas sera perdu lors des divisions cellulaires (fragment acentrique)

Les cellules filles conservent le chromosome cassé, c’est-à-dire le segment chromosomique qui contient le centromère

Question 46

Nommez un exemple de délétion terminale

Answer 46

Syndrome du Cri-du-Chat
-délétion temrinale du bras court du chromosome 5
-retard de croissance
-cri caractéristique à la naissance
-retard mental

Question 47

Définir la délétion interstitielle

Answer 47

Deux cassures dans le même chromosome

-2 cassures à l’intérieur d’un même bras chromosomique
-perte du matériel entre les 2 points de cassure (fragment acentrique)
-fusion aux 2 points de cassure

Question 48

Définir l’inversion paracentrique

Answer 48

Deux cassures dans un même chromosome

-si les cassures affectent le même bras chromosomique (le bras court p ou le bras long q) et s’il n’y a pas perte du segment,

Le segment chromosomique peut se recoller à l’invers ce qui entraînera une inversion paracentrique (inv)

LA POSITION DU CENTROMÈRE N’A PAS CHANGER, MAIS LE PATRON DE BANDES À CHANGÉ

Question 49

Décrire l’inversion péricentrique

Answer 49

Deux cassures dans un même chromosome

-si les cassures affectent chacun des bras chromosomiques (le bras court p et le bras long q) et est donc de part et d’autre du centromère

-le segment chromosomique peut se recoller à l’envers ce qui entraînera une inversion péricentrique (inv)

-ce type d’inversion change la position du centromère

PAS DE GAIN OU DE PERTE DE MATÉRIEL CHROMOSOMIQUE EN GÉNÉRl

Question 50

Qu’est-ce que la translocation?

Answer 50

Lorsqu’il y a 2 cassures qui se produisent sur 2 chromosomes différents (une cassure sur chaque chromosome)

Qu’il y a échange de matériel chromosomique

Recollage des segments

Question 51

Quels sont les 2 types de translocation?

Answer 51

La translocation réciproque
-exemple t (9,22)

La translocation robertsonienne
exemple rob (13;15) ou der (13;15)

Elles peuvent être équilibrées ou déséquilibrées

Question 52

Les translocations réciproques équilibrées se font entre quoi?

Answer 52

Se font entre des chromosomes non-homologues et le long des bras chromosomiques

Question 53

Est-ce que les translocations réciproques équilibrées font varier le nombre de chromosomes ou pas?

Answer 53

NE FAIT PAS varier le nbr de chromosomes (46)

Question 54

Est-ce qu’il y a une perte de matériel chromosomiques lors des translocations réciproques équilibrées?

Answer 54

Ne s’accompagne d’aucune perte de matériel chromosomique et par conséquent, n’a pas d’effet sur le phénotype (l’individu porteur est phénotypiquement normal)

Question 55

Les translocations réciproques équilibrées présentent quel risque lors de la méiose?

Answer 55

Présente un risque de ségrégation non-équilibrée lors des divisions de la méiose et par conséquent un risque accru

-de phénotype anormal chez les descendants
-de fausse couche
-d’infertilité

Question 56

Chez le porteur d’une translocation réciproque équilibrée (pour les 2 chromosomes impliqués dans la translocation), ses gamètes peuvent contenir soit :

Answer 56

-deux chromosomes normaux
-deux chromosomes transloqués mais équilibrés (comme le parent porteur)
-un chromosome transloqué et un normal

Question 57

Chez le porteur d’une translocation réciproque équilibrée ses gamètes peuvent contenir un chromosome transloqué et un normal, comment nomme-t-on cette combinaison?

Answer 57

Ségrégation non-équilibrée

Cette combinaison produira des zygotes anormaux avec une monosomie et une trisomie partielles combinées, et donc porteurs d’une translocation non-équilibrée

L’enfant, si viable, sera de phénotype normal

Question 58

Quels sont les types de ségrégation qui peuvent résulter d’une translocation équilibrer

Answer 58

Ségrégation alterne
-individu normal
-porteur ou non porteur de la translocation

Ségrégation adjancent-1 et -2
-individus phénotypiquement anormaux

TYPES DE ZYGOTES
Normal, porteur de translocation, duplication-deletion

Question 59

Le pedigree d’un chromosome de translocation comprend quoi?

Answer 59

-un individu affecté
-un porteur équilibré
-un individu normal
-des fausses couches

Question 60

Qu’est-ce que les translocations robertsonnienne?

