Chapitre 1

Question 1

Met les liaisons suivantes en ordre de force croissante.

Covalent, pont Hydrogène, ionique, Van Der Waals

Answer 1

Covalent&raquo_space; Ionique > Pont H&raquo_space; Van Der Waals

Question 2

Qu’est ce qui assure la polymérisation de la charpente sucre-phosphate?

Answer 2

Les liaisons phosphodiesters

Question 3

La règle de Chargaff valide le modèle Watson Crick. Quel est elle?

Answer 3

Peu importe l’espèce, l’ADN bicaténaire possède autant de purines que de pyrimidines.
%A=%T & %G=%C

Question 4

Qu’est ce qui cause la charge globalement négative de l’ADN?

Answer 4

La charge négative de groupements phosphate à PH neutre.

Question 5

Comment les protéines peuvent accéder à la séquence des bases (information génétique) sans ouvrir l’ADN?

Answer 5

Par les sillons (Majeurs et mineurs). Le sillon majeur fournit plus d’information.

Question 6

Quelle information est visible par les sillons?

Answer 6

A : gr accepteur de lien H (N- ou O-)
D : gr Donneur de lien H ( N-H+)
H : gr non polaire ( C-H)
M : gr méthyl (CH3)

Question 7

Que permet de distinguer les sillons mineurs? Et majeurs?

Answer 7

Mineur : A-T vs C-G

Majeur : A-T vs T-A vs C-G vs G-C

Question 8

Quel est la forme classique de l’ADN?
A, B ou Z
Et quelles sont les différences?

Answer 8

C’est B.
A est plus compact -> dans les hélices ARN et ARN-ADN et complexes protéiques
Z à gauche en zigzag car formation de doublet de bases. Tourne en doublet -> lorsque la concentration de Na+ est élevé ou surenroulement négatif

Question 9

La température de dénaturation est-elle toujours la même pour tout ADN?

Answer 9

Non le nombre de liaison C-G ou de A-T fait varier car C-G requiert plus d’énergie à défaire que les liaisons A-T

Question 10

Comment déterminer la spécificité de l’hybride (ou sonde) lors de la détection de séquences spécifiques?
Pourquoi?

Answer 10

Plus la température est élevée et proche de la température de dénaturation, plus l’hybride est spécifique.
Car à faible température des hybrides peu spécifiques pourraient parvenir à s’attacher. À plus haute température, plus de liens sont nécessaire pour que l’hybride tienne.

Question 11

Quelles sont les modifications post traductionnelles des queues d’histones et leurs effets?

Answer 11

Phosphorylation par ajout de sérine
Acétylation neutralise les charges +, moins d’interaction histone, ADN se déroule plus facilement
Méthylation par ajout d’arginine ou lysine, provoque une répression de la transcription, responsable de la déformation de l’hétérochromatine

Question 12

Qu’est le complexe FACT?

Qu’elle est sa fonction?

Answer 12

Un complexe protéique qui permet le passage de l’ARN polymerase lors de l’élongation. Il enlève un dimère H2A-H2B puis le replace après le passage de la polymerase

Question 13

Combien de sous unités sont essentielles à la transcription chez le complexe médiateur?

Answer 13

Une seule est essentielle, la Srb4. La perte ou mutation d’une sous unitée autre n’affecte l’expression d’un sous-ensemble du gène

Question 14

Qu’est le complexe médiateur?

Answer 14

Un énorme complexe protéique de 20 sous unités, qui contient des modificateurs de nucléosome et remodeleurs de chromatine. Il s’associe à l’ARN polymerase II et aux facteurs de transcriptions. Il permet l’initiation de la transcription

Question 15

Qu’est ce qui permet le dynamisme entre les histones et l’ADN

Answer 15

Des facteurs protéiques appelés complexes remodelants. Recrutés par les facteurs de transcriptions et les queues N-terminales des histones

Question 16

Quelles protéines contribuent à l’échafaudage nucléaire et au maintient de la structure du chromosome?

Answer 16

Topoisomérase II

Protéines SMC

Question 17

Quelles sont les 2 modèles de structure en hélice de L’ADN dans l’hétérochromatine

Answer 17

Solénoide : L’ADN à la surface des nucléosomes est bien exposé et l’ADN internucléosomique bien enfouit
Zigzag : ADN internucléosomique long facilite cette conformation

Question 18

Quelle est la position des queues d’histone?

Answer 18

H2B et H3 sortent entre 2 brins d’ADN où 2 sillons mineurs se font face
H2A et H4 sortent en haut et en bas des 2 hélices

Question 19

Combien de liens se forment entre l’histone et l’ADN

Answer 19

40 liens hydrogènes majorité lié aux O de la charpente. Seulement 7 sont liés aux bases du sillon mineur

Question 20

Dans quel ordre s’assemble les histones?

Answer 20

Le tétramère se lie en premier et induit une courbe. H2A-H2B s’ajoute pour stabiliser. Enfin, H1 viens resserer les nucléosomes de 20 pb de plus dans l’euchromatine

Question 21

De quoi sont composés les histones?

Answer 21

D’un haut pourcentage (20%) de lysine et arginines. Des AA chargés positivements permettant d’interagir avec la charpente négative de l’ADN au niveau du sillon mineur

Question 22

Explique la structure du nucléosome

Answer 22

8 sous unités d’histone plus 1 histone à l’extérieur. L’ADN est enroulé 1.65 tour et 20 à 60 pb intercallaire

Question 23

Quelles sont les 2 formes de la chromatine?

Answer 23

Hétérochromatine : très dense et inacessible

Euchromatine : moins compact, disponible pour la transcription

Question 24

Que retrouve-t-on dans l’ADN intergénique

Answer 24

Séquences régulatrice (promoteurs)
ARN régulateur
Orinines de réplication
Pseudogènes (Junk DNA)
Transposons
Séquences hautement répétitives (télomères, centromères, microsatellites

Question 25

Qu’est un plasmide

Answer 25

Chez la bactérie, il s’agit de petits ADN circulaires non attaché au chromosome. Réplication indépendante qui confère des caractères avantageux comme la résistance à un antibiotique

Question 26

Qu’est la ploïdie?

Answer 26

Le nombre de copie de chaque chromosome (n)
Eucaryotes 2n
Cell somatiques haploide n
Mégacaryocytes polyploides

Question 27

Combien de lien y a-t-il entre les A-T et C-G

Answer 27

A-T 2 liens

C-G 3 liens

Question 28

Si un brin d’ADN possède 15% de thymine, quel pourcentage y a-t-il de chacun des trois autres nucléotides?

Answer 28

T=15
A=15
C=30
G=30

Question 29

De quelle façon peut on distinguer les nucléotides de l’ADN sans ouvrir l’ADN?

Answer 29

En observant le sillon majeur ou mineur.

Question 30

Quelle information est visible par le sillon mineur?

Answer 30

Permet de distinguer les paires mais pas leur sens

AHA vs ADA

Question 31

Quelle information est visible par le sillon majeur?

Answer 31

Permet de distinguer les paires et leur sens ADAM vs MADA vs HDAA vs AADH

Question 32

Dans un southern, que signifie une bande pale?

Answer 32

Signifie que la soude est moins bien lié, moins spécifique.