CHAPITRE 4 Flashcards

1
Q

MITOCHONDRIE ET PRODUCTION D’ÉNERGIE

C’est le cycle de Krebs et la chaîne de transport d’électrons (système OXPHOS) qui ont pour fonction de produire l’essentiel de l’énergie cellulaire!

Cycle de Krebs: oxydation de l’… et formation de … réduites.

Système OXPHOS: oxydation de … réduites, consommation d’… et production d’…

A

Cycle de Krebs: oxydation de l’acétyl-CoA et formation de coenzymes réduites.

Système OXPHOS: oxydation de coenzymes réduites, consommation d’oxygène et production d’ATP.

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2
Q

Qui est le = «principaux organites producteurs d’énergie chez les organismes pluricellulaires».

A

Mitochondrie :)

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3
Q

LE CYCLE DE KREBS

Étape finale du catabolisme oxydatif des glucides, des acides gras et des acides aminés et qui assure la plus grande part des besoins énergétiques de la cellule.

Cet important apport en énergie est rendu possible grâce à l’oxydation de l’… et la formation de … réduits qui seront oxydés dans la chaîne respiratoire.

Il a lieu dans la … chez les eucaryotes, tout comme la b-oxydation, la cétogenèse et la phosphorylation oxydative.

Il fait intervenir un enzyme attaché à la membrane interne de la mitochondrie (le succinate déshydrogénase) et sept autres dispersés dans la matrice mitochondriale.

A

Cet important apport en énergie est rendu possible grâce à l’oxydation de l’acétyl-CoA et la formation de coenzymes réduits qui seront oxydés dans la chaîne respiratoire.

Il a lieu dans la mitochondrie chez les eucaryotes, tout comme la b-oxydation, la cétogenèse et la phosphorylation oxydative.

Il fait intervenir un enzyme attaché à la membrane interne de la mitochondrie (le succinate déshydrogénase) et sept autres dispersés dans la matrice mitochondriale.

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4
Q

CYCLE DE KREBS
RETENIR
RX 1-3-4-5-6-8

A
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5
Q

BILAN DU CYCLE DE KREBS

À la fin des huit réactions du cycle, pour chaque acétyl-CoA, il se génère:
? NADH+H+
? FADH2
? ATP (à partir du GTP)
? dioxyde de carbone (CO2)

A

À la fin des huit réactions du cycle, pour chaque acétyl-CoA, il se génère:
3 NADH+H+
1 FADH2
1 ATP (à partir du GTP)
2 dioxyde de carbone (CO2)

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6
Q

3 ÉTAPES DE RÉGULATION DU CYCLE DE KREBS (IRRÉVERSIBLES)

Le citrate synthase;
- activateurs = 2
- inhibiteurs = 3

L’isocitrate DH;
- activateurs = 3
- inhibiteurs = 3

L’α-cétoglutarate DH;
- activateurs = 3
- inhibiteurs = 3

A

Le citrate synthase;
- activateurs = NAD+ et ADP;
- inhibiteurs = NADH+H+, ATP et citrate;

L’isocitrate DH;
- activateurs = NAD+, ADP et calcium;
- inhibiteurs = NADH+H+, ATP et α-cétoglutarate;

L’α-cétoglutarate DH;
- activateurs = NAD+, ADP et calcium;
- inhibiteurs = NADH+H+, ATP et succinyl-CoA.

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7
Q

À noter qu’il n’y a pas de régulation par phosphorylation ou déphosphorylation des protéines

A
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8
Q

Effet d’une … dans les cellules hépatiques:

  • transport du citrate dans le cytosol pour produire, selon les besoins, des AG et/ou des TAG.
A

Effet d’une inhibition dans les cellules hépatiques:
- transport du citrate dans le cytosol pour produire, selon les besoins, des AG et/ou des TAG.

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9
Q
A
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10
Q

«Pour que le cycle de Krebs puisse se poursuivre, il faut que les coenzymes réduites NADH+H+ et FADH2, qui portent leurs électrons supplémentaires dans des liaisons riches en énergie, soient … ».

A

«Pour que le cycle de Krebs puisse se poursuivre, il faut que les coenzymes réduites NADH+H+ et FADH2, qui portent leurs électrons supplémentaires dans des liaisons riches en énergie, soient oxydées».

