Cours 12-la synthèse protéique Flashcards
Décrire la composition du code génétique
Composé en codons (triades nucléotidiques d’ARNm)
Décrire les trois caractéristiques du code génétique.
1- il n’y a pas d’ambiguité, car chaque codon code pour un acide aminé
2- Il existe plusieurs codons qui codent pour le même aa
3- 64 codons, 61 spécifient des aa, les 3 autres (UAA, UAG, UGA) qui sont des codons de terminaison.
Expliquer le cadre de lecture.
Il existe trois points de départ d’une suite de codons
Qu’est le cadre de lecture OUVERT?
la partie du cadre de lecture qui peut encoder une protéine, donc il s’agit d’une série sans codon de terminaison
Quel est le rôle de l’ARNt?
interprètent la lecture du code génétique, ce sont les médiatrices-clés entre lARNm et la séquence d’AA
Quels sont les 4 mutations génétiques dans le domaine codant de l’ADN?
1- faux sens
2- silencieuse
3-non-sens
4-continuation
Décrire la structure 2D des ARNt
Tige acceptrice, lobe anticodon, lobe tpsic et lobe d
Que se passe-t-il dans le lobe anticodon?
Appariement des anticodons avec les codons. il peut avoir plusieurs choix (flexibilité)
Dans le wobble, qu’est-ce qu’on nomme la position 5’ de l’anticodon?
Ça décrit la position de flottement
Expliquer la plasticité des codons synonymes.
L’adénine en position 5’ de l’anticodon perd son amine pour devenir inosine
Que sont les ARNt isoaccepteurs?
Les molécules d’ARN qui portent tous le même acide aminé
Qu’est l’aminoacyl-ARNt (ou ARNt activées)?
Quels enzymes catalysent cette réaction?
C’est un aa lié par covalence à l’extrémité 3’ d’un ARNt
Aminoacétyl-ARNt synthétase
Quels sont les éléments d’identité et la réaction globale de la synthèse d’aminoacyl-ARNt?
l’aa, le site, les interactions avec l’anticodon et la face concave de ARNt
aa + ARNt + ATP -> aminoacyl-ARNt + Ppi + AMP
Décrire la structure des ribosomes.
Ribonucléoprotéines composé deux tiers de d’ARN et un tiers de protéines
Nommer et décrire les deux sites de fixation au ribosome.
Site A (aminoacyle): contient une aminoacyl-ARNt
Site P (peptidyle): contient une aminoacyl-ARNt, mais qui contient une chaîne polypeptidique
Qu’est-ce que et quels sont les trois étapes de la synthèse protéique?
Une régie par une matrice (l’ARNm)
1 Initiation: assemblage du complexe de traduction du cadre de lecture autour du premier codon de l’ARNm (impose le bon codon d’initiation et le bon cadre de lecture)
2 Elongation: ribosomes marchent de 5’-3’ en synthétisant la protéine de son N-C
3 Terminaison: appareil de traduction se désagrège qui cause une dissociation des ribosomes avec l’ARNm
Qu’est-ce que l’ARNt initiateur fait ?
Reconnaît le codon AUG d’initiation. Chez les eucaryotes, il est désigné Met-ARNtimet
Décrire les étapes de l’Initiation de la traduction procaryote
1- dissociation des sous-unités ribosomales
2- assemblage du complexe d’initiation 30S
3- association de la sous-unité 50S
De quoi dépend le complexe d’initiation?
Les facteurs d’initiation
Chez les Procaryotes, le choix du codon d’initiation ne dépend pas seulement de l’interaction avec l’anticodon de l’ARNt et le codon de l’ARNm, mais aussi de quoi? Comment s’attache-t-il?
De l’interaction de la sous unité ribosomique 30s avec la matrice d’ARNm en amont
Elle s’attache à une région riche en purine (séquence shine-dalgarno)
Qu’implique le fait que les séquences de Shine-Dargarno son toujours placées en AMONT du codon d’initiation?
Que les complexes s’assemblent uniquement au niveau des codons initiateurs
La sous-unité ribosomique 40S se fixe à l’extrémité 5’ du message et parcourt l’ARNm de 5’ en 3’ jusqu’à ce qu’elle rencontre un codon initiateur. Comment se nomme ce prosessus?
Balayage
Quels sont les 4 étapes de l’initiation de la traduction chez les eucaryotes?
1- Dissociation
2- Assemblage du complexe ternaire
avec 40S
3- Recrutement de 40S et balayage
4- Association 60S-40S
Que font eIF2 et eIF4F dans l’initiation de la traduction chez les eucaryotes.
eIF2: protéine de liaison au GTP et lie Met ARNt
eIF4F: e, g, a aident à fixer la sous-unité avec le complexe à l’ARNm
Quels sont les étapes d’allongement de la chaîne de la traduction.
1La mise en place correcte de l’aminoacyl-ARNt au site A du ribosome.
2 La formation de la liaison peptidique.
3 La translocation, c’est-à-dire l’étape qui fait avancer le ribosome d’un codon sur l’ARNm
Quels positions occupent les deux sites différents de l’ARNt
L’ARNt initiateur occupe le site P du ribosome,
le site A est prêt à recevoir un ARNt aminoacylé
Que se passe-t-il dans la mise en place du microcycle d’allongement?
L’allongement commence par le placement du prochain aminoacyl-ARNt au site A du complexe de traduction.
Chez les bactéries, l’étape est catalysée par un facteur d’élongation EF-TU (a un site de fixation pour GTP EF-Tu-GTP qui reconnaît des propriétés à l’ARNt)
Que se passe-t-il dans le microcycle d’allongement 3/translocation
EF-G catalyse la translocation et le ribosome commence à glisser
QUel est le bilan du chargement d’un acide aminé sur ARNt par aminoacyl-ARNt synthétase et l’élongation?
Ça requiert 2 ATP (ATP à AMP) et 2 autres étapes pour la GTP de l’élongation
4 ATP/liaison
2aa font 9 liaisons
Que se passe-t-il lors de la terminaison de la traduction? Reconnu par qui?
- l’un des trois codons de terminaison (UGA, UAG, UAA) arrive en face du site A.
Ensuite - Peptidyl-transférase hydrolyse la liaison ester du peptidyl-ARNt
Ceux-ci sont recconus par les facteurs de relargage
Voir slide sur les protéines auxiliaires de la traduction chez eucaryotes
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