Chapitre 6 Flashcards
Définissez le transport vésiculaire par exocytose
Voie de biosynthèse et de sécértion allant de l’intérieur vers l’extérieur, soit à partir du RE à l’extérieur
Définissez le transport vésiculaire par endocytose
Voie allant de la membrane vers les endosomes et les lysosomes
Vrai ou faux
Chaque vésicule est sélective
Vrai
Comment est-ce que les vésicules maintiennent leur identité?
Grâce à la composition de leur membrane
Que peut-on retrouver à la surface cytosolique?
Des marqueurs qui servent de signal de guidage et qui assurent la fusion avec le bon compartiment
Quel est le rôle du manteau?
Sert de cage protéique qui permet la concentration des protéines membranaires spécifiques, facilite la sélection des molécules pour le transport et moule la vésicule en un treillis en forme de panier
Quelles sont les trois grandes classes de vésicules?
- Clathrine
- COPI
- COPII
Quelle est la différence entre les clathrines et COPI/II?
Les clathrines partent de la membrane plasmique ou de Golgi vers les endosomes tandis que COPI/II partent du Golgi ou du RE
Vrai ou faux
Malgré l’absence de manteau, la vésicule reste spécifique
Faux
Pas de manteau = pas de spécificité
Vrai ou faux?
Il exste uen grande variété de vésicules avec pas de fonctions
Vrai
De quoi est composé la clathrine?
Elle est composée de 3 peptides qui forment une structure à 3 bras. Elles sont assemblées en forme de panier sur la surface externe de la membrane.
Quel est le rôle des bras de la clathrine?
Lient l’actine du cytoquelette ce qui permet de contibuer au bourgeonnement de la membrane
Quel est le rôle de la protéine adaptatrice dans la clathrine?
Forment une deuxième couche entre la clathrine et la membrane en les liants ce qui permet de pièger les protéines transmembranaires (récepteurs et protéines de chargement)
Quelles sont les étapes de formation de vésicules à clathrine?
- Les récepteurs de chargement et les protéines solubles sont empaquetées dans chaque vésicules de transport recouverte de clathrine
- Il va y avoir un assemblage successif qui génère des forces permettant la formation de vésicules
- Le manteau de clathrines est éliminé après la formation de la vésicule
Quelle est l’utilité d’avoir différentes protéines adaptatrices?
Chacune est spécifique à un groupe de récepteurs de chargement ce qui permet d’avoir la formation de différents types de vésicules à clathrine
Décrivez l’assemblage des adaptines à la membrane
Il est très contrôlé via les interactions avec les autre protéines membranaires. Ça assure la bonne formation et le bon voyagement de la vésicule
Décrivez l’exemple de l’adaptine AP2
AP2 lie un PIP ce qui permet l’exposition du site de liaison pour le récepteur de chargement possédant des signaux d’endocytose. Ces signaux permettent l’amplification de la liaison AP2 à la membrane et stimule la courbature de la membrane avec les clathrines
Vrai ou faux?
AP2 ne se lie qu’à des PIP
Vrai, il requiert les signaux de PI
Qu’est-ce qu’un détecteur de coïncidence?
C’est une molécule qui a besoin d’au moins deux signaux pour être activée
Quel est le rôle des phospho-inositides membranaires?
Ils ont des fonctions régulatrices importantes et sont des marqueur d’identité de la vésicule
Comment est ce que les PI peuvent réaliser leurs différents rôles?
Ils peuvent être phosphorylé et déphosphorylé générant différents PIP en position 3, 4 et 5
Que permet la régulation des PIPs?
C’est la distribution et la régulation de enzymes qui déterminent la distribution de chaque sorte de PIP dans les différentes organels
Plus précisément, comment est-ce que les PIP permettent une fonction régulatrice?
Les groupements de têtes de PIP sont reconnus par des protéines spécifiques ce qui permet le recrutement d’adaptine spécifiques dans des régions spécifiques
Décrit moi en résumé le principe des phospho-inositides membranaires
Le type de kinase/phosphatase présent localement va influencer la sélection de PI/PIP. Ensuite, ça va avoir un effet sur la sélection d’adaptine spécifique ce qui détermine la sorte de vésicule
Comment est-ce que la vésicule permet de se séparer de la membrane?
Il y a la dynamine et d’autres protéines cytosoliques qui s’assemblent autour du col du bourgeon. Il va y avoir une séparation par pincement
Quel est le domaine de dynamine?
Domaine PI (4,5) P2
Que se passe-t-il lorsque la vésicule est libérée?
