Cours 1 Flashcards

Introduction, le génome humain, épigénétique, mutations et diversité génétique dans la population; cancer

1
Q

C’est quoi la similartité entre pharmacogénétique et pharmacogénomique?

A

Visent tous les deux à étudier comment le bagage génétique exerce un impact sur un phénotype qui est modulé par un médicament.

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2
Q

C’est quoi la différence entre pharmacogénétique et pharmacogénomique?

A

La pharmacogénétique vise l’étude des gènes uniques qui dominent les effets d’une réponse à un médicament tandis que la pharmacogénomique étudie plusieurs gènes qui créent une réponse complexe face à un médicament.

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3
Q

C’est quoi la médecine de précision?

A

Permet une stratification au niveau moléculaire. Donc, ajustement du traitement selon la maladie pour qu’il cible le plus parfaitement (bimoléculairement) le target de la maladie précise en question.

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4
Q

C’est quoi la médecine personnalisée?

A

-Vise à identifier des traitements spécifiques, et/ou à cibler des stratégies de prévention et de traitement en regard des caractéristiques uniques d’un individu (par exemple, socioculturelles). Donc, ajustement du traitement selon un patient.
-Exige un suivi avec des spécialistes

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5
Q

Y-a-t’il eu des avancements de la génétique et de la génomique? Donner un exemple de ce qu’on peut détecter maintenant?

A

OUI!!! Votre médecin possède dorénavant de nouveaux outils pour détecter, par exemple, le risque que vous souffriez de dépression ou d’une maladie cardiovasculaire.

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6
Q

Donner des exemples de types d’application de la médecine personnalisée

A

-Brosser le profil génomique de votre tumeur pour ajuster les traitements ou prédire le risque de récidive;
-Mesurer votre prédisposition génétique à certains cancers, dont le cancer du sein et le cancer de la prostate;
-Procéder à des tests pharmacogénétiques pour déterminer l’interaction entre les médicaments et vos gènes et ainsi savoir quel traitement sera le plus efficace pour vous;
-Utiliser l’ADN du fœtus que vous portez pour dépister des anomalies génétiques de façon sécuritaire.

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7
Q

Un médicament n’est pas nécéssairement efficace pour tout le monde… Pourquoi?

A

On a des mutations diffèrent (métabolisme différent ou pas métabolisé du tout)

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8
Q

Nommez quelques types d’études qui ont progressés dans la génétique

A

-Étude des protéines (protéomique)
-Étude des métabolites, de petites molécules produites par le métabolisme, comme le glucose (métabolomique)
-Étude de l’influence de l’environnement et des habitudes de vie sur la santé (épigénétique)

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9
Q

Combien de gène y-a-t’il dans notre corps?

A

Environ 25 000 gènes

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10
Q

Si on a plus de gènes est-ce qu’on est plus évoluer?

A

Oui et Non.
Oui, car besoin de plus de gènes pour des animaux qui doivent accomplir des fonctions , ce qui
leur rend plus evoluer.
Non, ce ne sont pas forcément des gènes avantageux (handicapant).

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11
Q

On trouve quoi dans un gène?

A

Séquence d’ADN 5’ -> 3’

Région régulatrice : contrôle de l’expression d’autres gènes ou de sa propre expression au bon moment et dans le bon organe

*Facteurs de transcription qui vont activer ou inhiber le gène.

↳ Promoteur : site de liaison ARNp, boîte tata

Enhancers, silencers

Site d’initiation de la transcription

Exon

Introns : retirés après l’épissage

Région terminal

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12
Q

C’est quoi un gène?

A

Avant, le gêne était une entité qui permettait de donner l’information d’une certaine caractère. Un gène est capable de produire un ARNm qui va être ensuite traduit en protéine

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13
Q

Qu’est-ce qu’il y a dans la région régulatrice?

A

Promoteur

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14
Q

Qu’est-ce qui se passe au promoteurs pour être activé ou désactivé?

