Chapitre 1 Flashcards
3 mécanismes de transport de protéines dans les organelles
1) Transport pores nucléaires : bidirectionnel, protéines repliées
2) Translocation ds membranes organelles: unidirectionnel, protéines dépliées
3) Transport vésiculaire (Cours de Tremblay)
Qui est responsable pour le ciblage des protéines dans les organelles, membranes et secretion?
Signal, sans signal prot reste ds cytosol
Facteurs modulant la localisation codée par les séquences signal (4)
1) struct prot
2) interact partenaire
3) modif post-trad
4) stimuli (infection, agonistes de recepteurs)
Structure noyau
Membrane interne: contient protéines
Membrane externe:
-en continuite avec RER
-contient ribosomes impliqués ds synthèse prot périplasmique
Quelles protéines sont transportées par les pores nucléaires? (3)
1) du cytosol au noyau: FT, ARN et ADN poly, histones
2) du noyau au cytosol: protéines associées au ARN (RNPs)
3) ss-u ribo (RNPs): protéines traduites ds le cytosol et importées au noyau assemblées avec ARNr (re sorties ds cyto)
Diffusion passive vs perméabilité sélective du NPC
Diffusion passive: petites molec <40 kDa (eau,sucres,ions)
Transport actif: >40 kDa bsn de prot transport
NPC = bidirectionnel et selectif
Cmt la structure des NPC facilite la diffusion passive bidirectionnelle? (3)
Fibrilles cytoplasmiques, reseau central et panier nucléaire
Composition du NPC (2)
-Couches concentriques formant tube central
-Nucléoporines (Nups) en particulier motifs hydrophobes FG (phe-gly) forment canal central —> empeche macromolec hydrophiles
Cmt traversent les macromolec a travers le NPC
cargo = prot a transp
facteur de transp transp prot
prot non liees exclues de lespace hydrophobe
2 types de signal de localisation nucleaire (NLS)
KKKRK
Signal en 2 parties avec aa basiques (sep par 10 aa)
Que fait une mutation ds le NLS
perte fct signal
Que faut il a la proteine au noyau pr etre exportee ds cyto
Signal dexport
Cest quoi une karyopherine
proteine de transport nuc
2 modes de reconnaissance prot cargo
liaison directe karyopherine
liaison indirecte adapteur
domaines des liaisons de karyopherines (3)
1- cargo
2- domaine HEAT hydrophobe pr lier Nups FG
3- GTPase Ran
V ou F il y a des karyopherines dimport et dexport
V
organisation des motifs HEAT des karyopherines
40 aa resid hydrophobes interagissant avec FG des Nups
organises en deux helices alpha relies par des coudes beta formant superhelice
Importine a vs importine b (3)
Importine a (adaptateur):
- contient motifs ARM qui lient NLS
- domaine IBB pr lier importine b
- struct coude similaire a importine b (pro-gly)
Importine b:
- contient motifs HEAT qui lient Nups
- domaine IBB pr lier importine a
- coude pro
cycle Ran GTPase
Import:
NLS cargo - importine - RanGDP va ds noyau (aide par NFT2)
RanGDP en RanGTP par RanGEF
RanGTP lie importine relachant cargo
Export:
NES cargo - exportine - RanGTP
RanGTP en RanGDP par RanGAP
RanGDP lie exportine relachant cargo
Chgmt confor Ran de GDP a GTP (3)
1- switch1 et 2 se rapprochent pr addition PO4 en y
2- c-term expose pr permettre liaison RanBD de RanBP2 a importine/exportine
3- RanBP2 facilite hydrolyse GTP par RanGAP
V ou F, ARNm exporte par karopherines
F, utilise un heterodimere. implique processus similaire avec Nups FG