Chap 10 : Traduction Flashcards
Définition traduction:
Processus par lequel est assemblé une protéine sous forme d’une structure primaire d’AA, dont la séquence est déterminée par l’information des codons de l’ARNm
Quel type de liaison relie 2 a.a?
liaison peptidique
Définition code génétique:
Règles par lesquelles la séquence de nucléotides d’un gène d’un ARNm est traduite en séquence d’AA (protéine)
Comment est lu le code génétique?
par codons
Codons =
groupes de 3 nucléotides consécutifs
Combien de codons totaux?
64
Noms des nucléotides à purines et la base qui leur est associée:
Adénosine (adénine=A)
Guanosine (Guanine = G)
Noms des nucléotides à pyrimidines et leur base azotée:
Uridine (uracyl U)
Cytidine (Cytosine C)
Définition dégénérescence :
un même AA peut être codé par plusieurs codons
à quoi est due la dégénérescence?
redondance du code génétique : 64 codons pour 20 AA
Codons STOP:
- UAA
- UAG
- UGA
Quels acides aminés ont 1 codon?
Met et trp (méthionine et tryptophane)
Quel est le codon d’initiation de traduction ?
AUG = méthionine
V ou F : les 2 derniers nucléotides sont généralement les mêmes et le 1er est variable
Faux: les 2 premiers nucléotides d’un même aa est généralement le même et le 3e est variable
V ou F : les aa similaires ont souvent des codons similaires?
Vrai
Comment sont les codons des AA hydrophobes?
une pyrimidine en 2e position
comment sont structurés les aa polaires ou chargés?
ont une purine en 2e position
quel est le code du tryptophane ?
ugg
Quel est l’avantage de la dégénérescence?
Mutations ont moins de chance d’entraîner des effets délétaires ou fatal
,
m
m
m
Comment le code génétique est-il non équivoque?
pour 1 codon = 1 AA
Mécanisme moléculaire du code génétique non équivoque :
dans 1 ARNt : 1 extrémité avec AA et 1 extrémité avec l’anticodon spécifique à l’AA
le code génétique se chevauche-t-il?
non
le code génétique comporte-t-il de la ponctuation?
non
le code génétique est-il universel?
oui mais quelques exceptions
Exceptions de l’universalité du code génétique:
chez certains organismes sont inhabituels :
- UGA code Trp au lieu de stop
- CUG code Thr au lieu de Leu
Définition mutation :
changement stable dans la séquence de nucléotides de l’ADN
2 grands types de mutations =
- par délétion ou insertion de pb
2. par substitution de pb
délétion =
perte de 1 ou + pb
insertion =
ajout de 1 ou + pb
conséquence des délétions et insertions au gène =
décalage du cadre de lecture
conséquence des délétions et insertions sur la protéine =
perte de structure et fonction de protéine
2 types de mutations ponctuelles par substitution =
- mutation par transition
2. mutation par transversion
Mutation par transition =
remplacement d’une base avec une autre base de même famille = purine par purine ( A-G) et pyrimidine par pyrimidine (T et C)
Mutation par transversion =
purine par pyrimidine
Conséquences des substitiution =
mutations : silencieuses, faux-sens, non-sens
mutation silencieuse =
codon changé par un codon donnant le même AA = aucun effet sur protéine
mutation faux-sens =
codon changé par codon d’un AA différent
2 types de mutations faux sens et effet =
- conservative : le AA substitué a des propriétés similaires = peu ou pas d’effet sur protéine
- non conservative : codon muté code pour un AA avec des propriétés différentes = perte partielle ou totale de la structure / fonction de la protéine
mutation non-sens =
codon changé par codon stop
conséquence des mutations non-sens =
terminaison prématurée et perte partielle ou totale de structure/fonction de protéine
définition ARNt =
molécules adaptatrices dont 1 extrémité reconnait et lie un codon et l’autre extrémité lie l’AA
Longueur de l’ARNt =
80 nucléotides
m
m
Structure tertiaire ARNt =
forme de L inversé:
- bras accepteur de l’AA et boucle de l’anticodon aux extrémités
- boucles D et T à l’angle du “L”
que possède la boucle de l’anticodon ?
l’anticodon = 3 nucléotides s’appariant au codon de l’ARNm
que possède le bras accepteur?
une courte séquence simple brin à l’extrémité 3’ de la molécule qui se termine par CCA-3’OH où sera fixé l’AA correspondant au codon
Quelle est l’enzyme catalysant la liaison covalente d’un AA à l’ARNt approprié?
aminoacyl-ARNt synthétases
combien il y a-t-il d’aminoacyl ARNt synthétase?
