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biochimie > Cours 11- Contrôle de la transcription et maturation d'ARN > Flashcards

Cours 11- Contrôle de la transcription et maturation d'ARN Flashcards

1
Q

Que contient l’ARNm?

A

L’information spécifiant la séquence des acides aminés d’une protéine.

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2
Q

Faire la distinction entre ARN codant et non-codant

A

Codant (ARNm): porte l’info pour déterminer comment la séquence d’une protéine

Non-codant (ARNt, ARNr): ne code pas pour des protéines

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3
Q

Décrire la structure de l’ARN

A

ribose en 2’OH, U au lieu de T, monocaténaire, instable

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4
Q

Que permettent les bases modifiées à l’ARN?

A

Augmenter la diversité structurale au-delà des 4 nucléotides

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5
Q

Comment nomme-t-on les ARN doués d’activité enzymatique?

A

Les ribozymes

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6
Q

Quels sont les nome des deux modifications communes de l’ARN?

A

Méthylation et pseudouridylation

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7
Q

Définir la transcription

A

Processus où l’information dans l’ADN est communiqué à l’ARN, disponible pour la synthèse protéique

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8
Q

Le transfert d’information génétique de l’ADN
aux protéines exige la participation de
plusieurs classes de molécules d’ARN. Que sont-ils et que font-ils?

A

ARNt: apporte les aa à la machinerie de traduction

ARNr: occupe la majorité du ribosome

ARNm: séquence complémentaire à un des brins d’ADN qui est traduit au niveau des ribosomes de la protéine

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9
Q

Par qui est catalysée la synthèse d’ARN? Décrire cette structure

A

ARN polymérase

Forme en crabe
Contient 5 sous-unités
Pas d’amorce

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10
Q

Où démarre la transcription?

A

Aux promoteurs (région de l’ADN)

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11
Q

Comment se fait la reconnaissance du promoteur chez les bactéries et les eucaryotes?

A

Bactérie: l’élément sigma (lie séquences -35 et -10).
Eucaryote: plusieurs protéines et cet ensemble s’appèle facteurs généraux de la transcription.

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12
Q

Qu’est-ce qu’un opéron?

A

Les gènes de la bactérie sont transcrits comme un tout commun. Un opéron est l’ensemble de ceux-ci.

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13
Q

Quels sont les deux informations dans l’ADN?

A

Comment faire les protéines et comment réguler l’ARNm

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14
Q

Pour quelle raisons l’initiation de la transcription chez les eucaryotes ne peut pas commencer avec l’ARN
polymérase et ses facteurs accessoires qui lient les séquences du promoteur

A
  • l’ADN est plus abondant
  • l’ADN est condensé en chromatine (barrière pour l’ARN polymérase)
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15
Q

Que se passe-t-il dans la transcription chez les eucaryotes?

A

1- remodelage de la chromatine
(par facteurs de transcription spécifiques qui ne lient pas le promoteur et complexes de remodelage qui ouvrent la chromatine)

2-Recrutement du médiateur

3-Recrutement de facteurs généraux de la transcription et de l’ARN polymérase

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16
Q

Que se passe-t-il lors du remodelage de la chromatine?

A

On rend les séquences d’ADN plus accessibles à la machinerie de transcription

Ceci commence quand les facteurs de transcription reconnaissent un site de liaison spécifique autour de la région du promoteur.
Ensuite, les pionniers recrutent les complexes de remodelage de la chromatine pour l’ouvrir et exposer la région du promoteur.

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17
Q

Que permet le code des histones?

A

déterminent la conformation ouvert/fermé de la chromatine.

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18
Q

Le médiateur est responsable de quoi?

A

Le recrutement de Pol II

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19
Q

Que se passe-t-il lors de l’élongation?

A

Les deux brins d’ADN se séparent et se rehybrident (WATCH VID)

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20
Q

Le répresseur lac I réprime la transcription. Qui régule l’activité de ce répresseur?

A

L’allolactose

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21
Q

Quand du lactose est disponible comme source de carbone, une partie de ce lactose se transforme en allolactose. Que permet cette fixation au répresseur lac I?

A

Une transformation qui cause la dissociation du répresseur de son site de liaison sur l’opérateur.

22
Q

Que permet l’inactivation du répresseur à l’ARN polymérase?

A

L’inactivation du répresseur permet à l’ARN polymérase de commencer à transcrire l’opéron et d’induire l’expression des gènes.

23
Q

Qui régule de façon positif l’opéron lac? Comment ça fonctionne?

A

La protéine CRP qui reçoit l’AMPc.

Il se fixe à l’ADN en présence d’AMPc.
Ceci permet à l’ARN polymérase de démarrer efficacement la transcription.

24
Q

Les gènes sont transcrits de façon contrôlée et soumis à une régulation en fonction de leurs rôles. Que sont les deux rôles?

A

1- les activateurs (accélèrent la transcription à partir des promoteurs peu puissants comma la CRP)

2- les répresseurs freinent la transcripton de deux façons

25
Q

Quels sont les deux moyens de fonctionnement des répresseurs?

