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Levures et organismes levuriformes > Cours 2 > Flashcards

Cours 2 Flashcards

1
Q

Quels sont les deux types de classification en taxonomie?

A

Artificielle (phénotypique) et naturelle (phylogénétique)

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2
Q

Vrai ou faux. Il y a moins d’espèces dans le règne des fungi que dans le règne des plantes.

A

Faux, il y a 10 fois plus d’espèces de champignons que de plantes

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3
Q

Comment se nourrissent les champignons?

A

Par absorption (ils sont hétérotrophes, donc nécessitent du carbone organique dans le milieu)

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4
Q

Nommer une grande distinction entre les plantes et les champignons.

A

La paroi cellulaire des champignons est composée de chitine, alors que celle des plantes est faite de cellulose

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5
Q

Quelle est la différence entre une levure et une moisissure?

A

Une levure est unicellulaire, alors qu’une moisissure est sous forme de filaments (classification artificielle)

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6
Q

Vrai ou faux. Peu de champignons font la reproduction sexuée.

A

Faux, la plupart en font

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7
Q

À quoi correspond les fungi imparfaits?

A

Auparavant, c’était une classe de champignons qui regroupait les espèces pour lesquelles il n’y avait pas de mode de reproduction sexué connu

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8
Q

À quoi correspond les champignons qu’on voit hors de la terre?

A

Ce sont les organes de fructification (basidioma). Les hyphes sont regroupe en mycélium et poussent pour permettre aux basidiospores d’être libérés

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9
Q

Vrai ou faux. Ce ne sont pas toutes les levures qui sont capables de fermenter.

A

Vrai

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10
Q

Vrai ou faux. Il n’y a pas d’organe de fructification chez les levures.

A

Vrai, la forme sexuée s’effectue d’une autre manière

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11
Q

Quel est le groupe de fungi duquel proviennent les “vraies” levures?

A

Groupe monophylétique saccharomycotina (si ne fait pas partie de ce groupe, on appelle “organisme levuriforme”)

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12
Q

Quelle est la particularité des espèces appartenant au groupe des ascomycota?

A

Les espèces sont plutôt homogènes, car elles proviennent toutes d’un ancêtre de levure commun

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13
Q

Vrai ou faux. On peut retrouver des levures dans plusieurs groupes phylogénétiques.

A

Vrai (levures = groupe polyphylétique), ex. ascomycota et basidiomycota. C’est un regroupement artificiel

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14
Q

Nommer les mode de reproduction asexuée (anamorphe).

A
  • Fission (cellules filles identiques)
  • Bourgeonnement unipolaire (cellule fille plus petite que la cellule mère, col très large)
  • Bourgeonnement bipolaire (plus petit col de bourgeonnement)
  • Bourgeonnement multilatéral (jamais au même endroit)
  • Bllistoconidies (formation d’un “spore” et propulsion)
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15
Q

Nommer une méthode qui permet de déterminer l’âge d’une cellule.

A

Staining au calcofluor permet de visualiser les cicatrices sur les cellules à bourgeonnement multilatéral, ce qui nous permet de savoir combien de reproduction elle a fait

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16
Q

En quoi consiste la technique de Dalmau?

A

Ensemencer une génoise en profondeur pour observer les structures caractéristiques des levures (ex. formation d’hyphes et d’arthroconidies, absence de filamentation…)

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17
Q

Homothallisme VS hétérothallisme

A
  • Homo: les cellules ont un “sexe” flexible à l’état 1n (suite au bourgeonnement)
  • Hétéro: Il y a des cellules + et des cellules -
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18
Q

Qu’est ce que la caryogamie chez les levures?

A

C’est l’état diploïde qui fait suite à la rencontre de deux cellules de “sexe” opposé (les spores sont formées à partir de là)

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19
Q

Comment fait-on pour déterminer si une levure est homo ou hétérothallique?

A

On prend une thalle (descendance d’une levure ex. via une colonie) et on remet en culture. Il va y avoir croissance seulement chez les hétérothalliques

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20
Q

Quelle est la forme de levure la plus observée?

A

Cellules diploïdes. Il y a formation d’ascospores surtout quand les conditions deviennent sous-optimales

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21
Q

Comment fait-on pour mettre en évidence les ascospores?

A

En faisant croitre la levure dans des conditions difficiles puis en colorant avec du vert de malachite (spores = paroi épaisse qui retient le colorant)

22
Q

Vrai ou faux. Les asques sont liés à la reproduction asexuée.

A

Faux, on voit souvent de la reproduction sexuée

23
Q

Quel milieu de culture utilise-t-on pour observer l’assimilation d’une source de carbone chez une levure?

A

Yeast nitrogen base (on fait varier les sucre et on voit sous quelle forme le carbone est assimilé)

24
Q

Quelle est la différence entre l’assimilation d’une source de carbone et la fermentation?

A

L’assimilation se fait via la voie oxydation et la fermentation utilise plutôt une voie indépendante de l’O2

25
Q

Quel milieu de culture utilise-t-on pour observer la fermentation d’une source de carbone chez une levure?

