Cours 10- Réplication et réparation d'ADN

Question 1

Quels sont les deux rôles de l’ADN

Answer 1

1- rôle dans la stabilité de l’information (gardien de l’information)
2- rôle dans la transmission

Question 2

Quelles sont les trois méthodes de la réplication d’ADN et lequel est utilisé chez nous?

Answer 2

Semi-conservative (chez nous), conservative et dispersive

Question 3

Décrire la réplication semi-conservative.

Answer 3

Les deux brins de l’hélice se détordent et chaque brin va servir de matrice pour la synthèse d’un brin complémentaire (1 brin parental et 1 brin synthétisé)

Question 4

La synthèse de l’ADN revient à la polymérisation de nucléotides. Décrire les trois caractéristiques principaux de la synthèse de l’ADN.

Answer 4

-catalysée par des ADN polymérases
-nécessite une amorce
-procède toujours en direction 5’ vers 3’

Question 5

Par qui est-ce que l’ADN double brin est séparé en double-matrice? Où?

Answer 5

L’hélicase sépare les deux brins-matrices dans des régions nommées origines de réplication (ORIs).

Question 6

Chez les eucaryotes, il existe plusieurs sites d’ORIs en même temps, que permet cela?

Answer 6

Ça permet une diminution du temps de réplication (copier l’ADN eucaryote proche de celui qui est nécessaire pour l’ADN procaryote).

Question 7

Les ORIs peuvent ressembler à quoi? Que permet cela?

Answer 7

Des bulles pour que la réplication est bi-directionnelle.

Question 8

Que fait une amorce d’ARN

Answer 8

Une amorce d’ARN (primase) fournit un point de départ d’ARN pour que l’ADN polymérase commence la synthèse.

Question 8

Après l’action de l’hélicase, qui permet le relâchement du surenroulement de l’ADN?

Answer 8

Topoisomérase

Question 9

Décrire la réplication à double sens de l’ADN chez les procaryotes. (4)

Answer 9

• la réplication démarre en un site unique
• Chacun des fourches possèdent des réplicateurs
• Le réplicateur catalyse les réactions rapidement
• Les 2 chx se séparent quand les fourches se rencontrent au site de terminaison

Question 10

Quels sont les rôles des différents ADNpol de l’eucaryote?

Answer 10

alpha et delta: effectuent les étapes d’allongement de la réplication de l’ADN

béta: enzyme de réparation dans le noyau

gamma: r.plique l’ADN mitochondrial

Question 10

Décrire la polymérisation de l’ADN

Answer 10

L’ADN polymérase catalyse la réaction pour synthèse du brin continue

Question 11

Quels sont les rôles des trois ADN polymérases chez E.coli?

Answer 11

ADNpol I: répare l’ADN et synthèse un des brins

ADNpol II: réparation de l’ADN

ADNpol III : compisant du réplicateur et enzyme principale de la réplication d’ADN. assure l’élongation de la chaîne au cours de sa réplication.

Question 12

Qu’est-ce qui explique que l’élongation de la chaîne via un transfert de groupement nucléotidyle explique l’activité directionnelle?

Answer 12

IMP et liaison phosphodiester

Question 13

Les brins ont quelle type de liaison mathématique?

Answer 13

Antiparallèle, c’est-à-dire que la synthèse doit se faire dans le sens opposé au déplacement de la fourche sur l’autre brin.

Question 14

Lequel des brins est retardé?

Answer 14

Le brin formé dans le sens inverse de la fourche.

Question 14

Le brin avancé est synthétisé sans interruption, dès que l’enzyme quitte l’ORI et suit la fourche. Ceci n’est pas le cas avec le brin retardé. Que se passe-t-il?

Answer 14

Le brin retardé est synthétisé de façon discontinue, en petits fragments de 5’ vers 3’ dans le sens opposé de la fourche.

Ces fragments se nomment fragments d’Okazaki.

Question 15

Où se situe la zone de terminaison?

Answer 15

Opposé à l’ORI sur le chx fermé en cercle

Question 15

Décrire les fragments d’okazaki.

Answer 15

La synthèse s’explique par la présence d’amorces d’ARN

Cette synthèse est catalysée par l’enzyme primase

Chaque amorce complémentaire est prolongé par l’extrémité 3’ par ADNpIII pour former un fragment.

Question 16

Comment se fait la ligation des fragments d’Okazaki?

Answer 16

L’amorce d’ARN est digéré par la Rnase H et remplacée par l’ADNpolymérase I (ou delta) et les fragments adjacents sont reliés par l’ADN ligase.

Question 17

C’est quand que la polymérase ajoute un nouveau nucléotide? s’il y a erreur?

Answer 17

Lorsque le précédent est complémentaire au brin-matrice. s’il y a erreur, la polymérase recule et reprend la synthèse.

Question 18

On attribue la lenteur relative du glissement de la fourche chez les eucaryotes à cause de quelles deux choses?

Answer 18

Vu que l’ADN eucaryote est tassé en chromatine, on attribue la lenteur à la fixation d’histones à l’ADN et son empaquetage en nucléosome.

Question 18

Comment fonctionne le terminateur de réplication (protéine Tus) pour le E.coli

Answer 18

empêche la fourche de dépasser en inhibant l’hélicase.

Question 18

Quand survient la terminaison de réplication chez les eucaryotes?

Answer 18

Lors de la rencontre de deux réplisomes provenant des ORIs différents

Question 19

Pour quelle raison l’ADN est la seule macromolécule que la cellule peut réparer?

Answer 19

• Les autres servent à rien
• les lésions à l’ADN menacent l’intégrité de l’organisme que le dépens d’énergie pour le réparer

Question 20

Expliquer la réparation par excision de base

Answer 20

Quand les bases endommagées ne peuvent pas être directement réparées, les enzymes ADN glycosylases reconnaissent les bases modifiées et les éliminent.

Question 20

Quels sont les deux risques de ADN endommagé?

Answer 20

L’accumulation de dommages causés à l’ADN mène à une perte de fonction cellulaires ou à une croissance anarchique des cellules

Question 21

Pourquoi est-ce que l’ADN est sensible aux rayons UV?

Answer 21

Car ceci provoque une dimérisation des thymines, ce qui distort le brin matrice. Il faut alors les éliminer.

Question 22

Quel est le mécanisme de réparation de la dimérisation de la thymine?

Answer 22

La photolyase (enzyme photoréactivatrice) qui se fixe sur l’ADN en face du dimère de thymine. Dès que ce complexe enzyme-ADN est activé par la lumière, ça provoque la réaction inverse.

Question 23

Spontanément dans l’eau, la cytosine peut subir une désamination qui donner l’uracile. Comment est-ce que l’enzyme uracile-ADN glycosylase (BER) évite la mutation?

Answer 23

En éliminant l’uracile des molécules d’ADN en initiant leur base excision.

Question 24

Explique le mécanisme d’action du Jonction des extrémités non homologues

Answer 24

Les radiations et radicaux libre causent des cassures de la double hélice

Ku (protéine) recrute des exonucléases et polymérases qui allongent les brins

L’ADN ligase finit la réparation

Question 24

Expliquer la réparation par excision de nucléotide (NER) et pour quoi il est utilisé

Answer 24

Utilisé pour la réparation des dommages causés par des radicaux/lumière UV

Un segment et environ 30 de ses voisins est enlevé et cette lacune est comblée par une ADN polymérase.

Question 25

Décrire la recombinaison homologue (HR)

Answer 25

échange de segments homologues de brin différents