College 4 Flashcards
Welke verschillen hebben RNA en DNA?
- De basis-suiker groep verandert, bij RNA heeft het een OH-groep extra (ribose) hierdoor is die soepeler
- de Thymine groep verandert in Uracil,
de uracil basepaart met A en G in RNA
Wat is sequentie en hoe bepaal je de DNA sequentie met RNA?
Sequentie betekent volgorde.
Als er RNA wordt gebouwd van de DNA streng. Dan heet de streng waar RNA direct aan zit de template strand. en de andere streng de coding strand, deze streng heeft dezelfde DNA sequentie als RNA.
Hoe ziet de DAN streng eruit waarvan RNA wordt afgelezen?
Noem hierin Promotor, Coding strand, UTR, Intronen exonen, Start- en stop codon.
RNA begint gebouwd te worden vanaf de promotor op de coding strand, deze kun je vaak herkennen door een consensus sequentie bijv. TATAAA.
Hierna wordt er ~20-30 BP’s niks gebouwd.
Het eerste en het laatste gedeelte wat wel gebouwd wordt noem je een UTR (UnTranslatedRegion) eerste = 5’UTR en laatste = 3’UTR.
Daartussen bestaat RNA uit Intronen(niet eiwit coderend, groot deel gen) en Exonen(eiwit coderend, heel klein deel gen)
Start en stop codon geven begin en eind eiwit synthese aan.
Op welke 2 manieren wrikt bacterie RNA zich los van de DNA streng?
- dmv een stemloop, de RNA streng bindt met zichzelf om zo een soort hefboom te verwezenlijken.
- dmv van een Rho-factor wat een Rut-sequentie herkent. zich oprolt en losrukt.
Wat is een enhancer?
Dat is een starting eiwit, nodig voor begin transriptie. Dit kan tot wel 100000 bp’s upstream (naar ‘5) of downstream (naar ‘3).
Hoe wordt het gemaakt RNA verwerkt?
1.Nadat het RNA wordt gevormd komt er een eiwit ‘cap’ op. Dit beschermt tegen RNA degradatie(vernietiging).
2. splicing: intronen worden uit RNA gehaald. (spliciosoom)
3. RNA wordt los geknipt, er vind polyadenylation plaats (allemaal A’tjes toegevoegd.) Dit is noodzakelijk voor het stoppen van translatie.
Nu is het mRNA
Hoe worden Intronen gedetecteerd?
Intronen worden opgezocht door smallmoleculair RNA wat zich vormt tot spliciosoom. dit smRNA gaat op zoek naar bepaalde sequenties wat bekent staan als splicing sites bijv. GU-AG
4 dingen die eukaryoten wel hebben en prokaryoten niet? (genen)
- Intronen en exonen
- Genoom in nucleus (celkern)
3.DNA verpakt als chromatine( transcriptie vereist voor maken DNA) - 3 verschillende RNA polymerases die verschillende RNA’s produceren
- Enhancers
Wat is Alternative splicing, Splicing enhancers en suppressors?
Alternative splcing betekent dat er van RNA niet altijd dezelfde intronen worden weggesneden, dat dit wel eens verschilt. Het wel of niet splicen wordt gestimuleerd door splicing enhancers (ESE & ISE) en destimuleerd door suppressors (ESS & ISS).
Wat kan er gebeuren bij RNA editing?
Basen kunnen worden gedeamoniseerd, eruit worden gehaald en gewijzigd.
Welke types RNA zijn er?
1.Messenger RNA: maakt eiwitten
2. Transfer RNA: brengt aminozuren naar ribosomen
3. Ribosomaal RNA: het katalytische deel van ribosomen bestaat uit RNA
4. small- nuclear RNA: deel spliciosoom
5. micro RNA: regulatie van genexpressie
6. siRNA en piRNA: virus bestrijding RNA
