Chap 9 : transcription Flashcards
Définition transcription=
procesus par lequel l’ARN correspondant à l’ADN d’un gène est transcit par l’ARN polymérase
V ou F : 1 transcription fait 1 copie d’ARN à partir d’1 gène
FAux : 1 transcription de nombreuses copies d’ARN sont produites d’un même gène
V ou F : 1 molécule d’ARN synthétise 1 protéine
faux: 1 ARN dirige la synthèse de plusieurs copies d’une même protéine
m
m
Quelle est l’ose de l’ARN
un ribose
Quelles sont les bases pyrimidiques et puriques de l’ARN
A C G U
V ou F : l’ARN possède 1 seule chaine nucléotidique assez courte.
vrai
Quelles sont les règles d’appariement d’ARN et le nombre de liaisons hydrogène par appariement
A et U (2 liaisons)
C et G (3 liaisons)
Quelles sont les 2 types de régions de la forme 3D de l’ARN?
- tiges : appariées
2. boucles : non appariées
Différences structurelles entre ADN et ARN:
- ARN est simple brin alors que l’ADN est double brin
- ARN a différents types de repliements pour faire une forme 3D
- ARN a un U au lieu d’un T
- ARN a un ribose et non pas un désoxyribose (OH sur son carbone 2)
Citer les types d’ARN
- ARN messager
- snRNA/snRNP : petits ARN nucléaires
- ARNr (ribosomal)
- ARNt (de transfert)
Pourquoi l’ARN porte un ribose et l’ADN un désoxyribose?
Puisque l’ARN est concu pour être utilisé comme matrice de traduction puis détruit, les groupes voisins du OH du ribose (C2 et C3) rendent l’ARN sensible à l’hydrolyse alcaline –> moins stable que l’ADN
Quel est le mécanisme de l’hydrolyse alcaline de l’ARN?
Un OH- libre extrait un H du 2’-OH en milieu basique pour générer un O- très réactif qui réagit avec le P adjacent en brisant le lien phosphodiester.
Puis, en présence d’H2O: liens phosphates (squelette sucre-phosphate) sont clivés
Pourquoi l’ADN n’a pas d’uracyle?
Car la désamination spontanée de la cytosine produit de l’uracyle et les enzymes de réparation de l’ADN ne pourraient pas distinguer les bases U mutées des U naturels.
Donc l’ADN contient de l’uracyle méthylé (thymine) au lieu de l’uracyle
Comment s’appelle la chaîne d’ARN produite par la transcription?
transcrit
V ou F : tout l’ADN est transcrit
Faux : seulement les portions appelées gènes
V ou F : 1 seul brin d’ADN sert de matrice pour l’ARN
Vrai
V ou F : L’ARN ne reste pas lié à la matrice d’ADN
Vrai: dès qu’un ribonucléotide est ajouté, l’hélice d’ADN se reforme et la chaine d’ARN est déplacée
Quelle est l’enzyme de transcription?
ARN pol
Dans quelle sens est la transcription de l’ARN?
5’–>3’
V ou F : la synthèse de l’ARN est antiparallèle et complémentaire
Vrai
Comment fonctionne l’ARN polymérase pour la synthèse d’ARN?
elle catalyse la formation de liens phosphodiesters entre les ribonucléotides avec des ribunucléosides triphosphates libres et l’énergie de la rupture de la 1ere liaison phosphodiester . Libère ainsi un PPi
L’ARN pol a-t-elle besoin d’une amorce?
Non!!
L’ADN pol est-elle plus ou moins précise que l’ARN pol et pourquoi?
plus précise car l’ARN n’est pas le lieu permanent de stockage de l’information génétique et les erreurs d’ARN ont des conséquences mineures
3 types d’ARN pol et fonctions:
- ARN pol I : transcrit ARN r
- ARN pol II: ARNm
- ARN pol III : ARNt et petites ARNs : ARNr 5ss
Combien de sous-unités a l’ARN pol?
2
Les sites catalytiques des ARN pol sont-ils différents entre eucaryotes et procaryotes?
Non
Définition promoteur:
région régulatrice du gène ayant une séquence nucléotidique (40 pb) indiquant le point de départ de la transcription
Est-ce que le promoteur est transcrit
non
Le promoteur est en amont ou en aval du site d’initiation ?
En amont
Quelle est l’enzyme de transcription?
ARN pol
Dans quelle sens est la transcription de l’ARN?