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11
Q

LE SYSTÈME OXPHOS

La fonction du système OXPHOS = «coordonner le transfert des … associés au … et au … vers l’O2 et la synthèse d’ATP».

Ces protons (électrons) sont d’abord transportés au sein des complexes ? (4) du système OXPHOS.

Le transfert de ces protons entre les 4 … est couplé au passage d’autres protons H+ déjà présents dans la matrice vers l’espace ….

L’énergie emmagasinée (= gradient de protons) est ensuite utilisée au sein du complexe ? pour générer l’ATP.

⭐️En fait, le complexe V est activé par le passage des protons de l’espace intermembranaire vers la matrice.

Les ATP formés seront transportés vers le … via l’antiport … (échangeur ADP/ATP) afin qu’ils soient utilisés pour combler les besoins énergétiques de la cellule.

A

La fonction du système OXPHOS = «coordonner le transfert des protons H+ associés au NADH+H+ et au FADH2 vers l’O2 et la synthèse d’ATP».

Ces protons (électrons) sont d’abord transportés au sein des complexes I, II, III et IV du système OXPHOS.

Le transfert de ces protons entre les 4 oxydoréductases est couplé au passage d’autres protons H+ déjà présents dans la matrice vers l’espace intermembranaire.

L’énergie emmagasinée (= gradient de protons) est ensuite utilisée au sein du complexe V pour générer l’ATP.

En fait, le complexe V est activé par le passage des protons de l’espace intermembranaire vers la matrice.

Les ATP formés seront transportés vers le cytosol via l’antiport ANT (échangeur ADP/ATP) afin qu’ils soient utilisés pour combler les besoins énergétiques de la cellule.

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12
Q

Dans le système OXPHOS, qui s’occupe de transférer des é ?

A

FMN
FAD
UBIQUINONE/UBIQUINOLE
CYTOCHROME C

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13
Q

LES COMPLEXES DU SYSTÈME OXPHOS

Quel est le complexe I et sa fonction ?

A
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14
Q

OXPHOS

Quel est le complexe II et sa fonction ?

A
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15
Q

OXPHOS

Quel est le complexe III et sa fonction ?

A
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16
Q

OXPHOS

Quel est le complexe IV et sa fonction ?

A
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17
Q

OXPHOS

Quel est le complexe V et sa fonction ?

A
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18
Q

OXPHOS

Qui peut transporter 2 protons ?
Capable d’accepter et de transporter 2 électrons.

A

FMN et FAD

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19
Q

CYTOCHROME C

Protéine … impliquée dans le transfert des électrons entre les complexes ? et ? de la chaîne respiratoire.

A

Protéine soluble impliquée dans le transfert des électrons entre les complexes III et IV de la chaîne respiratoire.

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20
Q

COENZYME Q (UBIQUINONE)
Dérivé de …, caractérisé par une longue chaîne … (hydrophobe) : … , donc intégré dans la …

Rôle = capter les électrons venant des complexes ? et ? et de les transférer au complexe ?

A

Dérivé de benzoquinone, caractérisé par une longue chaîne isoprénoïque (hydrophobe) = liposoluble, donc intégré dans la membrane

Rôle = capter les électrons venant des complexes I et II et de les transférer au complexe III

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21
Q

MÉCANISME DE TRANSFERT DES ÉLECTRONS

22
Q

LE COMPLEXE I (NADH-UQ RÉDUCTASE)

  • Le flot des électrons circule d’abord du … (cytosol et mitochondrie) au …
  • du … au … (= UQH2)

Combien de protons pompés ?

A
  • Le flot des électrons circule d’abord du NADH+H+ (cytosol et mitochondrie) au FMN
  • du FMNH2 au coenzyme Q (= UQH2)

4 protons pompés

23
Q

COMPLEXE II ( SUCCINATE-UQ RÉDUCTASE)

  • Le flot des électrons circule d’abord du … (ou du glycérol-3P) au … (= FADH2)
  • Du … au … (= UQH2)

Combien de protons pompés ?