20 (1 par AA)
Quelle est la double spécificité des aminoacyl-ARNt synthétase?
- avec l’AA
2. avec l’ARNt
3 étapes du chargement de l’AA sur l’ARNt =
par aminoacyl-ARNt synthétase :
- reconnaissance de l’AA et de l’ARNt
- activation de l’AA
- transfert de l’AA activé au bras accepteur de l’ARNt
Comment l’aminoacyl-ARNt synthétase reconnait-elle l’ARNt approprié?
en observant les éléments de l’ARNt:
- au moins 1 base de l’anticodon
- au moins 1 des 3 bases du bras accepteur
- la base non appariée qui précède
Comment l’aminoacyl-ARNt synthétase active-t-elle l’AA?
elle hydrolyse l’ATP en AMP et active l’AA en le liant à l’AMP = aminoacyl-AMP. Aminoacyl-AMP reste lié à l’enzyme
Comment l’aminoacyl-ARNt-synthétase trasfert-elle l’AA sur l’ARNt?
l’enzyme trasfert la partie aminoacyle au 3’-OH du ribose de l’adénine non apparié de la région 5’-CC-3’ du bras accepteur de l’ARNt, libérant l’AMP
Définition ribosome:
macromolécule qui glisse le long de l’ARNm, capte les ARNt, les positionne sur l’ARNm et lie de façon covalente les AA qu’ils portent pour former 1 protéine
De quoi le ribosome est fait moléculairement ?
+ de 50 protéines ribosomiques et plusieurs molécules d’ARNr
Quel est le coefficient de sédimentation total du ribosome?
80S
Structure générale du ribosome:
1 petite et 1 grande sous-unité
Coefficient de sédimentation des sous-unités ribosomales?
Grande sous-unité = 60S
petite sous-unité = 40S
Nombre de protéines et d’ARNr de la petite sous-unité?
33 protéines
1 ARNr
Coefficient de sédimentation de l’ARNr de la petite sous-unité du ribosome?
18S
Nb de protéines et d’ARNr de la grande sous-unité?
49 protéines
3 ARNr
où sont produites les sous-unités ribosomiques?
noyau
où sont synthétisées les protéines ribosomiques?
cytoplasmes
les sous-unités sont transportées hors du noyau sous forme individuelle ou assemblée?
individuelle
Quelle est la taille des sous-unités robosomales procaryotes et total?
70S –> 30S et 50S
Sites de liaison du ribosome?
1 site de liaison de l’ARNm
3 sites de laisons pour les ARNt chargés : A P et E
Que forme le coeur du ribosome
les ARNr en 3D qui forment les 3 sites A.,P et E
Quels ARNr ont une activité peptidyl transférase et à quel site du ribosome?
Les ARNr 28S et 23S(procaryote) au niveau du site P
Quel est le rôle des protéines ribosomiques?
replier et stabiliser le coeur en ARN
où est le site de liaison de l’ARNm dans le ribosome?
dans la petite sous-unité
QUe forme le pont entre les 2 sous-unités?
l’ARNt
où se trouve la boucle de l’anticodon dans le ribosome?
petite sous-unité
où se trouve le bras accepteur de l’AA dans le ribosome?
grande sous-unité
À quoi se lie le site A:
à l’aminoacyl-ARNt
que contient le site P?
l’ARNt associé à la chaîne de polypeptides en formation
que contient le site E ?
ARNt désacylé/déchargé
2 régions du ribosome =
- centre de décodage dans la petite sous-unité (codon est avec le bon anticodons)
- centre peptidyl transférase dans la grande sous-unité (où les liaison peptidiques sont catalysées)
Rôle de la petite sous-unité dans la traduction ?
apparier les ARNt aux codons de l’ARNm
rôle grande unité dans la traduction =
catalyser la formation de la liaison peptidique reliant les aa de la chaine polypeptidique
À quelle extrémité les 2 sous-unités s’assemblent sur l’ARNm pour démarrer la synthèse?
5’
3 phases de la traduction ?
- initiation 2. élongation 3. terminaison
