Chapitre 7 génétique et étude de la résistance aux bactéries Flashcards

1
Q

Variation phénotypique et génotypiques des bactéries

Si on met des bactéries en culture dans un milieu contenant du goudron, des bactéries peuvent elles pousser ?

Expliquer ce phénomène.

A

Oui. Après une grande période d’adaptation, ces bactéries poussent.

Variation du phénotype. : c’est une simple adaptation des bactéries ayant le même génotype à des nouvelles conditions de vie. Elle n’est pas transmissible à la descendance.

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Q

Variation phénotypique et génotypiques des bactéries

A
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3
Q

Variation phénotypique et génotypiques des bactéries

Qu’est ce que la variation génotypique ou variation génétique ou mutation ?

A

Il s’agit d’un changement spontané ou induit, rare, discontinu, indépendant, touchant un gène donné d’une bactérie. On parle de souche bactérienne mutée par rapport à une souche sauvage. La mutation se transmet à la descendance

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4
Q

Variation phénotypique et génotypiques des bactéries

A
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Q

Variation phénotypique et génotypiques des bactéries

Qu’est ce que la tuberculose ?

A

C’est une maladie bactérienne grave qui peut prendre plusieurs formes. La forme pulmonaire est la plus contagieuse. Transmission aérienne comme le Covid-19. La tuberculose est causée par Mycobacterium tuberculosis ou bacille de Koch (BK)

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6
Q

Variation phénotypique et génotypiques des bactéries

Si on met en culture 100 BK dans un milieu de culture solide A (contenant un antibiotique) et 100 BK dans un milieu de culture solide B (sans antibiotique).
Apès incubation, combien compte on de colonie dans le milieu A et B ?

A

Après incubation, on compte 100 colonies dans le milieu B et 0 colonie dans le milieu A.

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7
Q

Variation phénotypique et génotypiques des bactéries

Si on met 10^5 BK dans le milieu A et 10^5 BK dans le milieu B. Après incubation, combien compte on de colonies dans le milieux A et B ?

A

Après incubation, on compte 10^5 colonies dans le milieu B et 1 colonie dans le milieu A

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8
Q

Variation phénotypique et génotypiques des bactéries

Que peut on remarquer après le trouble bactérien, quand on met en culture la même quantité des bactéries dans le milieu A solide et dans le milieu B solide ?

A

On compte le même nombre de colonies dans les deux milieux.

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9
Q

Variation phénotypique et génotypiques des bactéries

Que trouve t on dans la colonie bacérienne du milieux A ?

A

Elle contient des BK mutants résistants. Dans toute population sauvage, il existe un ou plusieurs mutants.

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10
Q

Variation phénotypique et génotypiques des bactéries

Quelle est la probabilité d’apparition d’un BK mutant à un antibiotique ?
Nommer ce phénomène.
Comment traiter cela ?

A

La probabilité d’apparition d’un BK mutant à un antibiotique est de 1/10^6. Voilà pourquoi on parle de la spontanéité des mutations. Si dans une lésion tuberculeuse il y a 10^9 BK. Si vous traitez cette lésion avec un seul antibiotique, on sélectionne un nombre de résistant égal à 10^9 / 10^6 soient 1000 BK.

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11
Q

Transfert de matériel génétique

En dehors des mutations qui modifient le patrimoine des bactéries, par quoi le patrimoine génétique d’une bactérie peut il être modifiée ?

A

Le patrimoine génétique d’une bactérie peut être modifiée par l’acquisition de fragments d’ADN ou exogénote.

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12
Q

Transfert de matériel génétique

Comment se fait l’aquisition de la transformation bactérienne ?

A

Cette acquisition peut se faire :
o De façon légitime, cas de la transformation bactérienne, la conjugaison bactérienne et de la fixation d’un transposon.
o De façon illégitime, lors de la transduction et la conversion lysogènique.
Ce mécanisme a été décrit pour la première fois par Griffith en 1928. Il travaillait sur l’épidémiologie du Streptococcus pneumoniae.

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13
Q

Transfert de matériel génétique

Sous quelles formes la bactérie existe t elle ?

