Chapitre 9 Régulation transcription euca Flashcards
Quelle est l’étape la plus sensible de la transcription eucaryote?
L’initiation
Compare les régions régulatrices procaryotes et eucaryotes
Les séquences régulatrices eucaryotes sont beaucoup plus complexe, longue, plus nombreuse, et peuvent même être dans la région codante.
Quelle région soit toujours être présente peut importe le type de régulation lors de la transcription eucaryote?
Le promoteur basal
Que sont les Enhancer (amplificateur)?
Des séquences d’ADN qui fixe des facteurs régulateurs de transcription qui amplifient le nombre de trancritption du gène situé en aval ou amont
À quel distance se situent l’enhancer par rapport au promoteur basal?
Il peut être très loin du promoteur
Que sont les isolateurs?
Éléments spécifiques d’ADN contrôlant l’action des activateurs. Lorsque situé entre un enhancer et un promoteur, il agit comme un mur et inhibe l’activation du gène par l’activateur
Comment fait on pour déterminer le rôle des séquences régulatrices?
On retire et ajoute des segments et on observe les variations de phénotypes
Dans l’exemple de la feuille, on retire une boite distale et on observe production de pigmentation bien inférieure, que peut on déduire de cette boite?
Est probablement un activateur, sans elle il y a moins de transcription du pigment
Dans l’exemple de la feuille, on retire une boite et on observe une production de pigment supérieure que norma, que peut on dire de cette boite?
C’est probablement un répresseur
Dans l’exemple de la feuille, on retire une boite et on observe une absence totale du pigment, que peut on dire de cette boite?
C’est le promoteur basal, sans lui il n’y a tout simplement pas de transcription du gène
Qu’est un gène rapporteur?
Un gène qui code une protéine dont la présence se mesure facilement. Les séquences régulatrices sont les même que le gène d’intérêt
Quels sont les 3 caractéristiques d’un bon gène rapporteur?
Il doit être tranger au génome de l’organisme modifié
Le produit doit permettre une visualisation précise de l’expression dans les tissus
Le résultat doit être quantifiable pour permetre des calculs précis (pas juste on/off)
Quel type de résultat produit un gène rapporteur?
De la fluorescence (lumière)
De la couleur
Détectable par un anticorps
On étudie la production de ß-galactosidase (LacZ) (remplacé par luciférase qui produit de la lumière). Une séquence -500 produit bcq de lumière. On retire la boite -500 -250, en suit une perte de production de lumière. Que peut on dire de cette boite?
C’est un amplificateur à distance ayant un rôle dans la production de ß-galactosidase (LacZ)
Qu’est une protéine de fusion?
La protéine du gène d’intérêt à laquelle on ajoute un Tag rendant la prot observable (lumière, reconnaissance anticorps)
Vrai ou faux : les activateurs et les inhibiteurs sont modulaires
Vrai, ils sont compos. d’un domaine liant l’ADN et un domaine d’activation/inhibition
La protéine a-t-elle besoin d’être complète pour lier le domaine?
Non, mais elle doit être entière pour jouer son rôle d’activateur ou inhibiteur
Qu’est le site Gal4?
Une protéine amplificatrice (1000X en présence de galactose) du gène de l’enzyme métabolisant le galactose chez la levure. . Il possède 4 sites situé 275pb en amont
Si on exprime seulement le 1/3 du site de liaison Gal4, la prot peut elle lier l’ADN?
La prot lie l’ADN mais n’active pas la transcription.
La région activatrice de Gal4 peut lier le domaine de liaison à l’ADN de LexA, comment est ce possible?
Les activateurs et inhibiteurs sont modulaires, Le domaine liant l’ADN est très spécifique mais la région activatrice peut se lier à celle ci moins spécifiquement et remplir sa fonction normalement (devient une prot de fusion
De quelle façon les domaines de liaison à l’ADN lient l’ADN?
Ils sont formés d’une hélice qui s’insère dans le sillon majeur qui reconnait des séquences spécifiques
Qu’est un homéodomaine?
Un domaine de liaison à l’ADN formé de plusieurs hélices, une reconnaissant la séquence d’ADN, l’autre sert au bon positionnement sur la charpente
Vrai au faux : les homéodomaines sont des homodomères
Faux ,ils sont souvent des hétérodimères, mais peuvent tout aussi bien être des homodimères
Quel est l’avantage d’avoir des hétéromères comme domaine de liaison à l’ADN?
Permet d’augmenter la complexité et de permettre un nombre plus élevé de combinaison permettant de controler finement le transcriptome avec un nombre limité de TF