A
  • Le flot des électrons circule d’abord du succinate (ou du glycérol-3P) au FAD (= FADH2)
  • Du FADH2 au coenzyme Q (= UQH2)

Ne contribue pas à la création d’un gradient de protons. = Aucun proton pompé.

24
Q

LE COMPLEXE III (UQH2-CYTO C RÉDUCTASE)

Le complexe III oxyde l’… en …, les e- transférés servant à réduire le …

Le … et l’… sont des **transporteurs mobiles **

Ils transfèrent les e- entre les complexes

combien d’électrons sont pompés ?

A

Le complexe III oxyde l’UQH2 en UQ, les e- transférés servant à réduire le cytochrome C

4 protons pompés

25
# LE COMPLEXE IV (CYTOCHROME C OXYDASE) Finalement, le complexe IV couple l’oxydation du ... à la réduction d’... en ... Combien d'électrons pompés ?
Finalement, le complexe IV couple l’oxydation du **cytochrome C** à la réduction d’**oxygène en eau** **2 protons sont pompés**.
26
# LE DEVENIR DES PROTONS POMPÉS PAR LES COMPLEXES 1, 3 ET 4 OXPHOS - Augmentation de [?] dans l'**espace intermembranaire**. - Production d’un ... ... - Différence de potentiel électrique et un gradient de pH entre l'... et la ... Dissipation : Retour des ... vers la ... pour rééquilibrer les charges : **Pas à travers I, II, III, IV ni par diffusion** QUEL ALORS EST LE MOYEN POUR REGAGNER LA MATRICE ?
- Augmentation de [**H+**] dans l'espace intermembranaire. - Production d’un **gradient électrochimique** - Différence de potentiel électrique et un gradient de pH entre l'**espace intermembranaire** et la **matrice** Dissipation : Retour des **protons** vers la **matrice** pour rééquilibrer les charges : Pas à travers I, II, III ni IV, Ni par diffusion !!!!! **Un moyen pour regagner la matrice est de passer au travers du complexe V, l'ATP synthase!**
27
# STRUCTURE ET FONCTION DE L'ATP SYNTHASE Fonction: «transporter des protons le long du ... ... (ou force proton-motrice) et de récupérer l'énergie pour fabriquer de l'... à partir de l’... et du ... (Pi)».
Fonction: «transporter des protons le long du **gradient électrochimique** (ou force proton-motrice) et de récupérer l'énergie pour fabriquer de l'**ATP** à partir de l’**ADP** et du p**hosphate inorganique** (Pi)».
28
# STRUCTURE ET FONCTION ATP SYNTHASE L'ATP synthase est composée de deux grandes parties facilement séparables par une coupure ...: 1) Le domaine ... , un complexe ... intégré à la ... **Rôle**: - Transport ... des protons ... vers la ... - La **stœchiométrie** des sous-unités est **1a, 2b, 12c.** 2) Le domaine ..., qui est ..., qui est périphérique ou ... **Rôle**: - Synthèse de l’... à partir de ... et ... - La stœchiométrie des sous-unités est **3a, 3b, 1d, 1g, 1e** - F1 est lié à Fo par une courte tige, les sous-unités ... (dimère = 2b)
L'ATP synthase est composée de deux grandes parties facilement séparables par une coupure **protéolytique**: - Le **domaine F0**, un complexe **protéique** intégré à la membrane. Rôle: Transport **sélectif** des protons H+ vers la **matrice** La stœchiométrie des sous-unités est 1a, 2b, 12c. - Le **domaine F1**, **hydrophile**, qui est périphérique ou **extrinsèque** Rôle: Synthèse de l’**ATP à partir de Pi et ADP** La stœchiométrie des sous-unités est 3a, 3b, 1d, 1g, 1e F1 est lié à Fo par une courte tige, **les sous-unités b2** (dimère = 2b)
29
VOIR VIDEO ATP SYNTHASE | https://www.youtube.com/watch?v=k_DQ1FjFuYM
30