5’–>3’
V ou F : la synthèse de l’ARN est antiparallèle et complémentaire
Vrai
Comment fonctionne l’ARN polymérase pour la synthèse d’ARN?
elle catalyse la formation de liens phosphodiesters entre les ribonucléotides avec des ribunucléosides triphosphates libres et l’énergie de la rupture de la 1ere liaison phosphodiester . Libère ainsi un PPi
L’ARN pol a-t-elle besoin d’une amorce?
Non!!
L’ADN pol est-elle plus ou moins précise que l’ARN pol et pourquoi?
plus précise car l’ARN n’est pas le lieu permanent de stockage de l’information génétique et les erreurs d’ARN ont des conséquences mineures
3 types d’ARN pol et fonctions:
- ARN pol I : transcrit ARN r
- ARN pol II: ARNm
- ARN pol III : ARNt et petites ARNs : ARNr 5ss
Combien de sous-unités a l’ARN pol?
2
Les sites catalytiques des ARN pol sont-ils différents entre eucaryotes et procaryotes?
Non
Définition promoteur:
région régulatrice du gène ayant une séquence nucléotidique (40 pb) indiquant le point de départ de la transcription
Est-ce que le promoteur est transcrit
non
Le promoteur est en amont ou en aval du site d’initiation ?
En amont
Quelles sont les 4 étapes de la transcription?
- liaison de l’ARN Pol au promoteur
- initiation polymérisation
- élongation de la chaine
- terminaison de la chaine
Où est située la boite TATA et comment s’appelle cette région ?
à 25 nucléotides du site d’initiation dans la région -25
Qu’a besoin l’ARN pol II pour débuter la transcription?
Un complexe de protéines: les facteurs de transcription généraux FTG
Où l’ARNm mature-t-il?
dans le noyau
Que fait l’ARNm?
Synthèse protéique
Que fait l’ARNt?
adapteur qui séléctionne les a.a et les apporte sur le ribosome avant leur incorporation dans la protéine
Que fait l’ARNr?
coeur du ribosome sur lequel l’ARNm est traduit en protéine : fait la structure et la fonction des ribosome et la synthèse des protéines à partir des ARNm et ARNt
Que font les snARn?
épissage des introns, transport des protéines au RE, maturation et transport des ARNm
Que font les miARN (micro ARN)?
Régulent l’expression des ARNm
Qu’est-ce que TFIIH:
FTG (facteur de transcription général) hélicase avec une activité kinase = ajoute des Pi à l’ARN pol II du côté C-terminal
Quel est le transcrit de l’ARN pol II codant pour les miARN
pri-miRNA
Où sont situés les promoteurs par rapport au site de transcription?
en 5’
De quoi sont composés les promoteurs?
Boite TATA
Où est située la boite TATA et comment s’appelle cette région ?
à 25 nucléotides du site d’initiation dans la région -25
Que font les FTG pour commencer la transcription
Ils se fixent au promoteur pour attirer et positionner l’ARN pol II
Que forme le complexe d’initiation de la transcription?
les FTG (A B D F H) et l’ARN pol II
Rôles boite TATA (2):
- lier l’ARN pol II via TFIID
2. indiquer à ARN pol II le site initial de transcription
TFIID se lie à …
son domaine TBP se lie à la boite TATA
Que fait la TFIID lors de sa liaison à la boîte TATA
elle déroula la séquence TATA avec une courbure de 100 degrés de l’axe de l’hélice = forme de selle anglaise
V ou F : Les enzymes de maturation de l’ARN primaire sont étroitement associées à l’ARN pol II.
Vrai
Quel FTG ouvre la double hélice ADN et où?
TFIIH au niveau du codon d’initiation
Rôle de la phosphorylation de l’ARN pol II par TFIIH =
- dégagement de l’ARN pol II du complexe d’initiation de transcription
- Assemblage des facteurs de maturation de l’ARNm
V ou F : une fois la transcription débutée, tous les FTG restent liés à l’ADN jusqu’à la fin de la transcription
Faux : la plupart des FTG sont libérés de l’ADN quand la transcription débute et peuvent être disponibles pour recommencer l’initiation de la transcription
Qu’arrive-t-il à l’ARN pol II lorsqu’elle a fini la transcription ?
Ses groupements P sont déphorphorylées par des phosphatases, permettant d’initier la synthèse d’un autre ARN
Où se fait la polyadénylation ?