Answer 60

Survient après cassures et recollement au niveau des centromères des chromosomes acrocentriques (13, 14, 15, 21, 22)

-il y a alors fusion centrqiue des 2 chromosomes
-fait varier le nbr de chromosomes (45 chromosomes)
-s’accompagne d’une petit perte de matériel (les petits bras courts des 2 chromosomes acrocentriques) qui sont constitués d’hétérochromatine et par conséquent n’entraîne pas d’effet sur le phénotype chez les porteurs

Question 61

Les translocations Robertsonnienne présente un risque pour quel type de ségrégation?

Answer 61

Présente un risque de ségrégation non-équilibrée et une possibilité accrue de malségrégation lors de la méiose et par conséquent augmente le risque

-de phénotypes anormaux chez leurs enfants
-de fausses couches
-d’infertilité

Question 62

Décrire la formation d’une translocation robertsonnienne pour les chromosomes 14 et 21

Answer 62

-après cassures au centromère du chromosome 14 et au centromère du chromosome 21
-il y a fusion des bras longs des 2 chromosomes acrocentriques et formation d’un chromosome transloqué (14;21)
-un porteur de la translocation équilibrée à 45 chromosomes

Question 63

La formule équilibrée d’un porteur de translocation robertsonnienne est de combien de chromosomes?

Answer 63

45

Question 64

Nommez les types de ségrégations suite à une translocation Robertsonnienne

Answer 64

Ségrégation alterne : normal, porteur équilibré

Ségrégation adjacente : trisomie, monosomie

Question 65

La translocation Robertsonnienne non équilibrée est en cause dans ____ % des cas de _________

Answer 65

La translocation Robertsonnienne non équilibrée est en cause dans 2.5 % des cas de trisomie 21

Question 66

Lors du diagnostique clinique de la trisomie 21 chez un enfant, pourquoi serait-il pertinent de connaître son caryotype? Et celui des parents?

Answer 66

Le caryotype de l’enfant avec trisomie 21 détermine le risque de récidive pour les parents

-aneuploidie ou trisomie libre : environ 1%
-translocation robertsonnienne non-équilibrée : selon le statut de porteur des parents : de novo <1%
-un parent porteur à un risque de récurrence de trisomie 21 (15% pour une femme et 1% pour un homme)

Le caryotype des parents ne sera pas nécessaire si aneuploidie, mais primordial si translocation

Question 67

Qu’est-ce que la cytogénétique moléculaire?

Answer 67

Permet d’étudier le génome humain d’une façon plus fine que le caryotype standard

Question 68

Quelles sont les 2 techniques de cytogénétique moléculaire?

Answer 68

-hydridation in situ en fluorescence (FISH)
-hybridation génomique comparative sur micropuce

Question 69

Définir l’hybridation in situ en fluorescence (FISH)

Answer 69

-Appariement d’une séquence d’ADN connue d’acides nucléiques (la sonde) et marquée
-À une ou des séquences complémentaires qu’on veut étudier

Se fait sur chromosomes en métaphase, des noyaux interphasiques de cellules fixées, de frottis, empreinte ou sur une section de tissus

Question 70

Quels sont les principes de base de l’hybridation?

Answer 70

Se base sur la structure de l’ADN

-chaque chromosome contient une double hélice d’ADN hautement repliée et condensée
-chacun des brins est composé d’une polymère de désoxyribose phosphate lié à une base (purine ou pyrimidine)
-chacune des bases est reliée par une liaison hydrogène à une base qui lui est complémentaire (A-T, G-C)

Question 71

L’hybridation se fait grâce à quoi?

Answer 71

L’hybridation s’effectue grâce à une alternance des processus de dénaturation et de renaturation de l’ADN

Dénaturation : processus dans lequel les liaisons hydrogènes sont rompues entre les bases des 2 brins complémentaires e l’ADN. Rend l’ADN simple brin

Renaturation : processus dans lequel des segments d’ADN simple-brin complémentaires vont s’apparier. Il y aura formation de liaisons hydrogène entre les bases complémentaires

Question 72

Qu’est-ce que la sonde dans le principe d’hybridation?

Answer 72

Un fragment d’ADN simple-brin à séquence connue (sonde) sous des conditions spécifiques d’hybridation

Question 73

La sonde va se lier à quoi?

Answer 73

À l’ADN simple-brin complémentaire que l’on veut étudier

Question 74

Décrire les étapes de l’hybridation FISH

Answer 74

-dénaturation de la sonde et de l’ADN génomique à étudier
-hybridation des 2 ADN simple brin et renaturation
-visualisation au microscope à fluorescence

Question 75

Quelle est la résolution d’un caryotype versus la technique fish?

