Cours 12-la synthèse protéique

Question 1

Décrire la composition du code génétique

Answer 1

Composé en codons (triades nucléotidiques d’ARNm)

Question 2

Décrire les trois caractéristiques du code génétique.

Answer 2

1- il n’y a pas d’ambiguité, car chaque codon code pour un acide aminé

2- Il existe plusieurs codons qui codent pour le même aa

3- 64 codons, 61 spécifient des aa, les 3 autres (UAA, UAG, UGA) qui sont des codons de terminaison.

Question 3

Expliquer le cadre de lecture.

Answer 3

Il existe trois points de départ d’une suite de codons

Question 4

Qu’est le cadre de lecture OUVERT?

Answer 4

la partie du cadre de lecture qui peut encoder une protéine, donc il s’agit d’une série sans codon de terminaison

Question 5

Quel est le rôle de l’ARNt?

Answer 5

interprètent la lecture du code génétique, ce sont les médiatrices-clés entre lARNm et la séquence d’AA

Question 5

Quels sont les 4 mutations génétiques dans le domaine codant de l’ADN?

Answer 5

1- faux sens
2- silencieuse
3-non-sens
4-continuation

Question 6

Décrire la structure 2D des ARNt

Answer 6

Tige acceptrice, lobe anticodon, lobe tpsic et lobe d

Question 7

Que se passe-t-il dans le lobe anticodon?

Answer 7

Appariement des anticodons avec les codons. il peut avoir plusieurs choix (flexibilité)

Question 8

Dans le wobble, qu’est-ce qu’on nomme la position 5’ de l’anticodon?

Answer 8

Ça décrit la position de flottement

Question 9

Expliquer la plasticité des codons synonymes.

Answer 9

L’adénine en position 5’ de l’anticodon perd son amine pour devenir inosine

Question 10

Que sont les ARNt isoaccepteurs?

Answer 10

Les molécules d’ARN qui portent tous le même acide aminé

Question 11

Qu’est l’aminoacyl-ARNt (ou ARNt activées)?
Quels enzymes catalysent cette réaction?

Answer 11

C’est un aa lié par covalence à l’extrémité 3’ d’un ARNt

Aminoacétyl-ARNt synthétase

Question 12

Quels sont les éléments d’identité et la réaction globale de la synthèse d’aminoacyl-ARNt?

Answer 12

l’aa, le site, les interactions avec l’anticodon et la face concave de ARNt

aa + ARNt + ATP -> aminoacyl-ARNt + Ppi + AMP

Question 13

Décrire la structure des ribosomes.

Answer 13

Ribonucléoprotéines composé deux tiers de d’ARN et un tiers de protéines

Question 14

Nommer et décrire les deux sites de fixation au ribosome.

Answer 14

Site A (aminoacyle): contient une aminoacyl-ARNt

Site P (peptidyle): contient une aminoacyl-ARNt, mais qui contient une chaîne polypeptidique

Question 15

Qu’est-ce que et quels sont les trois étapes de la synthèse protéique?

Answer 15

Une régie par une matrice (l’ARNm)

1 Initiation: assemblage du complexe de traduction du cadre de lecture autour du premier codon de l’ARNm (impose le bon codon d’initiation et le bon cadre de lecture)

2 Elongation: ribosomes marchent de 5’-3’ en synthétisant la protéine de son N-C

3 Terminaison: appareil de traduction se désagrège qui cause une dissociation des ribosomes avec l’ARNm

Question 16

Qu’est-ce que l’ARNt initiateur fait ?

Answer 16

Reconnaît le codon AUG d’initiation. Chez les eucaryotes, il est désigné Met-ARNtimet

Question 17

Décrire les étapes de l’Initiation de la traduction procaryote

Answer 17

1- dissociation des sous-unités ribosomales

2- assemblage du complexe d’initiation 30S

3- association de la sous-unité 50S

Question 18

De quoi dépend le complexe d’initiation?

Answer 18

Les facteurs d’initiation

Question 19

Chez les Procaryotes, le choix du codon d’initiation ne dépend pas seulement de l’interaction avec l’anticodon de l’ARNt et le codon de l’ARNm, mais aussi de quoi? Comment s’attache-t-il?

Answer 19

De l’interaction de la sous unité ribosomique 30s avec la matrice d’ARNm en amont

Elle s’attache à une région riche en purine (séquence shine-dalgarno)

Question 20

Qu’implique le fait que les séquences de Shine-Dargarno son toujours placées en AMONT du codon d’initiation?

Answer 20

Que les complexes s’assemblent uniquement au niveau des codons initiateurs

Question 21

La sous-unité ribosomique 40S se fixe à l’extrémité 5’ du message et parcourt l’ARNm de 5’ en 3’ jusqu’à ce qu’elle rencontre un codon initiateur. Comment se nomme ce prosessus?

Answer 21

Balayage

Question 22

Quels sont les 4 étapes de l’initiation de la traduction chez les eucaryotes?

Answer 22

1- Dissociation

2- Assemblage du complexe ternaire
avec 40S

3- Recrutement de 40S et balayage

4- Association 60S-40S

Question 23

Que font eIF2 et eIF4F dans l’initiation de la traduction chez les eucaryotes.

Answer 23

eIF2: protéine de liaison au GTP et lie Met ARNt

eIF4F: e, g, a aident à fixer la sous-unité avec le complexe à l’ARNm

Question 24

Quels sont les étapes d’allongement de la chaîne de la traduction.

Answer 24

1La mise en place correcte de l’aminoacyl-ARNt au site A du ribosome.

2 La formation de la liaison peptidique.

3 La translocation, c’est-à-dire l’étape qui fait avancer le ribosome d’un codon sur l’ARNm

Question 25

Quels positions occupent les deux sites différents de l’ARNt

Answer 25

L’ARNt initiateur occupe le site P du ribosome,
le site A est prêt à recevoir un ARNt aminoacylé

Question 26

Que se passe-t-il dans la mise en place du microcycle d’allongement?

Answer 26

L’allongement commence par le placement du prochain aminoacyl-ARNt au site A du complexe de traduction.

Chez les bactéries, l’étape est catalysée par un facteur d’élongation EF-TU (a un site de fixation pour GTP EF-Tu-GTP qui reconnaît des propriétés à l’ARNt)

Question 27

Que se passe-t-il dans le microcycle d’allongement 3/translocation

Answer 27

EF-G catalyse la translocation et le ribosome commence à glisser

Question 28

QUel est le bilan du chargement d’un acide aminé sur ARNt par aminoacyl-ARNt synthétase et l’élongation?

Answer 28

Ça requiert 2 ATP (ATP à AMP) et 2 autres étapes pour la GTP de l’élongation
4 ATP/liaison
2aa font 9 liaisons

Question 29

Que se passe-t-il lors de la terminaison de la traduction? Reconnu par qui?

Answer 29

1. l’un des trois codons de terminaison (UGA, UAG, UAA) arrive en face du site A.
   Ensuite
2. Peptidyl-transférase hydrolyse la liaison ester du peptidyl-ARNt

Ceux-ci sont recconus par les facteurs de relargage

Question 30

Voir slide sur les protéines auxiliaires de la traduction chez eucaryotes

Answer 30

48