A

Facteurs de transcription qui vont se lier au région régulatrice

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15
Q

C’est quoi la chromatine?

A

C’est l’ADN dans son état physiologique (compaction de l’ADN)

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16
Q

C’est quoi un chromosome?

A

Forme la plus condensée de l’ADN

17
Q

Durant quel phase est-ce que la compaction de la chromatine est le plus élevé?

A

Mitose

18
Q

C’est quoi l’unité de base de la chromatine et son constitution?

A

-Le nucléosome (regroupement des histones avec l’ADN pour former plusieurs unité de nucléosomes)
-Constitué de 146 pb d’ADN enroulé ~2 fois autour d’un octamère des histones H2A, H2B, H3 et H4.
-Fonction : permet la compaction de l’ADN tout en régulant l’accès de cet ADN pour la transcription. Permet une stabilité génique + contrôle de l’expression des gènes.

19
Q

Il y a quoi dans le génome humain? IMP POUR EXAM il faut savoir 6 avec leur pourcentage

A

-Transposons et fragments défectives (45%)
-Exons (1%)
-Introns (22%)
-Centromères (1%)
-Pseudogènes (5%)
-Introns dans partie non-codante des gènes d’ARN (6%)
NOTRE GÉNOME CONTIENT SEULEMENT 2-5% DE GÈNES

20
Q

Ca fait quoi des protéines dans la cellule?

A

-Transcription (execute le contrôle génique)
-Des enzymes
-Transport
-Communication intracellulaire
-Transduction des signaux
Fonction biochimique général de la cellule
-Protéine structural
-C’est les protéines qui vont déterminer le bon ou le mauvais fonctionnement de la cellule.

21
Q

Qu’est-ce qui explique une si grande diversité dans les activités des protéines ?

A

L’épissage alternative permet de faire varier l’activité de la protéine selon ce qui est gardé et retiré dans le segment d’ADN.

22
Q

C’est quoi l’épigénétique?

A

Étude de l’influence de l’environnement et des habitudes de vie sur la santé.
-Exemple: Des jumeaux identiques sont génétiquement identique. Par contre, si on les sépare (différent environnement) ils vont avoir des différences. Donc, l’environnement a un effet

23
Q

C’est quoi un agent mutagène?

A

-Quelque chose qui permet de changer un nucleotide pour un autre.
-Exemples: Des rayons UV, des molécules toxiques et chimiques.

24
Q

C’est quoi le type de dommage à l’ADN qui est le plus toxique pour la cellule?

A

Bris double brins

25
Q

Nommez les différents types de dommage à l’ADN et le(s) voie(s) qui réparent ces dommages

A

-Bris simple brin –> Voie de réparation: BER
-Bris double brins –> Voies de réparation: HR ou NHEJ
-Adduit –> Voie de réparation: NER
-Mésappariement –> Voie de réparation: “mismatch repair”

26
Q

Ça sert à quoi les points de contrôle qui se déroule lors de la division cellulaire?

A

Vérifient si le baggage génétique est correct (apoptose si problème)

27
Q

Nommez les 3 types de mutations génétiques

A

-Mutations de gènes «maîtres» (mutation dans les gènes maîtres est plus importante que si on a un mutation dans d’autres gènes): gène p53 qui répare l’ADN
-Accumulation de mutations
-Mutations de gènes isolant
génétiquement une population

28
Q

Caractéristiques des SNP’s

A

-SNP’s «Single Nucleotide Polymorphisms». Identiques à 99,9% chez l’humain;
-Il existe 1 changement chaque 100-300 pb sur 3 milliards de pb du génome;
-On considère les SNP’s significatifs quand ils sont présents à 1% dans une population et plus de 10 millions ont été catalogués;
-Les SNP’s comptent pour 90% de toute la variabilité génétique ! Les autres sont attribuées aux erreurs de réplication de l’ADN, des insertions et délétions, des inversions de bases, etc.
-Un base qui est différent dans le génome (pas nécessairement un mutation)

29
Q

C’est quoi le problème avec les SNP’s?