Answer 75

Caryotype standard : 10 Mb
Caryotype haute résolution : 2-5 Mb
FISH : sonde 100-150 Kb
-permet la détection d’anomalies chromosomiques inframicroscopiques (non visibles au caryotype)

Question 76

Quels sont les types de sondes?

Answer 76

Peinture chromosomique

Sondes à séquence répétitive :
-sondes centromériques
-sondes télomèriques

Sondes à séquence unique : séquence d’une région spécifique du génome. ADN non répétitif

Question 77

Décrire la sonde à séquence unique + son utilisation

Answer 77

Sonde qui utilise une séquence d’une région spécifique du génome où l’ADN n’est pas répétitif

Utilisée pour le diagnostic des syndromes de microdélétion, microduploication

Question 78

Quelles sont les applications de la technique FISH?

Answer 78

Diagnostic cytogénétique :
-préciser une anomalie vue en cytogénétique classique et qui n’a pu être identifiée précisément en raison de sa complexité
-diagnostic de micro-remaniements chromosomiques, non visibles au caryotype
-FISH interphasique pour le diagnostic rapide

Question 79

Comment détermine-t-on quelle sonde utiliser?

Answer 79

Le choix de la sonde se fait grâce aux informations cliniques

Question 80

À quoi ressemble le caryotype lors de détection d’anomalies grâce à la technique FISH?

Answer 80

La détection de ces anomalies inframicroscopique ou cryptiques invisibles au microscope optique nécessite l’utilisation de sondes pour les mettre en évidence

Le caryotype est donc normal

Question 81

Nommez 4 syndromes classiques dont le diagnostic peut être fait grâce à la technique FISH

Answer 81

-S. Velo-cardio-facial/Di George : del(22)(q11.2q11.2)
-S. de Williams : del(7)(q11.23q11.23)
-S. Prader-Willi : del (15)(q11q13)
-S. d’Angelman : del(15)(q11q13)

Question 82

Qu’est-ce que le syndrome de DiGeorge ou vélocardiofacial?

Answer 82

Délétion interstitielle de la région 22q11.2

Incidence environ 1/4000

Phénotype très variable (expressivité) même dans une même famille

Question 83

Quels sont les signes majeurs du syndrome de DiGeorge?

Answer 83

Dysmorphie
Cardiopathie conotroncale (qui atteint les voies de chasse du coeur; ex tétralogie de Fallot)
Anomalie du paais (fente ouverte à insuffisance vélo-palatine)
Hypoparathyroidie
Hypoplasie du thymus (déficit immunitaire possible)
Retard psychomoteur (déficience intellectuelle rare; difficultés d’apprentissage fréquent)
Retard de croissance

Question 84

Quels sont les autres signes du syndrome de DiGeorge que ceux qui sont majeurs?

Answer 84

Surdité
An. rénales
An. endocriniennes
An. squelettiques
An. oculaires
Psychoses (30%)
An. laryngées

Question 85

Décrire la taille et les gènes impliqués dans le syndrome de DiGeorge

Answer 85

La majorité des patients (environ 90%) ont une large délétion (>3 Mb) comprenant environ 30 gènes, alors qu’une petite portion des patients (environ 7%) ont une plus petite délétion (1.5 Mb).

Les 2 types de délétions incluent le gène TBX1

Question 86

VRAI OU FAUX : Dans le syndrome de DiGeorge, la plupart du temps, le parent de l’enfant atteint est porteur

Answer 86

FAUX
93% survient de novo
Pour un individu atteint : transmission 50%

Question 87

Pourquoi est-ce qu’il y a des microdélétions récurrentes?

Answer 87

À cause des séquences répétées similaires à l’extérieur de la région fréquemment délétée (DNA Low Copy repeats)

Recombinaison homologue non allélique durant la méiose

Question 88

Les microdélétions récurrentes expliquent quoi?

Answer 88

-la fréquence de ces remaniements
-le haut taux de survenue de novo
-les points de cassures identiques

Question 89

Quelles sont les caractéristiques du syndrome de Williams?

Answer 89

-Retard mental
-Retard de croissance
-Lèvres proéminentes
-Iris “en étoile”
-Sténose aortique supraventriculaire, sténose pulmonaire
-Hypoplasie de l’émail

Question 90

Quelle est l’incidence et la transmission du syndrome de Williams?

Answer 90

Incidence environ 1/7500
Habituellement de novo
50% de risque de transmission pour les atteints

Question 91

Quelles sont les caractéristiques du Syndrome de Prader Willi?

