chiffres Flashcards
euchromatine partir sequencable du genome? cb de % des genes séquencés?
oui
99%
heterochromatine contient bcp de genes?
Non, presque vide de genes
heterochromatine formee de?
sequences d’adn hautement repetees
ou trouve t on lheterochromatine
telomeres, centromeres,..
combien delements vraiments importants y a t il dans notre genome? divisés en?
6%
2% de genes
4% de CNC
CNC?
conserved non coding
tres fonctionnels mais on ne connait pas leur fonction
seuls les elements … de notre genome sont conservés
importants
pourquoi on peut dire que les genes et les CNCs sont cruciaux?
car ils ont ete conservés avec le temps
combien de repetitions?
45%
combien de sequences non conservees?
43%
repetitions sont fonctionnelles ?
non
combien de genes dans le genome?
60 000
combien de genes codent pour des proteines?
20 000
en moyenne combien de transcrits par gene?
4
transcrit?
ARNm ne prennent pas tjr tous les exons, transcrits sont les differents assemblages d’exons
40’000 autres genes codent pour?
longs ARN non codants ARNt ARNr petits ARN non codants micro ARN
combien des 40000 genes qui ne codent pas pour des prots, codent pour les longs ARN non codants?
16000
ARNr et ARNt combien de genes les codent?
500
500
petits arn non codants combien les codent?
10000
4 categories de repetitions
- LINEs
- SINEs
- elements semblables a retrovirus
- transposons
LINEs? cb de % du genome?
regions longues, composees de genes morts autonomes qui peuvent se deplacer
21%
SINEs? cb de % du genome?
regions courtes non autonomes et pas fonctionnelles
13%
elements semblables a retrovirus? cb de % du genome?
retrovirus ayant envahi le genome mais qui y restent (autonome ou pas)
8%
transposons d’ADN fossiles autonome? cb de % du genome?
autonome ou pas
3%
combien de duplications dans le genome?
5%
comment le genome peut etre dupliqué?
- de maniere intrachromosomale (entre deux regions d’un meme chromosome)
- de maniere interchromosomale
combien de genes dans le genome mitochondrial?
17000 nucleotides
13 genes codant des prot
24 genes codant dautres elements genomiques
euchromatine %
heterochromatine %
93
7
differentes variations (polymorphismes)
- SNP
- SSR
- Insertion/deletion
- CNV
- inversion
- mixed polymorphisme
SNP?
variation d’un seul nucleotides entre deux alleles
1 nucleotide sur x varie entre deux genomes selectionnés au hasard
1000
Combien de SNP dans genome humain?
60 000
SSR?
variation de courtes sequences repetees d’un allele a l’autre
SSR 1 variation sur x bases
50 000
CNV
nombre de copies de sequences varie d’un allele a lautre
CNV concerne combien de regions du genome?
1000
mixed polymorphisme
differents mecanismes de polymorphismes assemblés
trois types de variations genomiques
- neutres
- predisposantes (predispositions a maladies)
- pathogeniques (provoquent maladies genetiques)
humains ont un genome a cb de % identique? le reste est capital pour?
99%
comprendre les variations entre individus et donc causes des maladies
combien de genes sur les 20 000 genes qui codent des prot peuvent comporter des mutations?
3500