A

Le SNP est un indicateur d’un état particulier du génome. Pas nécessairement responsable d’une maladie. Difficile de dire si un SNP cause une maladie. Unique a certains populations

30
Q

Expliquer l’effet fondateur

A

L’effet fondateurcorrespond à une perte de variabilité génétiquequi se produit lorsqu’une nouvelle population est établie par un très petit nombre d’individus appartenant à une population plus grande. En raison de la perte de la variation génétique, la nouvelle population peut être différente de la population parente dont elle est dérivée. Dans les cas extrêmes, on pense que l’effet fondateur conduit à la «spéciation» et à l’évolution subséquente de nouvelles espèces.

31
Q

La diversité génétique a un impact sur…?

A

Tous les traits humains de l’apparence extérieure jusqu’à la susceptibilité aux maladies ainsi que la réponse aux médicaments !!
-C’est la variabilité génétique qui contribue à la diversité génétique dans une population ainsi qu’aux différents individus

32
Q

Donner un exemple de maladie qui est causer par une seule mutation?

A

Fibrose kystique (mucus trop épais)

33
Q

Les types de mutations quels sont leurs effets?

A

Des mutations qui vont changer le cadre de lecture d’un gène. Beaucoup de mutation sont silencieuse. Des mutations qui cause une perte de fonction, gain de fonction, perte partielle….

34
Q

Pour passer de la phase G1 à S et G2 à M, il faut passer par des points de contrôle, si points de contrôle détecte problème qu’est-ce qui se passe?

A

Apoptose ou sénescence cellulaire. Point de contrôle important pour maintenir l’intégrité du baggage génétique

35
Q

Quelle système est le contrôle la destruction lorsqu’une cellule est cancéreuse?

A

Système immunitaire

36
Q

C’est quoi des oncogènes? Nommer des types de gènes qui peuvent être oncogènes

A

-Gène cellulaire (appelé proto-oncogène), susceptible de devenir modifié de façon qualitative ou quantitative et d’être capable de conférer expérimentalement le phénotype cancéreux (transformation) à une cellule normale.
-C’est un gêne qui favorise le développement et l’initiation du cancer
-Ont des mutations de type gain de fonction et dominante (doit muter seulement un des deux allèles pour exercer un effet sur la cellule)
-Les récepteurs tyrosine kinase, RAS (GTPase). Souvent des gènes qui sont impliqué dans la croissance cellulaire.

37
Q

C’est quoi les suppresseurs de tumeurs?

A

-Un gènesuppresseur de tumeurs est un régulateur négatif de la prolifération cellulaire.Ils sont souvent inactivés dans les cancers ce qui confère un phénotype cancéreux.
-Mutation de type perte de fonction (lorsque les 2 allèles sont mutées) donc on a un effet négatif sur la prolifération cellulaire

38
Q

Les tests d’ADN permet…?

A

Permet de voir l’historique de la famille, ancêtres, identité personnelle et info sur la santé
-La vente de ces tests augmentent chaque années

39
Q

Nommez des bons côtés et des mauvais côtés aux tests d’ADN commercialisés en vente libre.

A

Bon côté :

Permet d’obtenir énormément d’information génétique relié dans le temps et l’espace ce qui peut aider les études statistiques en génomique et l’identification de facteurs lier à l’ADN surtout avec un accès aux informations de santé, permet de connaître ses origines facilement (dont l’historique de famille). Peut permettre de connaître ses prédispositions à des maladies à origines génétiques. Peut éventuellement donnez lieu à de la médecine personnalisée !!

Mauvais côté :

Parfois des trousses de mauvaise qualité , les informations peuvent arrivées aux mains des assurances qui peuvent faire de la discrimination selon tes prédispositions génétiques à des maladies comme la fibrose kystique.