Cours 10- Réplication et réparation d'ADN Flashcards
Quels sont les deux rôles de l’ADN
1- rôle dans la stabilité de l’information (gardien de l’information)
2- rôle dans la transmission
Quelles sont les trois méthodes de la réplication d’ADN et lequel est utilisé chez nous?
Semi-conservative (chez nous), conservative et dispersive
Décrire la réplication semi-conservative.
Les deux brins de l’hélice se détordent et chaque brin va servir de matrice pour la synthèse d’un brin complémentaire (1 brin parental et 1 brin synthétisé)
La synthèse de l’ADN revient à la polymérisation de nucléotides. Décrire les trois caractéristiques principaux de la synthèse de l’ADN.
-catalysée par des ADN polymérases
-nécessite une amorce
-procède toujours en direction 5’ vers 3’
Par qui est-ce que l’ADN double brin est séparé en double-matrice? Où?
L’hélicase sépare les deux brins-matrices dans des régions nommées origines de réplication (ORIs).
Chez les eucaryotes, il existe plusieurs sites d’ORIs en même temps, que permet cela?
Ça permet une diminution du temps de réplication (copier l’ADN eucaryote proche de celui qui est nécessaire pour l’ADN procaryote).
Les ORIs peuvent ressembler à quoi? Que permet cela?
Des bulles pour que la réplication est bi-directionnelle.
Que fait une amorce d’ARN
Une amorce d’ARN (primase) fournit un point de départ d’ARN pour que l’ADN polymérase commence la synthèse.
Après l’action de l’hélicase, qui permet le relâchement du surenroulement de l’ADN?
Topoisomérase
Décrire la réplication à double sens de l’ADN chez les procaryotes. (4)
- la réplication démarre en un site unique
- Chacun des fourches possèdent des réplicateurs
- Le réplicateur catalyse les réactions rapidement
- Les 2 chx se séparent quand les fourches se rencontrent au site de terminaison
Quels sont les rôles des différents ADNpol de l’eucaryote?
alpha et delta: effectuent les étapes d’allongement de la réplication de l’ADN
béta: enzyme de réparation dans le noyau
gamma: r.plique l’ADN mitochondrial
Décrire la polymérisation de l’ADN
L’ADN polymérase catalyse la réaction pour synthèse du brin continue
Quels sont les rôles des trois ADN polymérases chez E.coli?
ADNpol I: répare l’ADN et synthèse un des brins
ADNpol II: réparation de l’ADN
ADNpol III : compisant du réplicateur et enzyme principale de la réplication d’ADN. assure l’élongation de la chaîne au cours de sa réplication.
Qu’est-ce qui explique que l’élongation de la chaîne via un transfert de groupement nucléotidyle explique l’activité directionnelle?
IMP et liaison phosphodiester
Les brins ont quelle type de liaison mathématique?
Antiparallèle, c’est-à-dire que la synthèse doit se faire dans le sens opposé au déplacement de la fourche sur l’autre brin.
Lequel des brins est retardé?
Le brin formé dans le sens inverse de la fourche.
Le brin avancé est synthétisé sans interruption, dès que l’enzyme quitte l’ORI et suit la fourche. Ceci n’est pas le cas avec le brin retardé. Que se passe-t-il?
Le brin retardé est synthétisé de façon discontinue, en petits fragments de 5’ vers 3’ dans le sens opposé de la fourche.
Ces fragments se nomment fragments d’Okazaki.
Où se situe la zone de terminaison?
Opposé à l’ORI sur le chx fermé en cercle
Décrire les fragments d’okazaki.
La synthèse s’explique par la présence d’amorces d’ARN
Cette synthèse est catalysée par l’enzyme primase
Chaque amorce complémentaire est prolongé par l’extrémité 3’ par ADNpIII pour former un fragment.
Comment se fait la ligation des fragments d’Okazaki?
L’amorce d’ARN est digéré par la Rnase H et remplacée par l’ADNpolymérase I (ou delta) et les fragments adjacents sont reliés par l’ADN ligase.
C’est quand que la polymérase ajoute un nouveau nucléotide? s’il y a erreur?
Lorsque le précédent est complémentaire au brin-matrice. s’il y a erreur, la polymérase recule et reprend la synthèse.
On attribue la lenteur relative du glissement de la fourche chez les eucaryotes à cause de quelles deux choses?
Vu que l’ADN eucaryote est tassé en chromatine, on attribue la lenteur à la fixation d’histones à l’ADN et son empaquetage en nucléosome.
Comment fonctionne le terminateur de réplication (protéine Tus) pour le E.coli
empêche la fourche de dépasser en inhibant l’hélicase.
Quand survient la terminaison de réplication chez les eucaryotes?
Lors de la rencontre de deux réplisomes provenant des ORIs différents
Pour quelle raison l’ADN est la seule macromolécule que la cellule peut réparer?
- Les autres servent à rien
- les lésions à l’ADN menacent l’intégrité de l’organisme que le dépens d’énergie pour le réparer
Expliquer la réparation par excision de base
Quand les bases endommagées ne peuvent pas être directement réparées, les enzymes ADN glycosylases reconnaissent les bases modifiées et les éliminent.
Quels sont les deux risques de ADN endommagé?
L’accumulation de dommages causés à l’ADN mène à une perte de fonction cellulaires ou à une croissance anarchique des cellules
Pourquoi est-ce que l’ADN est sensible aux rayons UV?
Car ceci provoque une dimérisation des thymines, ce qui distort le brin matrice. Il faut alors les éliminer.
Quel est le mécanisme de réparation de la dimérisation de la thymine?
La photolyase (enzyme photoréactivatrice) qui se fixe sur l’ADN en face du dimère de thymine. Dès que ce complexe enzyme-ADN est activé par la lumière, ça provoque la réaction inverse.
Spontanément dans l’eau, la cytosine peut subir une désamination qui donner l’uracile. Comment est-ce que l’enzyme uracile-ADN glycosylase (BER) évite la mutation?
En éliminant l’uracile des molécules d’ADN en initiant leur base excision.
Explique le mécanisme d’action du Jonction des extrémités non homologues
Les radiations et radicaux libre causent des cassures de la double hélice
Ku (protéine) recrute des exonucléases et polymérases qui allongent les brins
L’ADN ligase finit la réparation
Expliquer la réparation par excision de nucléotide (NER) et pour quoi il est utilisé
Utilisé pour la réparation des dommages causés par des radicaux/lumière UV
Un segment et environ 30 de ses voisins est enlevé et cette lacune est comblée par une ADN polymérase.
Décrire la recombinaison homologue (HR)
échange de segments homologues de brin différents