Answer 91

-Hypotonie néonatale
-Difficultés alimentaires dans la première année de vie (gavage)
-Hyperphagie et prise de poids rapide à partir de 1 à 6 ans
-Obésité morbide
-Retard de développement et mental
-Phénotype : teint pâle, yeux en amande, petites mains et pieds
-Hypogonadisme

Question 92

Quelles sont les complications associées au Syndrome de Prader Willi?

Answer 92

-Complications : diabète, apnées obstructives

Question 93

Quels sont les traitements pour le Syndrome de Prader Willi?

Answer 93

Hormone de croissance, restriction calorique, exercices, réadaptation

Question 94

Quelle est la différence au niveau chromosomique entre le syndrome de Prader Willi et le syndrome d’Angelmann?

Answer 94

Prader Willi : sur chromosome du père
Angelmann : sur chromosome de la mère

Question 95

Pour le syndrome de Prader Willi, dans quelle situation la technique FISH est-elle pertinente?

Answer 95

La diagnostic cytogénétique (par FISH) permet de poser un diagnostic seulement s’il s’agit d’une délétion

Question 96

Quel est le gène exprimé dans le syndrome de Prader-Willi?

Answer 96

Gène SNRPN sur la copie paternelle

Région soumise à l’empreinte parentale : 15q11q13q

Question 97

Le syndrome de Prader Willi provient de quoi?

Answer 97

70% délétion allèle parternel
25% disomie maternelle
2% empreinte anormale

Question 98

Le syndrome d’Angelmann provient de quel gène et de quel parent généralement?

Answer 98

Gène UBE3A exprimé à partir de l’allèle maternel

70% délétion allèle matenrel (détectable par FISH)
2-5% disomie paternelle
5% aN empreinte
20% mutation intragénique

Question 99

Quelles sont les caractéristiques du syndrome d’Angelmann?

Answer 99

Retard mental important, ataxie, rires inappropriés

Question 100

Les syndromes de microduplication ont quoi de différent des délétions pour les mêmes régions?

Answer 100

-phénotypes peu distinctifs, moins typés
-phénotypes moins sévères
-plus difficile à suspecter cliniquement a priori

Question 101

Décrire Dup(15)(q11q13)

Answer 101

Duplication de la région Prader-Willi/Angelmann

-peu de malformations
-retard mental et autisme
-convulsions

Question 102

Comment se fait le diagnostic de Dup(15)(q11q13)

Answer 102

Diagnostic sur noyaux interphasiques
Difficile sur métaphase

Question 103

Quel est l’avantage de faire le FISH interphasique?

Answer 103

Pas besoin de mitoses donc pas nécessaire d’avoir des cellules en division (pas de culture); l’échantillon peut être traité immédiatement

Un grand nbr de cellules peuvent donc être analysées rapidement

Question 104

Quand utilise-t-on FISH interphasique?

Answer 104

L’hybridation in situ en interphase, ie sur noyaux sans culture cellulaire s’avère indispensable pour la détection d’anomalies de nombre ou d’anomalie de structure dans les cas où :

-l’index mitotique est peu élevé (ex cellules néoplasiques)
-un résultat rapide est nécessaire (ex diagnostic prénatal)
-pour un diagnostic d’une mosaïque/clone faible pour une aneuploïdie ou pour une anomalie clonale précise

Question 105

Quel type de sonde est utilisé pour le FISH interphasique?

Answer 105

Tout type de sonde peut être utilisé (sauf les peintures et les sondes télomériques)

Question 106

Expliquez l’utilisation de FISH en oncologie

Answer 106

-Translocation 9;22 impliquant la fusion des gènes BCR et ABL
-Important facteur diagnostique et pronostique dans les leucémie myéloide chronique et leucémie aigue lymphoblastique
-parfois non visible au caryotype

FISH utilisé sur noyaux interphasiques pour le diagnostic rapide de la fusion des gènes BCR et ABL :
-sans translocation : 2 signaux séparés
-avec translocation : signaux fusionnés

Question 107

Quels sont les principes de l’hybridation génomique comparative?

Answer 107

Comparaison de l’ADN d’un patient avec un ADN contrôle

Cette comparaison s’effectue grâce à l’hybridation de ces ADN marqués en fluorescence (patient + contrôle) sur un support d’ADN
-préparation chromosomique contrôle (lame cytogénétique)
-fragments de l’ADN génomique que l’on veut étudier (micropuce)

Se base sur les mêmes principes d’hybridation (dénaturation et renaturation) de la FISH

Intensité de la fluorescence hybridée sur un segment donné contrôle vs patient évalué par un ordinateur

Question 108

L’hybridation génomique comparative sur micropuce permet quoi?

