Chaptire 10 Developpement

Question 1

Que sont les gènes signatures?

Answer 1

Des gènes spécifiques à un type de cellule particulier. Les gènes sont présent chez toutes les cell mais exprimé seulement chez la cellule un question

Question 2

Qu’est ce qui permet la différenciation d’une cellule?

Answer 2

La régulation de la transcriptions de gènes spécifiques et les interactions entres les cellules

Question 3

Qu’est la morphogenèse?

Answer 3

Le processus de développement des structures d’un organisme au cours de son embryogenèse

Question 4

Qu’est ce qu’un gène homologue?

Answer 4

Un gène commun à toutes les espèces provenant du même phylum, mais seulement exprimé chez un type de cell

Question 5

Quels sont les 2 banques d’ADN?

Answer 5

Banque d’ADN génomique (représente tout le génome)

et Banque d’ADN complémentaire (représente tous les ARNm exprimés dans un tissu ou à un stade de développement donné)

Question 6

Quelle est l’utilité des banques d’ADNg?

Answer 6

Étude des séquences régulatrices, frontières intron exon, séquencage des génomes, criblage.

Question 7

Quelle est l’utilité des banques d’ADN complémentaire?

Answer 7

Permet d’enrichir la banque en séquences codantes

Question 8

Comment forme-t-on une banque d’ADN complémentaire?

Answer 8

À base d’ARNm rétrotranscrit en ADN double brin

Question 9

À quoi sert le criblage?

Answer 9

À identifier et isoler les clones d’intérêt contenus dans les banques d’ADN par l’hybridation des séquences formant des puces à ADN

Question 10

Comment utilise-t-on des séquences dégénérés?

Answer 10

On connait la séquence d’a.a., on peut déduire la séquence de nucléotides et fabriquer des amorces pour le PCR ou le criblage.

Question 11

Quels sont les 3 stratégies favorisant le différenciation des cell?

Answer 11

Changement de localisation des ARNm par Induction de polarité.
Contact entre les cellules voisines/sécrétion paracrine
Gradient moléculaire dictant les patrons moléculaires

Question 12

Par quel moyen les ARNm sont ils mobilisés dans la cellule?

Answer 12

Par les protéines se mouvant sur les filament d’actine. L’asymétrie du processus repose sur l’asymétrie intrinsèque des éléments du cytosquelette

Question 13

Comment le contact cellule-cellule agie sur les voies de différenciation des cell?

Answer 13

Présentation de prot membranaires ou sécrétion de protéines qui, lorsque liés à une cellule adjacente, provoque une réponse chez la cell cible

Question 14

Quelles sont les 2 voies d’influence cell-cell?

Answer 14

Inhibition latérale

Signalisation inductive

Question 15

Quels sont les récepteurs exprimés par les cell épidermiques et les neuroblastes?

Answer 15

Neuroblastes expriment Delta

Epidermique exprime Notch

Question 16

Que provoque la perte de signal Notch?

Answer 16

La surproduction de cellule neurale

Question 17

Comment fonctionne les gradients de morphogenèse?

Answer 17

Dans le tube neural par exemple, les cellules centrales sécrètent un morphogène Shh . En fonction de la concentration de Shh à laquelles elles sont exposés, les cellules auront des différentiations différentes

Question 18

Quels facteurs de transcription régulent la présence de stomates chez la plante?

Answer 18

SPCH qui promeut la division asymétrique
MUTE qui promeut la différenciation
FAMA qui permet la division symétrique formant le stomate

Question 19

Comment se forme les bandes chez l’oeuf de drosophile?

Answer 19

La transcription du gène Eve dépend de 5 enhancers qui sont activés ou inhibés en fonction de la concentration des répresseurs. La concentration de ces répresseurs varie sous la forme d’un gradient antéro-postérieur faisant que les bandes se forment à des endroits précis selon leur affinité avec les répresseurs

Question 20

Quelle méthode permet d’étudier les commutateurs complexes in vitro?

Answer 20

Co-immuno-précipitation

Question 21

Quelle méthode permet d’étudier les commutateurs complexes in vivo?

Answer 21

Le système de double hybride,
Transfer d’énergie et de lumière
Immuno-précipitation de la chromatine

Question 22

Comment fonctionne la co-immunoprécipitation?

Answer 22

On fusionne GST (glutathione S-trnsférase) à notre gène d’intéret. La protéine de fusion est ensuite purifiée en la passant dans une colonne de chromatographie où GSP reste lier aux billes. On lave ensuite la colonne avec un enzyme clivant le lien GST-prot. On obtient ainsi notre prot . On peut visualider les prot présente avec un anticorps spécifique

Question 23

Explique le système double hybride

Answer 23

On lie un domaine de liaison de l’ADN avec une prot connue et on observe si la prot inconnue, liée à Gal4, vient s’y lier. Si oui un gne essentiel à la survie de la levure sera produit. Si non, la levure meurt. Permet de faire une puce d’ADN avec les données

Question 24

Explique comment l’interaction prot-prot peut être visualisé en fluorescence

Answer 24

Une prot fusionnée à la luciférase et une autre liée à Yellow fluorescent prot. Si les deux partenaires se lient, il y a transfert d’énergie de la luciférase vers YFP. Une fluorescence est alors émise

Question 25

Explique l’approche chromatine immunoPrécipitation on chip (ChIP-chip)

Answer 25

Le génome est coupé en fragment et amplifié par PCR et marquées par fluorescence. Ils sont ensuite hybridés sur une puce ADN. Les sites de liaison des prot à l’ADN sont identifiés selon l’intensité de la fluorescence sur la puce. On peut ainsi situer les séquences identifiées sur une carte du génome

Question 26

Quelle est la différence entre ChIP-chip et ChIP-seq

Answer 26

Les séquences immunoprécipitées sont recueillis pour former une banque de séquences analysée par séquençage à haut débi (plus précis)t, plutot que l’observer sur une puce. On peut ensuite comparer la fréquence obtenue avec le génome connu

Question 27

Que cause l’expression inadéquate des gènes Hoxa et Hoxd?

Answer 27

Polydactylie,
Permet d’avoir uniquement que 5 doigt, mais permet aux poissons d’avoir plus de 5 rayons à leurs nageoires. Dépend de leur régulation

Question 28

Quel est le rôle des gènes homéotiques?

Answer 28

Responsable de la diversification des différentes parties du corps

Question 29

Quel complexe de gènes homéotiques régulent la formation des pattes chez la mouche?

Answer 29

Antennapedia

Question 30

Que ce passe-t-il si Antennapedia est sur exprimé au niveau de la tête?

Answer 30

Formation de pattes au lieu des antennes

Question 31

Que ce passe-t-il si Antennapedia est sous-exprimé au niveau du mésothorax?

Answer 31

Pattes ressemblant à des antennes formées

Question 32

Que controle l’homéodomaine Ubx (ultrabithorax)

Answer 32

La formation d’une seconde paire d’aile métathoracique. (inhibe le développement du deuxième segment thoracique dont ANTP)

Question 33

Quelle différence fait que l’homéodomaine Ubx est exprimé chez le papillon mais non chez la mouche?

Answer 33

Le gène est inhibé par un répresseur chez la mouche, mais cette séquence régulatrice est modifiée chez le papillon de telle sorte que la prot Ubx ne peut plus s’y lier