# FONCTIONNEMENT DE L'ATP SYNTHASE L'ATP synthase est composée d'une partie ... (stator) et d'une partie ... (rotor). Les sous-unités **a, b, alpha, beta et delta** constituent le ... Les sous-unités **c, epsilone et gamma** constituent le ... Le passage des **protons H+** à l'interface entre le rotor et le stator dans le domaine membranaire ... cause la ...
L'ATP synthase est composée d'une **partie fixe** (stator) et d'une **partie mobile** (rotor). Les sous-unités a, b, a, b et d constituent le **stator** Les sous-unités c, e et g constituent le **rotor**. Le passage des protons H+ à l'interface entre le rotor et le stator dans le **domaine membranaire F0** cause la **rotation**.
31
# FONCTIONNEMENT DE L'ATP SYNTHASE * La rotation des sous-unités Gamma-Epsilone déforme les sous-unités alpha-beta du domaine extra-membranaire ... - La rotation causée par le passage des protons H+ est nécessaire à la synthèse d'... À noter : il faut le passage des ? protons H+ vers la matrice pour former une molécule d’ATP
* La rotation des sous-unités ge déforme les sous-unités ab du domaine extra-membranaire **F1**. * La rotation causée par le passage des protons H+ est nécessaire à la synthèse d'**ATP**. À noter : il faut le passage des **3** protons H+ vers la matrice pour former une molécule d’ATP
32
# FONCTIONNEMENT DE L'ATP SYNTHASE Mécanisme: chacun des sites catalytiques formés par les sous-unités alpha-beta passe successivement par trois états caractérisés par des constantes d’affinité différentes pour les substrats (ADP +Pi) et le produit (ATP): Conformations: 1) « ... », 2) « ... » et 3) « ... »
Mécanisme: chacun des sites catalytiques formés par les sous-unités ab passe successivement par trois états caractérisés par des constantes d’affinité différentes pour les substrats (ADP +Pi) et le produit (ATP): Conformations: 1) « **ouverte** », 2) « **relâchée** » et 3) « **fermée** »
33
# MÉCANISMES DE CHANGEMENT DE LIAISONS Dans le site catalytique de l’ATP synthase, chaque module αβ passe successivement par les trois états en fonction de la rotation de la ... du rotor.
Dans le site catalytique de l’ATP synthase, chaque module αβ passe successivement par les trois états en fonction de la rotation de la **tige** du rotor 
34
# TRANSPORT DE L'ATP FORMÉ DANS LES MITOCHONDRIES L'ATP mitochondrial doit se diriger vers le ... pour y être utilisé pour les divers travaux cellulaires. Inversement, l'ADP et le H2PO4- (Pi) doivent entrer dans la ... pour la synthèse d'ATP. Combien ? protéines de transport localisées dans la membrane interne assurent ce cycle . L'... = ..., échangeur ... pour ... La ... = ... du H2PO4- et des protons H+ (ou, indistinctement, l'échange électroneutre entre H2PO4- pour OH-)
L'ATP mitochondrial doit se diriger vers le **cytosol** pour y être utilisé pour les divers travaux cellulaires. Inversement, l'ADP et le H2PO4- (Pi) doivent entrer dans la **mitochondrie** pour la synthèse d'ATP. **2 protéines** de transport localisées dans la membrane interne assurent ce cycle . L'**adénine nucléotide translocase ou ANT** = **antiport**, échangeur **ADP pour ATP** La **phosphate translocase** = **symport** du H2PO4- et des protons H+ (ou, indistinctement, l'échange électroneutre entre H2PO4- pour OH-)
35
# ANT OU ADÉNINE NUCLEOTIDE TRANSLOCASE **Antiport**: déplace l’... vers l'... contre l’... vers l'.... La réaction d'échange est ... et rendue possible par le composant électrique du gradient de protons H+. Force nécessaire pour la réaction d’échange = potentiel de membrane ... généré par le système OXPHOS : 1 charge ... par molécule d’ATP L’ATP est attiré vers les charges ... localisées dans la partie ... de la membrane ...
Antiport: déplace l’**ADP** vers l'**intérieur** contre l’**ATP** vers l'**extérieur**. La réaction d'échange est **électrogénique** et rendue possible par le composant électrique du gradient de protons H+. Force nécessaire pour la réaction d’échange = potentiel de membrane **POSITIF** généré par le système OXPHOS : 1 charge **négative** par molécule d’ATP L’ATP est attiré vers les charges positives localisées dans la partie **extérieure** de la membrane **interne**