Answer 108

Hybridation sur des séquences d’ADN fractionnées (sondes) qui représentent tout le génome

Permet de comparer l’ADN d’un patient à un ADN de référence et de déceler des :
-surplus de séquences par rapport à cet ADN de référence : duplication de la séquence pour le patient
-pertes de séquences par rapport à cet ADN de référence : délétion pour le patient

Question 109

Nommez les tapes de l’hybridation génomique comparative sur micropuce

Answer 109

1-3 : L’ADN du patient + l’ADN de contrôle ont un marqueur de fluorescence
4 : Les 2 ADN compétitionnent pour s’attachent/hybrider le micropuce
5 : Le micropuce mesure le signal d’intensité defluorescence
6 : L’ordinateur ramasse les données

Question 110

Quels sont les types de micropuce? + description

Answer 110

BACs
-sondes de la taille d’une sonde de FISH
-résolution de l’analyse moins grande

Oligonucléotides
Meilleure résolution vs BACs
Sondes oligonucléotides : fragments d’ADN de env 60 pb

Oligonucléotides avec ou sans marqueurs SNPs
SNP : single nucleotide polymorphism
-polymorphisme le plus commun du génome humain
-segment d’ADN où les 2 chromosomes ne diffèrent que par 1 nucléotide ou paire de base
-permet de détecter allèles différents (hétérozygotes vs homozygotes)
-résultat techniquement plus fiable et technique plus rapide

Question 111

À quoi sert la technique de micropuce? + description

Answer 111

Sert à détecter des variants du nombre de copie (CNV) pathogénique expliquant le phénotype du patient

Un déséquilibre à 1 Kb ou plus

Toujours déséquilibré : délétion (perte de matériel), duplication, triplication (surplus de matériel)…

Sont des variations fréquentes dans le génome normal
-seraient présents dans 5-13% du génome
-11 700 CNV décrit sur 1000 gènes
-la majorité sont rares

Question 112

Quels sont les avantages d’hybridation génomique sur micropuce?

Answer 112

-permet de raffiner l’analyse chromosomique à une résolution de quelques dizaines de kb et donc de poser un diagnostic chez un plus grand nombre de sujets (env 25%)
-meilleure sensibilité pour la détection de duplication que la FISH
-allie la précision de la FISH et l’approche d’évaluation globale du génome du caryotype (ne nécessite pas de savoir où cibler dans le génome au préalable)
-ne nécessite pas de cellules en division (extraction d’ADN)

Question 113

L’analyse par micropuce est recommandée pour l’investigation des sujets avec quoi?

Answer 113

-retard intellectuel, retard de développement
-désordres du spectre de l’autisme
-malformations congénitales, dysmorphies

Recherche d’un déséquilibre chromosomique chez ces patients

Question 114

Quels sont les désavantages/limites de l’hybridation génomique sur micropuce?

Answer 114

Ne permet pas de détecter les remaniements équilibrés (translocation, inversion, etc)

Ne permet pas de “voir” l’organisation cytogénétique du remaniement détecté

Limite quant à la détection des mosaïques (anomalie d’environ 20% et plus détectable)

Polymorphismes sans conséquence du génome fréquents et parfois n’ont jamais été vus encore dans le lab
-la plupart sont rares (retrouvés chez <2% de la population)
-impact sur le phénotype clinique pas toujours clair

Risque de trouve aN pathogénique non reliée (ex gènes cancer, gènes à révélation tardive, porteurs)

Question 115

Quels sont les critères pour déterminer la pathogénicité d’une délétion ou d’une duplication

Answer 115

1. Taille du remaniement
2. Survenu de novo
   -mais, présence de remaniement de non chez 1% des contrôles
   -certains parents peuvent avoir un phénotype plus léger (expressivité) ou non exprimé (non pénétrance)
3. Type de gènes impliqués et lien avec le phénotype (le plus fort)
4. Remaniement déjà décrit avec phénotype semblable dans la littérature ou les bases de données
5. vs région connue comme polymorphique

Question 116

Les analyses par micropuce ne sont pas recommandés dans quels cas?

Answer 116

-rechercher des remaniements équilibrés (ex translocation) car non détectable par cette méthode

-si phénotype clair d’anomalie chromosomique précise

Question 117

Quelles sont les indications pour les caryotypes?

Answer 117

Recherche de remaniements chromosomiques équilibrés
-couples avec avortements spontanés répétés
-infertilité
-histoire familiale d’un tel remaniemement

Recherche de mosaïcisme

Phénotype clinique clair d’une anomalie chromosomique détectable par caryotype