Chapitre 1 Flashcards
Présentation de l'ADN
Met les liaisons suivantes en ordre de force croissante.
Covalent, pont Hydrogène, ionique, Van Der Waals
Covalent»_space; Ionique > Pont H»_space; Van Der Waals
Qu’est ce qui assure la polymérisation de la charpente sucre-phosphate?
Les liaisons phosphodiesters
La règle de Chargaff valide le modèle Watson Crick. Quel est elle?
Peu importe l’espèce, l’ADN bicaténaire possède autant de purines que de pyrimidines.
%A=%T & %G=%C
Qu’est ce qui cause la charge globalement négative de l’ADN?
La charge négative de groupements phosphate à PH neutre.
Comment les protéines peuvent accéder à la séquence des bases (information génétique) sans ouvrir l’ADN?
Par les sillons (Majeurs et mineurs). Le sillon majeur fournit plus d’information.
Quelle information est visible par les sillons?
A : gr accepteur de lien H (N- ou O-)
D : gr Donneur de lien H ( N-H+)
H : gr non polaire ( C-H)
M : gr méthyl (CH3)
Que permet de distinguer les sillons mineurs? Et majeurs?
Mineur : A-T vs C-G
Majeur : A-T vs T-A vs C-G vs G-C
Quel est la forme classique de l’ADN?
A, B ou Z
Et quelles sont les différences?
C’est B.
A est plus compact -> dans les hélices ARN et ARN-ADN et complexes protéiques
Z à gauche en zigzag car formation de doublet de bases. Tourne en doublet -> lorsque la concentration de Na+ est élevé ou surenroulement négatif
La température de dénaturation est-elle toujours la même pour tout ADN?
Non le nombre de liaison C-G ou de A-T fait varier car C-G requiert plus d’énergie à défaire que les liaisons A-T
Comment déterminer la spécificité de l’hybride (ou sonde) lors de la détection de séquences spécifiques?
Pourquoi?
Plus la température est élevée et proche de la température de dénaturation, plus l’hybride est spécifique.
Car à faible température des hybrides peu spécifiques pourraient parvenir à s’attacher. À plus haute température, plus de liens sont nécessaire pour que l’hybride tienne.
Quelles sont les modifications post traductionnelles des queues d’histones et leurs effets?
Phosphorylation par ajout de sérine
Acétylation neutralise les charges +, moins d’interaction histone, ADN se déroule plus facilement
Méthylation par ajout d’arginine ou lysine, provoque une répression de la transcription, responsable de la déformation de l’hétérochromatine
Qu’est le complexe FACT?
Qu’elle est sa fonction?
Un complexe protéique qui permet le passage de l’ARN polymerase lors de l’élongation. Il enlève un dimère H2A-H2B puis le replace après le passage de la polymerase
Combien de sous unités sont essentielles à la transcription chez le complexe médiateur?
Une seule est essentielle, la Srb4. La perte ou mutation d’une sous unitée autre n’affecte l’expression d’un sous-ensemble du gène
Qu’est le complexe médiateur?
Un énorme complexe protéique de 20 sous unités, qui contient des modificateurs de nucléosome et remodeleurs de chromatine. Il s’associe à l’ARN polymerase II et aux facteurs de transcriptions. Il permet l’initiation de la transcription
Qu’est ce qui permet le dynamisme entre les histones et l’ADN
Des facteurs protéiques appelés complexes remodelants. Recrutés par les facteurs de transcriptions et les queues N-terminales des histones
Quelles protéines contribuent à l’échafaudage nucléaire et au maintient de la structure du chromosome?
Topoisomérase II
Protéines SMC
Quelles sont les 2 modèles de structure en hélice de L’ADN dans l’hétérochromatine
Solénoide : L’ADN à la surface des nucléosomes est bien exposé et l’ADN internucléosomique bien enfouit
Zigzag : ADN internucléosomique long facilite cette conformation
Quelle est la position des queues d’histone?
H2B et H3 sortent entre 2 brins d’ADN où 2 sillons mineurs se font face
H2A et H4 sortent en haut et en bas des 2 hélices
Combien de liens se forment entre l’histone et l’ADN
40 liens hydrogènes majorité lié aux O de la charpente. Seulement 7 sont liés aux bases du sillon mineur
Dans quel ordre s’assemble les histones?
Le tétramère se lie en premier et induit une courbe. H2A-H2B s’ajoute pour stabiliser. Enfin, H1 viens resserer les nucléosomes de 20 pb de plus dans l’euchromatine
De quoi sont composés les histones?
D’un haut pourcentage (20%) de lysine et arginines. Des AA chargés positivements permettant d’interagir avec la charpente négative de l’ADN au niveau du sillon mineur
Explique la structure du nucléosome
8 sous unités d’histone plus 1 histone à l’extérieur. L’ADN est enroulé 1.65 tour et 20 à 60 pb intercallaire
Quelles sont les 2 formes de la chromatine?
Hétérochromatine : très dense et inacessible
Euchromatine : moins compact, disponible pour la transcription
Que retrouve-t-on dans l’ADN intergénique
Séquences régulatrice (promoteurs) ARN régulateur Orinines de réplication Pseudogènes (Junk DNA) Transposons Séquences hautement répétitives (télomères, centromères, microsatellites
Qu’est un plasmide
Chez la bactérie, il s’agit de petits ADN circulaires non attaché au chromosome. Réplication indépendante qui confère des caractères avantageux comme la résistance à un antibiotique
Qu’est la ploïdie?
Le nombre de copie de chaque chromosome (n)
Eucaryotes 2n
Cell somatiques haploide n
Mégacaryocytes polyploides
Combien de lien y a-t-il entre les A-T et C-G
A-T 2 liens
C-G 3 liens
Si un brin d’ADN possède 15% de thymine, quel pourcentage y a-t-il de chacun des trois autres nucléotides?
T=15
A=15
C=30
G=30
De quelle façon peut on distinguer les nucléotides de l’ADN sans ouvrir l’ADN?
En observant le sillon majeur ou mineur.
Quelle information est visible par le sillon mineur?
Permet de distinguer les paires mais pas leur sens
AHA vs ADA
Quelle information est visible par le sillon majeur?
Permet de distinguer les paires et leur sens ADAM vs MADA vs HDAA vs AADH
Dans un southern, que signifie une bande pale?
Signifie que la soude est moins bien lié, moins spécifique.