A

Bouillon peptone et ampoule de Durham (croissance et production de CO2)

26
Q

Décrire les lois de Kluyver (4)

A
  • Une levure qui ne peut assimiler une source de carbone ne peut la fermenter
  • Une levure qui le peut fermenter le glucose ne fermente aucun sucre
  • Une levure qui peut fermenter le glucose peut aussi fermenter le fructose et le mannose
  • Une levure qui fermente le lactose ne peut fermenter le maltose (et vice versa)
27
Q

Quel milieu de culture utilise-t-on pour observer l’assimilation d’une source d’azote chez une levure?

A

Yeast carbon base (contient du glucose, on fait varier la source d’azote)

28
Q

Vrai ou faux. Il y a une différence entre les ascomycetes et les basidiomycetes quant à l’hydrolyse de l’urée.

A

Vrai, la plupart des asco sont négatifs, tant dis que les basidio sont plutôt positifs

29
Q

Quels types de métabolites s’accumulent lors de l’hydrolyse de l’urée?

A

Métabolites alcalins (ex. ammoniaque), ce qui augmente l’acidité du milieu

30
Q

Quel milieu de culture utilise-t-on pour observer l’hydrolyse de l’urée?

A

Gélose urée de Christensen (rouge vire au jaune lorsque acide)

31
Q

Quel milieu de culture utilise-t-on pour observer la résistance au cycloheximide?

A

Yeast nitrogen base + glucose + 0.1µg/ml de clycloheximide

32
Q

À quoi sert le bleu de diazonium B?

A

On l’ajoute au milieu de croissance pour différencier les ascomycetes (colonies blanches/jaunes car rx négative) des basidiomycètes (colonies rouges/mauves car rx positive)

33
Q

Que peut nous indiquer la nature du coenzyme Q?

A

On peut différencier les ascomycètes des basidiomycetes selon le nombre d’unités isoprènes de la chaine latérale de la quinone (6 à 8 VS 9 à 10)

34
Q

À quoi sert la coenzyme Q?

A

Elle est impliquée dans le transport d’électrons dans les mitochodries

35
Q

À quoi sert la taxonomie moléculaire?

A

À savoir si deux levures appartiennent à la même espèce ou à savoir le % d’homologie de séquence entre deux espèces (basé sur le % en GC et la réassociation)

36
Q

Vrai ou faux. Un % en GC différent permet d’affirmer que les deux levures ne sont pas de la même espèce.

A

Vrai

37
Q

Vrai ou faux. Un même % en GC permet d’affirmer que les deux levures appartiennent à la même espèce.

A

Faux. Le % en GC est spécifique, mais pas exclusif (les séquences peuvent être différentes malgré une ressemblance dans leur composition)

38
Q

Qu’est ce que la T° de fusion de l’ADN?

A

C’est la T° lorsque la moitié des brins sont séparés (t° médiane entre l’ADN double brin et simple brin)

39
Q

De quoi dépend la T° de fusion?

A

Entre autre du contenu en GC

40
Q

Vrai ou faux. Il peut y avoir une variation d’environ 15% en GC au sein d’une même espèce.

A

Faux. 1-2% de différence dans le % en GC indique que les souches appartiennent à des espèces différentes

41
Q

Vrai ou faux. Les basidiomycètes ont un % en GC plus élevé que les ascomycètes.

A

Vrai. 50-70% VS 27-50%

42
Q

Plus la T° de fusion augmente, plus le % en GC…

A

est grand

43
Q

Quelle est la principale différence entre le % en GC et le test de réassociation?

A

Lors du test de réassociation, on ne peut pas comparer à des études antérieures

44
Q

Quelle conclusion peut-on tirer lorsque la réassociation est supérieure à 80%?

A

Il s’agit de la même espèce

45
Q

Sous quel % de réassociation peut-on dire qu’il s’agit d’espèces distinctes?

A

< 40%

46
Q

Vrai ou faux. Le séquençage permet seulement d’étudier les liens de parenté proches.

A

Faux, on peut aussi étudier les liens de parenté distants, selon la séquence étudiée

47
Q

Nommer une bonne séquence à utiliser pour comparer deux levures entre elles.

A

Région D1/D2 de la sous unité ribosome 26S

48
Q

Qu’est ce que la E value dans BLAST?

A

c’est une valeur de concordance. Plus elle s’approche de zéro, plus la séquence étudiée et la séquence correspondante sont semblables

49
Q

Quelle est la forme des levures à reproduction asexuée?

A

Forme anamorphe

50
Q

Quel est le mode de reproduction des levures à forme télomorphe?

A

Reproduction sexuée

51
Q

Nommer 3 choses qu’il faut décrire lorsqu’on identifie une nouvelle espèce de levure?

A
  • Écologie et spécificité de l’habitat
  • Description de la morphologie
  • Ordre phylogénétique basé sur l’analyse de la séquence D1/D2 de l’unité 26S
52
Q

Décrire les deux types de clé d’identification.

A
  • Générale: permettent d’identifier toutes les levures

- Spécialisées: permettent d’identifier certains groupes de levures

Levures et organismes levuriformes (7 decks)

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