36
# LA PHOSPHATE TRANSLOCASE (SYMPORT) Travaille en concert avec l’... : véhicule le transport de H2PO4- qui entre dans la matrice ... avec ? proton ...
Travaille en concert avec l’**ANT**: véhicule le transport de H2PO4- qui entre dans la **matrice mitochondriale** avec **UN proton H+**
37
# LA PHOSPHATASE TRANSLOCASE (SYMPORT) Force nécessaire pour l’échange = gradient de ... Coût de l’entrée = ? H+ par molécule d'ATP, ce qui contribue à dissiper le gradient ... et à rééquilibrer le ... entre la ... et l’espace ....
Force nécessaire pour l’échange = **gradient de pH**  Coût de l’entrée = **1 H+** par molécule d'ATP, ce qui contribue à dissiper le gradient **électrochimique** et à rééquilibrer le **pH** entre la **matrice** et l’**espace intermembranaire**.
38
# LES SYSTÈMES NAVETTES Contexte: Lors de la glycolyse, les cofacteurs ... produits doivent être transportés vers la chaîne de transport d’électrons ... pour produire de l’... Problème: les NADH+H+ sont incapables de franchir la membrane ... ... Solution: faire entrer les cofacteurs NADH+H+ cytosolique dans la mitochondrie sous une autre forme par 2 systèmes dits "**navettes**": 1) La navette ... 2) La navette du ... Bénéfices: - Le transfert des électrons du NADH+H+ dans la mitochondrie se fait par transfert des ... vers le ... ou le ... - La concentration de cofacteurs ... est restaurée dans le ...
Contexte: Lors de la glycolyse, les cofacteurs **NADH+H+** produits doivent être transportés vers la chaîne de transport d’électrons **mitochondriale** pour produire de l’**ATP**. Problème: les NADH+H+ sont incapables de franchir la membrane **mitochondriale interne**. Solution: faire entrer les cofacteurs NADH+H+ cytosolique dans la mitochondrie sous une autre forme par deux systèmes dits "navettes": 1) La navette **malate-aspartate** 2) La navette du **glycérol 3-phosphate** Bénéfices: - Le transfert des électrons du NADH+H+ dans la mitochondrie se fait par transfert des **protons H+** vers le **malate** ou le **glycérol 3-P** - La concentration de cofacteurs **NAD +** est restaurée dans le **cytosol**
39
# NAVETTE MALATE-ASPARTATE Système biochimique de ... des cofacteurs NADH+H+ de la ... sous forme de ... à travers la membrane ... de la ... pour la production d’... chez les ...
Système biochimique de **translocation** des cofacteurs NADH+H+ de la **glycolyse** sous forme de **malate** à travers la membrane **interne** de la mitochondrie pour la production d’**ATP** chez les **eucaryotes**
40
# NAVETTE MALATE-ASPARTATE La navette malate-aspartate comporte: 1) Les formes ... et ... du malate ..., ... et ... 2) Les formes cytosoliques et mitochondriales de l’..., ... et ... 3) ? protéines de transport ancrées dans la membrane interne de la mitochondrie : * l’... (AMK) qui échange ... de part et d'autre de la membrane un ... contre un ...; et * l’... (AAG) qui échange de la même façon, un ... contre un ...
La navette malate-aspartate comporte: 1) Les formes **cytosoliques** et **mitochondriales** du malate **déshydrogénase**, **MDHc et MDHm** 2) Les formes cytosoliques et mitochondriales de l’**aspartate aminotransférase**, **ASATc et ASATm** 3) **Deux** protéines de transport ancrées dans la membrane interne de la mitochondrie : - l’**antiport malate/a-cétoglutarate** (AMK) qui échange **réversiblement** de part et d'autre de la membrane un **malate** contre un **a-cétoglutarate**; et - l’**antiport aspartate/glutamate** (AAG) qui échange de la même façon, un **aspartate** contre un **glutamate**