Extrémité 3’-terminale
TFIIE se lie à …
TFIIA B et D
TFIIF se lie à …
ARN pol II
TFIIH se lie à…
TFIIA/B/D/E
TFIID se lie à …
son domaine TBP se lie à la boite TATA
Que doit faire un ARNm (transcrit primaire) pour être traduit?
- modifications/maturation : stabilisation, protection contre la dégradation, transport vers le cytosol
- transport dans la cytoplasme hors du noyau par pores de la membrane nucléaire
Comment s’appellent les séquences non-codantes des gènes?
Introns (comme intrus)
3 étapes de maturation de l’ARNm depuis le début de synthèse:
- ajout coiffe 5’
- polyadénylation
- épissage
l’ARNm est coiffé avec quel nucléotide à son extrémité 5’?
7-méthylguanosine : une guanine avec groupement méthyle
La coiffe 5’ est ajoutée quand?
Lorsque l’ARN pol II a synthétisé un ribonucléotide de 25 nucléotides (avant fin transcription)
Mécanisme d’ajout de la coiffe 5’ :
- La guanylyl-transférase additionne une GMP sur le transcrit primaire à l’aide d’un GTP.
- GMP méthylée = 7-méthylguanosine
Où se fait la polyadénylation ?
Extrémité 3’-terminale
Que font les 2 enzymes modifiant l’extremité 3’-terminale de l’ARNm?
1ère enzyme : coupe la chaîne d’ARN au niveau d’une séquence particulière de nucléotide
2e enzyme : ajoute une série d’adénine après le site de coupure = Queue poly-A
Combien de nucléotides contient la queue poly-A?
Une centaine de nucléotides adénine
Par quoi sont ajoutés les adénines lors de la polyadénylation?
la poly(A) polymérase
Rôles de la coiffe 5’ et la queue poly-A:
- augmentent stabilité ARNm = protection contre dégradation
- facilitent exportation ARNm vers cytoplasme
- permettent d’identifier l’ARNm du transcrit primaire
- utilisées par la machinerie de traduction pour s’assurer que le message est complet avant synthèse protéique
Comment s’appellent les séquences codantes des gènes?
exons
Comment s’appellent les séquences non-codantes des gènes?
Introns (comme intrus)
Comment sont différenciés les introns pour l’épissage?
Chaque intron contient de courtes séquences nucléotidiques = signaux pour son excision ( site d’épissage 5’ et 3’ et site de branchement)
Quelle est la durée de vie d’un ARNm :
10h
2e raison pourquoi l’ARN a un ribose et pas un désoxyribose?
Car lors de l’épissage : l’extrémité 5’ de l’intro se lie au 2’-OH de l’adénine
La quantité de protéines dépend de quoi?
la dégradation de l’ARNm, l’efficacité des étapes de transcription, la dégradation des protéines
Que forment le coeur du complexe d’épissage / splicéosome?
Des petits ARN nucléaires (ARNsn) qui se lient à des protéines = petites particules nucléaires ribonucléoprotéiques snRNP
Comment s’appelle le complexe d’épissage et dequoi est-il formé?
splicéosome : gros complexe d”ARN-protéines avec des snRNP
Rôle dans splicéosome des ARNsn (petits ARN):
reconnaître et s’apparier au sites d’épissage et point de branchement d’un intron
Rôle des snRNP dans le splicéosome :
rassemblent les 2 extrémité d’intron afin de les épisser
Comment l’épissage permet de produire plusieurs protéines à partir du même gène?
les gènes peuvent être épissés différemment pour produire des ARNm différents
Quel % des gènes humains font l’épissage alternatif?
60%
Quelles protéines déterminent si un ARNm est prêt à être exporter par les pores nucléaires?
- Protéines de liaison à la queue poly-A
- complexe de reconnaissance de la coiffe
- protéines qui reconnaissent l’ARNm correctement épissé
Qu’arrivent aux ARN restant dans le noyaux?
Ils sont dégradés et les éléments sont réutilisés pour de nouvelles transcription
Quelle est la durée de vie d’un ARNm :
10h
La durée de vie des ARNm est contrôlée par quoi?
les miARN qui se lient à des séquences nucléotidiques des régions 5’ et 3’ non traduites de l’ARNm
La quantité de protéines dépend de quoi?
la dégradation de l’ARNm, l’efficacité des étapes de transcription, la dégradation des protéines
Existe-t-il réellement de transcrit primaire dans la cellule ?
Non
