College 9 2-12-2022 Flashcards
Wat voor soort DNA zegt veel over de geschiedenis? en noem 2 voorbeelden met eigenschappen.
DNA waar geen recombinatie kan plaatsvinden.
1. Mitochrondriale genen(mtDNA)(maternaal)
- sterk geconserveerd (in stand gehouden)
-geen recombinatie
-maternale afstammingen kunnen diep in de tijd worden gevolgd
2. Y-chromosoom(paternaal)
-Geen reombinatie
- paternale afstammingen kunnen diep in de tijd worden gevolgd
Wat is een snip en wat is een indel? En hoe kun je ze detecteren?
snip:
verandering van 1 base in het DNA
indel:
kleine deletie of insertie van 1 of een paar nuleotiden.
Microarray:
breng bekende SNP’s in kaart en indel’s in kaart
Genoom moet al bekedn zijn
Restrictie analyse:
RFLP(TPA practicum)- meestal random op hele veel plaatsen
AFLP-amplificeer met primers die een random 3’ stukje hebben een deel van de fragmenten tussen restrictie sites.
Sequensen:
-exome sequencing: sequesen van het eiwit-coderende deel van het genoom
-Rad-seq: random sequensen van restrictie fragmenten
-Whole genome sequencing
welke drie soorten paringssystemen bestaan er?
- willekeurige paring
random - Positieve assortatieve paring
soort zoekt soort - negatieve assortatieve paring
vermijden van inteelt: vb: verstoting, migratie, wetgeving.
Wat is inteelt?
teken van inteelt:
allelfrequenties blijven gelijk,
genotype frequenties veranderen
toename in homozygoten
Wanneer:
Paring met verwanten
Kleine (geïsoleerde) populaties
Positieve assortatieve paring