A

o Une forme encapsulée (forme Smooth) qui donne des colonies lisses en culture ;
o Une forme non capsulée (forme Rough) qui donne des colonies rugueuses en culture.
La forme S donne une septicémie mortelle chez la souris. La forme R n’est pas virulente chez la souris.
GRIFFITH avait incubé un lysat de la forme S et les bactéries R vivantes. Il avait isolé des bactéries S vivantes. GRIFFITH avait conclu à l’existence d’un facteur transformant.
En 1944, Avery, Mac Carty et Mc Leod avaient démontré que le facteur transformant était de l’ADN, ils ont publié la notion de support d’hérédité de l’ADN. La transformation bactérienne n’est qu’un processus mineur dans la variabilité génétique des bactéries.

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14
Q

Transfert de matériel génétique

Qu’est ce que la transduction et la conversion ?

A

C’est un mécanisme de transfert d’un gène bactérien vers une autre bactérie par l’intermédiaire d’un phage (bactériophage).

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15
Q

Transfert de matériel génétique

Quels sont les deux types de transduction ?

A

o La transduction généralisée, qui permet le transfert de n’importe quel gène bactérien. Elle est assurée par des phages virulents.
o La transduction restreinte ou spécifique, qui transfert un gène spécifique. Elle est assurée par un phage tempéré lors de la sortie d’un cycle lysogènique.

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16
Q

Transfert de matériel génétique

Qu’est ce que la conversion lysogénique ?

A

Certains phages qui infectent les bactéries, font un cycle lysogènique en intégrant leur génome dans l’ADN de la bactérie. Le matériel phagique intégré est appelé Prophage
Lorsque la bactérie exprime un caractère somatique phagique, on parle de conversion bactérienne.

17
Q

La conjugaison bactérienne aux antibiotiques

Qu’est ce que la conjugaison bactérienne aux antibiotiques ?

A

 Mécanisme de transfert de gènes entre une bactérie male et une bactérie femelle

18
Q

La conjugaison bactérienne aux antibiotiques

Comment se fait la conjugaison bactérienne aux antibiotique ?

A

Le mâle porte le gène F qui permet l’expression du pilus sexuel. Lorsque le gène F est localisé dans le chromosome bactérien, le mâle est qualifié Hfr. Lorsque le gène est localisé dans le plasmide, le mâle est qualifié F+. La conjugaison entre un mâle Hfr et une femelle ne change pas le thalle des bactéries. La conjugaison entre le mâle F+ et la femelle donne deux mâles F+. Le facteur F passe toujours en dernier.

19
Q

La résistance aux antibiotiques

Quels sont les différents mécanismes de résistance aux AB selon les bactéries ?

A
  • Soit la cible de l’antibiotique est absente des bactéries.
    Ex pour les Mycoplasmes, il y a une résistance naturelle aux bêta lactamines car elles n’ont pas de paroi.
  • Soit la cible des AB est peu accessible, exemple chez les bactéries gram- les macrolides passent difficilement dans le cytoplasme.
  • Soit la modification de l’affinité de la cible
  • Soit la présence des enzymes inactivant l’antibiotique, cas des bêta lactamases.
  • Soit la mise au point d’un mécanisme d’efflux de l’antibiotique
20
Q

La résistance aux antibiotiques

Qu’est ce que la résistance naturelle ou primaire ?

A

Elle est présente chez les bactéries d’une même espèce. Les gènes de cette résistance sont portés par le chromosome. Elle concerne une seule famille d’AB

21
Q

La résistance aux antibiotiques

Qu’est ce que la résistance acquise ou secondaire ?

A

Constitue le mécanisme principal

C’est une résistance qui apparaît au sein d’une espèce habituellement sensible. Elle peut être chromosomique ou plasmidique. Elle concerne plusieurs familles d’AB

22
Q

La résistance aux antibiotiques

Comment s’effectue la sélection des souches résistantes ?

A

La cause principale de la sélection des mutants résistants est la mauvaise antibiothérapie (mésusage). Mais, cette sélection se fait aussi lors des contacts avec des bactéries commensales, et lors de la transmission interhumaine des bactéries résistantes.

23
Q

Les modalités et les effets des AB

Qu’est ce que le diagnostic clinique ?
Donner des exemples.

A

Elle basée sur l’analyse des signes et symptômes. Les signes sont objectifs c a d ils sont constatés par le praticien.
Ex fièvre, anomalie de reflexe Les symptômes sont subjectifs : fatigue, douleur, vertiges, vomissement, diarrhée.

24
Q

Les modalités et les effets des AB

Quels sont les éléments a demander dans l’interrogatoire :

A

allure de la fièvre, rechercher les signes traduisant la souffrance d’un organe, les ATCD, sujet contact, vaccination et notion de voyage.
Toute suspicion d’une infection nécessite une confirmation microbiologique.

