College 8 29-11-2022

Question 1

Wat is Sanger sequencing?

Answer 1

Bij sanger sequencing worden bepaalde base ipv van gedeoxyireerd gedideooxyrireerd. de OH-groep wordt vervangen voor een enkele H-groep. Hierdoor kan er geen base meer aansluiten. Daarna worden verschillende buisjes met verschillende laatste bases door een gel geleid. Het streepje wat het laagst komt is de base van die kolom. zo kun je de sequence bepalen

Question 2

Wat zijn pseudogenen?

Answer 2

genen die in ons genoom liggen die miljoenenjaren vroeger functioneel waren maar nu niet meer. Bijvoorbeeld: aanmaken van eigeel.

Question 3

Wat is whole-genome shotgun sequencing?

Answer 3

1. genoom wordt opengebroken in stukjes random dna.
2. alle fragmenten worden gesequenced.
3. De stukjes overlappend DNA worden achter elkaar gelegd
4. een complete sequence wordt gemaakt.

Question 4

Wat is nano-pore sequencing?

Question 5

Wat is illumina sequencing?

Answer 5

1. Isolated DNA wordt in stukken opgebroken, de open eindes worden gerepareerd en adapters op geplaatst.
2. Fragmenten worden op een glasplaat geplaatst waar in veel stappen alle stukjes DNA worden vermeervoudigd op een bepaald klein stukje plaat
3. De gevormde DNA stroken binden met fluoriscerende bases, van elke base laag wordt een er kopie gemaakt. zo zie je van elke laag welke bases er op zitten