Une PIP phosphatase élimine le PI(4,5)P2 ce qui déstabilise l’acrochage de l’adaptine/récepteur de chargement qui mène ensuite à la perte des protéines adaptatrices. Cette perte mène à la perte du manteau de la vésicule
Quelle est la voie de régulation dans une cellule pour l’assemblage du manteau?
C’est les GTPases de recrutement
Quelle est la différence entre la voie PIP et GTPases de recrutement?
PIP c’est pour l’assemblage de la clathrine sur la membrane plasmique
GTPases c’est pour l’assemblage du manteau pour les vésicules ne partant pas du manteau (COPI, COPII et clathrine sur endosome)
Décrivez les GTPases monomériques
Ce sont des commutateurs moléculaires, passant d’un état actif (GTP) et un état inactif (GDP)
Quel est l’action des GAP et des GEF sur les GTPases?
Les GEF activent les protéines en catalysant l’échange du GDP en GTP
Les GAP inactivent les protéines par l’hydrolysedu GTP en GDP
Que sont Arf et Sar1?
Ils sont tous deux des GTPases qui:
Arf permet l’assemblage de vésicules COPI et les clathrines sur le golgi
Sar1 assemble les vésicules COPII sur le RE
Quel est le rôle de Arf et Sar1
Ils permettent le contôle des aspects spaciaux et temporels des échanges membranaires et sont présentes à hautes concentrations dans le cytosol
Quelle est la forme inactive et active de Arf et Sar1?
Forme inactive: lié au GDP
Forme active: lié au GTP
Décrivez la formation d’une vésicule COPII avec Sar1
Après le signal provenant de la lumière du RE, Sar1-GEF qui lie Sar1-GDP va libérer le GDP et fixer le GTP ce qui permet d’exposer l’hélice amphiphile ainsi que son insertion dans la membrane. Il va y avoir ensuite recrutement des protéines complèxes COPII et formation du bourgeonnement membranaire avec le récepteur et sa charge.
On finit par une séparation par pincement et libération de la vésicule.
Vrai ou faux?
Les vésicules COPII vont perdre leur manteau immédiatement après libération
Faux, ils ne le perdent pas immédiatement
Quelles sont les protéines complexes de COPII?
Sec23/24 et Sec13/31
Comment se produit la dissociation du manteau de COPII?
Sar1 va jouer un rôle dans la dissociation du manteau via hydrolyse par GAP du GTP en GDP sur Sar1 induisant une sortie de Sar1 de la membrane
Vrai ou faux?
Le recrutement de Sar1 par GEF doit être plus rapide que la dissociation
Explique ta réponse
C’est vrai si on veut qu’il y ait formation d’une vésicule
Comment est-ce que les vésicules font pour arriver à la bonne destination dans un cytoplasme bruyant?
La spécificité de reconnaissance se fait par les marqueurs de surface sur les vésicules selon l’origine et la cargaison et sur membrane cibles (récepteurs complémentaires)
Quel est le système en deux étapes qui permet l’arrimage des vésicules?
- Protéines et effecteurs Rab dirigent vers la cible spécifique
- Protéines et régulateurs SNARE servent d’intermédiaire de fusion des bicouches lipidiques
Vrai ou faux?
La distribution sélective des protéines Rab en fait des marqueurs efficaces pour identifier différentes membranes
Vrai
Quels sont les deux états de la protéine Rab?
Inactive lorsque lié au GDP, elle lie une GDI qui est inhibiteur qui le garde soluble
Active lorsque lié au GTP, elle lie une membrane et aux effecteurs Rab
Quel est le rôle des effecteurs Rab?
Facilitent le transport vésiculaire, l’arrimage, la fusion
Quelles sont les différentes structures des effecteurs Rab?
- Protéines motrices qui les propulsent la vésicule sur le MF ou MT
- Complexes reliant 2 membranes proche
- Peuvent intéragir avec les SNARES
Quel est le rôle des protéines SNARES?
Catalyser la fusion des vésicules
Quels sont les deux types de SNARES?
SNARE-v qui sont des chaînes uniques et propres à chaque vésicule
SNARE-t qui se trouve sur les cibles. Ce sont 3 protéines
Expliquez l’interaction entre SNARE-v et -t
Leur domaines hélicoïdaux particuliers permettent de s’enrouler l’un autour de l’autre et forment un faisceau à 4 hélices
Quel SNARE qui permet le verrouillage des deux membranes ensemble?
Trans-SNARE
Vrai ou faux?
L’appariement des SNARE-v et -t est très spécifique
Vrai