A
  • empêchent l’ARN polymérase d’atteindre le promoteur
  • inhibent les réactions d’initiation comme quand l’enzyme quitte le promoteur (ex lac)
26
Q

Que font les facteurs de transcription?

A

Ce sont des protéines qui décident si un gène est à exprimer ou pas (répriment ou régulent l’expression de milliers de gènes).

Il existe deux types: les facteurs régulateurs et constitutives

27
Q

Que sont les éléments de réponse?

A

Ce sont des sites de fixation initiale des FT qui recrutent le médiateur, les facteurs généraux et l’ARN polymérase. Ils peuvent agir de distance

28
Q

Sur quoi repose la différence des cellules ?

A

Déoend de l’action des FT spécifiques à chaque type cellulaire.

29
Q

Donne des exemples de FT pour cellule

A

MyoD: muscle
GATA1: cellules rouges
combinaison: cellules pancréatiques

30
Q

Que sont les amplificateurs eucaryotes?

A

Ce sont des séquences d’ADN qui augmentent la transcription et peuvent agir à distance du promoteur. Ça augmente l’affinité pour 1FT à l’autre

31
Q

Définir coactivateur.

A

Aident à enlever l’effet répresseur des histones et les modifie

32
Q

Définir corépresseurs

A

Opposent l’action de coactivateurs, modifient la chromatine

33
Q

L’ensemble des modifications qui transforment les transcrits primaires d’ARN en molécules matures est appelé maturation de l’ARN. Il existe 3 remaniements pour maturer l’ARN. Que sont-ils?

A

_ la soustraction de nucléotides aux transcrits primaires d’ARN

  • l’addition de séquences nucléotidiques non codées par le gène correspondant
  • la modification covalent des bases
34
Q

Vrai ou faux. Chez les procaryotes, le transcrit primaire d’ARNm est traduit avant même que la transcription ne s’achève

A

Vrai

35
Q

Dans l’eucaryote, dans quels compartiments cellulaires différents est-ce que la transcription et la traduction se passent? Pourquoi?

A

Transcription dans le noyau
Traduction dans le cytoplasme

Car les précurseurs d’ARNm dans le noyau n’interfèrent pas avec la traduction

36
Q

Qui sont les portes de sortie des molécules d’ARNm

A

les pores nucléaires

37
Q

À quel moment est-ce que la maturation commence?

A

Avant la fin de la transcription, c’est-à-dire dès que le transcrit émerge de l’ARN polymérase.

38
Q

Quel est le nom de de la structure résultante d’une modificationi de l’extrémité 5’? Quand arrive-t-il?

A

C’est la coiffe, arrive dès que L’ARN sort de la pol II.

39
Q

Quel est le rôle de la coiffe?

A

La coiffe transforme aussi le précurseur d’ARNm en substrat pour d’autres enzymes nucléaires de maturation.

Dans l’ARNm définitif, la coiffe ancre les ribosomes pour la traduction.

40
Q

Les précurseurs d’ARNm eucaryotes sont aussi modifiés à leur extrémité 3’. Ceci sert à quoi? (AAUAAA)

A

D’amorce à l’addition d’une séroe d’adénosine durant que l’ADN poly est en action.

41
Q

Les modificateurs à l’extrémité 3’ peut constitué un appendice de polyadénylate connu sous quel nom?

A

queue poly-A

42
Q

Que permet la formation d’un complexe ARN-protéine des queues poly-A précurseurs et ARN matures?

A

Ceci stabilise l’ARNm, qui protége une dégradation partant de 3’

43
Q

De quoi sont constitués les sites d’épissage.

A

Ce sont des squences consensus aux extrémités 3’ et 5’ des introns

44
Q

Qu’est-ce qui se passe dans le processus d’épissage?

A

Les introns sont enlevés et les extrons sont mis ensembles. L’adénosine joue un rôle central dans le processus d’épissage

45
Q

Expliquer le mécanisme de l’épissage

A

1- une attaque nucléophile du 2’OH du ribose libère l’extrémité 3’

2- le 3’ libéré au niveau de l’exon coupe l’autre lien intron-exon et ils s’associent.

46
Q

Que fait le spliceosome?

A

Catalyse le processus d’épissage

47
Q

Décrire le processus d’épissage alternatif.

A

les exons peuvent être conservés dans l’ARNm ou ciblés pour elimination qui mène à la création d’un réseau varié d’ARNm à partir d’un seul précurseur d’ARNm

48
Q

Que fait l’ARN polymérase?

A

Synthèse de l’ARN ribosomique

49
Q

Que fait l’ARN polymérase III

A

Synthèse de l’ARNt et l’ARNr 5S

50
Q

Qu’est un ribozyme dans l’Autoépissage?

A

Molécule d’ARN qui catalyse toutes les réactions d’épissage

51
Q

Quels sont les interférents d’ARN et que font-ils?

A

Inhibent l’expression des ARNm
siARN, miARN, piARN

52
Q

Expliquer la biogenèse de siARN.

A

La RISC choisit un brin de l’ARN double brin comme gujide et ceci a une activité de coupure de l’ARN cible

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