41
# NAVETTE MALATE-ASPARTATE * **Dans le cytosol**, les deux protons H+ du NADH+H+ sont transportés dans la matrice par le ..., formé par la ... à partir de l’... * **Dans la matrice**, les deux protons H+ du malate sont transférés vers un ... par la ... pour former du ... et de l’... Les deux protons H+ du NADH+H+ seront transférés au complexe ? de la chaîne de transport d’électrons.
Dans le cytosol, les deux protons H+ du NADH+H+ sont transportés dans la matrice par le **malate**, formé par la **MDHc** à partir de l’**oxaloacétate** Dans la matrice, les deux protons H+ du malate sont transférés vers un **NAD+** par la **MDHm** pour former du N**ADH+H+** et de l’**oxaloacétate**. Les deux protons H+ du NADH+H+ seront transférés au **complexe I** de la chaîne de transport d’électrons.
42
# NAVETTE DU GLYCÉROL-3-PHOSPHATE Système biochimique de translocation des cofacteurs NADH+H+ de la glycolyse sous forme de ... à travers la membrane ... de la mitochondrie.
Système biochimique de translocation des cofacteurs NADH+H+ de la glycolyse sous forme de **glycérol 3-phosphate** à travers la **membrane interne** de la mitochondrie.
43
La navette glycérol 3-P comporte: 1) Les formes **cytosoliques** et **mitochondriales** du **glycérol 3-P déshydrogénase** - **G3P-DHc, réaction**: ... + ... -> ... + ... - **G3P-DHm, réaction:** ... + ... -> ... + ... 2) Deux protéines de transport ancrées dans la membrane ... de la mitochondrie : - Un transporteur du **glycérol 3-P** ... vers la ... - Un transporteur du **DHAP** ... vers le ...
La navette glycérol 3-P comporte: 1) Les formes **cytosoliques** et **mitochondriales** du glycérol 3-P déshydrogénase * G3P-DHc, réaction: **DHAP + NADH+H+ -> glycérol 3-P + NAD+** * G3P-DHm, réaction: **glycérol 3-P + FAD -> DHAP + FADH2** Deux protéines de transport ancrées dans la membrane **externe** de la mitochondrie : Un transporteur du glycérol 3-P **cytosolique vers la matrice** Un transporteur du DHAP **mitochondrial vers le cytosol**
44
# LA NAVETTE DU GLYCÉROL 3-PHOSPHATE Dans cette navette, les ? électrons du NADH+H+ transportés par le **glycérol 3-P** sont transférés au complexe ? de la chaîne de transport d’électrons
Dans cette navette, les **2** électrons du NADH+H+ transportés par le glycérol 3-P sont transférés au **complexe II** de la chaîne de transport d’électrons
45
# OXYDATION DU NADH+H+ CYTOSOL PAR OXPHOS
46
# BILAN FORMATION D'ATP Combien faut-il de H+ pour former 1 ATP ?
4 H+ pour 1 ATP
47
# BILAN FORMATION ATP PAR MOL GLUCOSE Réactions/voies requises pour une production maximale d’**ATP en aérobie**: * La glycolyse + les systèmes navettes * L’oxydation du pyruvate en acétyl-CoA + le cycle de Krebs * La phosphorylation oxydative.
48
# BILAN ÉNERGÉTIQUE DE LA GLYCOLYSE La glycolyse consomme ? moles d’ATP Mais génère ? moles d’ATP par mole de glucose: Donc, elle produit au total: ? moles d'ATP ? moles de NADH+H+ ? moles de pyruvate
La glycolyse consomme **2** moles d’ATP... Mais génère **4** moles d’ATP par mole de glucose: Donc, elle produit au total: **2** moles d'ATP **2** moles de NADH+H+ **2** moles de pyruvate
49
# BILAN ÉNERGÉTIQUE OXYDATION PYRUVATE PAR LE PDH Le PDH produit par 1 mole de glucose: ? moles de NADH+H+ ? moles d’acétyl-CoA
Le PDH produit par mole de glucose: **2** moles de NADH+H+ **2** moles d’acétyl-CoA
50
# BILAN DU CYCLE DE KREBS Pour chaque mol de glucose : ? moles de NADH+H+ ? moles de FADH2 ? moles d’ATP (à partir du GTP)
**6** moles de NADH+H+ **2** moles de FADH2 **2** moles d’ATP (à partir du GTP)
51
# BILAN FORMATION ATP PAR MOL DE GLUCOSE
52