25
Q

Les modalités et les effets des AB

A
26
Q

Les modalités et les effets des AB

Qu’est ce que le diagnostic bactériologique ?
Que contient il ? Préciser

A

Prélèvement pathologique : selon le contexte clinique on prélève le sang, l’urine (ECBU), les selles, le LCR, LBA, prélèvement cervico-vaginal…
Examen macroscopique de prélèvement : Ex pour les selles : mousseuses, jus de melon. L’odeur caractéristique
Examen microscopique directe : A l’état frais pour étudier la cytologie. Après coloration au gram : g+ ou g-. Dans le cas des crachats coloration de Ziehl pour voir les BAAR

27
Q

Les modalités et les effets des AB

Quelles sont les différentes cultures des bactéries ?

A

o Uroculture : culture d’un échantillon d’urine
o Coproculture : Culture des selles
o Hémoculture : Culture de sang

28
Q

Les modalités et les effets des AB

Comment identifier les différentes bactéries ?

A

Par une série des tests en galerie.

29
Q

Les modalités et les effets des AB

Qu’est ce qu’un antibiogramme ?

Comment réalise t on un antibiogramme ?

A

Nom de la bactérie il comporte deux mots latins ; le premier mot s’écrit toujours en majuscule, il désigne le genre de la bactérie. Le second mot s’écrit en minuscule, il désigne l’espèce de la bactérie
Exemple : Mycobacterium tuberculosis / Genre Mycobacterium espèce : tuberculosis

NB: lorsque l’espèce n’est pas connue on met sp
Exemple : Staphylococcus sp
Dans un cadre épidémique, il est impératif de donner le sérotype (en utilisant les anticorps) ou un lysotypie en utilisant les phages.
Ex Salmonelle typhi sérotype 1 / Staphylococcus aureus lysotype a

30
Q

Les modalités et les effets des AB

Qu’est ce que le diagnostic indirect ou sérologique ?

A

Il est basé sur la séroconversion avec augmentation du taux des anticorps.

31
Q

Les modalités et les effets des AB (diagnostic indirect/sérologique)

Lors d’une primo-infection, quand les premiers anticorps apparaissent il en moyenne ?
Lesquels sont il ?
Quand disparaissent ils ?

A

les premiers anticorps apparaissent en moyenne au bout de 7 jours et atteignent leur acrophase (pic) au bout de 15 à 22 jours. Les premiers anticorps qui apparaissent en primo-infection sont des IgM. Ils disparaissent au bout de 4 mois.

32
Q

Les modalités et les effets des AB

Quels sont les les anticorps sériques majoritaires de la phase tardive ?

A

Les ac sériques majoritaires de la phase tardive sont les IgG qui persistent à des taux variables durant toute la vie à cause de B mémoire et des plasmocytes à très longue durée de vie.

33
Q

Les modalités et les effets des AB

QUe témoignent les IgM ?

A

Lors de l’examen sérologique, la présence des IgM témoigne d’une immunisation récente (< à 3 – 4 mois)

34
Q

Les modalités et les effets des AB

A
35
Q

Les modalités et les effets des AB

En cas d’infection tardive ou de réactivation, qu’observe t on ?

A

En cas d’infection tardive ou de réactivation, il y a une montée des IgG. Qui est confirmée en comparant les taux dans deux sérums à 15 jours d’intervalle. Dans le deuxième sérum il y a 4 fois plus d’AC que dans le premier.

36
Q

Les modalités et les effets des AB

Quel est la spécficité des IgG ?

A

Les IgG sont les seules immunoglobulines qui traversent le placenta, elles peuvent passer de la mère vers le fœtus.

37
Q

Les modalités et les effets des AB

Quelles sont les propriété interressante du diagnostic sérologique ?

A

Le diagnostic sérologique est rapide, il est réalisé pour certaines bactéries qui poussent difficilement en culture.

38
Q

Les modalités et les effets des AB

Qu’est ce que le Test ELISA ?
Quelle est son utilité ?

A

Cette technique est utilisée en diagnostic et en recherche. Elle est basée sur la réaction Ag-AC et une coloration par une réaction enzymatique.
Utilités :
o Dosage d’un antigène dans le surnageant de culture cellulaire, dans le plasma ou dans un lysat des cellules (ELISA directe)
o Dosage des anticorps dans le sérum lors des infections et dans les maladies auto-immunes. (ELISA indirecte)