Cours 1 - Diapo 55 Flashcards
Quelle est la quantité de matériel totale nécessaire pour une expérience de RMN ?
Entre 1 et 10 mg.
Vrai ou faux : La cristallographie à rayons X nécessite généralement moins de 10 mg de matériel.
Faux. Elle nécessite plus de 10 mg.
Quelle est la quantité de matériel nécessaire pour une analyse par Cryo-ME (APU) ?
Entre 0.1 et 1 mg.
Quelle concentration de protéine est idéale pour une expérience de RMN ?
Idéalement supérieure à 5 mg/mL.
Vrai ou faux : La concentration de protéine recommandée pour la cristallographie à rayons X est supérieure à 5 mg/mL.
Vrai.
Quelle est la concentration typique de protéine utilisée pour la Cryo-ME (APU) ?
Entre 0.1 et 5 mg/mL.
Dans quel état l’échantillon doit-il être pour la RMN ?
En solution.
Sous quelle forme l’échantillon est-il utilisé en cristallographie à rayons X ?
Sous forme de cristal.
Vrai ou faux : L’échantillon utilisé en Cryo-ME est sous forme cristalline.
Faux. Il est en solution.
Quelle est la taille typique d’un échantillon étudié par RMN ?
Inférieure à 30 kDa.
En cristallographie à rayons X, quels types de protéines peuvent être étudiés ?
Celles qui cristallisent, souvent inférieures à 100 kDa.
Quelle est la taille minimale recommandée d’un échantillon pour la Cryo-ME ?
Supérieure à 30 kDa.
Combien de temps dure typiquement une expérience de RMN ?
Plusieurs semaines.
Quelle est la durée typique d’une expérience en cristallographie à rayons X ?
Quelques heures.
Vrai ou faux : La Cryo-ME permet d’obtenir des résultats en moins d’un jour.
Faux. Elle prend entre 24 et 72 heures.
Quelle est la résolution limite typique atteinte par la RMN ?
N/A (mais généralement entre 2.0 et 2.5 Å).
Quelle technique offre une résolution limite d’environ 0.5 Å ?
La cristallographie à rayons X.
Quelle est la résolution limite atteignable par la Cryo-ME ?
1.22 Å.
Quels sont les critères de validation utilisés en RMN ?
RMSD et Ramachandran.
Quels critères de validation sont utilisés pour la cristallographie à rayons X ?
Ramachandran, Facteur R, CC1/2.
Quels sont les critères de validation en Cryo-ME (APU) ?
Ramachandran et FSC.