Chapitre 2

Question 1

Combien y a t il d’origine de réplication chez les procaryote? Par rapport au eucaryotes

Answer 1

1 origine chez les procaryote

Plusieurs chez les eucaryotes (30000-50000 ORI)

Question 2

Comment se nomme les sites spécifiques auxquels commence la réplication?

Answer 2

Les origines de réplication (ORI)

Question 3

Comment se compare la vitesse de réplication chez les eucaryotes par rapport aux procaryotes

Answer 3

La réplication est 20x plus lente chez les eucaryotes (2-3kb/min)
Pour compenser, le génome a plusieurs sites de réplications qui répliquent l’ADN simultanément

Question 4

Pourquoi l’origine de réplication est elle riche en A-T

Answer 4

Car il y a moins de pont H et que c’est plus facile à défaire

Question 5

Qu’est ce qui est particulier des protéines initiatrice

Answer 5

Seul protéine à reconnaitre une séquence spécifique de l’ADN. (Le site 9-mère) Les autres prot reconnaissent la protéines. La prot initiatrice sert de socle pour l’assemblage du complexe d’initiation

Question 6

Qu’est le site 13-mère?

Answer 6

Le site de séparation initial des brins. Riche en A-T

Question 7

Qu’est la DnaA

Answer 7

L’équivalent de la protéine iniatrice chez le procaryote. Se lie spécifiquement à la séquence 9-mère.
Lorsque lié à l’ATP, la protéine interagit aussi avec un site 13-mère et permet de séparer l’ADN

Question 8

Qu’est le complexe de reconnaissance de l’origine de réplication

Answer 8

C’est l’initiateur, un complexe de 6 protéines qui permet l’initiation de la réplication

Question 9

Quels motifs structurels permet la reconnaissance de l’origine de l’réplication chez les Eucaryotes?

Answer 9

Séquence riche en AT
Structure d’ADN particulière
Régions libres de nucléosomes
région impliqués dans la transcription

Question 10

Comment fonctionne l’hélicase?

Answer 10

six sous unités en forme d’anneau qui se fixe sur L’ADNsb qui force la séparation de l’ADNdb grâce la liaison de la charpende sucre-p en hydrolisant l’ATP pour se déplacer

Question 11

Que sont les protéines SSB

Answer 11

Des prot fixatrice de l’ADN monocaténaire, empêche l’ADNsb de se recoller ou de former des épingles

Question 12

Qu’elle est la différence entre la topoisomérase I et II?

Answer 12

topo I coupe un seul brin pour le désenrouler puis ressoude

Topo II coupe et ressoude les deux brins

Question 13

De quoi a besoin l’ADN polymérase pour initier l’élongation?

Answer 13

D’une amorce, fabriqué par l’ARN polymérase. L’amorce est ensuite reconnue par un poseur d’anneau coulissante qui installe l’anneau en l’ouvrant (ATP). L’ADN polymérase se lie à l’anneau en compétitionnant avec le site de liaison du poseur

Question 14

À quoi sert l’anneau coulissante?

Answer 14

À augmenter la processivité de la polymérase (temps d’attention)

Question 15

Quelles sont les 2 polymérases chez les procaryotes et leurs fonctions?

Answer 15

ADN Pol I substitut les amorces ARN possède une fonction exonucléase 5’
ADN Pol III Réplication du chromosome (élongation normale

Question 16

Quelles sont les 3 polymérases chez les eucaryotes et leurs fonctions?

Answer 16

L’ADN Pol ε synthétise le brin continu
L’ADN Pol δ synthétise le brin discontinu
(ε et δ répliquent l’ADN et participe à la réparation par excision NER et BER)

L’ADN Pol alpha synthétise des amorces d’ADN pendant la réplication de l’ADN en travaillant de paire avec la primase

Question 17

Nomme les étapes de l’initiation chez les eucaryotes

Answer 17

Synthèse de l’amorce d’ARN par la primase
Synthèse d’un peu d’ADN par l’ADN polymérase alpha
reconnaissance de l’amorce par le poeur d’anneau
pose de l’Anneau coulissante
La polymérase vient se lier pour l’élongation

Question 18

Comment fonctionne la sélectivité cinétique de la polymérase

Answer 18

Essai de trouver le nucléotide compatible par essai erreur, pas d’analyse, comme essayer des aimants magnétiques. Lorsqu’il y a match, la catalyse lie le nucléotide à la charpente sucre-P

Question 19

Comment l’ADN polymérase distingue rNTP des dNTP?

Answer 19

La forme de la prot discrimine les RNTP qui ne peuvent être incorporés en raison d’un groupe oxy.
On parle d’exclusion stérique

Question 20

Qu’est le répliosome?

Answer 20

Le répliosome est le complexe de réplication associant toutes les protéines nécessaire à la réplication

Question 21

Quelles protéines sont impliqués dans le répliosome

Answer 21

Topoisomérase
Hélicase
Primase
Prot SSB fixatrice d'ADN
Anneau coulissante
Polymérase

Question 22

Quelles sont les étapes du remplacement de l’amorce d’ARN?

Answer 22

La RNase H retire les nucléotides de l’amorce sauf le dernier
Une exonucléase 5’ retire le dernier
L’ADN polymérase comble la brèche
L’ADN ligase forme la liaison phosphodiester pour lier le fragment

Question 23

Comment s’associe le nucléosome au brin nouvellement formé?

Answer 23

Le vieux nucléosome est partagé entre les deux nouveaux brins alors que les nouveaux sont recrutés par la clamp (ou anneau coulissante)

Question 24

Quelle extrémité du chromosome ne peut pas être répliqué?

Combien de nucléotides sont perdus?

Answer 24

L’extrémité 3’

5 à 10 nucléotides

Question 25

Quelle enzyme permet d’allonger l’extrémité des télomères?

Answer 25

La télomérase

Question 26

Comment fonctionne la télomérase?

Answer 26

Elle ajoute des séquences répétitives au bout de l’extrémité 3’ comme une polymérase. Elle se sert de sa partie ARN comme matrice. Cela permet l’ajout d’un fragment d’okazaki de plus.

Question 27

Lorsque le télomère est long, la télomérase est elle plus ou moins active?

Answer 27

Moins active, ça empêche que le télomère devienne trop long

Question 28

De quelle façon le bout du télomère évite d’être pris pour un bris de l’ADN?

Answer 28

En laissant une séquence de 50 à 300 nucléotides riche en G qui est reconnu par la prot. TRF2 qui assure le positionnement du complexe shelterin. La prot POT1 vient alors lier la séquence d’ADNsb puis forme la T-loop

Question 29

Qu’est la formation T-loop?

Answer 29

Une formation au bout du télomère qui forme une boucle afin d’éviter d’être pris pour un bris double brin de l’ADN.

Question 30

Quelles sont les protéines impliqués dans le complexe shelterin ?

Answer 30

TRF2 et POT1

Question 31

Que sont les caténanes?

Answer 31

Lorsque deux fourches de réplications se rencontre, il en résulte un surenroulement.

Question 32

Comment corrige t-on les caténanes?

Answer 32

Grĉe aux topoisomérases, on désenroule l’ADN